Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0H2S9I6

Protein Details
Accession A0A0H2S9I6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-128RDGFRDKDRRDKPRDERDRRPDLGBasic
220-241GGVNIKKMRTWRQYMNRRGGFHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-125ERRDRDDRRPPRDGERPRERSRDRERDGFRDKDRRDKPRDERDRRP
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12.5, cyto 8, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MVGILKRQETIGAEETAAGRKKGEEEGLGTTTEIATEEAAADDRVALLADGVVREARHDGETIAETGGVRAHIIYPREHERRDRDDRRPPRDGERPRERSRDRERDGFRDKDRRDKPRDERDRRPDLGDDRSRRDSDRDGRTSKVNSVEPAGAPGPSKSQGAPLTRRVDLDPDSAEPEEGEEEGEEMDVVDEEAAAMQAMMGFGGFGTTKNQHVTGNPEGGVNIKKMRTWRQYMNRRGGFHRPLDKIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.26
4 0.27
5 0.21
6 0.18
7 0.18
8 0.21
9 0.23
10 0.25
11 0.2
12 0.21
13 0.25
14 0.26
15 0.25
16 0.22
17 0.19
18 0.16
19 0.14
20 0.11
21 0.07
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.07
27 0.07
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.05
32 0.05
33 0.05
34 0.04
35 0.04
36 0.05
37 0.05
38 0.05
39 0.06
40 0.06
41 0.07
42 0.09
43 0.1
44 0.1
45 0.11
46 0.1
47 0.11
48 0.13
49 0.13
50 0.11
51 0.1
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.07
56 0.06
57 0.05
58 0.07
59 0.1
60 0.12
61 0.13
62 0.17
63 0.26
64 0.3
65 0.33
66 0.37
67 0.41
68 0.49
69 0.58
70 0.61
71 0.61
72 0.68
73 0.75
74 0.76
75 0.75
76 0.7
77 0.67
78 0.69
79 0.69
80 0.68
81 0.69
82 0.7
83 0.7
84 0.76
85 0.71
86 0.71
87 0.73
88 0.73
89 0.67
90 0.68
91 0.66
92 0.65
93 0.68
94 0.65
95 0.6
96 0.59
97 0.56
98 0.58
99 0.61
100 0.62
101 0.63
102 0.66
103 0.7
104 0.71
105 0.8
106 0.78
107 0.8
108 0.8
109 0.8
110 0.72
111 0.65
112 0.57
113 0.5
114 0.5
115 0.48
116 0.43
117 0.4
118 0.43
119 0.42
120 0.39
121 0.38
122 0.37
123 0.37
124 0.42
125 0.43
126 0.41
127 0.42
128 0.45
129 0.43
130 0.4
131 0.36
132 0.28
133 0.23
134 0.23
135 0.22
136 0.19
137 0.19
138 0.16
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.12
145 0.1
146 0.14
147 0.19
148 0.24
149 0.27
150 0.32
151 0.35
152 0.35
153 0.36
154 0.32
155 0.31
156 0.28
157 0.26
158 0.21
159 0.18
160 0.2
161 0.19
162 0.18
163 0.14
164 0.13
165 0.11
166 0.09
167 0.08
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.02
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.02
190 0.02
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.09
195 0.11
196 0.13
197 0.16
198 0.18
199 0.18
200 0.2
201 0.27
202 0.28
203 0.29
204 0.27
205 0.25
206 0.24
207 0.26
208 0.26
209 0.22
210 0.22
211 0.2
212 0.22
213 0.29
214 0.39
215 0.44
216 0.5
217 0.57
218 0.63
219 0.73
220 0.8
221 0.84
222 0.81
223 0.77
224 0.75
225 0.74
226 0.71
227 0.69
228 0.68