Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0W4ZMB5

Protein Details
Accession A0A0W4ZMB5    Localization Confidence High Confidence Score 23.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-118LEEAKTEKVKKKQLRPFLIIHydrophilic
533-554RWLNGRKISSKKNENVKKRLIVHydrophilic
560-633NINVVNRRKERENKSRKKIQLKIEDKMVQTTEKKRKRNDDSDPNEINDKKRKRLSYIISRKKTEKKSTTGKTVTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-111AKPRHRSDKKTLEEAKTEKVKKKQ
475-501KEKKRAPLTREENLRDGNPKKGKKGIV
566-581RRKERENKSRKKIQLK
592-596KKRKR
608-625KKRKRLSYIISRKKTEKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034805  Nop4_RRM1  
IPR034806  Nop4_RRM2  
IPR034809  Nop4_RRM4  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12674  RRM1_Nop4p  
cd12675  RRM2_Nop4p  
cd12676  RRM3_Nop4p  
cd12677  RRM4_Nop4p  
Amino Acid Sequences MTQDGNENVHNTSIFVRRIPLDVSLPSFTSFFEEIGRVKHAMIVTDPETKKSKGYGFVSFSTHSDAEKAICELKKRTLSGHFLKAEFAKPRHRSDKKTLEEAKTEKVKKKQLRPFLIIRNLPWSVRKKDHAFFLEFGKYGKVVNVIIPRKKGGKMSGFAFVHMKQMSAAEEAIKCINGVELEGRHVAVDWALSQSEWKDFLEKEEKSAKDIDTDDSVSSFMETKDIISNNTELVNKSDSSEKGSVIKEDQKPPTALYDSNERTLFVKNLSFQTTDNELFSHFCQFGRLKYARVVMDAFTGRSKGTAFVCFHHKMDMENCLNVYRDLTQQSALSVNKKSTVLQNQILDDNIEKFTLDGHLVSVFPALNKEDISVIEDNNRKERKHIVEKNLDKRNIFLLNEGYIDPKSSLFNLLNETERDMRNQSLTQRKKLLEKNPSLYISLTRLAVRNIPKDISDKDLKALARKACVDFAKEVKEKKRAPLTREENLRDGNPKKGKKGIVRQAKILQEKNGQARGCGFIEYVGHRWALMGLRWLNGRKISSKKNENVKKRLIVEFALENINVVNRRKERENKSRKKIQLKIEDKMVQTTEKKRKRNDDSDPNEINDKKRKRLSYIISRKKTEKKSTTGKTVT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.26
4 0.26
5 0.28
6 0.29
7 0.28
8 0.25
9 0.26
10 0.29
11 0.27
12 0.27
13 0.26
14 0.24
15 0.21
16 0.23
17 0.2
18 0.17
19 0.17
20 0.18
21 0.18
22 0.21
23 0.24
24 0.2
25 0.19
26 0.22
27 0.21
28 0.2
29 0.2
30 0.22
31 0.22
32 0.31
33 0.32
34 0.33
35 0.37
36 0.36
37 0.37
38 0.37
39 0.38
40 0.37
41 0.41
42 0.44
43 0.44
44 0.46
45 0.48
46 0.44
47 0.4
48 0.37
49 0.33
50 0.26
51 0.22
52 0.21
53 0.18
54 0.18
55 0.19
56 0.2
57 0.22
58 0.26
59 0.29
60 0.36
61 0.42
62 0.41
63 0.44
64 0.45
65 0.52
66 0.54
67 0.59
68 0.54
69 0.48
70 0.5
71 0.48
72 0.46
73 0.46
74 0.43
75 0.45
76 0.47
77 0.55
78 0.63
79 0.68
80 0.7
81 0.72
82 0.79
83 0.75
84 0.79
85 0.78
86 0.72
87 0.72
88 0.68
89 0.66
90 0.65
91 0.65
92 0.63
93 0.63
94 0.68
95 0.7
96 0.77
97 0.78
98 0.79
99 0.8
100 0.79
101 0.79
102 0.78
103 0.78
104 0.7
105 0.62
106 0.58
107 0.51
108 0.46
109 0.45
110 0.43
111 0.41
112 0.45
113 0.51
114 0.51
115 0.53
116 0.6
117 0.58
118 0.54
119 0.48
120 0.47
121 0.43
122 0.37
123 0.33
124 0.26
125 0.21
126 0.18
127 0.17
128 0.14
129 0.11
130 0.16
131 0.24
132 0.3
133 0.34
134 0.36
135 0.38
136 0.4
137 0.42
138 0.41
139 0.4
140 0.39
141 0.39
142 0.39
143 0.45
144 0.41
145 0.4
146 0.39
147 0.32
148 0.3
149 0.26
150 0.24
151 0.15
152 0.16
153 0.16
154 0.14
155 0.14
156 0.11
157 0.12
158 0.13
159 0.13
160 0.12
161 0.1
162 0.09
163 0.1
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.07
175 0.07
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.12
186 0.12
187 0.18
188 0.25
189 0.24
190 0.27
191 0.34
192 0.34
193 0.33
194 0.36
195 0.3
196 0.26
197 0.27
198 0.24
199 0.19
200 0.2
201 0.18
202 0.15
203 0.15
204 0.12
205 0.11
206 0.1
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.11
212 0.12
213 0.12
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.15
218 0.15
219 0.12
220 0.14
221 0.15
222 0.14
223 0.14
224 0.18
225 0.16
226 0.21
227 0.21
228 0.2
229 0.22
230 0.22
231 0.22
232 0.22
233 0.29
234 0.29
235 0.35
236 0.37
237 0.36
238 0.36
239 0.35
240 0.35
241 0.29
242 0.25
243 0.2
244 0.26
245 0.25
246 0.27
247 0.26
248 0.23
249 0.23
250 0.24
251 0.23
252 0.15
253 0.15
254 0.14
255 0.16
256 0.18
257 0.18
258 0.16
259 0.19
260 0.21
261 0.2
262 0.18
263 0.16
264 0.14
265 0.15
266 0.15
267 0.14
268 0.11
269 0.1
270 0.13
271 0.14
272 0.14
273 0.21
274 0.21
275 0.2
276 0.22
277 0.26
278 0.23
279 0.23
280 0.23
281 0.16
282 0.18
283 0.17
284 0.15
285 0.11
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.14
293 0.15
294 0.16
295 0.23
296 0.24
297 0.24
298 0.24
299 0.23
300 0.19
301 0.19
302 0.24
303 0.19
304 0.17
305 0.18
306 0.16
307 0.17
308 0.15
309 0.15
310 0.09
311 0.1
312 0.11
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.12
317 0.14
318 0.14
319 0.14
320 0.14
321 0.14
322 0.15
323 0.16
324 0.16
325 0.19
326 0.24
327 0.26
328 0.29
329 0.3
330 0.29
331 0.29
332 0.28
333 0.23
334 0.17
335 0.14
336 0.1
337 0.08
338 0.07
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.05
344 0.05
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.11
359 0.1
360 0.1
361 0.16
362 0.19
363 0.2
364 0.28
365 0.31
366 0.28
367 0.3
368 0.37
369 0.4
370 0.47
371 0.54
372 0.54
373 0.62
374 0.7
375 0.77
376 0.78
377 0.72
378 0.61
379 0.54
380 0.49
381 0.42
382 0.34
383 0.27
384 0.2
385 0.18
386 0.19
387 0.18
388 0.15
389 0.12
390 0.12
391 0.11
392 0.1
393 0.1
394 0.09
395 0.12
396 0.12
397 0.13
398 0.15
399 0.16
400 0.18
401 0.17
402 0.2
403 0.2
404 0.19
405 0.2
406 0.19
407 0.19
408 0.2
409 0.22
410 0.26
411 0.33
412 0.39
413 0.42
414 0.46
415 0.48
416 0.53
417 0.58
418 0.6
419 0.59
420 0.61
421 0.6
422 0.59
423 0.58
424 0.51
425 0.44
426 0.37
427 0.3
428 0.24
429 0.21
430 0.17
431 0.16
432 0.16
433 0.21
434 0.24
435 0.25
436 0.26
437 0.26
438 0.26
439 0.28
440 0.29
441 0.3
442 0.3
443 0.27
444 0.26
445 0.3
446 0.29
447 0.3
448 0.35
449 0.31
450 0.3
451 0.33
452 0.32
453 0.33
454 0.34
455 0.32
456 0.29
457 0.31
458 0.35
459 0.36
460 0.41
461 0.42
462 0.5
463 0.5
464 0.54
465 0.61
466 0.59
467 0.6
468 0.65
469 0.65
470 0.64
471 0.7
472 0.65
473 0.59
474 0.55
475 0.53
476 0.5
477 0.45
478 0.47
479 0.47
480 0.48
481 0.48
482 0.53
483 0.58
484 0.59
485 0.67
486 0.68
487 0.7
488 0.68
489 0.7
490 0.7
491 0.7
492 0.68
493 0.61
494 0.57
495 0.52
496 0.55
497 0.56
498 0.55
499 0.47
500 0.41
501 0.39
502 0.37
503 0.32
504 0.26
505 0.2
506 0.15
507 0.17
508 0.19
509 0.2
510 0.17
511 0.16
512 0.15
513 0.15
514 0.16
515 0.16
516 0.14
517 0.18
518 0.18
519 0.2
520 0.24
521 0.26
522 0.28
523 0.3
524 0.32
525 0.32
526 0.39
527 0.46
528 0.52
529 0.6
530 0.65
531 0.72
532 0.79
533 0.82
534 0.83
535 0.81
536 0.79
537 0.74
538 0.71
539 0.63
540 0.55
541 0.48
542 0.41
543 0.35
544 0.3
545 0.24
546 0.19
547 0.16
548 0.19
549 0.19
550 0.2
551 0.26
552 0.29
553 0.35
554 0.44
555 0.54
556 0.6
557 0.67
558 0.76
559 0.79
560 0.84
561 0.89
562 0.9
563 0.9
564 0.88
565 0.87
566 0.87
567 0.83
568 0.78
569 0.77
570 0.74
571 0.64
572 0.61
573 0.53
574 0.48
575 0.48
576 0.53
577 0.54
578 0.58
579 0.65
580 0.7
581 0.78
582 0.82
583 0.85
584 0.86
585 0.86
586 0.84
587 0.86
588 0.8
589 0.72
590 0.7
591 0.63
592 0.6
593 0.59
594 0.59
595 0.59
596 0.64
597 0.66
598 0.66
599 0.73
600 0.75
601 0.76
602 0.8
603 0.82
604 0.82
605 0.82
606 0.84
607 0.84
608 0.84
609 0.84
610 0.81
611 0.79
612 0.81
613 0.83