FuNGI

A0A0H2RR18

Protein Details

Accession

A0A0H2RR18

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
267-291	INDFTSTSTRKRKRKQPRIEPYLIP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
276-284	RKRKRKQPR

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 14, cyto 9.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5 IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN

Amino Acid Sequences

MASRGFSAREFLSLSARVDDGSESESSDGFDDDLDSLEAPHEGELYLCHRISSLICLLDSEGPFASNQRILDASRRIFEEENIEEMVARYRRMDREVRNKDGALEDAFDLSLGARMSRVPCATSEISMFGVICKRRLEETLVIRLFNKTTSDDRFQMTSVFAVSKSPGRVYFEASSIQHVRDLCASMNFLYIKSIFYVPLEERVALLGNPKLPTSLKVDDRVKVRSGLYKGDVGSVFRVMDQPVRVIVKLKSREVRPTDSIENRGEINDFTSTSTRKRKRKQPRIEPYLIPKHPVRAELLFSGTQVSPIDDGFVFRDKAYTNDGYRLLEVRCDRVERVSTVVPGLSAPANSAAPSIIEPTSSGISVPRFLHVGNHVLISNGPAQGMSGTINQLSDESAVITFDEKNSTDLYKTSPVQAEVTLSEITRLFELGESVEVKVGAHLGRSGMIGEIKGDTVSILDQALIEMIHVSLAFIDTCAKNSSSRARYEDGDSDIKQGHRVIVMKGKHGGKEGILAVIRHHVVTVIEDVSGVEIVTGRQNIRVISTNRELKAWLQSEGSNESSTKAQQRDFFTTLAISIGMNLNEV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.22
3	0.22
4	0.2
5	0.19
6	0.18
7	0.14
8	0.14
9	0.13
10	0.12
11	0.13
12	0.13
13	0.13
14	0.13
15	0.12
16	0.09
17	0.09
18	0.09
19	0.08
20	0.1
21	0.09
22	0.09
23	0.08
24	0.09
25	0.09
26	0.08
27	0.08
28	0.07
29	0.07
30	0.07
31	0.09
32	0.12
33	0.17
34	0.16
35	0.16
36	0.16
37	0.18
38	0.18
39	0.21
40	0.22
41	0.18
42	0.18
43	0.19
44	0.2
45	0.24
46	0.23
47	0.2
48	0.16
49	0.15
50	0.15
51	0.16
52	0.18
53	0.16
54	0.16
55	0.16
56	0.17
57	0.18
58	0.25
59	0.31
60	0.31
61	0.3
62	0.32
63	0.33
64	0.32
65	0.33
66	0.32
67	0.27
68	0.26
69	0.24
70	0.22
71	0.19
72	0.19
73	0.24
74	0.19
75	0.17
76	0.18
77	0.23
78	0.27
79	0.32
80	0.4
81	0.43
82	0.53
83	0.61
84	0.65
85	0.64
86	0.61
87	0.57
88	0.51
89	0.43
90	0.33
91	0.26
92	0.19
93	0.15
94	0.15
95	0.13
96	0.1
97	0.08
98	0.09
99	0.07
100	0.07
101	0.07
102	0.09
103	0.11
104	0.15
105	0.16
106	0.14
107	0.15
108	0.21
109	0.22
110	0.21
111	0.21
112	0.18
113	0.18
114	0.17
115	0.16
116	0.12
117	0.17
118	0.16
119	0.19
120	0.19
121	0.2
122	0.21
123	0.23
124	0.27
125	0.29
126	0.33
127	0.4
128	0.39
129	0.38
130	0.37
131	0.37
132	0.32
133	0.26
134	0.22
135	0.16
136	0.2
137	0.25
138	0.29
139	0.3
140	0.31
141	0.31
142	0.29
143	0.27
144	0.23
145	0.17
146	0.13
147	0.12
148	0.1
149	0.1
150	0.11
151	0.13
152	0.14
153	0.16
154	0.17
155	0.21
156	0.22
157	0.27
158	0.27
159	0.25
160	0.27
161	0.25
162	0.29
163	0.25
164	0.24
165	0.21
166	0.2
167	0.19
168	0.17
169	0.18
170	0.14
171	0.14
172	0.14
173	0.12
174	0.15
175	0.14
176	0.12
177	0.12
178	0.12
179	0.11
180	0.12
181	0.12
182	0.1
183	0.1
184	0.13
185	0.12
186	0.16
187	0.16
188	0.15
189	0.14
190	0.14
191	0.14
192	0.11
193	0.13
194	0.1
195	0.12
196	0.12
197	0.12
198	0.13
199	0.13
200	0.15
201	0.19
202	0.23
203	0.23
204	0.3
205	0.33
206	0.36
207	0.38
208	0.39
209	0.34
210	0.32
211	0.3
212	0.29
213	0.28
214	0.27
215	0.26
216	0.25
217	0.24
218	0.24
219	0.23
220	0.18
221	0.17
222	0.14
223	0.13
224	0.1
225	0.11
226	0.09
227	0.11
228	0.11
229	0.1
230	0.12
231	0.13
232	0.12
233	0.14
234	0.16
235	0.22
236	0.25
237	0.29
238	0.32
239	0.34
240	0.41
241	0.43
242	0.46
243	0.41
244	0.42
245	0.43
246	0.4
247	0.42
248	0.35
249	0.32
250	0.27
251	0.24
252	0.2
253	0.14
254	0.13
255	0.09
256	0.09
257	0.09
258	0.11
259	0.12
260	0.17
261	0.27
262	0.34
263	0.43
264	0.51
265	0.61
266	0.7
267	0.8
268	0.85
269	0.87
270	0.89
271	0.89
272	0.85
273	0.78
274	0.74
275	0.73
276	0.62
277	0.54
278	0.43
279	0.38
280	0.34
281	0.32
282	0.27
283	0.18
284	0.2
285	0.17
286	0.19
287	0.15
288	0.13
289	0.14
290	0.12
291	0.11
292	0.09
293	0.09
294	0.07
295	0.07
296	0.08
297	0.06
298	0.06
299	0.07
300	0.09
301	0.09
302	0.09
303	0.1
304	0.1
305	0.11
306	0.15
307	0.17
308	0.16
309	0.18
310	0.2
311	0.19
312	0.19
313	0.2
314	0.16
315	0.17
316	0.17
317	0.16
318	0.17
319	0.18
320	0.18
321	0.18
322	0.2
323	0.16
324	0.19
325	0.17
326	0.16
327	0.15
328	0.15
329	0.12
330	0.1
331	0.1
332	0.07
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.08
343	0.06
344	0.06
345	0.07
346	0.08
347	0.09
348	0.08
349	0.08
350	0.08
351	0.09
352	0.12
353	0.12
354	0.12
355	0.12
356	0.12
357	0.14
358	0.14
359	0.17
360	0.14
361	0.14
362	0.13
363	0.13
364	0.13
365	0.12
366	0.12
367	0.09
368	0.08
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.08
373	0.07
374	0.06
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.07
381	0.07
382	0.06
383	0.06
384	0.05
385	0.06
386	0.06
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.09
391	0.09
392	0.1
393	0.11
394	0.12
395	0.12
396	0.13
397	0.16
398	0.19
399	0.19
400	0.22
401	0.22
402	0.23
403	0.23
404	0.22
405	0.2
406	0.15
407	0.17
408	0.14
409	0.12
410	0.12
411	0.11
412	0.11
413	0.1
414	0.1
415	0.07
416	0.07
417	0.08
418	0.07
419	0.08
420	0.08
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.08
425	0.08
426	0.09
427	0.08
428	0.07
429	0.08
430	0.07
431	0.08
432	0.08
433	0.09
434	0.08
435	0.08
436	0.08
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.07
441	0.07
442	0.06
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.06
451	0.05
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.04
456	0.04
457	0.04
458	0.04
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.09
463	0.09
464	0.11
465	0.14
466	0.15
467	0.16
468	0.2
469	0.3
470	0.31
471	0.36
472	0.38
473	0.39
474	0.41
475	0.44
476	0.44
477	0.39
478	0.39
479	0.35
480	0.34
481	0.34
482	0.32
483	0.3
484	0.27
485	0.23
486	0.22
487	0.23
488	0.24
489	0.29
490	0.3
491	0.32
492	0.38
493	0.39
494	0.37
495	0.38
496	0.36
497	0.29
498	0.32
499	0.28
500	0.26
501	0.24
502	0.22
503	0.2
504	0.23
505	0.23
506	0.18
507	0.17
508	0.14
509	0.13
510	0.14
511	0.16
512	0.11
513	0.11
514	0.11
515	0.11
516	0.1
517	0.1
518	0.08
519	0.05
520	0.05
521	0.06
522	0.1
523	0.13
524	0.13
525	0.16
526	0.18
527	0.18
528	0.21
529	0.29
530	0.28
531	0.33
532	0.41
533	0.45
534	0.44
535	0.45
536	0.43
537	0.38
538	0.44
539	0.39
540	0.33
541	0.28
542	0.28
543	0.31
544	0.34
545	0.34
546	0.26
547	0.24
548	0.24
549	0.24
550	0.28
551	0.32
552	0.32
553	0.35
554	0.39
555	0.46
556	0.52
557	0.52
558	0.47
559	0.41
560	0.36
561	0.32
562	0.26
563	0.2
564	0.11
565	0.1
566	0.13

A0A0H2RR18

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer