FuNGI

A0A0H2R4Y6

Protein Details

Accession

A0A0H2R4Y6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
272-297	ASRSSDTTTRKRKRANTKRLEPYLLP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
282-286	KRKRA

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5 IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN

Amino Acid Sequences

MADRPVDPRSFLDDIAGVDDGEESQSSSDELDFWDRDNGEAVTETPSSSRTRYREVDNADATSSDFGERAEELAARFRERERLARSRARNVLAVSTQEQPYTAGPSNLSGFHPTDKDAGVFGLFCKKGVEEILVLQFTRKILDVENNEGAYRDIRAVFYIPISPGRIYFEASRALAVETVAATMLDVYYKSIFVVSLEDRVALLAGRSSSRLFEVGERVRIRNGVYEGDIGIVHSIIGAHDEIVVKVKSRNKHHALTVVERTVPDELGNDGASRSSDTTTRKRKRANTKRLEPYLLPRHPHKAELLDGRRVAVNEDGFKFSGEMYTNDGYLLLHYRCDRLKRISGGTCESSSLADAQASEVLDGLSVLSTPSFFNVGDHVLVSKGSGVGSIGTINKLSLDIALIVLDEDGESRAPGLQSVSTEAPLSDLTRLFELGELVEVQSGVHKGRSGQVAEFDVDKQFMRIADLRKNEVIEVSSKDVDTVQSKDAERQVLVRSERRRDVTSLELGCNVVIQKGRHEGKQGTVSCLKRNVVIVSEDVTGCQFIVSREFVKPLSVKQQVPHSLEVWRRDAFKALAISIGMELDLFSVMRDGEEYVSSRINKFPPDYKEPVPHTLMHDRHKRIQNFWNFVKIHGIRTSDMIEVARYKAASGQEPEGQVQKPFEDDVYAFWSFADDVFIDLNNEASRDLRESHGKDLIETPAQEQQRWECCFTELARRLKITIKYVGLPLDYEDVSQTHVCTIEHEREGFEGQEVYIWGGSYKGRFGRVKQMNGTRCKLQLESVVFGVNTIVVDSDRLIAKCGCTLGNGRRRPKWSFDLKSVISLFDRTLKVDDPRARTPELERDTTPEAEFHDPASHGMWLFHPRIAELRKTHAFHVKIDSHPDSEVSGRREGKVLSDPNGPMHPLPMSFSPNVMVRYEIKKKDEVRMELLPVHTLSAAGPKPKRRHAVISGDQIGDVVVYVRSAGDNSAQILEAGSTEITYIAKSEICLLDESGHALHLRSFEVLCSPKLMAERPRVAVRFESPHLHSVVQTRRGKIIHSMAGEMAVSFLRFSNKFEVVIQSIGANGVPEELRILGSRDWVAALDNRTELFIIIDRERHEKLFIRFDEEDLTHGCLRHFEHIQKPFRQGDEMSDDDEVFGG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.23
3	0.21
4	0.14
5	0.12
6	0.12
7	0.1
8	0.1
9	0.09
10	0.07
11	0.07
12	0.08
13	0.08
14	0.08
15	0.08
16	0.08
17	0.11
18	0.16
19	0.16
20	0.17
21	0.23
22	0.22
23	0.22
24	0.24
25	0.22
26	0.18
27	0.18
28	0.17
29	0.16
30	0.16
31	0.16
32	0.14
33	0.16
34	0.18
35	0.21
36	0.28
37	0.29
38	0.37
39	0.41
40	0.47
41	0.53
42	0.56
43	0.61
44	0.56
45	0.53
46	0.46
47	0.41
48	0.35
49	0.28
50	0.22
51	0.15
52	0.11
53	0.1
54	0.11
55	0.11
56	0.11
57	0.11
58	0.12
59	0.12
60	0.2
61	0.22
62	0.22
63	0.24
64	0.25
65	0.33
66	0.35
67	0.43
68	0.44
69	0.51
70	0.57
71	0.65
72	0.7
73	0.7
74	0.74
75	0.68
76	0.64
77	0.56
78	0.53
79	0.46
80	0.43
81	0.36
82	0.34
83	0.32
84	0.28
85	0.27
86	0.22
87	0.21
88	0.23
89	0.23
90	0.19
91	0.19
92	0.21
93	0.23
94	0.23
95	0.23
96	0.21
97	0.21
98	0.23
99	0.24
100	0.23
101	0.23
102	0.22
103	0.21
104	0.18
105	0.17
106	0.14
107	0.13
108	0.12
109	0.19
110	0.18
111	0.17
112	0.18
113	0.17
114	0.19
115	0.2
116	0.21
117	0.13
118	0.17
119	0.21
120	0.21
121	0.21
122	0.2
123	0.2
124	0.18
125	0.18
126	0.15
127	0.12
128	0.13
129	0.22
130	0.25
131	0.3
132	0.34
133	0.33
134	0.32
135	0.31
136	0.3
137	0.22
138	0.19
139	0.15
140	0.12
141	0.12
142	0.14
143	0.15
144	0.15
145	0.15
146	0.16
147	0.15
148	0.17
149	0.19
150	0.18
151	0.18
152	0.22
153	0.21
154	0.22
155	0.22
156	0.22
157	0.24
158	0.24
159	0.23
160	0.19
161	0.18
162	0.16
163	0.14
164	0.11
165	0.07
166	0.07
167	0.07
168	0.06
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.05
173	0.05
174	0.06
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.08
179	0.08
180	0.08
181	0.12
182	0.11
183	0.14
184	0.14
185	0.14
186	0.14
187	0.14
188	0.13
189	0.09
190	0.08
191	0.07
192	0.08
193	0.08
194	0.1
195	0.11
196	0.11
197	0.13
198	0.14
199	0.13
200	0.15
201	0.22
202	0.25
203	0.32
204	0.34
205	0.34
206	0.34
207	0.35
208	0.33
209	0.3
210	0.28
211	0.22
212	0.21
213	0.21
214	0.19
215	0.18
216	0.17
217	0.12
218	0.1
219	0.08
220	0.06
221	0.05
222	0.05
223	0.04
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.07
228	0.08
229	0.08
230	0.12
231	0.12
232	0.12
233	0.18
234	0.23
235	0.3
236	0.37
237	0.47
238	0.5
239	0.54
240	0.56
241	0.58
242	0.57
243	0.56
244	0.54
245	0.46
246	0.41
247	0.36
248	0.34
249	0.28
250	0.23
251	0.16
252	0.11
253	0.1
254	0.1
255	0.11
256	0.09
257	0.08
258	0.08
259	0.09
260	0.09
261	0.1
262	0.09
263	0.14
264	0.2
265	0.3
266	0.4
267	0.49
268	0.56
269	0.63
270	0.71
271	0.79
272	0.84
273	0.85
274	0.85
275	0.86
276	0.88
277	0.85
278	0.8
279	0.71
280	0.69
281	0.68
282	0.62
283	0.56
284	0.49
285	0.52
286	0.49
287	0.49
288	0.42
289	0.35
290	0.35
291	0.42
292	0.42
293	0.4
294	0.38
295	0.37
296	0.36
297	0.32
298	0.28
299	0.22
300	0.2
301	0.18
302	0.2
303	0.21
304	0.2
305	0.2
306	0.19
307	0.15
308	0.16
309	0.13
310	0.12
311	0.15
312	0.15
313	0.15
314	0.15
315	0.15
316	0.12
317	0.11
318	0.15
319	0.1
320	0.12
321	0.13
322	0.16
323	0.2
324	0.24
325	0.29
326	0.3
327	0.37
328	0.39
329	0.44
330	0.46
331	0.46
332	0.46
333	0.44
334	0.38
335	0.33
336	0.28
337	0.22
338	0.18
339	0.15
340	0.1
341	0.08
342	0.07
343	0.07
344	0.08
345	0.08
346	0.07
347	0.06
348	0.06
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.03
353	0.03
354	0.03
355	0.03
356	0.04
357	0.04
358	0.05
359	0.06
360	0.06
361	0.07
362	0.08
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.08
368	0.07
369	0.07
370	0.06
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.03
395	0.03
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.05
401	0.05
402	0.06
403	0.06
404	0.06
405	0.07
406	0.1
407	0.11
408	0.1
409	0.1
410	0.1
411	0.1
412	0.1
413	0.1
414	0.08
415	0.09
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.08
421	0.08
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.04
429	0.05
430	0.06
431	0.06
432	0.07
433	0.07
434	0.08
435	0.11
436	0.15
437	0.15
438	0.15
439	0.17
440	0.17
441	0.18
442	0.18
443	0.15
444	0.12
445	0.12
446	0.11
447	0.09
448	0.09
449	0.08
450	0.1
451	0.13
452	0.16
453	0.22
454	0.24
455	0.27
456	0.27
457	0.27
458	0.24
459	0.21
460	0.18
461	0.14
462	0.14
463	0.14
464	0.14
465	0.13
466	0.13
467	0.13
468	0.14
469	0.14
470	0.13
471	0.12
472	0.15
473	0.16
474	0.18
475	0.2
476	0.2
477	0.18
478	0.18
479	0.19
480	0.21
481	0.23
482	0.27
483	0.3
484	0.34
485	0.38
486	0.39
487	0.39
488	0.35
489	0.35
490	0.32
491	0.33
492	0.3
493	0.26
494	0.23
495	0.21
496	0.19
497	0.17
498	0.13
499	0.08
500	0.09
501	0.09
502	0.11
503	0.18
504	0.2
505	0.21
506	0.25
507	0.24
508	0.25
509	0.33
510	0.32
511	0.28
512	0.33
513	0.34
514	0.32
515	0.35
516	0.31
517	0.24
518	0.25
519	0.21
520	0.16
521	0.16
522	0.14
523	0.12
524	0.13
525	0.11
526	0.1
527	0.09
528	0.08
529	0.07
530	0.06
531	0.05
532	0.04
533	0.06
534	0.08
535	0.09
536	0.1
537	0.11
538	0.11
539	0.13
540	0.14
541	0.13
542	0.2
543	0.23
544	0.24
545	0.25
546	0.31
547	0.35
548	0.37
549	0.37
550	0.3
551	0.3
552	0.32
553	0.33
554	0.3
555	0.25
556	0.24
557	0.23
558	0.24
559	0.19
560	0.18
561	0.16
562	0.13
563	0.12
564	0.1
565	0.1
566	0.08
567	0.07
568	0.04
569	0.03
570	0.03
571	0.03
572	0.03
573	0.03
574	0.03
575	0.03
576	0.03
577	0.03
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.05
582	0.07
583	0.07
584	0.1
585	0.11
586	0.12
587	0.14
588	0.15
589	0.16
590	0.18
591	0.23
592	0.26
593	0.32
594	0.36
595	0.36
596	0.42
597	0.43
598	0.45
599	0.41
600	0.36
601	0.34
602	0.37
603	0.39
604	0.39
605	0.44
606	0.43
607	0.49
608	0.56
609	0.53
610	0.51
611	0.54
612	0.55
613	0.53
614	0.51
615	0.51
616	0.44
617	0.42
618	0.45
619	0.38
620	0.32
621	0.29
622	0.29
623	0.22
624	0.23
625	0.24
626	0.16
627	0.16
628	0.13
629	0.11
630	0.1
631	0.11
632	0.1
633	0.08
634	0.08
635	0.1
636	0.11
637	0.13
638	0.14
639	0.16
640	0.17
641	0.18
642	0.19
643	0.19
644	0.18
645	0.17
646	0.16
647	0.13
648	0.12
649	0.11
650	0.1
651	0.09
652	0.08
653	0.09
654	0.13
655	0.13
656	0.12
657	0.11
658	0.11
659	0.1
660	0.1
661	0.1
662	0.05
663	0.05
664	0.06
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.07
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.07
674	0.08
675	0.09
676	0.11
677	0.18
678	0.19
679	0.22
680	0.26
681	0.25
682	0.24
683	0.25
684	0.25
685	0.2
686	0.18
687	0.17
688	0.19
689	0.19
690	0.19
691	0.18
692	0.21
693	0.27
694	0.29
695	0.29
696	0.24
697	0.25
698	0.26
699	0.27
700	0.32
701	0.31
702	0.34
703	0.34
704	0.34
705	0.35
706	0.38
707	0.41
708	0.35
709	0.32
710	0.29
711	0.28
712	0.29
713	0.28
714	0.22
715	0.19
716	0.16
717	0.13
718	0.11
719	0.1
720	0.09
721	0.08
722	0.1
723	0.1
724	0.1
725	0.08
726	0.09
727	0.09
728	0.11
729	0.15
730	0.17
731	0.19
732	0.19
733	0.19
734	0.19
735	0.2
736	0.17
737	0.14
738	0.09
739	0.07
740	0.08
741	0.08
742	0.07
743	0.06
744	0.06
745	0.05
746	0.06
747	0.07
748	0.07
749	0.1
750	0.11
751	0.17
752	0.19
753	0.22
754	0.32
755	0.38
756	0.43
757	0.46
758	0.53
759	0.55
760	0.59
761	0.6
762	0.52
763	0.47
764	0.45
765	0.38
766	0.32
767	0.3
768	0.27
769	0.25
770	0.23
771	0.21
772	0.19
773	0.18
774	0.16
775	0.1
776	0.07
777	0.05
778	0.05
779	0.04
780	0.04
781	0.05
782	0.07
783	0.09
784	0.09
785	0.11
786	0.12
787	0.12
788	0.13
789	0.14
790	0.12
791	0.11
792	0.17
793	0.24
794	0.33
795	0.4
796	0.45
797	0.51
798	0.56
799	0.58
800	0.6
801	0.59
802	0.61
803	0.58
804	0.58
805	0.59
806	0.54
807	0.55
808	0.49
809	0.41
810	0.31
811	0.27
812	0.22
813	0.21
814	0.21
815	0.17
816	0.18
817	0.2
818	0.21
819	0.29
820	0.34
821	0.34
822	0.4
823	0.42
824	0.42
825	0.41
826	0.42
827	0.44
828	0.42
829	0.39
830	0.34
831	0.35
832	0.37
833	0.37
834	0.34
835	0.25
836	0.24
837	0.24
838	0.23
839	0.2
840	0.18
841	0.17
842	0.17
843	0.18
844	0.15
845	0.12
846	0.12
847	0.14
848	0.16
849	0.17
850	0.18
851	0.17
852	0.16
853	0.22
854	0.25
855	0.29
856	0.26
857	0.32
858	0.38
859	0.39
860	0.42
861	0.44
862	0.43
863	0.39
864	0.45
865	0.42
866	0.38
867	0.43
868	0.42
869	0.35
870	0.34
871	0.32
872	0.25
873	0.24
874	0.27
875	0.23
876	0.28
877	0.28
878	0.28
879	0.3
880	0.29
881	0.29
882	0.32
883	0.32
884	0.28
885	0.32
886	0.32
887	0.32
888	0.34
889	0.31
890	0.23
891	0.21
892	0.19
893	0.14
894	0.16
895	0.16
896	0.19
897	0.18
898	0.19
899	0.19
900	0.21
901	0.23
902	0.2
903	0.2
904	0.2
905	0.27
906	0.36
907	0.39
908	0.39
909	0.45
910	0.48
911	0.54
912	0.58
913	0.54
914	0.51
915	0.49
916	0.48
917	0.44
918	0.41
919	0.35
920	0.26
921	0.23
922	0.17
923	0.14
924	0.11
925	0.15
926	0.17
927	0.22
928	0.28
929	0.36
930	0.43
931	0.52
932	0.58
933	0.56
934	0.62
935	0.63
936	0.68
937	0.67
938	0.69
939	0.64
940	0.58
941	0.52
942	0.44
943	0.35
944	0.24
945	0.17
946	0.09
947	0.04
948	0.04
949	0.04
950	0.05
951	0.05
952	0.06
953	0.07
954	0.08
955	0.09
956	0.11
957	0.11
958	0.11
959	0.11
960	0.11
961	0.1
962	0.08
963	0.08
964	0.06
965	0.05
966	0.05
967	0.06
968	0.06
969	0.06
970	0.07
971	0.07
972	0.08
973	0.08
974	0.12
975	0.13
976	0.14
977	0.15
978	0.15
979	0.15
980	0.15
981	0.17
982	0.13
983	0.12
984	0.12
985	0.11
986	0.12
987	0.12
988	0.13
989	0.12
990	0.12
991	0.12
992	0.18
993	0.2
994	0.19
995	0.2
996	0.19
997	0.2
998	0.23
999	0.28
1000	0.29
1001	0.36
1002	0.4
1003	0.43
1004	0.49
1005	0.48
1006	0.48
1007	0.46
1008	0.44
1009	0.41
1010	0.39
1011	0.41
1012	0.37
1013	0.39
1014	0.39
1015	0.36
1016	0.32
1017	0.35
1018	0.4
1019	0.44
1020	0.46
1021	0.45
1022	0.48
1023	0.48
1024	0.48
1025	0.47
1026	0.46
1027	0.42
1028	0.38
1029	0.37
1030	0.32
1031	0.32
1032	0.3
1033	0.22
1034	0.15
1035	0.1
1036	0.08
1037	0.07
1038	0.08
1039	0.13
1040	0.14
1041	0.18
1042	0.23
1043	0.25
1044	0.26
1045	0.27
1046	0.31
1047	0.28
1048	0.28
1049	0.25
1050	0.19
1051	0.17
1052	0.16
1053	0.14
1054	0.09
1055	0.07
1056	0.08
1057	0.08
1058	0.07
1059	0.08
1060	0.08
1061	0.1
1062	0.1
1063	0.14
1064	0.12
1065	0.16
1066	0.17
1067	0.16
1068	0.16
1069	0.15
1070	0.16
1071	0.18
1072	0.2
1073	0.19
1074	0.2
1075	0.19
1076	0.19
1077	0.19
1078	0.17
1079	0.14
1080	0.15
1081	0.17
1082	0.18
1083	0.22
1084	0.24
1085	0.29
1086	0.32
1087	0.31
1088	0.33
1089	0.35
1090	0.39
1091	0.45
1092	0.44
1093	0.46
1094	0.45
1095	0.45
1096	0.46
1097	0.39
1098	0.35
1099	0.28
1100	0.31
1101	0.25
1102	0.25
1103	0.24
1104	0.22
1105	0.25
1106	0.29
1107	0.33
1108	0.35
1109	0.42
1110	0.51
1111	0.59
1112	0.61
1113	0.65
1114	0.64
1115	0.6
1116	0.58
1117	0.49
1118	0.47
1119	0.46
1120	0.42
1121	0.37
1122	0.33
1123	0.31

A0A0H2R4Y6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer