FuNGI

A0A0H2R0L4

Protein Details

Accession

A0A0H2R0L4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
236-256	LDSPSRKRRFKTGRPNPCLFT	Hydrophilic
875-896	AANYKREDKELKKRNRSTANTP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR041973 KOW_Spt5_1 IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5 IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN
CDD	cd06081 KOW_Spt5_1

Amino Acid Sequences

MASRFVDVEAEVHGDGDELSSDDELFGDIRDLLDDTENARMGPSSNANINIIDDLSQHPDTFRTIAEETAAIFREREIASREEQLSALNDADLPLTAWLPNHDDLILFEVRVKRGHEAELVLRLYRRTYLNDVWRPEMGSVFAIPSHPGRIFIEAKSPKRLLPFIESVLDVYTSLWDVVSLEDRVSLIGSFRPTDHLKVGSWVVVKYGLYAGDFGQIVDIDQNHDRTVVKLPSRILDSPSRKRRFKTGRPNPCLFTRAEAEKRFGSEAVSGIDPFTCDGIDYTRDGFCLAHIDYNSVKAARPSLSDVKLFLTAAEASLCFELFNKEAPHSPLNDIEIFNRASLDLASVSFPSNIRQGDRVKIASGPLAGMYARVVEPPVLQTVNVQIDDASLGPPNNQDPIVAVEVTALTKIFREGDFVEVNSGLYSGHRGVVVSTDDITITIQDDAQSDSITVPWCYIDYDTSQDTSTLPIGTGNPPTVQPRPPETKCMDHLAIEAIGKQAYVWKGKWKGKIGIVKSMSGLSAAVAFVSSYILGGNLTYVKRDDLVNISMQTLLTGKPPILTPAEYISFSKFLSGALSDRSATPPPLTNEMDDFLTPPPSDEPFFVHGKSSESLDVAIRAKNCPTSPTRKFVMHINNHRSAKIAGVKTGRVAVDNSPLKFPLSTSQAAEVLVEFTDARSNELREMIPVKDLSPKHTKAGEEHVIIRGDKMGSLVLHIRNKRDRARVYFEGTDKRKEGFFLEYKTSGTGVAITVTIMPKASPPPAHWINKLRKVPKGTLREWARASNERFDINAAIFVYKSRVRAEAGVKQNAKGWRGPCGQYHKYNEGVNGLNSGHLLDVCIKKLCAERIHKIEIPDDIRVKLANDIAAIQYFAANYKREDKELKKRNRSTANTPVNRSNNDQSNTSTLPVTSAPEPHRSPLTSPTQGARSSYERSLPPSSDSDIYYTANTHFASSSDEPTSSDRFSNLAVDPQTSPIRPTRGLAQIRRRWPRPSVPFLGFEDDEIVLPKAKGAQNNGEHYMPQYLDGDSEEVFPEISDLIADKKKTDMFIDLTTPKRTSKRAAATEPPVRQKKFRPAIIIKDDKLDSHVPDLFIDPVLKTEDRAGPSAPPVRQKKFRPAAIIEDGNSKSRMPALFNTGSNAGDEAGPSAPPVPAGPLKPRIMNKAFYREVIEILDSP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.09
3	0.09
4	0.08
5	0.06
6	0.07
7	0.07
8	0.08
9	0.07
10	0.07
11	0.08
12	0.08
13	0.07
14	0.08
15	0.07
16	0.08
17	0.09
18	0.09
19	0.1
20	0.12
21	0.12
22	0.12
23	0.17
24	0.17
25	0.16
26	0.16
27	0.15
28	0.14
29	0.18
30	0.21
31	0.2
32	0.23
33	0.26
34	0.26
35	0.26
36	0.26
37	0.22
38	0.19
39	0.15
40	0.13
41	0.13
42	0.18
43	0.19
44	0.18
45	0.17
46	0.18
47	0.21
48	0.21
49	0.19
50	0.18
51	0.18
52	0.18
53	0.19
54	0.18
55	0.17
56	0.19
57	0.2
58	0.15
59	0.14
60	0.14
61	0.19
62	0.19
63	0.21
64	0.21
65	0.23
66	0.25
67	0.32
68	0.33
69	0.28
70	0.28
71	0.27
72	0.25
73	0.23
74	0.21
75	0.14
76	0.13
77	0.12
78	0.12
79	0.1
80	0.09
81	0.07
82	0.08
83	0.08
84	0.09
85	0.11
86	0.15
87	0.16
88	0.16
89	0.15
90	0.15
91	0.15
92	0.19
93	0.18
94	0.13
95	0.16
96	0.2
97	0.21
98	0.24
99	0.26
100	0.26
101	0.27
102	0.3
103	0.29
104	0.28
105	0.3
106	0.34
107	0.33
108	0.3
109	0.29
110	0.27
111	0.25
112	0.26
113	0.25
114	0.24
115	0.3
116	0.36
117	0.45
118	0.51
119	0.54
120	0.53
121	0.52
122	0.48
123	0.42
124	0.34
125	0.25
126	0.19
127	0.16
128	0.13
129	0.12
130	0.12
131	0.13
132	0.13
133	0.16
134	0.15
135	0.17
136	0.17
137	0.23
138	0.25
139	0.24
140	0.33
141	0.37
142	0.41
143	0.46
144	0.46
145	0.43
146	0.46
147	0.47
148	0.41
149	0.4
150	0.4
151	0.35
152	0.35
153	0.33
154	0.28
155	0.26
156	0.23
157	0.15
158	0.11
159	0.1
160	0.08
161	0.08
162	0.07
163	0.06
164	0.06
165	0.08
166	0.1
167	0.1
168	0.1
169	0.1
170	0.1
171	0.1
172	0.11
173	0.09
174	0.07
175	0.1
176	0.12
177	0.12
178	0.13
179	0.18
180	0.2
181	0.23
182	0.26
183	0.25
184	0.24
185	0.26
186	0.27
187	0.25
188	0.24
189	0.21
190	0.18
191	0.18
192	0.17
193	0.15
194	0.15
195	0.12
196	0.1
197	0.11
198	0.1
199	0.11
200	0.11
201	0.1
202	0.1
203	0.09
204	0.09
205	0.1
206	0.1
207	0.1
208	0.13
209	0.14
210	0.14
211	0.15
212	0.16
213	0.16
214	0.22
215	0.26
216	0.26
217	0.29
218	0.3
219	0.32
220	0.37
221	0.36
222	0.34
223	0.37
224	0.43
225	0.5
226	0.59
227	0.65
228	0.65
229	0.66
230	0.73
231	0.74
232	0.76
233	0.76
234	0.77
235	0.79
236	0.82
237	0.85
238	0.77
239	0.71
240	0.63
241	0.52
242	0.45
243	0.39
244	0.38
245	0.41
246	0.4
247	0.39
248	0.38
249	0.39
250	0.36
251	0.31
252	0.25
253	0.19
254	0.17
255	0.16
256	0.15
257	0.13
258	0.12
259	0.12
260	0.1
261	0.09
262	0.09
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.08
267	0.1
268	0.11
269	0.12
270	0.12
271	0.13
272	0.13
273	0.12
274	0.1
275	0.13
276	0.12
277	0.14
278	0.14
279	0.16
280	0.16
281	0.18
282	0.19
283	0.16
284	0.16
285	0.13
286	0.16
287	0.15
288	0.16
289	0.2
290	0.25
291	0.28
292	0.28
293	0.27
294	0.26
295	0.26
296	0.24
297	0.18
298	0.13
299	0.11
300	0.1
301	0.1
302	0.08
303	0.08
304	0.08
305	0.08
306	0.06
307	0.06
308	0.08
309	0.08
310	0.12
311	0.13
312	0.14
313	0.17
314	0.22
315	0.23
316	0.23
317	0.25
318	0.23
319	0.24
320	0.25
321	0.23
322	0.19
323	0.2
324	0.18
325	0.16
326	0.15
327	0.12
328	0.1
329	0.09
330	0.09
331	0.06
332	0.06
333	0.07
334	0.08
335	0.09
336	0.09
337	0.1
338	0.1
339	0.14
340	0.15
341	0.15
342	0.2
343	0.22
344	0.26
345	0.29
346	0.29
347	0.25
348	0.25
349	0.24
350	0.21
351	0.18
352	0.14
353	0.1
354	0.09
355	0.08
356	0.07
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.07
364	0.08
365	0.1
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.13
370	0.15
371	0.14
372	0.13
373	0.11
374	0.11
375	0.11
376	0.11
377	0.08
378	0.06
379	0.07
380	0.07
381	0.08
382	0.09
383	0.1
384	0.1
385	0.09
386	0.09
387	0.12
388	0.13
389	0.11
390	0.1
391	0.09
392	0.09
393	0.1
394	0.09
395	0.06
396	0.04
397	0.05
398	0.05
399	0.07
400	0.06
401	0.09
402	0.1
403	0.14
404	0.14
405	0.14
406	0.15
407	0.13
408	0.13
409	0.1
410	0.1
411	0.06
412	0.05
413	0.07
414	0.06
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.09
420	0.1
421	0.09
422	0.09
423	0.08
424	0.08
425	0.08
426	0.08
427	0.06
428	0.06
429	0.05
430	0.05
431	0.06
432	0.06
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.08
447	0.08
448	0.11
449	0.11
450	0.12
451	0.12
452	0.12
453	0.11
454	0.11
455	0.11
456	0.08
457	0.07
458	0.07
459	0.09
460	0.1
461	0.11
462	0.11
463	0.11
464	0.12
465	0.15
466	0.17
467	0.19
468	0.2
469	0.25
470	0.33
471	0.34
472	0.39
473	0.39
474	0.41
475	0.4
476	0.42
477	0.37
478	0.29
479	0.28
480	0.23
481	0.2
482	0.15
483	0.13
484	0.08
485	0.07
486	0.06
487	0.06
488	0.08
489	0.1
490	0.13
491	0.13
492	0.2
493	0.29
494	0.34
495	0.41
496	0.42
497	0.44
498	0.48
499	0.54
500	0.49
501	0.49
502	0.45
503	0.39
504	0.35
505	0.31
506	0.24
507	0.17
508	0.15
509	0.06
510	0.05
511	0.05
512	0.04
513	0.03
514	0.03
515	0.03
516	0.03
517	0.03
518	0.03
519	0.03
520	0.03
521	0.03
522	0.03
523	0.03
524	0.06
525	0.06
526	0.07
527	0.07
528	0.07
529	0.08
530	0.09
531	0.09
532	0.1
533	0.11
534	0.12
535	0.12
536	0.12
537	0.12
538	0.11
539	0.1
540	0.08
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.06
545	0.07
546	0.07
547	0.09
548	0.1
549	0.1
550	0.09
551	0.11
552	0.12
553	0.12
554	0.13
555	0.12
556	0.12
557	0.11
558	0.11
559	0.08
560	0.07
561	0.07
562	0.07
563	0.07
564	0.07
565	0.08
566	0.08
567	0.09
568	0.11
569	0.11
570	0.11
571	0.11
572	0.13
573	0.14
574	0.19
575	0.19
576	0.17
577	0.17
578	0.18
579	0.17
580	0.14
581	0.13
582	0.09
583	0.1
584	0.09
585	0.09
586	0.09
587	0.1
588	0.11
589	0.1
590	0.12
591	0.14
592	0.15
593	0.15
594	0.15
595	0.14
596	0.15
597	0.15
598	0.14
599	0.11
600	0.1
601	0.1
602	0.1
603	0.11
604	0.1
605	0.12
606	0.11
607	0.11
608	0.12
609	0.14
610	0.14
611	0.15
612	0.19
613	0.26
614	0.29
615	0.33
616	0.35
617	0.34
618	0.35
619	0.38
620	0.44
621	0.43
622	0.49
623	0.51
624	0.55
625	0.55
626	0.54
627	0.48
628	0.39
629	0.34
630	0.31
631	0.25
632	0.21
633	0.22
634	0.22
635	0.21
636	0.24
637	0.2
638	0.14
639	0.15
640	0.12
641	0.19
642	0.22
643	0.22
644	0.2
645	0.21
646	0.2
647	0.19
648	0.18
649	0.14
650	0.15
651	0.16
652	0.16
653	0.17
654	0.17
655	0.17
656	0.16
657	0.12
658	0.08
659	0.07
660	0.06
661	0.05
662	0.04
663	0.07
664	0.07
665	0.09
666	0.1
667	0.11
668	0.12
669	0.14
670	0.13
671	0.12
672	0.14
673	0.13
674	0.13
675	0.13
676	0.13
677	0.18
678	0.18
679	0.22
680	0.28
681	0.29
682	0.3
683	0.33
684	0.33
685	0.28
686	0.36
687	0.35
688	0.28
689	0.28
690	0.28
691	0.27
692	0.26
693	0.23
694	0.17
695	0.13
696	0.11
697	0.1
698	0.08
699	0.07
700	0.08
701	0.12
702	0.15
703	0.21
704	0.23
705	0.28
706	0.33
707	0.39
708	0.44
709	0.48
710	0.5
711	0.5
712	0.57
713	0.56
714	0.55
715	0.54
716	0.51
717	0.52
718	0.49
719	0.46
720	0.39
721	0.36
722	0.31
723	0.27
724	0.26
725	0.23
726	0.24
727	0.24
728	0.26
729	0.25
730	0.25
731	0.25
732	0.23
733	0.17
734	0.13
735	0.1
736	0.07
737	0.06
738	0.06
739	0.05
740	0.06
741	0.06
742	0.06
743	0.06
744	0.06
745	0.07
746	0.09
747	0.12
748	0.12
749	0.13
750	0.21
751	0.29
752	0.32
753	0.36
754	0.43
755	0.49
756	0.57
757	0.63
758	0.59
759	0.57
760	0.59
761	0.61
762	0.61
763	0.6
764	0.53
765	0.55
766	0.56
767	0.56
768	0.53
769	0.5
770	0.46
771	0.45
772	0.46
773	0.42
774	0.39
775	0.33
776	0.32
777	0.29
778	0.25
779	0.18
780	0.17
781	0.11
782	0.1
783	0.09
784	0.09
785	0.12
786	0.13
787	0.14
788	0.14
789	0.15
790	0.16
791	0.21
792	0.26
793	0.31
794	0.35
795	0.41
796	0.41
797	0.4
798	0.43
799	0.42
800	0.4
801	0.35
802	0.3
803	0.3
804	0.34
805	0.36
806	0.37
807	0.43
808	0.46
809	0.49
810	0.55
811	0.5
812	0.49
813	0.48
814	0.43
815	0.38
816	0.33
817	0.26
818	0.22
819	0.18
820	0.15
821	0.13
822	0.12
823	0.08
824	0.07
825	0.07
826	0.1
827	0.12
828	0.14
829	0.15
830	0.14
831	0.17
832	0.21
833	0.25
834	0.28
835	0.33
836	0.39
837	0.43
838	0.49
839	0.49
840	0.47
841	0.44
842	0.41
843	0.37
844	0.35
845	0.31
846	0.25
847	0.24
848	0.23
849	0.22
850	0.19
851	0.17
852	0.13
853	0.11
854	0.12
855	0.12
856	0.11
857	0.1
858	0.08
859	0.07
860	0.07
861	0.09
862	0.11
863	0.11
864	0.13
865	0.22
866	0.23
867	0.26
868	0.34
869	0.41
870	0.49
871	0.58
872	0.67
873	0.69
874	0.75
875	0.81
876	0.83
877	0.81
878	0.79
879	0.79
880	0.79
881	0.74
882	0.72
883	0.71
884	0.66
885	0.63
886	0.6
887	0.56
888	0.53
889	0.49
890	0.47
891	0.4
892	0.41
893	0.39
894	0.34
895	0.28
896	0.19
897	0.19
898	0.17
899	0.18
900	0.14
901	0.19
902	0.21
903	0.27
904	0.29
905	0.3
906	0.33
907	0.31
908	0.32
909	0.33
910	0.39
911	0.35
912	0.36
913	0.37
914	0.37
915	0.36
916	0.36
917	0.33
918	0.29
919	0.29
920	0.3
921	0.31
922	0.29
923	0.33
924	0.36
925	0.33
926	0.32
927	0.3
928	0.31
929	0.29
930	0.28
931	0.25
932	0.23
933	0.23
934	0.2
935	0.18
936	0.16
937	0.17
938	0.17
939	0.15
940	0.13
941	0.12
942	0.19
943	0.2
944	0.22
945	0.21
946	0.21
947	0.21
948	0.25
949	0.28
950	0.22
951	0.21
952	0.18
953	0.17
954	0.18
955	0.2
956	0.18
957	0.19
958	0.19
959	0.2
960	0.2
961	0.24
962	0.26
963	0.23
964	0.25
965	0.25
966	0.29
967	0.28
968	0.29
969	0.31
970	0.37
971	0.45
972	0.51
973	0.57
974	0.6
975	0.69
976	0.77
977	0.75
978	0.71
979	0.7
980	0.72
981	0.7
982	0.7
983	0.67
984	0.61
985	0.61
986	0.58
987	0.57
988	0.46
989	0.37
990	0.31
991	0.24
992	0.21
993	0.19
994	0.17
995	0.12
996	0.12
997	0.12
998	0.16
999	0.19
1000	0.23
1001	0.26
1002	0.34
1003	0.4
1004	0.45
1005	0.48
1006	0.42
1007	0.4
1008	0.37
1009	0.36
1010	0.27
1011	0.22
1012	0.18
1013	0.14
1014	0.14
1015	0.15
1016	0.15
1017	0.11
1018	0.12
1019	0.11
1020	0.1
1021	0.1
1022	0.09
1023	0.09
1024	0.07
1025	0.07
1026	0.06
1027	0.06
1028	0.11
1029	0.15
1030	0.16
1031	0.16
1032	0.2
1033	0.23
1034	0.24
1035	0.25
1036	0.25
1037	0.25
1038	0.27
1039	0.33
1040	0.35
1041	0.37
1042	0.39
1043	0.39
1044	0.4
1045	0.42
1046	0.43
1047	0.44
1048	0.48
1049	0.54
1050	0.58
1051	0.63
1052	0.66
1053	0.69
1054	0.74
1055	0.74
1056	0.74
1057	0.73
1058	0.68
1059	0.68
1060	0.68
1061	0.7
1062	0.71
1063	0.69
1064	0.69
1065	0.67
1066	0.74
1067	0.78
1068	0.77
1069	0.67
1070	0.64
1071	0.59
1072	0.49
1073	0.47
1074	0.4
1075	0.32
1076	0.29
1077	0.31
1078	0.26
1079	0.26
1080	0.27
1081	0.23
1082	0.21
1083	0.2
1084	0.15
1085	0.14
1086	0.18
1087	0.17
1088	0.16
1089	0.21
1090	0.25
1091	0.27
1092	0.29
1093	0.28
1094	0.26
1095	0.33
1096	0.39
1097	0.37
1098	0.41
1099	0.48
1100	0.54
1101	0.62
1102	0.67
1103	0.71
1104	0.73
1105	0.75
1106	0.74
1107	0.69
1108	0.68
1109	0.67
1110	0.64
1111	0.54
1112	0.52
1113	0.47
1114	0.42
1115	0.39
1116	0.31
1117	0.24
1118	0.26
1119	0.26
1120	0.24
1121	0.26
1122	0.32
1123	0.36
1124	0.36
1125	0.39
1126	0.36
1127	0.34
1128	0.3
1129	0.26
1130	0.18
1131	0.14
1132	0.13
1133	0.11
1134	0.1
1135	0.1
1136	0.1
1137	0.1
1138	0.1
1139	0.1
1140	0.1
1141	0.14
1142	0.18
1143	0.22
1144	0.29
1145	0.36
1146	0.4
1147	0.47
1148	0.51
1149	0.55
1150	0.55
1151	0.59
1152	0.59
1153	0.61
1154	0.6
1155	0.55
1156	0.55
1157	0.47
1158	0.44
1159	0.37

A0A0H2R0L4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer