Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2XDS9

Protein Details
Accession A0A0C2XDS9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-92DECKTNTKRKRDAEESVKSKKKBasic
593-621IVRQAEGGLKKKKKKGKSKKAVPSYWYIDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
78-98KRKRDAEESVKSKKKGAIRKG
601-612LKKKKKKGKSKK
Subcellular Location(s) cyto 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018606  Arb1  
Gene Ontology GO:0033167  C:ARC complex  
GO:0031047  P:RNA-mediated gene silencing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09692  Arb1  
Amino Acid Sequences MTATTANLVNPVDGPFIRFPPFPIAPAGVRIMPFKEFTEHGIRIEAGADDAEVDALGIPTIVIGRKGHATDECKTNTKRKRDAEESVKSKKKGAIRKGWAESWKESELLRFSTSVNPNSTPFEKLQAAAADFTSGRPWPTNFARETGPRFIWDKFQRYIGIPESASAPVKNTRTPENVDGGADGNISDDEGTEENAENEGDAETSNIMTGIIKSADLPATLARQKQEIDNEEKMHTFFGNPEKSIRVFMSSYSRTMGYIWSDVNLECMPRLLTFFVEFILHNKVLPTYERDLRSALKVITIAQKELPNMSALAKATPDQLSVSFLNCWGKKADTYSVNIPMPSVDEPVVTDASIKDLSAETEEHTAQPDATGWGNPSTGNESSGWGASETPNTWGATAEDATEGSSWGELVPESVDPAEGGADDLASWFGTTPPETLLTLLGPTALPLTHTTGIVERSMRIIKKIEPPQINPPKSSPQGEGICEPDYEAVEADLDRLFTKVIMSPKIDWDGGDSPVYSRPAILKTSQGLVVDPANPPPESAAGDGSAAVAPAEGTAKPYDPLHDDITLLVLATPEKVELLSVGMGLGGTWVQIVRQAEGGLKKKKKKGKSKKAVPSYWYIDELPIIIPSFWTVPGVPVPVSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.23
4 0.26
5 0.25
6 0.26
7 0.31
8 0.33
9 0.3
10 0.3
11 0.3
12 0.28
13 0.31
14 0.31
15 0.24
16 0.24
17 0.25
18 0.23
19 0.22
20 0.23
21 0.21
22 0.22
23 0.21
24 0.25
25 0.32
26 0.31
27 0.3
28 0.3
29 0.29
30 0.25
31 0.25
32 0.2
33 0.12
34 0.11
35 0.09
36 0.07
37 0.07
38 0.06
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.04
44 0.04
45 0.04
46 0.04
47 0.06
48 0.06
49 0.09
50 0.09
51 0.11
52 0.16
53 0.17
54 0.2
55 0.25
56 0.29
57 0.31
58 0.39
59 0.41
60 0.45
61 0.49
62 0.56
63 0.59
64 0.64
65 0.69
66 0.7
67 0.75
68 0.75
69 0.8
70 0.8
71 0.81
72 0.8
73 0.8
74 0.79
75 0.71
76 0.67
77 0.63
78 0.61
79 0.61
80 0.63
81 0.63
82 0.65
83 0.73
84 0.74
85 0.74
86 0.72
87 0.68
88 0.61
89 0.56
90 0.48
91 0.4
92 0.35
93 0.33
94 0.3
95 0.28
96 0.25
97 0.2
98 0.2
99 0.28
100 0.33
101 0.33
102 0.33
103 0.33
104 0.33
105 0.37
106 0.38
107 0.32
108 0.28
109 0.29
110 0.26
111 0.25
112 0.26
113 0.24
114 0.23
115 0.2
116 0.19
117 0.16
118 0.14
119 0.15
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.14
124 0.15
125 0.2
126 0.25
127 0.31
128 0.3
129 0.31
130 0.34
131 0.38
132 0.42
133 0.41
134 0.37
135 0.34
136 0.35
137 0.33
138 0.38
139 0.4
140 0.4
141 0.37
142 0.39
143 0.38
144 0.38
145 0.41
146 0.34
147 0.31
148 0.25
149 0.23
150 0.23
151 0.22
152 0.21
153 0.16
154 0.16
155 0.18
156 0.21
157 0.23
158 0.23
159 0.27
160 0.31
161 0.35
162 0.36
163 0.34
164 0.32
165 0.3
166 0.28
167 0.23
168 0.19
169 0.14
170 0.11
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.04
176 0.05
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.06
185 0.07
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.12
207 0.14
208 0.16
209 0.15
210 0.17
211 0.18
212 0.2
213 0.25
214 0.26
215 0.3
216 0.32
217 0.33
218 0.33
219 0.32
220 0.3
221 0.25
222 0.2
223 0.14
224 0.13
225 0.19
226 0.2
227 0.2
228 0.21
229 0.23
230 0.23
231 0.25
232 0.22
233 0.17
234 0.15
235 0.16
236 0.22
237 0.21
238 0.21
239 0.21
240 0.2
241 0.18
242 0.18
243 0.17
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.1
248 0.11
249 0.1
250 0.12
251 0.11
252 0.09
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.13
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.12
273 0.15
274 0.15
275 0.2
276 0.22
277 0.22
278 0.24
279 0.24
280 0.25
281 0.23
282 0.18
283 0.14
284 0.13
285 0.13
286 0.18
287 0.17
288 0.16
289 0.16
290 0.18
291 0.17
292 0.17
293 0.16
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.1
303 0.1
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.09
311 0.1
312 0.15
313 0.15
314 0.16
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.16
319 0.2
320 0.17
321 0.2
322 0.21
323 0.25
324 0.25
325 0.24
326 0.21
327 0.16
328 0.16
329 0.14
330 0.12
331 0.08
332 0.07
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.07
348 0.09
349 0.1
350 0.1
351 0.11
352 0.11
353 0.09
354 0.09
355 0.08
356 0.07
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.09
362 0.08
363 0.09
364 0.11
365 0.11
366 0.12
367 0.11
368 0.12
369 0.12
370 0.12
371 0.12
372 0.08
373 0.09
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.1
378 0.12
379 0.11
380 0.11
381 0.11
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.09
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.07
390 0.07
391 0.05
392 0.05
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.04
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.03
416 0.04
417 0.06
418 0.06
419 0.07
420 0.08
421 0.09
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.09
426 0.08
427 0.08
428 0.07
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.07
435 0.11
436 0.12
437 0.12
438 0.13
439 0.14
440 0.15
441 0.16
442 0.15
443 0.11
444 0.14
445 0.19
446 0.19
447 0.2
448 0.21
449 0.25
450 0.33
451 0.41
452 0.46
453 0.46
454 0.5
455 0.58
456 0.66
457 0.64
458 0.57
459 0.53
460 0.52
461 0.51
462 0.5
463 0.42
464 0.39
465 0.4
466 0.4
467 0.37
468 0.33
469 0.29
470 0.26
471 0.24
472 0.17
473 0.14
474 0.12
475 0.11
476 0.08
477 0.07
478 0.07
479 0.08
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.06
486 0.08
487 0.11
488 0.15
489 0.19
490 0.21
491 0.23
492 0.26
493 0.3
494 0.28
495 0.24
496 0.25
497 0.24
498 0.23
499 0.22
500 0.18
501 0.16
502 0.2
503 0.22
504 0.17
505 0.15
506 0.16
507 0.19
508 0.21
509 0.21
510 0.21
511 0.22
512 0.24
513 0.25
514 0.23
515 0.2
516 0.19
517 0.2
518 0.18
519 0.17
520 0.17
521 0.18
522 0.17
523 0.17
524 0.16
525 0.16
526 0.16
527 0.16
528 0.14
529 0.12
530 0.13
531 0.12
532 0.12
533 0.1
534 0.08
535 0.07
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.06
540 0.05
541 0.08
542 0.09
543 0.11
544 0.12
545 0.13
546 0.16
547 0.18
548 0.22
549 0.23
550 0.23
551 0.22
552 0.2
553 0.21
554 0.18
555 0.14
556 0.1
557 0.08
558 0.07
559 0.08
560 0.08
561 0.06
562 0.07
563 0.06
564 0.06
565 0.06
566 0.08
567 0.07
568 0.07
569 0.07
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.04
575 0.03
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.09
580 0.1
581 0.11
582 0.12
583 0.13
584 0.18
585 0.26
586 0.35
587 0.41
588 0.49
589 0.57
590 0.65
591 0.74
592 0.79
593 0.83
594 0.86
595 0.87
596 0.89
597 0.91
598 0.93
599 0.95
600 0.92
601 0.85
602 0.82
603 0.77
604 0.7
605 0.62
606 0.52
607 0.42
608 0.35
609 0.31
610 0.23
611 0.18
612 0.16
613 0.12
614 0.11
615 0.12
616 0.13
617 0.12
618 0.13
619 0.12
620 0.13
621 0.16
622 0.18