FuNGI

A0A0C2YL37

Protein Details

Accession

A0A0C2YL37

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
31-54	FPITKQMTSRTRLKRKQVDDVLGG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cysk 11, cyto 7, nucl 5, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001529 DNA-dir_RNA_pol_M/15kDasu IPR045055 DNA2/NAM7-like IPR041679 DNA2/NAM7-like_C IPR041677 DNA2/NAM7_AAA_11 IPR027417 P-loop_NTPase IPR047187 SF1_C_Upf1 IPR034014 Zn_ribbon_RPC11_C IPR001222 Znf_TFIIS
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0004386 F:helicase activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription GO:0042779 P:tRNA 3'-trailer cleavage
Pfam	View protein in Pfam PF13086 AAA_11 PF13087 AAA_12 PF02150 RNA_POL_M_15KD PF01096 TFIIS_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51133 ZF_TFIIS_2
CDD	cd18808 SF1_C_Upf1 cd10509 Zn-ribbon_RPC11

Amino Acid Sequences

MLFCPTCANLLVISGETGLNKWACNTCPYEFPITKQMTSRTRLKRKQVDDVLGGDEMWAHADKTQASCDKCNFNSAYFYQLQIRSADEPMTTCSKDYSVDSAYTPLFSVRRQSAAEGEWLQENEEENEDVPVVSQVPRSRFDWRGRATSRAKAVVLRDGERTRIRRIRPSVPMDDENDPFLPAIRNYSLKYLKLLALEEAESEAALKDRLSSWSVDLLRKEGYCMTGLSAYWLNANQFGRPVAAFLLGPGVNLPESKFDIGTQVLVSRHDPLKEEPLMGSVLSRSQSQIRVCFPNHFDLHEGEWRLDLGRPNLMYERMRAAVSHLRNDVQKIEDEVPRTSTEIILQGTKVRDIILRSFKMGYTRAPSTEEEVSADASSESGGIFKEDQRIQSWAKRYSQHNPMVMEGDPPLVGLNASQIRAMATMIGERMSLIQGPPGTGKTKTIIETIKLLKVHFEVPQPILVCTYTNVAVDNLVEGFAKVGVKPLRVGYNGNVRESLLQHSLDYKLQQHPLHRPLTAFVEEQATITPKIQKLLQDCQTLDEKLKTSVRPRKSSSQRVSNMKAGIIKLEERQVFLKRRIYAMQQGMLKDVIEAADVICTTCITSACHALNAADFPVVFIDEASMSTEPSSLIPLMKGSRHVALIGDHKQLPPIIVNTQAKEGGFGVSLFERLIEEEHVPSVMLDIQYRMHPAISRFPAMEFYDLALQDGTVDSGGKALPGLEPPRSKHMTRLEGKKHRPSVIFLDHTGNESFRGRSVLNLTEGHIVASIVEDLLLNNKRLRGHDIGIIAPYAAQIKLLTRMINTDPTYRERFKAVLGDQRMLHLEHIEIKTVDGFEGREKDVIIFSTVRNNGGGNIGFLADKKRLNVGLTRAKRGLFVVGSISTLRAAKMASSGGNTSVSSSISTTDEAEVPLPPPVVRVGKGAESWRRYADYLTEGGLVISLKGEKLETALYEHLCAVQGEQQQEMWRAAVGVKEVKRVRIAGTVR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.11
3	0.1
4	0.11
5	0.14
6	0.14
7	0.13
8	0.17
9	0.2
10	0.21
11	0.26
12	0.3
13	0.28
14	0.32
15	0.36
16	0.42
17	0.39
18	0.42
19	0.46
20	0.46
21	0.46
22	0.45
23	0.5
24	0.48
25	0.53
26	0.59
27	0.6
28	0.67
29	0.73
30	0.8
31	0.81
32	0.81
33	0.86
34	0.84
35	0.8
36	0.73
37	0.66
38	0.58
39	0.48
40	0.41
41	0.3
42	0.21
43	0.14
44	0.12
45	0.1
46	0.08
47	0.09
48	0.11
49	0.14
50	0.16
51	0.23
52	0.28
53	0.31
54	0.37
55	0.41
56	0.46
57	0.45
58	0.5
59	0.45
60	0.41
61	0.43
62	0.38
63	0.4
64	0.32
65	0.34
66	0.33
67	0.33
68	0.33
69	0.28
70	0.3
71	0.25
72	0.26
73	0.25
74	0.19
75	0.18
76	0.21
77	0.25
78	0.23
79	0.21
80	0.21
81	0.2
82	0.21
83	0.22
84	0.24
85	0.21
86	0.22
87	0.22
88	0.23
89	0.23
90	0.21
91	0.19
92	0.18
93	0.16
94	0.16
95	0.22
96	0.22
97	0.26
98	0.26
99	0.28
100	0.28
101	0.28
102	0.33
103	0.27
104	0.26
105	0.25
106	0.24
107	0.23
108	0.2
109	0.2
110	0.16
111	0.17
112	0.16
113	0.13
114	0.14
115	0.13
116	0.11
117	0.1
118	0.09
119	0.09
120	0.09
121	0.14
122	0.18
123	0.21
124	0.24
125	0.27
126	0.33
127	0.39
128	0.45
129	0.5
130	0.51
131	0.57
132	0.57
133	0.63
134	0.62
135	0.61
136	0.59
137	0.53
138	0.5
139	0.44
140	0.43
141	0.42
142	0.41
143	0.36
144	0.37
145	0.34
146	0.39
147	0.43
148	0.44
149	0.46
150	0.5
151	0.53
152	0.56
153	0.61
154	0.64
155	0.66
156	0.7
157	0.67
158	0.66
159	0.64
160	0.59
161	0.56
162	0.48
163	0.42
164	0.35
165	0.28
166	0.21
167	0.19
168	0.17
169	0.13
170	0.17
171	0.17
172	0.2
173	0.2
174	0.29
175	0.32
176	0.3
177	0.32
178	0.3
179	0.3
180	0.29
181	0.28
182	0.22
183	0.19
184	0.18
185	0.16
186	0.14
187	0.11
188	0.09
189	0.08
190	0.07
191	0.06
192	0.06
193	0.06
194	0.07
195	0.08
196	0.11
197	0.12
198	0.13
199	0.14
200	0.21
201	0.24
202	0.27
203	0.26
204	0.26
205	0.27
206	0.26
207	0.26
208	0.2
209	0.18
210	0.16
211	0.15
212	0.15
213	0.13
214	0.13
215	0.14
216	0.14
217	0.13
218	0.13
219	0.14
220	0.13
221	0.16
222	0.17
223	0.15
224	0.15
225	0.15
226	0.15
227	0.14
228	0.14
229	0.1
230	0.1
231	0.09
232	0.08
233	0.12
234	0.1
235	0.1
236	0.09
237	0.1
238	0.09
239	0.09
240	0.1
241	0.09
242	0.11
243	0.12
244	0.12
245	0.11
246	0.14
247	0.14
248	0.14
249	0.12
250	0.13
251	0.12
252	0.14
253	0.14
254	0.17
255	0.18
256	0.19
257	0.21
258	0.2
259	0.27
260	0.26
261	0.26
262	0.22
263	0.21
264	0.2
265	0.18
266	0.15
267	0.09
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.1
272	0.13
273	0.19
274	0.21
275	0.25
276	0.27
277	0.32
278	0.33
279	0.37
280	0.36
281	0.39
282	0.37
283	0.34
284	0.31
285	0.27
286	0.29
287	0.29
288	0.27
289	0.19
290	0.19
291	0.18
292	0.17
293	0.17
294	0.17
295	0.14
296	0.17
297	0.17
298	0.18
299	0.2
300	0.22
301	0.21
302	0.2
303	0.21
304	0.19
305	0.19
306	0.17
307	0.2
308	0.24
309	0.25
310	0.27
311	0.25
312	0.26
313	0.27
314	0.29
315	0.26
316	0.2
317	0.19
318	0.19
319	0.21
320	0.21
321	0.23
322	0.22
323	0.22
324	0.21
325	0.21
326	0.18
327	0.14
328	0.13
329	0.13
330	0.13
331	0.12
332	0.12
333	0.14
334	0.14
335	0.14
336	0.13
337	0.11
338	0.12
339	0.14
340	0.2
341	0.24
342	0.24
343	0.25
344	0.26
345	0.26
346	0.27
347	0.27
348	0.23
349	0.2
350	0.21
351	0.21
352	0.23
353	0.23
354	0.24
355	0.24
356	0.21
357	0.17
358	0.16
359	0.15
360	0.12
361	0.12
362	0.08
363	0.06
364	0.06
365	0.05
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.05
370	0.06
371	0.07
372	0.13
373	0.15
374	0.16
375	0.18
376	0.21
377	0.23
378	0.27
379	0.33
380	0.31
381	0.34
382	0.38
383	0.41
384	0.45
385	0.52
386	0.52
387	0.49
388	0.45
389	0.42
390	0.38
391	0.34
392	0.27
393	0.19
394	0.13
395	0.09
396	0.08
397	0.07
398	0.05
399	0.05
400	0.04
401	0.07
402	0.08
403	0.09
404	0.09
405	0.09
406	0.09
407	0.09
408	0.09
409	0.06
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.06
421	0.06
422	0.07
423	0.08
424	0.09
425	0.11
426	0.11
427	0.12
428	0.12
429	0.14
430	0.15
431	0.18
432	0.17
433	0.16
434	0.21
435	0.21
436	0.22
437	0.21
438	0.2
439	0.18
440	0.18
441	0.18
442	0.16
443	0.16
444	0.15
445	0.15
446	0.18
447	0.17
448	0.16
449	0.15
450	0.13
451	0.11
452	0.09
453	0.1
454	0.08
455	0.07
456	0.08
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.06
461	0.05
462	0.04
463	0.04
464	0.04
465	0.04
466	0.04
467	0.05
468	0.04
469	0.09
470	0.1
471	0.1
472	0.11
473	0.13
474	0.15
475	0.16
476	0.17
477	0.15
478	0.23
479	0.24
480	0.24
481	0.23
482	0.21
483	0.21
484	0.2
485	0.21
486	0.13
487	0.12
488	0.12
489	0.13
490	0.14
491	0.13
492	0.14
493	0.14
494	0.15
495	0.2
496	0.22
497	0.25
498	0.3
499	0.35
500	0.36
501	0.34
502	0.31
503	0.27
504	0.28
505	0.27
506	0.2
507	0.14
508	0.14
509	0.14
510	0.14
511	0.13
512	0.11
513	0.09
514	0.1
515	0.13
516	0.12
517	0.13
518	0.14
519	0.17
520	0.2
521	0.26
522	0.31
523	0.31
524	0.3
525	0.32
526	0.33
527	0.3
528	0.27
529	0.22
530	0.17
531	0.17
532	0.2
533	0.2
534	0.27
535	0.35
536	0.41
537	0.45
538	0.49
539	0.56
540	0.62
541	0.7
542	0.68
543	0.69
544	0.69
545	0.69
546	0.69
547	0.63
548	0.54
549	0.45
550	0.4
551	0.3
552	0.24
553	0.19
554	0.16
555	0.13
556	0.18
557	0.17
558	0.16
559	0.19
560	0.24
561	0.27
562	0.3
563	0.35
564	0.31
565	0.33
566	0.34
567	0.34
568	0.36
569	0.34
570	0.34
571	0.3
572	0.29
573	0.28
574	0.26
575	0.22
576	0.15
577	0.12
578	0.07
579	0.05
580	0.05
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.05
589	0.05
590	0.06
591	0.07
592	0.11
593	0.12
594	0.12
595	0.12
596	0.11
597	0.11
598	0.11
599	0.1
600	0.06
601	0.06
602	0.05
603	0.05
604	0.05
605	0.05
606	0.04
607	0.04
608	0.04
609	0.05
610	0.06
611	0.06
612	0.06
613	0.06
614	0.07
615	0.07
616	0.07
617	0.08
618	0.06
619	0.07
620	0.07
621	0.09
622	0.1
623	0.11
624	0.13
625	0.14
626	0.15
627	0.15
628	0.15
629	0.13
630	0.14
631	0.19
632	0.21
633	0.22
634	0.22
635	0.22
636	0.22
637	0.22
638	0.2
639	0.16
640	0.14
641	0.12
642	0.19
643	0.21
644	0.21
645	0.22
646	0.23
647	0.21
648	0.2
649	0.19
650	0.12
651	0.1
652	0.09
653	0.09
654	0.08
655	0.08
656	0.07
657	0.07
658	0.06
659	0.06
660	0.07
661	0.08
662	0.08
663	0.09
664	0.09
665	0.09
666	0.09
667	0.08
668	0.08
669	0.08
670	0.08
671	0.07
672	0.08
673	0.09
674	0.1
675	0.12
676	0.11
677	0.1
678	0.12
679	0.14
680	0.21
681	0.23
682	0.24
683	0.23
684	0.23
685	0.26
686	0.25
687	0.24
688	0.16
689	0.14
690	0.16
691	0.16
692	0.16
693	0.12
694	0.1
695	0.09
696	0.09
697	0.08
698	0.04
699	0.05
700	0.04
701	0.05
702	0.05
703	0.05
704	0.05
705	0.05
706	0.06
707	0.1
708	0.12
709	0.17
710	0.21
711	0.24
712	0.31
713	0.35
714	0.35
715	0.39
716	0.45
717	0.49
718	0.54
719	0.61
720	0.64
721	0.7
722	0.78
723	0.79
724	0.77
725	0.73
726	0.67
727	0.61
728	0.59
729	0.56
730	0.51
731	0.43
732	0.42
733	0.37
734	0.37
735	0.34
736	0.26
737	0.2
738	0.19
739	0.17
740	0.14
741	0.16
742	0.14
743	0.16
744	0.19
745	0.2
746	0.21
747	0.22
748	0.22
749	0.23
750	0.23
751	0.2
752	0.17
753	0.13
754	0.1
755	0.1
756	0.08
757	0.05
758	0.05
759	0.04
760	0.04
761	0.11
762	0.13
763	0.15
764	0.16
765	0.2
766	0.22
767	0.24
768	0.3
769	0.29
770	0.29
771	0.31
772	0.31
773	0.29
774	0.28
775	0.26
776	0.19
777	0.14
778	0.13
779	0.1
780	0.08
781	0.07
782	0.07
783	0.08
784	0.13
785	0.15
786	0.15
787	0.14
788	0.18
789	0.2
790	0.26
791	0.27
792	0.27
793	0.29
794	0.34
795	0.4
796	0.4
797	0.39
798	0.35
799	0.34
800	0.32
801	0.36
802	0.34
803	0.36
804	0.37
805	0.39
806	0.36
807	0.37
808	0.36
809	0.3
810	0.26
811	0.18
812	0.15
813	0.19
814	0.2
815	0.2
816	0.19
817	0.18
818	0.19
819	0.19
820	0.18
821	0.12
822	0.12
823	0.14
824	0.18
825	0.19
826	0.18
827	0.18
828	0.19
829	0.19
830	0.19
831	0.17
832	0.15
833	0.15
834	0.22
835	0.23
836	0.23
837	0.22
838	0.21
839	0.19
840	0.22
841	0.21
842	0.13
843	0.13
844	0.12
845	0.12
846	0.13
847	0.15
848	0.15
849	0.17
850	0.17
851	0.21
852	0.23
853	0.25
854	0.3
855	0.35
856	0.41
857	0.45
858	0.5
859	0.48
860	0.46
861	0.45
862	0.41
863	0.38
864	0.27
865	0.23
866	0.2
867	0.18
868	0.19
869	0.18
870	0.17
871	0.14
872	0.14
873	0.13
874	0.1
875	0.1
876	0.09
877	0.11
878	0.13
879	0.12
880	0.14
881	0.15
882	0.16
883	0.17
884	0.17
885	0.17
886	0.16
887	0.15
888	0.13
889	0.13
890	0.13
891	0.13
892	0.14
893	0.14
894	0.14
895	0.15
896	0.15
897	0.15
898	0.14
899	0.14
900	0.15
901	0.15
902	0.13
903	0.13
904	0.17
905	0.2
906	0.2
907	0.22
908	0.23
909	0.25
910	0.29
911	0.36
912	0.39
913	0.4
914	0.42
915	0.43
916	0.42
917	0.4
918	0.38
919	0.35
920	0.3
921	0.27
922	0.25
923	0.23
924	0.19
925	0.18
926	0.17
927	0.13
928	0.09
929	0.09
930	0.09
931	0.08
932	0.09
933	0.09
934	0.08
935	0.1
936	0.12
937	0.11
938	0.15
939	0.19
940	0.19
941	0.2
942	0.2
943	0.19
944	0.19
945	0.18
946	0.15
947	0.18
948	0.21
949	0.22
950	0.22
951	0.23
952	0.26
953	0.29
954	0.29
955	0.23
956	0.18
957	0.18
958	0.18
959	0.18
960	0.18
961	0.23
962	0.24
963	0.33
964	0.35
965	0.39
966	0.41
967	0.41
968	0.4

A0A0C2YL37

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer