FuNGI

A0A0C3CHC2

Protein Details

Accession

A0A0C3CHC2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
365-384	LPDAPPPKPRQRRSPIGAPL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 9, plas 6, cyto 5, pero 5, cyto_pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024337 tRNA_splic_suSen54 IPR024336 tRNA_splic_suSen54_N
Gene Ontology	GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF12928 tRNA_int_end_N2

Amino Acid Sequences

MDDSLEIPTAHAPTTPLGDIPPEDDDERSSDEEDGGLDWTKLLPPSARPVIPRRGEKEFEPRAGGGTNLQLHVLDRSRSAMFETLRATRTISSKAISYATWHPDLARTHVTLARGIHFSTMGHSAPRPTTGGTGEEGLAKIQKRLELLPEEAIYLIERGSLFCWKQTDLELGQVPGLSDVGGSPITVQQAFSEMLGKGDLTMEKFQVYAYLKRLGYAVTRSDPPDPYYPIPPGLADVKPGFSFLQCLKSIFPLWTSFISRFIGGGFSWWHPVQISRWLHHDKNYGYLFRSLRFMPAGHAIPWKTSEATLKAKASSPYRIFFNIYKPSTSFKKSAPPPPDSHLVVINGRTTPMPTLQELTDLFEVLPDAPPPKPRQRRSPIGAPLPAAAPPPPPPIIPTVEPSFIRKLFPWAFPPIPPAPMARKPNPFVALKSGKKIIVIAVVDAGNISFFRFGQGEFTEWPMV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.17
3	0.15
4	0.15
5	0.17
6	0.16
7	0.18
8	0.19
9	0.18
10	0.19
11	0.19
12	0.2
13	0.21
14	0.24
15	0.23
16	0.22
17	0.19
18	0.18
19	0.18
20	0.16
21	0.14
22	0.12
23	0.11
24	0.1
25	0.09
26	0.1
27	0.12
28	0.12
29	0.14
30	0.14
31	0.16
32	0.25
33	0.31
34	0.33
35	0.36
36	0.43
37	0.51
38	0.56
39	0.61
40	0.59
41	0.6
42	0.6
43	0.59
44	0.63
45	0.6
46	0.55
47	0.51
48	0.45
49	0.4
50	0.37
51	0.33
52	0.24
53	0.23
54	0.22
55	0.18
56	0.18
57	0.17
58	0.17
59	0.21
60	0.22
61	0.17
62	0.16
63	0.19
64	0.19
65	0.19
66	0.21
67	0.22
68	0.19
69	0.22
70	0.24
71	0.25
72	0.26
73	0.26
74	0.26
75	0.23
76	0.26
77	0.26
78	0.25
79	0.22
80	0.22
81	0.23
82	0.23
83	0.2
84	0.21
85	0.23
86	0.26
87	0.26
88	0.25
89	0.24
90	0.28
91	0.29
92	0.3
93	0.27
94	0.23
95	0.24
96	0.27
97	0.27
98	0.25
99	0.24
100	0.23
101	0.2
102	0.2
103	0.17
104	0.15
105	0.14
106	0.14
107	0.15
108	0.13
109	0.13
110	0.13
111	0.15
112	0.16
113	0.18
114	0.17
115	0.14
116	0.16
117	0.16
118	0.17
119	0.15
120	0.15
121	0.14
122	0.14
123	0.13
124	0.11
125	0.13
126	0.12
127	0.13
128	0.13
129	0.15
130	0.15
131	0.16
132	0.2
133	0.2
134	0.22
135	0.22
136	0.21
137	0.2
138	0.18
139	0.17
140	0.13
141	0.09
142	0.07
143	0.06
144	0.06
145	0.06
146	0.07
147	0.11
148	0.11
149	0.13
150	0.15
151	0.15
152	0.16
153	0.17
154	0.2
155	0.16
156	0.19
157	0.18
158	0.16
159	0.16
160	0.15
161	0.13
162	0.09
163	0.09
164	0.05
165	0.04
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.05
171	0.06
172	0.07
173	0.07
174	0.07
175	0.06
176	0.08
177	0.09
178	0.08
179	0.09
180	0.08
181	0.09
182	0.09
183	0.08
184	0.06
185	0.07
186	0.08
187	0.08
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.09
192	0.09
193	0.13
194	0.14
195	0.15
196	0.17
197	0.23
198	0.22
199	0.23
200	0.23
201	0.19
202	0.18
203	0.18
204	0.17
205	0.14
206	0.15
207	0.17
208	0.19
209	0.19
210	0.2
211	0.21
212	0.22
213	0.21
214	0.22
215	0.21
216	0.2
217	0.19
218	0.16
219	0.14
220	0.14
221	0.12
222	0.12
223	0.12
224	0.12
225	0.11
226	0.13
227	0.11
228	0.08
229	0.11
230	0.1
231	0.15
232	0.14
233	0.15
234	0.14
235	0.16
236	0.17
237	0.15
238	0.15
239	0.11
240	0.13
241	0.14
242	0.15
243	0.14
244	0.15
245	0.16
246	0.14
247	0.13
248	0.11
249	0.11
250	0.08
251	0.09
252	0.09
253	0.08
254	0.12
255	0.12
256	0.12
257	0.11
258	0.12
259	0.13
260	0.2
261	0.22
262	0.2
263	0.27
264	0.32
265	0.33
266	0.37
267	0.41
268	0.32
269	0.37
270	0.39
271	0.34
272	0.3
273	0.35
274	0.31
275	0.26
276	0.28
277	0.21
278	0.2
279	0.2
280	0.18
281	0.15
282	0.18
283	0.19
284	0.17
285	0.21
286	0.19
287	0.19
288	0.2
289	0.2
290	0.16
291	0.15
292	0.17
293	0.19
294	0.24
295	0.27
296	0.27
297	0.27
298	0.29
299	0.32
300	0.32
301	0.36
302	0.34
303	0.32
304	0.33
305	0.34
306	0.34
307	0.32
308	0.36
309	0.37
310	0.35
311	0.34
312	0.33
313	0.36
314	0.38
315	0.4
316	0.35
317	0.29
318	0.37
319	0.42
320	0.5
321	0.52
322	0.52
323	0.51
324	0.53
325	0.56
326	0.48
327	0.43
328	0.37
329	0.33
330	0.29
331	0.27
332	0.24
333	0.18
334	0.17
335	0.16
336	0.14
337	0.13
338	0.15
339	0.16
340	0.15
341	0.17
342	0.17
343	0.2
344	0.19
345	0.21
346	0.18
347	0.16
348	0.15
349	0.12
350	0.13
351	0.1
352	0.11
353	0.08
354	0.1
355	0.12
356	0.18
357	0.25
358	0.35
359	0.45
360	0.51
361	0.61
362	0.68
363	0.76
364	0.78
365	0.81
366	0.79
367	0.76
368	0.72
369	0.62
370	0.54
371	0.45
372	0.38
373	0.29
374	0.21
375	0.16
376	0.17
377	0.2
378	0.21
379	0.2
380	0.21
381	0.24
382	0.28
383	0.28
384	0.29
385	0.28
386	0.31
387	0.32
388	0.35
389	0.37
390	0.33
391	0.33
392	0.29
393	0.34
394	0.34
395	0.37
396	0.38
397	0.39
398	0.4
399	0.39
400	0.44
401	0.38
402	0.35
403	0.32
404	0.32
405	0.32
406	0.39
407	0.46
408	0.48
409	0.54
410	0.55
411	0.61
412	0.62
413	0.57
414	0.51
415	0.53
416	0.55
417	0.51
418	0.53
419	0.51
420	0.46
421	0.44
422	0.42
423	0.34
424	0.31
425	0.27
426	0.22
427	0.21
428	0.2
429	0.19
430	0.18
431	0.15
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.07
436	0.07
437	0.1
438	0.11
439	0.11
440	0.16
441	0.18
442	0.21
443	0.21

A0A0C3CHC2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer