Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0W4ZHN0

Protein Details
Accession A0A0W4ZHN0    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-50RIERNDRNERRSDRDRPRRDVPSDREBasic
70-99DREHGHRRSREEDERRRRRRDEEYAQNERNBasic
130-151REDWYRRSRSPRYRGREPTPDLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-43RRGERSERERERIERNDRNERRSDRDRPRR
62-89RHERANDRDREHGHRRSREEDERRRRRR
120-140DRINRDRRSGREDWYRRSRSP
Subcellular Location(s) nucl 27
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR006529  U2AF_lg  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12230  RRM1_U2AF65  
cd12231  RRM2_U2AF65  
cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MRRSEIVNGVGRDRRGERSERERERIERNDRNERRSDRDRPRRDVPSDREDRHYYHSERPLRHERANDRDREHGHRRSREEDERRRRRRDEEYAQNERNHDMVHSLGSGRPERERDERPDRINRDRRSGREDWYRRSRSPRYRGREPTPDLTDIVPINERRRRMSMWDVKPTGYEAITAEQAKMSGLFPLPGAPRQSMMDLSKLSTVHKGPGAMNIPNPQALQPLQSRQSRRIHVGNIPQPIDEEHLVNFFNDTMSCLNVTTSGDNPVISAQVNHEKGYAFLEFRQPEDATVAIGFDGISYMNNSLKIRRPMDYIVPQMPTDDGSYVPGVISTNFTDTPNKIHIGGLPTYLDDEQVIELLKSFGELKAFNLIKDAATNESKGFAFCEYVDPDVTDIACEGLNGMELGDKILVVKRASIGTKQKPISTSGGGIASITMLAEEEGQLRPTRVLQMFNMVTPEELQDDDEYEEISEDIRDECSKYGKVLDLKIPRGIGGSRSNFGVGKVYVRFETEMSCLKAMKDLAGRKFSDRTVLTSFYPEENYEVGAW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.41
3 0.46
4 0.49
5 0.55
6 0.65
7 0.68
8 0.72
9 0.72
10 0.72
11 0.75
12 0.76
13 0.76
14 0.74
15 0.74
16 0.78
17 0.78
18 0.79
19 0.79
20 0.75
21 0.74
22 0.74
23 0.76
24 0.76
25 0.8
26 0.83
27 0.81
28 0.84
29 0.84
30 0.82
31 0.82
32 0.78
33 0.78
34 0.78
35 0.74
36 0.72
37 0.66
38 0.62
39 0.59
40 0.6
41 0.54
42 0.53
43 0.59
44 0.6
45 0.6
46 0.65
47 0.68
48 0.67
49 0.68
50 0.68
51 0.67
52 0.69
53 0.74
54 0.72
55 0.65
56 0.67
57 0.66
58 0.66
59 0.66
60 0.65
61 0.67
62 0.68
63 0.7
64 0.69
65 0.72
66 0.74
67 0.76
68 0.78
69 0.79
70 0.82
71 0.86
72 0.88
73 0.85
74 0.82
75 0.81
76 0.8
77 0.79
78 0.79
79 0.79
80 0.8
81 0.8
82 0.75
83 0.67
84 0.58
85 0.48
86 0.38
87 0.28
88 0.2
89 0.15
90 0.13
91 0.12
92 0.12
93 0.13
94 0.17
95 0.19
96 0.2
97 0.23
98 0.25
99 0.29
100 0.35
101 0.4
102 0.45
103 0.51
104 0.56
105 0.6
106 0.66
107 0.68
108 0.72
109 0.75
110 0.71
111 0.72
112 0.72
113 0.7
114 0.68
115 0.65
116 0.62
117 0.63
118 0.65
119 0.64
120 0.68
121 0.69
122 0.65
123 0.71
124 0.74
125 0.73
126 0.77
127 0.78
128 0.76
129 0.8
130 0.84
131 0.82
132 0.82
133 0.77
134 0.74
135 0.68
136 0.61
137 0.52
138 0.44
139 0.38
140 0.29
141 0.24
142 0.21
143 0.19
144 0.26
145 0.28
146 0.3
147 0.31
148 0.35
149 0.35
150 0.37
151 0.45
152 0.47
153 0.51
154 0.58
155 0.56
156 0.52
157 0.5
158 0.46
159 0.37
160 0.26
161 0.2
162 0.11
163 0.11
164 0.14
165 0.14
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.11
177 0.12
178 0.14
179 0.16
180 0.15
181 0.16
182 0.17
183 0.18
184 0.17
185 0.17
186 0.17
187 0.15
188 0.16
189 0.17
190 0.16
191 0.16
192 0.17
193 0.17
194 0.16
195 0.17
196 0.18
197 0.16
198 0.21
199 0.23
200 0.2
201 0.21
202 0.22
203 0.22
204 0.21
205 0.21
206 0.15
207 0.15
208 0.14
209 0.15
210 0.15
211 0.18
212 0.23
213 0.28
214 0.3
215 0.35
216 0.42
217 0.41
218 0.44
219 0.43
220 0.41
221 0.41
222 0.47
223 0.45
224 0.42
225 0.4
226 0.35
227 0.31
228 0.28
229 0.26
230 0.18
231 0.13
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.07
238 0.06
239 0.05
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.13
260 0.14
261 0.15
262 0.15
263 0.14
264 0.15
265 0.16
266 0.15
267 0.09
268 0.09
269 0.15
270 0.15
271 0.16
272 0.18
273 0.16
274 0.15
275 0.16
276 0.15
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.04
288 0.05
289 0.06
290 0.08
291 0.09
292 0.12
293 0.18
294 0.24
295 0.25
296 0.26
297 0.28
298 0.28
299 0.34
300 0.36
301 0.34
302 0.3
303 0.29
304 0.28
305 0.25
306 0.23
307 0.18
308 0.14
309 0.1
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.08
319 0.07
320 0.09
321 0.1
322 0.11
323 0.13
324 0.14
325 0.17
326 0.18
327 0.18
328 0.16
329 0.16
330 0.17
331 0.18
332 0.19
333 0.16
334 0.14
335 0.13
336 0.14
337 0.13
338 0.11
339 0.07
340 0.07
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.06
350 0.06
351 0.08
352 0.08
353 0.09
354 0.17
355 0.18
356 0.17
357 0.18
358 0.18
359 0.16
360 0.17
361 0.17
362 0.13
363 0.14
364 0.15
365 0.13
366 0.15
367 0.15
368 0.14
369 0.14
370 0.11
371 0.1
372 0.1
373 0.14
374 0.13
375 0.14
376 0.14
377 0.13
378 0.13
379 0.13
380 0.12
381 0.08
382 0.07
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.04
388 0.05
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.06
395 0.05
396 0.06
397 0.09
398 0.12
399 0.11
400 0.12
401 0.13
402 0.16
403 0.18
404 0.24
405 0.32
406 0.36
407 0.44
408 0.45
409 0.47
410 0.45
411 0.47
412 0.45
413 0.38
414 0.32
415 0.25
416 0.24
417 0.21
418 0.19
419 0.15
420 0.11
421 0.08
422 0.06
423 0.04
424 0.03
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.06
429 0.07
430 0.09
431 0.1
432 0.11
433 0.12
434 0.13
435 0.2
436 0.2
437 0.23
438 0.22
439 0.29
440 0.29
441 0.29
442 0.29
443 0.22
444 0.2
445 0.18
446 0.18
447 0.11
448 0.11
449 0.11
450 0.1
451 0.12
452 0.12
453 0.11
454 0.11
455 0.09
456 0.09
457 0.08
458 0.08
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.09
463 0.1
464 0.11
465 0.14
466 0.18
467 0.19
468 0.2
469 0.22
470 0.26
471 0.3
472 0.33
473 0.4
474 0.43
475 0.45
476 0.47
477 0.44
478 0.38
479 0.36
480 0.32
481 0.29
482 0.3
483 0.31
484 0.29
485 0.3
486 0.32
487 0.29
488 0.29
489 0.28
490 0.2
491 0.21
492 0.22
493 0.24
494 0.23
495 0.25
496 0.26
497 0.21
498 0.23
499 0.22
500 0.26
501 0.26
502 0.27
503 0.25
504 0.24
505 0.29
506 0.27
507 0.28
508 0.3
509 0.34
510 0.4
511 0.46
512 0.48
513 0.47
514 0.51
515 0.46
516 0.47
517 0.41
518 0.39
519 0.38
520 0.39
521 0.36
522 0.36
523 0.38
524 0.32
525 0.33
526 0.28
527 0.26
528 0.23