Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3CAL6

Protein Details
Accession A0A0C3CAL6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
132-152DKEDARKESQWERRFRRKRKMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-152SRRFRSAQEAKDKEDARKESQWERRFRRKRKM
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 13.5, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR004859  Xrn1_N  
Gene Ontology GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03159  XRN_N  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSKKYPKIIYPVQEEEEIKVPDENGDNITVPLNISLPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEEEMMVEVFKYTERVVNMIRPRKLLFMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKDKEDARKESQWERRFRRKRKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.57
3 0.61
4 0.64
5 0.63
6 0.61
7 0.59
8 0.55
9 0.5
10 0.47
11 0.42
12 0.4
13 0.34
14 0.27
15 0.22
16 0.2
17 0.18
18 0.19
19 0.17
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.13
24 0.13
25 0.11
26 0.1
27 0.09
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.11
32 0.11
33 0.13
34 0.14
35 0.14
36 0.15
37 0.15
38 0.16
39 0.14
40 0.15
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.1
45 0.09
46 0.07
47 0.06
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.06
54 0.09
55 0.1
56 0.1
57 0.14
58 0.17
59 0.19
60 0.21
61 0.21
62 0.21
63 0.2
64 0.22
65 0.18
66 0.16
67 0.13
68 0.12
69 0.11
70 0.08
71 0.07
72 0.05
73 0.05
74 0.04
75 0.05
76 0.05
77 0.08
78 0.08
79 0.1
80 0.11
81 0.18
82 0.26
83 0.32
84 0.33
85 0.33
86 0.34
87 0.34
88 0.34
89 0.3
90 0.23
91 0.18
92 0.18
93 0.16
94 0.16
95 0.14
96 0.14
97 0.12
98 0.11
99 0.08
100 0.09
101 0.14
102 0.22
103 0.31
104 0.4
105 0.5
106 0.61
107 0.69
108 0.76
109 0.78
110 0.74
111 0.71
112 0.72
113 0.73
114 0.71
115 0.74
116 0.68
117 0.65
118 0.7
119 0.66
120 0.6
121 0.59
122 0.55
123 0.51
124 0.53
125 0.54
126 0.56
127 0.64
128 0.67
129 0.68
130 0.73
131 0.77
132 0.82