Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3CJG4

Protein Details
Accession A0A0C3CJG4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
437-461KTNGRGRKGYLGKRKNHKSPSTANSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-102RVARKTAVREK
369-397KAHVKALRAAGRPPKSAGIKPAGKRGENK
428-454KEPKKNEGGKTNGRGRKGYLGKRKNHK
Subcellular Location(s) cyto 20, cyto_nucl 13.333, cyto_mito 12.499, nucl 3.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047150  SGT  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13432  TPR_16  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSTIPQNEAAILKDGGAVNIQSTDATAIVGEQSTAVVVNEPTPESSAKIEGQEMTGTSDDNSLNNTPAPSVNVVISPPKSTEELIAARALKRVARKTAVREKAEGHKRAGDILFESKNYKASYPQYLEAIKLWGSNPEYFISLASAYRKLQWYEEAAHAATRALTLDPKNSEARYIRGVARMEQRLLKPARIDFETVLEHDSSHFRARAALTEVNHFIASSSQLGSHDLGPNPVDEMVKSVDFGFPHYDGEALEIASVSDSSDCNHVGNGIQCRFYNHDGCGRGTACTFSHAPDEKSVRDELGKNVCIYFLLDQCKFGAAKCIYSHAKEALPKIGWWTSEEQIAKVKSVLEVAEQKSREQRQLENERWKAHVKALRAAGRPPKSAGIKPAGKRGENKGGDASPVAEQPAEGTVVADVVASAPAAGNQKEPKKNEGGKTNGRGRKGYLGKRKNHKSPSTANSSTKIEETLPAVPVPAGATAPGFTDYQLNVPPAAAKPVVDAPVALQY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.16
4 0.15
5 0.12
6 0.12
7 0.12
8 0.09
9 0.09
10 0.09
11 0.08
12 0.08
13 0.06
14 0.06
15 0.07
16 0.07
17 0.07
18 0.06
19 0.05
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.07
24 0.07
25 0.09
26 0.11
27 0.12
28 0.13
29 0.15
30 0.15
31 0.15
32 0.17
33 0.19
34 0.19
35 0.2
36 0.21
37 0.2
38 0.2
39 0.2
40 0.18
41 0.17
42 0.16
43 0.14
44 0.13
45 0.15
46 0.14
47 0.14
48 0.17
49 0.15
50 0.17
51 0.18
52 0.17
53 0.15
54 0.16
55 0.18
56 0.16
57 0.16
58 0.15
59 0.14
60 0.15
61 0.19
62 0.2
63 0.19
64 0.19
65 0.2
66 0.21
67 0.2
68 0.21
69 0.21
70 0.21
71 0.21
72 0.24
73 0.23
74 0.23
75 0.24
76 0.24
77 0.22
78 0.27
79 0.32
80 0.34
81 0.4
82 0.44
83 0.51
84 0.61
85 0.67
86 0.62
87 0.59
88 0.57
89 0.6
90 0.65
91 0.59
92 0.52
93 0.47
94 0.45
95 0.47
96 0.43
97 0.34
98 0.27
99 0.28
100 0.27
101 0.23
102 0.25
103 0.21
104 0.25
105 0.24
106 0.22
107 0.22
108 0.25
109 0.32
110 0.34
111 0.35
112 0.34
113 0.34
114 0.34
115 0.29
116 0.27
117 0.19
118 0.16
119 0.15
120 0.16
121 0.18
122 0.18
123 0.18
124 0.17
125 0.18
126 0.17
127 0.17
128 0.13
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.14
133 0.13
134 0.17
135 0.2
136 0.2
137 0.2
138 0.22
139 0.23
140 0.23
141 0.25
142 0.23
143 0.2
144 0.2
145 0.18
146 0.16
147 0.12
148 0.09
149 0.08
150 0.06
151 0.1
152 0.1
153 0.14
154 0.16
155 0.19
156 0.21
157 0.21
158 0.25
159 0.23
160 0.25
161 0.24
162 0.25
163 0.24
164 0.27
165 0.27
166 0.27
167 0.33
168 0.33
169 0.31
170 0.33
171 0.31
172 0.34
173 0.35
174 0.33
175 0.28
176 0.27
177 0.29
178 0.26
179 0.27
180 0.19
181 0.2
182 0.19
183 0.17
184 0.17
185 0.13
186 0.12
187 0.11
188 0.12
189 0.12
190 0.13
191 0.14
192 0.12
193 0.15
194 0.15
195 0.17
196 0.2
197 0.21
198 0.19
199 0.21
200 0.22
201 0.2
202 0.19
203 0.16
204 0.12
205 0.09
206 0.1
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.09
212 0.1
213 0.11
214 0.13
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.1
222 0.06
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.09
236 0.08
237 0.09
238 0.08
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.04
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.11
256 0.15
257 0.15
258 0.16
259 0.16
260 0.19
261 0.22
262 0.24
263 0.23
264 0.19
265 0.24
266 0.24
267 0.25
268 0.26
269 0.22
270 0.2
271 0.17
272 0.18
273 0.12
274 0.13
275 0.13
276 0.11
277 0.17
278 0.18
279 0.19
280 0.22
281 0.25
282 0.23
283 0.24
284 0.24
285 0.19
286 0.19
287 0.2
288 0.2
289 0.24
290 0.24
291 0.23
292 0.22
293 0.21
294 0.19
295 0.18
296 0.15
297 0.13
298 0.16
299 0.16
300 0.17
301 0.17
302 0.19
303 0.18
304 0.15
305 0.2
306 0.16
307 0.19
308 0.19
309 0.24
310 0.25
311 0.26
312 0.28
313 0.22
314 0.24
315 0.24
316 0.26
317 0.25
318 0.24
319 0.22
320 0.24
321 0.23
322 0.21
323 0.2
324 0.22
325 0.18
326 0.23
327 0.23
328 0.2
329 0.24
330 0.24
331 0.22
332 0.19
333 0.18
334 0.13
335 0.14
336 0.14
337 0.12
338 0.17
339 0.19
340 0.25
341 0.25
342 0.26
343 0.33
344 0.36
345 0.38
346 0.35
347 0.37
348 0.41
349 0.5
350 0.57
351 0.6
352 0.61
353 0.58
354 0.58
355 0.57
356 0.48
357 0.46
358 0.42
359 0.34
360 0.36
361 0.41
362 0.45
363 0.44
364 0.48
365 0.5
366 0.5
367 0.49
368 0.45
369 0.44
370 0.41
371 0.42
372 0.42
373 0.42
374 0.45
375 0.45
376 0.52
377 0.51
378 0.5
379 0.52
380 0.54
381 0.55
382 0.49
383 0.49
384 0.44
385 0.39
386 0.37
387 0.33
388 0.27
389 0.18
390 0.17
391 0.16
392 0.11
393 0.1
394 0.1
395 0.1
396 0.09
397 0.08
398 0.07
399 0.06
400 0.06
401 0.07
402 0.05
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.06
410 0.1
411 0.11
412 0.15
413 0.22
414 0.31
415 0.39
416 0.42
417 0.45
418 0.52
419 0.59
420 0.62
421 0.64
422 0.64
423 0.66
424 0.71
425 0.76
426 0.71
427 0.67
428 0.62
429 0.56
430 0.58
431 0.58
432 0.59
433 0.6
434 0.64
435 0.7
436 0.79
437 0.86
438 0.86
439 0.86
440 0.84
441 0.81
442 0.81
443 0.79
444 0.78
445 0.75
446 0.69
447 0.63
448 0.59
449 0.53
450 0.45
451 0.39
452 0.3
453 0.26
454 0.25
455 0.23
456 0.22
457 0.19
458 0.19
459 0.17
460 0.16
461 0.15
462 0.12
463 0.09
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.1
468 0.11
469 0.1
470 0.1
471 0.14
472 0.14
473 0.17
474 0.2
475 0.2
476 0.18
477 0.18
478 0.21
479 0.18
480 0.23
481 0.2
482 0.17
483 0.19
484 0.23
485 0.25
486 0.22
487 0.2