Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0H2RHM3

Protein Details
Accession A0A0H2RHM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
250-271EPDPRELKRKRGKNSVRREPSVBasic
424-443LVQLQRQPTRPKNPRPSSLQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
247-267KGREPDPRELKRKRGKNSVRR
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12, nucl 10.5, mito 2, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005824  KOW  
IPR041988  KOW_RPL26/RPL24  
IPR005100  NGN-domain  
IPR036735  NGN_dom_sf  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR039659  SPT5  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0032784  P:regulation of DNA-templated transcription elongation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00467  KOW  
PF03439  Spt5-NGN  
CDD cd06089  KOW_RPL26  
Amino Acid Sequences MRNRHAASRFLDLVAGVDDEDDSEEGDELDELDVDEEEDLEEADLRPPAPNAFDDHGGDAAAELDEAFDALLKRSKERGAEDPASIPPIEGRGGYTERDCATSVLRRQVDVPGPEDVPMYSIQVKRGKDQLLAFRLTNKALKTNATDILSILALPKKAPGRIYVEARNGSASVRLLCSGMHFIYPNSIFMVPVSERVALLLSQPTSSRPPSFKRGDLVKIRNGVYRDDLGEVVDVSDGYDTLVVKVKGREPDPRELKRKRGKNSVRREPSVYDKEELRRLHFFNGDFDFIDLGEDAGFNFGGKHYTNDGYLVLKIRRDRVERLGVHRTMVDQLEAQARLSDEDLSRTSNGTLTSHRKMSSHPEARLSLCCSSSDDLPRSLALASSIPPPKFIRPGVRVRITAGASAGAVARVIDVKSSPPYTALVQLQRQPTRPKNPRPSSLQEQNSKMTPPIMMPPIKFDIELAYLTRVYEIGDHVEVKVGEMRGRVGMVTMVTCVEGEVVHVVDSKELLEFQVPASFIDTYEPPFVRRLAPADAPIYHLGSPVKITRGKNAGKTGRVVMIQRERECVTVLEDVTDIEDYLDSWL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.18
3 0.1
4 0.08
5 0.08
6 0.07
7 0.09
8 0.08
9 0.07
10 0.07
11 0.08
12 0.07
13 0.08
14 0.07
15 0.07
16 0.07
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.05
28 0.07
29 0.07
30 0.09
31 0.1
32 0.11
33 0.12
34 0.13
35 0.14
36 0.16
37 0.16
38 0.2
39 0.22
40 0.24
41 0.25
42 0.25
43 0.24
44 0.21
45 0.19
46 0.14
47 0.11
48 0.08
49 0.06
50 0.05
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.04
55 0.05
56 0.06
57 0.08
58 0.13
59 0.14
60 0.18
61 0.22
62 0.26
63 0.3
64 0.34
65 0.39
66 0.43
67 0.46
68 0.44
69 0.43
70 0.4
71 0.37
72 0.32
73 0.25
74 0.17
75 0.15
76 0.14
77 0.12
78 0.11
79 0.14
80 0.16
81 0.18
82 0.18
83 0.2
84 0.2
85 0.22
86 0.21
87 0.18
88 0.2
89 0.26
90 0.3
91 0.35
92 0.35
93 0.34
94 0.34
95 0.4
96 0.42
97 0.37
98 0.34
99 0.28
100 0.28
101 0.27
102 0.26
103 0.2
104 0.15
105 0.13
106 0.13
107 0.16
108 0.17
109 0.23
110 0.29
111 0.3
112 0.32
113 0.38
114 0.37
115 0.37
116 0.4
117 0.42
118 0.42
119 0.43
120 0.4
121 0.38
122 0.37
123 0.35
124 0.34
125 0.26
126 0.26
127 0.25
128 0.27
129 0.27
130 0.29
131 0.31
132 0.28
133 0.27
134 0.23
135 0.22
136 0.19
137 0.15
138 0.14
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.14
143 0.16
144 0.18
145 0.2
146 0.22
147 0.27
148 0.32
149 0.38
150 0.39
151 0.42
152 0.41
153 0.41
154 0.37
155 0.3
156 0.25
157 0.21
158 0.16
159 0.12
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.11
165 0.12
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.16
171 0.16
172 0.15
173 0.14
174 0.14
175 0.13
176 0.12
177 0.16
178 0.11
179 0.13
180 0.14
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.13
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.12
192 0.15
193 0.17
194 0.2
195 0.22
196 0.27
197 0.34
198 0.39
199 0.39
200 0.41
201 0.43
202 0.47
203 0.52
204 0.52
205 0.48
206 0.48
207 0.47
208 0.45
209 0.41
210 0.35
211 0.29
212 0.25
213 0.21
214 0.18
215 0.16
216 0.13
217 0.12
218 0.1
219 0.08
220 0.06
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.09
230 0.1
231 0.11
232 0.13
233 0.17
234 0.2
235 0.23
236 0.3
237 0.3
238 0.4
239 0.48
240 0.53
241 0.59
242 0.6
243 0.68
244 0.69
245 0.72
246 0.69
247 0.72
248 0.75
249 0.75
250 0.81
251 0.82
252 0.8
253 0.75
254 0.71
255 0.63
256 0.61
257 0.57
258 0.48
259 0.39
260 0.35
261 0.35
262 0.38
263 0.36
264 0.31
265 0.29
266 0.28
267 0.29
268 0.29
269 0.26
270 0.23
271 0.24
272 0.22
273 0.18
274 0.17
275 0.14
276 0.11
277 0.1
278 0.07
279 0.05
280 0.04
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.05
289 0.05
290 0.07
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.11
295 0.12
296 0.11
297 0.11
298 0.13
299 0.12
300 0.14
301 0.16
302 0.2
303 0.24
304 0.27
305 0.29
306 0.32
307 0.4
308 0.4
309 0.44
310 0.46
311 0.42
312 0.39
313 0.35
314 0.3
315 0.24
316 0.21
317 0.16
318 0.09
319 0.1
320 0.12
321 0.12
322 0.12
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.08
329 0.1
330 0.11
331 0.12
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.11
336 0.12
337 0.11
338 0.16
339 0.21
340 0.23
341 0.26
342 0.26
343 0.25
344 0.26
345 0.33
346 0.39
347 0.4
348 0.38
349 0.4
350 0.41
351 0.42
352 0.43
353 0.38
354 0.29
355 0.22
356 0.21
357 0.19
358 0.19
359 0.2
360 0.23
361 0.21
362 0.21
363 0.21
364 0.2
365 0.18
366 0.17
367 0.14
368 0.09
369 0.08
370 0.08
371 0.14
372 0.19
373 0.18
374 0.21
375 0.23
376 0.25
377 0.29
378 0.31
379 0.34
380 0.35
381 0.44
382 0.49
383 0.52
384 0.5
385 0.47
386 0.48
387 0.41
388 0.35
389 0.26
390 0.18
391 0.13
392 0.13
393 0.11
394 0.06
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.08
403 0.12
404 0.13
405 0.13
406 0.13
407 0.15
408 0.15
409 0.2
410 0.22
411 0.24
412 0.26
413 0.31
414 0.38
415 0.4
416 0.44
417 0.48
418 0.52
419 0.58
420 0.65
421 0.7
422 0.74
423 0.78
424 0.8
425 0.79
426 0.79
427 0.77
428 0.77
429 0.74
430 0.7
431 0.66
432 0.62
433 0.56
434 0.49
435 0.4
436 0.31
437 0.24
438 0.18
439 0.2
440 0.23
441 0.25
442 0.24
443 0.28
444 0.3
445 0.3
446 0.29
447 0.24
448 0.2
449 0.18
450 0.19
451 0.15
452 0.14
453 0.13
454 0.13
455 0.13
456 0.11
457 0.09
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.12
462 0.12
463 0.12
464 0.15
465 0.15
466 0.15
467 0.18
468 0.15
469 0.16
470 0.16
471 0.17
472 0.15
473 0.15
474 0.14
475 0.1
476 0.1
477 0.09
478 0.09
479 0.08
480 0.08
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.06
485 0.05
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.09
494 0.09
495 0.08
496 0.08
497 0.09
498 0.08
499 0.09
500 0.09
501 0.12
502 0.12
503 0.12
504 0.14
505 0.14
506 0.13
507 0.15
508 0.15
509 0.16
510 0.21
511 0.22
512 0.21
513 0.23
514 0.24
515 0.24
516 0.26
517 0.27
518 0.26
519 0.28
520 0.3
521 0.32
522 0.31
523 0.32
524 0.31
525 0.29
526 0.24
527 0.24
528 0.21
529 0.18
530 0.21
531 0.21
532 0.25
533 0.29
534 0.31
535 0.36
536 0.45
537 0.5
538 0.53
539 0.6
540 0.62
541 0.59
542 0.61
543 0.57
544 0.52
545 0.5
546 0.45
547 0.44
548 0.46
549 0.51
550 0.49
551 0.5
552 0.47
553 0.44
554 0.44
555 0.36
556 0.29
557 0.26
558 0.24
559 0.21
560 0.19
561 0.18
562 0.18
563 0.17
564 0.13
565 0.09
566 0.09