Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2XTH1

Protein Details
Accession A0A0C2XTH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-54PPDQARPGSSRRRSRSQQIKSYRSSGHydrophilic
817-842WISTKRVPFHRTRHLRNPWNNDREVKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50882  YTH  
CDD cd00590  RRM_SF  
cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MARRLTHFFLGPDLQTASDSMGDDSQGPPPDQARPGSSRRRSRSQQIKSYRSSGSHPPPGYGAPATNPTESIQHHRPDGFQGSSLQYPTLAAASPYTQRPGYNPPYAMTTPTPPSYGFPHSYHHPDQRNVQANYPPMLQPPVPVFPYQRLSLEVTSAPPFTGNLPHPVNPASPPFSGQGVPLSPSYVSPSSSFHSLQYPPPVTTPPYAFPPSFPQSPMYQPPFRPSPYGQHYTPTPTGETESQGTWYYLPRPSQSPYDQAPSYQGHYSVNYPQLGASEMSYSAPPSSSARPSSSTYSLLPSKGFSHQSQSDNHIPSDSSRASAVDPRTQSRANSVSSGSGRHQPISDRPVIRRSYHPNPPAHRSEWVMWAGNVPSDATHDELWRFFNAPPESRVKTGESSATGVLSIFLISRSSCVFVNYESEACLHEAISRFNGVPVRPYEPRCPRLVCRVRRKDDDLKAGVGGQRGMGMHTRWIQAQKGKARGREQTQSDKSTSDEPSTSPSIRSGISEQLASPMASLSLSSDEDGKRPARPRYSSSSGSFASTNSSFLTKYFPERYFILKSLTQEDLDISVSRGVWATQKHNEEILDQAFRTSKRVNLIFGVNKSGEFYGYARMSGPVLHGERRVSWASRSSSHHSSSSSSGLHPPPSHPPIFFSPGDHRLVDASPLPVDAPTSDGRLLKSALHQADGHIQPSRPHQTAPAVIGQKYHLPTLITPATKYSLDQFKATYPESVSSDSFELDASAPARAMRSKQGSSSSDHVVDGGEKSAGPTRGPTLEVVDEEEERRAGGEPEVGEDATTKEQEPSWGDSFAVEWISTKRVPFHRTRHLRNPWNNDREVKVSRDGTELEPSVGKRLLDEWDKLADLNAPLAVVVPKSTSAGKRRLGAKNTPSLPPPPEGGAITEGGGGGGGGGGSSSKSEPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.19
3 0.19
4 0.16
5 0.14
6 0.14
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.14
11 0.14
12 0.18
13 0.2
14 0.2
15 0.21
16 0.23
17 0.28
18 0.31
19 0.33
20 0.33
21 0.36
22 0.44
23 0.53
24 0.61
25 0.65
26 0.69
27 0.76
28 0.78
29 0.82
30 0.84
31 0.84
32 0.84
33 0.85
34 0.85
35 0.81
36 0.79
37 0.73
38 0.65
39 0.59
40 0.59
41 0.57
42 0.58
43 0.53
44 0.49
45 0.47
46 0.45
47 0.44
48 0.36
49 0.28
50 0.22
51 0.28
52 0.29
53 0.27
54 0.27
55 0.24
56 0.27
57 0.29
58 0.33
59 0.34
60 0.35
61 0.39
62 0.39
63 0.39
64 0.41
65 0.44
66 0.37
67 0.32
68 0.31
69 0.31
70 0.32
71 0.31
72 0.25
73 0.19
74 0.18
75 0.17
76 0.14
77 0.11
78 0.09
79 0.09
80 0.12
81 0.15
82 0.17
83 0.2
84 0.2
85 0.21
86 0.24
87 0.32
88 0.37
89 0.4
90 0.39
91 0.37
92 0.42
93 0.42
94 0.42
95 0.36
96 0.34
97 0.31
98 0.32
99 0.32
100 0.26
101 0.28
102 0.29
103 0.32
104 0.32
105 0.3
106 0.32
107 0.36
108 0.44
109 0.48
110 0.52
111 0.53
112 0.52
113 0.57
114 0.62
115 0.66
116 0.6
117 0.58
118 0.54
119 0.5
120 0.49
121 0.44
122 0.36
123 0.28
124 0.3
125 0.26
126 0.23
127 0.24
128 0.26
129 0.25
130 0.27
131 0.27
132 0.29
133 0.33
134 0.32
135 0.29
136 0.27
137 0.29
138 0.27
139 0.28
140 0.23
141 0.21
142 0.22
143 0.21
144 0.18
145 0.14
146 0.14
147 0.13
148 0.18
149 0.18
150 0.23
151 0.26
152 0.27
153 0.29
154 0.3
155 0.3
156 0.27
157 0.29
158 0.26
159 0.23
160 0.24
161 0.24
162 0.24
163 0.23
164 0.21
165 0.2
166 0.16
167 0.18
168 0.16
169 0.15
170 0.14
171 0.14
172 0.18
173 0.16
174 0.16
175 0.16
176 0.18
177 0.2
178 0.23
179 0.24
180 0.2
181 0.24
182 0.25
183 0.27
184 0.33
185 0.33
186 0.3
187 0.31
188 0.32
189 0.3
190 0.31
191 0.3
192 0.24
193 0.28
194 0.3
195 0.29
196 0.29
197 0.33
198 0.35
199 0.34
200 0.33
201 0.29
202 0.28
203 0.34
204 0.4
205 0.39
206 0.39
207 0.39
208 0.43
209 0.46
210 0.45
211 0.44
212 0.39
213 0.41
214 0.43
215 0.48
216 0.43
217 0.41
218 0.41
219 0.43
220 0.43
221 0.35
222 0.28
223 0.24
224 0.26
225 0.24
226 0.24
227 0.19
228 0.17
229 0.17
230 0.17
231 0.17
232 0.14
233 0.15
234 0.17
235 0.19
236 0.21
237 0.21
238 0.23
239 0.26
240 0.32
241 0.33
242 0.35
243 0.34
244 0.37
245 0.35
246 0.32
247 0.34
248 0.29
249 0.29
250 0.24
251 0.22
252 0.18
253 0.19
254 0.21
255 0.21
256 0.23
257 0.21
258 0.2
259 0.19
260 0.18
261 0.18
262 0.16
263 0.12
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.09
272 0.11
273 0.14
274 0.18
275 0.2
276 0.22
277 0.25
278 0.28
279 0.31
280 0.31
281 0.29
282 0.26
283 0.28
284 0.28
285 0.26
286 0.23
287 0.2
288 0.19
289 0.22
290 0.25
291 0.21
292 0.26
293 0.3
294 0.33
295 0.34
296 0.38
297 0.4
298 0.38
299 0.37
300 0.31
301 0.26
302 0.24
303 0.28
304 0.22
305 0.16
306 0.14
307 0.15
308 0.15
309 0.2
310 0.22
311 0.21
312 0.23
313 0.25
314 0.29
315 0.29
316 0.28
317 0.28
318 0.29
319 0.25
320 0.24
321 0.22
322 0.22
323 0.22
324 0.24
325 0.2
326 0.23
327 0.23
328 0.22
329 0.22
330 0.21
331 0.26
332 0.29
333 0.34
334 0.3
335 0.32
336 0.38
337 0.4
338 0.4
339 0.41
340 0.44
341 0.45
342 0.51
343 0.55
344 0.55
345 0.57
346 0.6
347 0.59
348 0.53
349 0.47
350 0.42
351 0.37
352 0.34
353 0.32
354 0.26
355 0.21
356 0.2
357 0.18
358 0.15
359 0.13
360 0.09
361 0.06
362 0.07
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.1
367 0.1
368 0.11
369 0.13
370 0.12
371 0.13
372 0.12
373 0.19
374 0.21
375 0.22
376 0.24
377 0.28
378 0.29
379 0.29
380 0.3
381 0.25
382 0.23
383 0.23
384 0.22
385 0.17
386 0.17
387 0.15
388 0.13
389 0.11
390 0.1
391 0.08
392 0.06
393 0.05
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.1
409 0.1
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.07
414 0.08
415 0.09
416 0.09
417 0.1
418 0.1
419 0.09
420 0.11
421 0.13
422 0.11
423 0.13
424 0.14
425 0.18
426 0.21
427 0.24
428 0.32
429 0.37
430 0.4
431 0.4
432 0.42
433 0.4
434 0.47
435 0.53
436 0.54
437 0.57
438 0.64
439 0.67
440 0.68
441 0.73
442 0.71
443 0.67
444 0.65
445 0.56
446 0.46
447 0.41
448 0.37
449 0.32
450 0.23
451 0.17
452 0.09
453 0.09
454 0.08
455 0.08
456 0.09
457 0.07
458 0.09
459 0.12
460 0.13
461 0.13
462 0.15
463 0.17
464 0.19
465 0.25
466 0.27
467 0.35
468 0.37
469 0.41
470 0.44
471 0.47
472 0.48
473 0.49
474 0.48
475 0.49
476 0.49
477 0.47
478 0.44
479 0.39
480 0.36
481 0.33
482 0.3
483 0.22
484 0.18
485 0.15
486 0.18
487 0.2
488 0.2
489 0.16
490 0.15
491 0.15
492 0.15
493 0.15
494 0.13
495 0.13
496 0.13
497 0.13
498 0.12
499 0.13
500 0.13
501 0.12
502 0.1
503 0.07
504 0.06
505 0.06
506 0.05
507 0.04
508 0.05
509 0.06
510 0.06
511 0.09
512 0.09
513 0.1
514 0.13
515 0.14
516 0.17
517 0.22
518 0.28
519 0.32
520 0.36
521 0.39
522 0.45
523 0.5
524 0.49
525 0.46
526 0.45
527 0.38
528 0.36
529 0.31
530 0.23
531 0.21
532 0.17
533 0.15
534 0.12
535 0.12
536 0.11
537 0.11
538 0.15
539 0.12
540 0.17
541 0.22
542 0.22
543 0.24
544 0.25
545 0.3
546 0.29
547 0.3
548 0.28
549 0.24
550 0.25
551 0.26
552 0.26
553 0.21
554 0.18
555 0.17
556 0.14
557 0.13
558 0.12
559 0.09
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.08
564 0.07
565 0.1
566 0.12
567 0.16
568 0.22
569 0.25
570 0.25
571 0.27
572 0.27
573 0.24
574 0.24
575 0.21
576 0.17
577 0.14
578 0.14
579 0.15
580 0.15
581 0.18
582 0.17
583 0.17
584 0.22
585 0.24
586 0.24
587 0.24
588 0.29
589 0.29
590 0.29
591 0.3
592 0.24
593 0.22
594 0.22
595 0.2
596 0.14
597 0.11
598 0.11
599 0.13
600 0.13
601 0.14
602 0.13
603 0.13
604 0.13
605 0.12
606 0.13
607 0.12
608 0.14
609 0.15
610 0.17
611 0.17
612 0.18
613 0.22
614 0.23
615 0.2
616 0.2
617 0.24
618 0.26
619 0.29
620 0.34
621 0.37
622 0.39
623 0.41
624 0.4
625 0.35
626 0.35
627 0.32
628 0.3
629 0.25
630 0.21
631 0.24
632 0.24
633 0.27
634 0.25
635 0.25
636 0.3
637 0.34
638 0.34
639 0.29
640 0.31
641 0.32
642 0.36
643 0.34
644 0.3
645 0.31
646 0.34
647 0.36
648 0.32
649 0.28
650 0.24
651 0.24
652 0.22
653 0.17
654 0.13
655 0.11
656 0.11
657 0.11
658 0.09
659 0.09
660 0.08
661 0.09
662 0.09
663 0.11
664 0.13
665 0.15
666 0.15
667 0.17
668 0.18
669 0.16
670 0.18
671 0.23
672 0.22
673 0.22
674 0.22
675 0.21
676 0.29
677 0.28
678 0.27
679 0.23
680 0.23
681 0.23
682 0.3
683 0.36
684 0.29
685 0.28
686 0.29
687 0.31
688 0.34
689 0.34
690 0.34
691 0.3
692 0.29
693 0.29
694 0.28
695 0.28
696 0.26
697 0.24
698 0.18
699 0.17
700 0.17
701 0.22
702 0.27
703 0.22
704 0.21
705 0.23
706 0.24
707 0.23
708 0.24
709 0.23
710 0.26
711 0.27
712 0.28
713 0.27
714 0.28
715 0.32
716 0.32
717 0.28
718 0.22
719 0.23
720 0.24
721 0.26
722 0.23
723 0.21
724 0.2
725 0.18
726 0.17
727 0.13
728 0.12
729 0.1
730 0.11
731 0.1
732 0.09
733 0.09
734 0.1
735 0.11
736 0.12
737 0.14
738 0.2
739 0.26
740 0.28
741 0.31
742 0.38
743 0.38
744 0.41
745 0.42
746 0.39
747 0.34
748 0.32
749 0.28
750 0.22
751 0.21
752 0.17
753 0.14
754 0.1
755 0.08
756 0.1
757 0.16
758 0.16
759 0.15
760 0.16
761 0.19
762 0.2
763 0.21
764 0.21
765 0.19
766 0.19
767 0.2
768 0.21
769 0.19
770 0.19
771 0.19
772 0.19
773 0.15
774 0.13
775 0.14
776 0.12
777 0.11
778 0.11
779 0.13
780 0.12
781 0.15
782 0.17
783 0.16
784 0.14
785 0.14
786 0.15
787 0.15
788 0.16
789 0.14
790 0.14
791 0.14
792 0.18
793 0.21
794 0.25
795 0.25
796 0.24
797 0.24
798 0.22
799 0.22
800 0.2
801 0.17
802 0.11
803 0.1
804 0.11
805 0.16
806 0.17
807 0.18
808 0.24
809 0.3
810 0.37
811 0.45
812 0.52
813 0.59
814 0.68
815 0.76
816 0.79
817 0.82
818 0.86
819 0.87
820 0.89
821 0.88
822 0.85
823 0.81
824 0.75
825 0.68
826 0.65
827 0.6
828 0.53
829 0.5
830 0.46
831 0.42
832 0.41
833 0.4
834 0.35
835 0.37
836 0.33
837 0.28
838 0.28
839 0.27
840 0.28
841 0.28
842 0.24
843 0.19
844 0.2
845 0.25
846 0.27
847 0.29
848 0.27
849 0.28
850 0.28
851 0.27
852 0.26
853 0.23
854 0.18
855 0.17
856 0.14
857 0.11
858 0.1
859 0.12
860 0.12
861 0.09
862 0.09
863 0.09
864 0.1
865 0.12
866 0.17
867 0.23
868 0.3
869 0.38
870 0.42
871 0.47
872 0.56
873 0.63
874 0.65
875 0.67
876 0.68
877 0.69
878 0.68
879 0.66
880 0.6
881 0.57
882 0.53
883 0.47
884 0.42
885 0.35
886 0.33
887 0.3
888 0.29
889 0.25
890 0.23
891 0.2
892 0.17
893 0.14
894 0.11
895 0.1
896 0.07
897 0.05
898 0.04
899 0.03
900 0.02
901 0.03
902 0.03
903 0.04
904 0.06