Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3C4F1

Protein Details
Accession A0A0C3C4F1    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-59PSSSHNAHHPPPPKKRKKNNQKAKQHKNASNSTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-51PPPPKKRKKNNQKAKQH
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5, mito 1, pero 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MMAATRPVVSYDDITLPYDQPDELQPSSSHNAHHPPPPKKRKKNNQKAKQHKNASNSTSQRAEFLNSTGGSSKQPPEGEKWDADDYGNEDEDGGEGEESRELTHEEIWDDSALVNAWEAATEEYEAYHGPDKGWKGEPVKKSPLWYNVPVASSTKDVKAGASSSTNVPSATALEPDSQPLNFDTFVPTHDPSLDIPTGLASDQLPVPDTMYIPAAGESAVVSQDEAFSRALNAMYWGGYWTAIYHAQRQLATQSTALNAPSGAVGGAVAAEEEEEDEDLEQIEIDVDDFTSTQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.22
3 0.2
4 0.2
5 0.19
6 0.16
7 0.15
8 0.17
9 0.21
10 0.2
11 0.22
12 0.2
13 0.25
14 0.3
15 0.3
16 0.28
17 0.28
18 0.34
19 0.35
20 0.42
21 0.47
22 0.51
23 0.61
24 0.7
25 0.77
26 0.82
27 0.89
28 0.93
29 0.95
30 0.96
31 0.96
32 0.95
33 0.95
34 0.96
35 0.96
36 0.95
37 0.93
38 0.88
39 0.85
40 0.83
41 0.76
42 0.75
43 0.68
44 0.62
45 0.56
46 0.5
47 0.44
48 0.36
49 0.34
50 0.25
51 0.23
52 0.22
53 0.18
54 0.19
55 0.18
56 0.18
57 0.17
58 0.2
59 0.21
60 0.2
61 0.22
62 0.23
63 0.27
64 0.32
65 0.34
66 0.31
67 0.33
68 0.3
69 0.29
70 0.27
71 0.22
72 0.19
73 0.18
74 0.17
75 0.13
76 0.11
77 0.1
78 0.1
79 0.09
80 0.07
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.03
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.11
118 0.12
119 0.15
120 0.17
121 0.2
122 0.23
123 0.3
124 0.34
125 0.37
126 0.42
127 0.4
128 0.4
129 0.4
130 0.42
131 0.4
132 0.37
133 0.34
134 0.3
135 0.29
136 0.27
137 0.24
138 0.18
139 0.16
140 0.16
141 0.13
142 0.13
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.11
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.1
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.09
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.12
173 0.15
174 0.14
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.13
179 0.17
180 0.16
181 0.12
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.08
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.09
229 0.13
230 0.15
231 0.2
232 0.23
233 0.26
234 0.26
235 0.27
236 0.28
237 0.27
238 0.28
239 0.23
240 0.21
241 0.19
242 0.21
243 0.2
244 0.16
245 0.12
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06