FuNGI

A0A0C3CU04

Protein Details

Accession

A0A0C3CU04

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
514-535	AIKAERQVRRAEKKSTKEQFGA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
275-281	KGKKRRK
500-531	PRDESKEEKKARKAAIKAERQVRRAEKKSTKE

Subcellular Location(s)

nucl 22, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKSKSIFRQPGAQHFQLVHRSQRDPLINDPNASAHVLKPFERDNVKKGKSRADLETLLAPEELVGQRNVGEASLYGIYFDDTEYDYMRHLRAVGIQEDGVESILIEAPSSSKQKSKAQLKQKTGIDLLDLPDGVLASTSELPRTYESQQAIPESIAGFQPDMDAHLRQVLEALEDDAFIDDELEDNFFGELVADGERGSDEEVAFEFDENGIDETKETSETDADGEDAWEKRFADFKKKHTGSGVKFGSDDGYDSEGGDTIGRLPEMSVIGGKGKKRRKGTSDASGYSMSSSSMFRNEALQTLDERFDQMILKQYDEDGGNECTSSDDEGDSDEAPELITSREDFDSMVNTFLNEFEILGRKMKPKLGGENGIEKLDILRRAMGEDERVRIANADDEEKEETDLLATEEGDKKDRWDCETILTTYTNLENHPRLIRARDSIPVPQIVLDRKTGLPSVLIKAEKPKHRVGQVSFSSKSEETNELDDEHHRAPGQTIARPRDESKEEKKARKAAIKAERQVRRAEKKSTKEQFGAEVKDQKTRISNKELRLKKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.58
3	0.5
4	0.53
5	0.53
6	0.51
7	0.48
8	0.46
9	0.47
10	0.47
11	0.53
12	0.54
13	0.48
14	0.52
15	0.55
16	0.51
17	0.5
18	0.48
19	0.41
20	0.36
21	0.34
22	0.27
23	0.19
24	0.22
25	0.24
26	0.24
27	0.27
28	0.28
29	0.33
30	0.41
31	0.43
32	0.45
33	0.53
34	0.58
35	0.6
36	0.62
37	0.64
38	0.63
39	0.64
40	0.62
41	0.58
42	0.54
43	0.5
44	0.5
45	0.41
46	0.34
47	0.29
48	0.22
49	0.15
50	0.17
51	0.16
52	0.13
53	0.13
54	0.12
55	0.12
56	0.14
57	0.14
58	0.09
59	0.09
60	0.07
61	0.09
62	0.1
63	0.1
64	0.09
65	0.09
66	0.09
67	0.09
68	0.09
69	0.08
70	0.08
71	0.09
72	0.1
73	0.11
74	0.12
75	0.14
76	0.15
77	0.14
78	0.13
79	0.13
80	0.17
81	0.2
82	0.2
83	0.19
84	0.19
85	0.18
86	0.18
87	0.17
88	0.12
89	0.08
90	0.07
91	0.06
92	0.07
93	0.07
94	0.06
95	0.06
96	0.08
97	0.12
98	0.15
99	0.16
100	0.19
101	0.24
102	0.32
103	0.42
104	0.51
105	0.56
106	0.64
107	0.72
108	0.75
109	0.78
110	0.73
111	0.68
112	0.59
113	0.5
114	0.42
115	0.34
116	0.29
117	0.21
118	0.18
119	0.13
120	0.12
121	0.11
122	0.09
123	0.07
124	0.05
125	0.06
126	0.08
127	0.09
128	0.1
129	0.1
130	0.12
131	0.14
132	0.18
133	0.18
134	0.21
135	0.23
136	0.25
137	0.26
138	0.26
139	0.25
140	0.21
141	0.2
142	0.14
143	0.13
144	0.11
145	0.1
146	0.08
147	0.07
148	0.08
149	0.07
150	0.09
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.13
155	0.12
156	0.12
157	0.13
158	0.11
159	0.1
160	0.09
161	0.1
162	0.07
163	0.07
164	0.07
165	0.06
166	0.06
167	0.05
168	0.05
169	0.04
170	0.04
171	0.05
172	0.05
173	0.05
174	0.05
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.05
182	0.04
183	0.04
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.06
188	0.06
189	0.05
190	0.06
191	0.06
192	0.08
193	0.08
194	0.08
195	0.07
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.07
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.07
204	0.07
205	0.08
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.08
210	0.08
211	0.07
212	0.07
213	0.06
214	0.06
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.1
219	0.1
220	0.1
221	0.16
222	0.17
223	0.26
224	0.31
225	0.36
226	0.45
227	0.46
228	0.47
229	0.47
230	0.54
231	0.46
232	0.5
233	0.45
234	0.35
235	0.34
236	0.33
237	0.27
238	0.19
239	0.17
240	0.08
241	0.09
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.05
249	0.04
250	0.05
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.08
260	0.11
261	0.13
262	0.2
263	0.26
264	0.33
265	0.39
266	0.45
267	0.48
268	0.54
269	0.58
270	0.59
271	0.59
272	0.54
273	0.5
274	0.44
275	0.39
276	0.31
277	0.24
278	0.15
279	0.09
280	0.09
281	0.07
282	0.09
283	0.09
284	0.09
285	0.11
286	0.11
287	0.12
288	0.12
289	0.12
290	0.12
291	0.13
292	0.13
293	0.11
294	0.11
295	0.1
296	0.1
297	0.09
298	0.09
299	0.15
300	0.15
301	0.15
302	0.15
303	0.15
304	0.16
305	0.16
306	0.16
307	0.11
308	0.11
309	0.11
310	0.11
311	0.11
312	0.09
313	0.09
314	0.09
315	0.07
316	0.06
317	0.06
318	0.07
319	0.08
320	0.07
321	0.07
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.07
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.08
335	0.11
336	0.11
337	0.11
338	0.09
339	0.09
340	0.09
341	0.09
342	0.09
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.1
347	0.11
348	0.13
349	0.16
350	0.18
351	0.21
352	0.24
353	0.28
354	0.29
355	0.35
356	0.39
357	0.43
358	0.41
359	0.45
360	0.44
361	0.38
362	0.34
363	0.27
364	0.22
365	0.2
366	0.19
367	0.13
368	0.13
369	0.13
370	0.14
371	0.16
372	0.15
373	0.18
374	0.18
375	0.2
376	0.2
377	0.2
378	0.19
379	0.18
380	0.18
381	0.16
382	0.15
383	0.15
384	0.14
385	0.16
386	0.18
387	0.17
388	0.17
389	0.14
390	0.12
391	0.1
392	0.1
393	0.08
394	0.07
395	0.06
396	0.09
397	0.13
398	0.14
399	0.17
400	0.17
401	0.19
402	0.24
403	0.26
404	0.28
405	0.27
406	0.27
407	0.3
408	0.34
409	0.33
410	0.29
411	0.28
412	0.24
413	0.21
414	0.22
415	0.17
416	0.14
417	0.19
418	0.18
419	0.21
420	0.23
421	0.25
422	0.26
423	0.29
424	0.32
425	0.31
426	0.31
427	0.32
428	0.33
429	0.35
430	0.35
431	0.32
432	0.28
433	0.26
434	0.27
435	0.27
436	0.26
437	0.23
438	0.23
439	0.22
440	0.24
441	0.23
442	0.2
443	0.18
444	0.19
445	0.21
446	0.24
447	0.24
448	0.23
449	0.32
450	0.4
451	0.44
452	0.47
453	0.52
454	0.53
455	0.58
456	0.65
457	0.6
458	0.62
459	0.61
460	0.63
461	0.57
462	0.51
463	0.5
464	0.42
465	0.4
466	0.33
467	0.3
468	0.25
469	0.27
470	0.27
471	0.24
472	0.25
473	0.25
474	0.26
475	0.23
476	0.22
477	0.19
478	0.19
479	0.19
480	0.24
481	0.26
482	0.27
483	0.35
484	0.38
485	0.43
486	0.46
487	0.47
488	0.48
489	0.5
490	0.53
491	0.54
492	0.6
493	0.64
494	0.69
495	0.75
496	0.75
497	0.78
498	0.78
499	0.74
500	0.74
501	0.75
502	0.76
503	0.76
504	0.78
505	0.77
506	0.71
507	0.74
508	0.74
509	0.74
510	0.71
511	0.73
512	0.73
513	0.74
514	0.83
515	0.83
516	0.8
517	0.74
518	0.69
519	0.67
520	0.64
521	0.62
522	0.58
523	0.57
524	0.51
525	0.55
526	0.53
527	0.49
528	0.5
529	0.52
530	0.53
531	0.55
532	0.61
533	0.63
534	0.72

A0A0C3CU04

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer