Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0H2S4J0

Protein Details
Accession A0A0H2S4J0    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
314-342NGVTNEFNKRPKKQPRQPKERFQRIKVDQHydrophilic
374-400IVTRGDGFRKEKNKKKRGSYRGGEITLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-163AKAKKSAKAEKKSKAK
243-245KKR
259-283KKLEKKAKEAKSESKSEEASSKKEK
322-333KRPKKQPRQPKE
382-391RKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 12.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MARKGANGVVNDDVAFSLLYNNITKSMGKKTISNLKEGLKDLLELKDMIEDKDSTIKNVRKRWEKMKESSWPEFYGTLSKLSPTPPASSDSSSEGESSSSSSSAASTSKTGKKKVKEPIVVSKSSSGSSSSSSSSSSSSESEAEHVPAKAKKSAKAEKKSKAKSSSSDTDSGTESDDEAESDAEEDVKPKAVANGINKKDVKTSEAKAKSASSSSSSSSESESASASESDSSSEEEEEPQPKKKRRTDENGSSVAVVEKKLEKKAKEAKSESKSEEASSKKEKKVTIEEPTTTTQNGSVADGQEDVNGQTVPENGVTNEFNKRPKKQPRQPKERFQRIKVDQVEYEHDRLKDNSYDSKGGVDNDYGARASRDLIVTRGDGFRKEKNKKKRGSYRGGEITLETHSIRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.09
4 0.08
5 0.09
6 0.11
7 0.12
8 0.13
9 0.14
10 0.16
11 0.18
12 0.2
13 0.27
14 0.32
15 0.33
16 0.36
17 0.42
18 0.5
19 0.5
20 0.51
21 0.47
22 0.45
23 0.48
24 0.47
25 0.42
26 0.33
27 0.33
28 0.3
29 0.28
30 0.24
31 0.19
32 0.17
33 0.2
34 0.2
35 0.19
36 0.2
37 0.18
38 0.18
39 0.26
40 0.26
41 0.24
42 0.32
43 0.37
44 0.42
45 0.49
46 0.57
47 0.59
48 0.66
49 0.73
50 0.75
51 0.78
52 0.78
53 0.79
54 0.79
55 0.77
56 0.76
57 0.69
58 0.6
59 0.53
60 0.46
61 0.39
62 0.34
63 0.28
64 0.24
65 0.2
66 0.19
67 0.19
68 0.2
69 0.24
70 0.21
71 0.23
72 0.22
73 0.26
74 0.28
75 0.28
76 0.29
77 0.27
78 0.26
79 0.24
80 0.22
81 0.19
82 0.16
83 0.14
84 0.13
85 0.1
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.1
92 0.09
93 0.11
94 0.18
95 0.25
96 0.3
97 0.38
98 0.44
99 0.5
100 0.57
101 0.64
102 0.68
103 0.68
104 0.68
105 0.71
106 0.7
107 0.65
108 0.58
109 0.51
110 0.43
111 0.35
112 0.3
113 0.21
114 0.16
115 0.17
116 0.17
117 0.15
118 0.14
119 0.15
120 0.15
121 0.14
122 0.14
123 0.14
124 0.13
125 0.13
126 0.13
127 0.12
128 0.14
129 0.13
130 0.14
131 0.14
132 0.13
133 0.16
134 0.17
135 0.19
136 0.23
137 0.25
138 0.29
139 0.36
140 0.45
141 0.51
142 0.59
143 0.66
144 0.69
145 0.77
146 0.79
147 0.78
148 0.76
149 0.7
150 0.64
151 0.63
152 0.61
153 0.54
154 0.5
155 0.43
156 0.37
157 0.34
158 0.29
159 0.23
160 0.16
161 0.12
162 0.1
163 0.09
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.08
178 0.09
179 0.13
180 0.2
181 0.29
182 0.3
183 0.36
184 0.36
185 0.36
186 0.37
187 0.33
188 0.3
189 0.25
190 0.26
191 0.29
192 0.31
193 0.31
194 0.3
195 0.3
196 0.27
197 0.24
198 0.22
199 0.16
200 0.15
201 0.16
202 0.16
203 0.16
204 0.16
205 0.16
206 0.16
207 0.13
208 0.12
209 0.11
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.1
223 0.12
224 0.16
225 0.18
226 0.25
227 0.33
228 0.39
229 0.48
230 0.53
231 0.6
232 0.65
233 0.73
234 0.75
235 0.77
236 0.76
237 0.7
238 0.63
239 0.54
240 0.44
241 0.36
242 0.27
243 0.17
244 0.12
245 0.14
246 0.17
247 0.24
248 0.29
249 0.28
250 0.37
251 0.46
252 0.52
253 0.57
254 0.6
255 0.63
256 0.63
257 0.68
258 0.61
259 0.56
260 0.49
261 0.41
262 0.41
263 0.34
264 0.34
265 0.38
266 0.44
267 0.43
268 0.47
269 0.48
270 0.48
271 0.54
272 0.55
273 0.54
274 0.51
275 0.49
276 0.48
277 0.49
278 0.44
279 0.35
280 0.29
281 0.21
282 0.17
283 0.16
284 0.14
285 0.13
286 0.12
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.11
291 0.11
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.09
299 0.09
300 0.1
301 0.09
302 0.12
303 0.13
304 0.15
305 0.21
306 0.24
307 0.31
308 0.38
309 0.44
310 0.52
311 0.62
312 0.71
313 0.75
314 0.82
315 0.85
316 0.89
317 0.92
318 0.93
319 0.93
320 0.93
321 0.91
322 0.86
323 0.86
324 0.79
325 0.8
326 0.74
327 0.68
328 0.59
329 0.54
330 0.55
331 0.49
332 0.47
333 0.42
334 0.37
335 0.35
336 0.34
337 0.35
338 0.33
339 0.32
340 0.36
341 0.37
342 0.38
343 0.35
344 0.37
345 0.35
346 0.32
347 0.3
348 0.23
349 0.21
350 0.19
351 0.2
352 0.17
353 0.16
354 0.15
355 0.14
356 0.14
357 0.15
358 0.17
359 0.17
360 0.18
361 0.2
362 0.2
363 0.23
364 0.26
365 0.25
366 0.28
367 0.31
368 0.38
369 0.46
370 0.56
371 0.63
372 0.69
373 0.77
374 0.81
375 0.88
376 0.9
377 0.9
378 0.9
379 0.88
380 0.87
381 0.86
382 0.79
383 0.69
384 0.59
385 0.5
386 0.42
387 0.36