FuNGI

A0A0C3CBN2

Protein Details

Accession

A0A0C3CBN2

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-28	SMALLFHPKKNNKPDTQTPTPKL	Hydrophilic
162-183	KGKAGAAKKRFQRKTRQVFFVP	Hydrophilic
583-606	TVNGNPIPKAKKRKAPPTGAAPVT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
37-43	SPNPRRK
155-175	GPSKEKEKGKAGAAKKRFQRK
591-597	KAKKRKA

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MAPKASMALLFHPKKNNKPDTQTPTPKLDPPKPGAGSPNPRRKTLPSPKREEEEEDLKLPDGPYQEFRLLSSVLNGWKYDVMKFDSRRPVDIFRWTQPIKLNRKDMRRDEGPSNVLPEAVGPMLGTDGKPVMGSDGKIVMVDAEGRPIQANGGAGPSKEKEKGKAGAAKKRFQRKTRQVFFVPEEVRQLRREERYPWVMEDSSTAQNEVWVGQMEDASKSDTHAFFMPAANDVFKFVPAHRWYKFQKRLKHDLPTDTANVESLYNLNQKRDPQAWLASRKGKGPSSATVAMFKAEAEGRPLAGGSSLVHSSGQSLGPGGRKLKTVDSGMDHLFEDDEDGGDGARRRRNRELGEEGDLDEQVYENDFADDEEHMEVDENDEEAKELEERLKKEYKSANKQRDTGVDESDEETEEPKTSKQAKAMQKLIRNREDNEAYASDDEKNPYATSEEEEEEEPPIVETAGSAIQQQQRQVESRAQTPKPVPARPTGVTSPNSRATSPTLSPGHGGHSVVAKRATSPKIPKPKTTNTSRGNSPLGGQSTLTGSRGTSPVAEARNGVASPKTGTKRKADDTPTTSSTQPATTVNGNPIPKAKKRKAPPTGAAPVTISSADLEAALLNWLKNTTNATTRDCIHHFTPYLTDQEKKAEFSNMVRKHAQLRNSILVLRTRGGSSAPSPPAN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.69
3	0.73
4	0.72
5	0.76
6	0.81
7	0.8
8	0.84
9	0.85
10	0.79
11	0.78
12	0.73
13	0.71
14	0.7
15	0.68
16	0.66
17	0.61
18	0.66
19	0.6
20	0.59
21	0.6
22	0.6
23	0.63
24	0.65
25	0.7
26	0.64
27	0.64
28	0.66
29	0.65
30	0.66
31	0.67
32	0.67
33	0.67
34	0.73
35	0.77
36	0.78
37	0.75
38	0.71
39	0.67
40	0.63
41	0.57
42	0.5
43	0.44
44	0.39
45	0.37
46	0.31
47	0.26
48	0.22
49	0.21
50	0.22
51	0.26
52	0.28
53	0.26
54	0.27
55	0.27
56	0.25
57	0.22
58	0.2
59	0.2
60	0.2
61	0.22
62	0.21
63	0.2
64	0.22
65	0.23
66	0.23
67	0.23
68	0.25
69	0.31
70	0.34
71	0.42
72	0.48
73	0.49
74	0.51
75	0.51
76	0.52
77	0.48
78	0.55
79	0.52
80	0.46
81	0.54
82	0.5
83	0.5
84	0.51
85	0.56
86	0.56
87	0.59
88	0.65
89	0.63
90	0.72
91	0.78
92	0.77
93	0.76
94	0.72
95	0.69
96	0.64
97	0.63
98	0.58
99	0.49
100	0.46
101	0.37
102	0.31
103	0.25
104	0.21
105	0.16
106	0.11
107	0.1
108	0.06
109	0.06
110	0.07
111	0.08
112	0.07
113	0.07
114	0.07
115	0.07
116	0.08
117	0.07
118	0.1
119	0.11
120	0.12
121	0.12
122	0.13
123	0.13
124	0.13
125	0.13
126	0.09
127	0.08
128	0.1
129	0.08
130	0.1
131	0.1
132	0.11
133	0.11
134	0.11
135	0.11
136	0.1
137	0.11
138	0.08
139	0.11
140	0.11
141	0.11
142	0.14
143	0.15
144	0.18
145	0.23
146	0.25
147	0.26
148	0.32
149	0.36
150	0.4
151	0.47
152	0.51
153	0.55
154	0.59
155	0.62
156	0.64
157	0.7
158	0.72
159	0.71
160	0.75
161	0.76
162	0.81
163	0.82
164	0.81
165	0.74
166	0.72
167	0.68
168	0.65
169	0.56
170	0.46
171	0.44
172	0.39
173	0.37
174	0.33
175	0.34
176	0.31
177	0.35
178	0.38
179	0.35
180	0.4
181	0.44
182	0.44
183	0.42
184	0.4
185	0.34
186	0.31
187	0.29
188	0.26
189	0.23
190	0.21
191	0.2
192	0.15
193	0.16
194	0.16
195	0.13
196	0.1
197	0.07
198	0.07
199	0.07
200	0.08
201	0.08
202	0.09
203	0.09
204	0.1
205	0.09
206	0.1
207	0.14
208	0.13
209	0.14
210	0.14
211	0.15
212	0.14
213	0.15
214	0.15
215	0.13
216	0.13
217	0.12
218	0.11
219	0.11
220	0.11
221	0.1
222	0.11
223	0.1
224	0.18
225	0.21
226	0.27
227	0.27
228	0.34
229	0.39
230	0.48
231	0.58
232	0.57
233	0.62
234	0.65
235	0.73
236	0.73
237	0.76
238	0.7
239	0.65
240	0.61
241	0.55
242	0.48
243	0.38
244	0.32
245	0.23
246	0.19
247	0.13
248	0.1
249	0.07
250	0.09
251	0.14
252	0.15
253	0.17
254	0.19
255	0.21
256	0.25
257	0.27
258	0.27
259	0.24
260	0.29
261	0.33
262	0.36
263	0.39
264	0.41
265	0.4
266	0.41
267	0.42
268	0.36
269	0.34
270	0.32
271	0.29
272	0.29
273	0.31
274	0.28
275	0.27
276	0.25
277	0.22
278	0.19
279	0.16
280	0.11
281	0.09
282	0.08
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.08
287	0.09
288	0.07
289	0.06
290	0.06
291	0.04
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.07
298	0.08
299	0.08
300	0.06
301	0.06
302	0.08
303	0.09
304	0.12
305	0.13
306	0.12
307	0.14
308	0.16
309	0.17
310	0.18
311	0.18
312	0.18
313	0.18
314	0.2
315	0.18
316	0.18
317	0.16
318	0.13
319	0.11
320	0.09
321	0.08
322	0.05
323	0.05
324	0.04
325	0.04
326	0.03
327	0.05
328	0.07
329	0.1
330	0.15
331	0.18
332	0.23
333	0.28
334	0.35
335	0.37
336	0.42
337	0.45
338	0.43
339	0.44
340	0.4
341	0.35
342	0.29
343	0.25
344	0.18
345	0.12
346	0.09
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.06
363	0.06
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.05
371	0.05
372	0.1
373	0.14
374	0.15
375	0.2
376	0.26
377	0.25
378	0.31
379	0.38
380	0.43
381	0.5
382	0.59
383	0.64
384	0.63
385	0.66
386	0.62
387	0.59
388	0.54
389	0.45
390	0.37
391	0.28
392	0.24
393	0.23
394	0.21
395	0.16
396	0.12
397	0.11
398	0.09
399	0.09
400	0.09
401	0.08
402	0.14
403	0.18
404	0.2
405	0.25
406	0.33
407	0.41
408	0.48
409	0.55
410	0.55
411	0.58
412	0.63
413	0.66
414	0.65
415	0.59
416	0.54
417	0.53
418	0.49
419	0.43
420	0.39
421	0.32
422	0.25
423	0.23
424	0.21
425	0.16
426	0.15
427	0.16
428	0.13
429	0.14
430	0.12
431	0.12
432	0.12
433	0.11
434	0.12
435	0.13
436	0.13
437	0.14
438	0.14
439	0.14
440	0.14
441	0.13
442	0.11
443	0.08
444	0.08
445	0.06
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.11
453	0.15
454	0.17
455	0.2
456	0.21
457	0.23
458	0.25
459	0.27
460	0.29
461	0.27
462	0.33
463	0.39
464	0.37
465	0.4
466	0.4
467	0.45
468	0.46
469	0.47
470	0.43
471	0.39
472	0.45
473	0.41
474	0.45
475	0.4
476	0.39
477	0.38
478	0.39
479	0.39
480	0.4
481	0.4
482	0.34
483	0.33
484	0.31
485	0.34
486	0.31
487	0.33
488	0.27
489	0.26
490	0.28
491	0.26
492	0.26
493	0.22
494	0.22
495	0.16
496	0.2
497	0.2
498	0.21
499	0.22
500	0.19
501	0.2
502	0.26
503	0.29
504	0.31
505	0.38
506	0.45
507	0.55
508	0.59
509	0.65
510	0.66
511	0.73
512	0.73
513	0.74
514	0.75
515	0.71
516	0.72
517	0.68
518	0.65
519	0.57
520	0.49
521	0.42
522	0.37
523	0.32
524	0.27
525	0.23
526	0.19
527	0.19
528	0.2
529	0.19
530	0.14
531	0.11
532	0.13
533	0.14
534	0.14
535	0.11
536	0.12
537	0.17
538	0.18
539	0.19
540	0.17
541	0.17
542	0.2
543	0.19
544	0.18
545	0.14
546	0.13
547	0.16
548	0.23
549	0.29
550	0.32
551	0.37
552	0.44
553	0.5
554	0.55
555	0.61
556	0.6
557	0.62
558	0.61
559	0.63
560	0.59
561	0.54
562	0.49
563	0.42
564	0.37
565	0.28
566	0.25
567	0.2
568	0.19
569	0.2
570	0.22
571	0.25
572	0.3
573	0.3
574	0.29
575	0.35
576	0.39
577	0.43
578	0.52
579	0.55
580	0.59
581	0.68
582	0.78
583	0.8
584	0.83
585	0.82
586	0.81
587	0.81
588	0.72
589	0.64
590	0.54
591	0.45
592	0.37
593	0.29
594	0.2
595	0.12
596	0.11
597	0.09
598	0.08
599	0.07
600	0.06
601	0.06
602	0.08
603	0.08
604	0.08
605	0.09
606	0.1
607	0.1
608	0.12
609	0.16
610	0.18
611	0.24
612	0.28
613	0.33
614	0.35
615	0.37
616	0.42
617	0.41
618	0.42
619	0.37
620	0.4
621	0.36
622	0.34
623	0.36
624	0.32
625	0.37
626	0.35
627	0.36
628	0.31
629	0.38
630	0.38
631	0.36
632	0.36
633	0.34
634	0.33
635	0.38
636	0.47
637	0.44
638	0.48
639	0.48
640	0.48
641	0.53
642	0.56
643	0.54
644	0.51
645	0.53
646	0.54
647	0.54
648	0.53
649	0.47
650	0.47
651	0.44
652	0.38
653	0.33
654	0.27
655	0.25
656	0.24
657	0.24
658	0.22
659	0.28

A0A0C3CBN2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer