FuNGI

A0A0C2YCU9

Protein Details

Accession

A0A0C2YCU9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
190-215	PTSVIGSHKRRSRRPPAQKRDWAHVI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
198-206	KRRSRRPPA
482-488	RGGPPAR

Subcellular Location(s)

cyto 12.5, cyto_nucl 11.5, nucl 9.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006401 P:RNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MDISLRDESIDQIVYPQPEGASKILEGLHLASFPSTSEIHEDIEKLLLSPPRAVPDYWLSSYQTPTTRNPTGLTSTSLNRPPGPNKNFVRGKSGYVPFWPGGFDDVDTASSDAKNLGKEAKGLRSIPPGFSRGLRLPGDPVEDEELVAIEEEETGGLDDTDDLGSAADGPPDEYSDITLDRSHGVDDLLPTSVIGSHKRRSRRPPAQKRDWAHVIDVNTPLSNFHELVPEMAHKYPFELDTFQKQAVYHLEMGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAEKHMTRAIYTSPIKALSNQKFRDFKQTFSSSSVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYKGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDAERGVVWEEVIIMLPDHVNIILLSATVPNTKEFADWVGRTKKKDIYVISTAHRPVPLEHYLYAGREMYKIVDAQRNFLALGYKEAGEALRRKQDKEREAAGLPPVQRVGARGAAPAQRGQQRGGPPARGGRTAVPAPRSGAPQRMMHAATDKNIYVHLLGHLRKKSLLPVVVFTFSKKRCEENAATLTNADLCTSVEKSEVHVAIEKALSRLKGPDRKLPQILRTRDLLSRGIGIHHGGLLPLVKELVEILFARGLVKILFATETFAMGVNMPAKCVVFSNIRKHDGRNFREILPGEYTQMAGRAGRRGLDPTGTVIIVSNESLPEQTTLHTMMLGIPGKLSSQFRLTYNMILNLLRVEALRVEEMIKRSFSENSSQRLLPEQQRKVTESEKLLSVMPKLDCNICLPDIDLYYDETLEIVEKNRRLLEITLRYPEGSKILNAGRVVVLRDGHFRHNNLGIILRQAPIPALDAGILAKVKTYFVLAWVDPETKAGRADVDMEAVPPMWPLTPSSLNIKDGVYELRAVPFSSIVMITSRVIKVNVNDIVDRHLISRMKEVIASLQTFVQELSTTATIPEVDWSRLRALEFQELLRSRDSVAEKLGKRHQLCPSFPEHQNIAYLKLAISDQNLELIPDYEQRIGVLKDLKFIDQNSTIQLKGRVACEINSANELILTELILENTLASYEPEEVVALLSCFVFQEKTDVEPLLSPKLEEGRDAILAIADRVGRIQDFHKVAAEDFRSDLKFGLVEVVYEWAKGMPFEQITSLTDVAEGTIVRVITRLDETCREVRDAARVIGDAELFRKMEDSQTKIKRDIVFAASLYF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.19
3	0.19
4	0.17
5	0.18
6	0.21
7	0.19
8	0.17
9	0.16
10	0.18
11	0.17
12	0.17
13	0.16
14	0.15
15	0.15
16	0.13
17	0.13
18	0.11
19	0.1
20	0.1
21	0.12
22	0.11
23	0.11
24	0.16
25	0.17
26	0.19
27	0.2
28	0.21
29	0.19
30	0.21
31	0.19
32	0.15
33	0.18
34	0.2
35	0.2
36	0.24
37	0.25
38	0.29
39	0.31
40	0.3
41	0.3
42	0.34
43	0.39
44	0.37
45	0.37
46	0.35
47	0.35
48	0.38
49	0.39
50	0.37
51	0.34
52	0.37
53	0.43
54	0.43
55	0.43
56	0.42
57	0.41
58	0.41
59	0.39
60	0.37
61	0.33
62	0.33
63	0.38
64	0.41
65	0.41
66	0.39
67	0.43
68	0.47
69	0.54
70	0.56
71	0.59
72	0.58
73	0.65
74	0.68
75	0.64
76	0.64
77	0.55
78	0.56
79	0.55
80	0.55
81	0.47
82	0.42
83	0.45
84	0.38
85	0.36
86	0.31
87	0.22
88	0.2
89	0.18
90	0.16
91	0.12
92	0.12
93	0.13
94	0.13
95	0.13
96	0.12
97	0.11
98	0.11
99	0.13
100	0.14
101	0.14
102	0.15
103	0.19
104	0.19
105	0.24
106	0.28
107	0.32
108	0.36
109	0.36
110	0.38
111	0.43
112	0.44
113	0.44
114	0.43
115	0.39
116	0.35
117	0.35
118	0.37
119	0.32
120	0.36
121	0.33
122	0.31
123	0.32
124	0.32
125	0.35
126	0.29
127	0.28
128	0.25
129	0.24
130	0.22
131	0.19
132	0.16
133	0.12
134	0.12
135	0.09
136	0.05
137	0.05
138	0.05
139	0.04
140	0.04
141	0.05
142	0.05
143	0.05
144	0.05
145	0.05
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.05
150	0.05
151	0.05
152	0.06
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.07
157	0.08
158	0.09
159	0.1
160	0.09
161	0.1
162	0.11
163	0.12
164	0.12
165	0.12
166	0.12
167	0.13
168	0.13
169	0.13
170	0.11
171	0.11
172	0.11
173	0.12
174	0.12
175	0.12
176	0.11
177	0.1
178	0.1
179	0.12
180	0.13
181	0.18
182	0.23
183	0.29
184	0.36
185	0.45
186	0.54
187	0.61
188	0.7
189	0.75
190	0.81
191	0.85
192	0.89
193	0.92
194	0.92
195	0.86
196	0.84
197	0.79
198	0.7
199	0.62
200	0.55
201	0.46
202	0.4
203	0.37
204	0.3
205	0.23
206	0.21
207	0.19
208	0.17
209	0.18
210	0.15
211	0.14
212	0.17
213	0.16
214	0.17
215	0.18
216	0.18
217	0.18
218	0.19
219	0.2
220	0.16
221	0.17
222	0.19
223	0.18
224	0.18
225	0.18
226	0.2
227	0.26
228	0.29
229	0.27
230	0.27
231	0.26
232	0.27
233	0.28
234	0.28
235	0.22
236	0.2
237	0.2
238	0.18
239	0.18
240	0.15
241	0.11
242	0.07
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.07
251	0.08
252	0.08
253	0.07
254	0.08
255	0.08
256	0.08
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.06
263	0.06
264	0.09
265	0.09
266	0.1
267	0.11
268	0.11
269	0.11
270	0.13
271	0.14
272	0.19
273	0.2
274	0.21
275	0.21
276	0.23
277	0.23
278	0.27
279	0.35
280	0.36
281	0.45
282	0.46
283	0.52
284	0.55
285	0.56
286	0.62
287	0.54
288	0.48
289	0.47
290	0.48
291	0.43
292	0.42
293	0.41
294	0.3
295	0.29
296	0.26
297	0.18
298	0.13
299	0.11
300	0.08
301	0.09
302	0.09
303	0.08
304	0.09
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.08
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.06
317	0.07
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.09
323	0.12
324	0.11
325	0.1
326	0.11
327	0.14
328	0.15
329	0.14
330	0.15
331	0.13
332	0.13
333	0.13
334	0.12
335	0.09
336	0.09
337	0.1
338	0.08
339	0.07
340	0.09
341	0.09
342	0.09
343	0.1
344	0.09
345	0.08
346	0.1
347	0.1
348	0.07
349	0.07
350	0.09
351	0.09
352	0.09
353	0.09
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.05
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.05
372	0.06
373	0.07
374	0.08
375	0.08
376	0.09
377	0.09
378	0.09
379	0.09
380	0.12
381	0.15
382	0.16
383	0.22
384	0.3
385	0.33
386	0.36
387	0.39
388	0.41
389	0.4
390	0.45
391	0.41
392	0.38
393	0.4
394	0.41
395	0.39
396	0.39
397	0.36
398	0.32
399	0.3
400	0.23
401	0.2
402	0.22
403	0.23
404	0.21
405	0.2
406	0.21
407	0.21
408	0.21
409	0.21
410	0.16
411	0.13
412	0.11
413	0.12
414	0.1
415	0.1
416	0.11
417	0.13
418	0.18
419	0.18
420	0.2
421	0.2
422	0.2
423	0.19
424	0.18
425	0.17
426	0.11
427	0.14
428	0.12
429	0.12
430	0.11
431	0.11
432	0.11
433	0.12
434	0.15
435	0.16
436	0.23
437	0.24
438	0.27
439	0.34
440	0.43
441	0.44
442	0.47
443	0.47
444	0.42
445	0.41
446	0.41
447	0.36
448	0.31
449	0.26
450	0.21
451	0.18
452	0.15
453	0.14
454	0.13
455	0.13
456	0.13
457	0.13
458	0.12
459	0.15
460	0.18
461	0.19
462	0.19
463	0.21
464	0.23
465	0.24
466	0.24
467	0.26
468	0.26
469	0.33
470	0.34
471	0.31
472	0.27
473	0.31
474	0.32
475	0.28
476	0.27
477	0.21
478	0.23
479	0.24
480	0.25
481	0.22
482	0.21
483	0.22
484	0.22
485	0.24
486	0.21
487	0.24
488	0.24
489	0.24
490	0.24
491	0.26
492	0.24
493	0.21
494	0.23
495	0.19
496	0.17
497	0.18
498	0.16
499	0.13
500	0.13
501	0.12
502	0.09
503	0.09
504	0.09
505	0.12
506	0.15
507	0.21
508	0.22
509	0.22
510	0.23
511	0.23
512	0.24
513	0.24
514	0.25
515	0.19
516	0.21
517	0.22
518	0.23
519	0.22
520	0.2
521	0.23
522	0.21
523	0.26
524	0.24
525	0.26
526	0.26
527	0.33
528	0.34
529	0.34
530	0.38
531	0.34
532	0.33
533	0.29
534	0.27
535	0.21
536	0.19
537	0.11
538	0.06
539	0.05
540	0.07
541	0.07
542	0.07
543	0.08
544	0.08
545	0.09
546	0.13
547	0.13
548	0.12
549	0.13
550	0.13
551	0.13
552	0.14
553	0.12
554	0.1
555	0.11
556	0.11
557	0.09
558	0.13
559	0.19
560	0.25
561	0.27
562	0.34
563	0.38
564	0.43
565	0.48
566	0.47
567	0.48
568	0.5
569	0.5
570	0.44
571	0.41
572	0.39
573	0.35
574	0.34
575	0.28
576	0.19
577	0.18
578	0.16
579	0.14
580	0.12
581	0.11
582	0.08
583	0.07
584	0.07
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.05
589	0.04
590	0.04
591	0.04
592	0.03
593	0.04
594	0.03
595	0.04
596	0.04
597	0.05
598	0.05
599	0.05
600	0.06
601	0.06
602	0.06
603	0.05
604	0.05
605	0.04
606	0.04
607	0.05
608	0.04
609	0.06
610	0.05
611	0.06
612	0.06
613	0.06
614	0.06
615	0.05
616	0.06
617	0.08
618	0.08
619	0.08
620	0.08
621	0.08
622	0.08
623	0.08
624	0.1
625	0.15
626	0.2
627	0.29
628	0.33
629	0.38
630	0.39
631	0.4
632	0.46
633	0.49
634	0.47
635	0.45
636	0.43
637	0.39
638	0.43
639	0.42
640	0.36
641	0.3
642	0.26
643	0.2
644	0.18
645	0.18
646	0.13
647	0.13
648	0.11
649	0.08
650	0.09
651	0.1
652	0.1
653	0.11
654	0.11
655	0.13
656	0.13
657	0.13
658	0.12
659	0.12
660	0.12
661	0.11
662	0.1
663	0.08
664	0.08
665	0.07
666	0.07
667	0.06
668	0.05
669	0.05
670	0.05
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.08
676	0.09
677	0.08
678	0.08
679	0.08
680	0.07
681	0.11
682	0.11
683	0.09
684	0.08
685	0.08
686	0.09
687	0.11
688	0.12
689	0.09
690	0.12
691	0.14
692	0.15
693	0.2
694	0.21
695	0.22
696	0.22
697	0.22
698	0.2
699	0.18
700	0.17
701	0.12
702	0.11
703	0.08
704	0.07
705	0.06
706	0.05
707	0.06
708	0.06
709	0.06
710	0.08
711	0.1
712	0.12
713	0.14
714	0.13
715	0.14
716	0.15
717	0.17
718	0.17
719	0.23
720	0.25
721	0.28
722	0.31
723	0.3
724	0.29
725	0.31
726	0.34
727	0.34
728	0.39
729	0.4
730	0.41
731	0.43
732	0.45
733	0.44
734	0.42
735	0.38
736	0.32
737	0.29
738	0.25
739	0.24
740	0.23
741	0.2
742	0.19
743	0.18
744	0.16
745	0.15
746	0.15
747	0.15
748	0.15
749	0.16
750	0.17
751	0.13
752	0.13
753	0.12
754	0.12
755	0.12
756	0.12
757	0.1
758	0.09
759	0.09
760	0.09
761	0.08
762	0.07
763	0.06
764	0.06
765	0.06
766	0.08
767	0.12
768	0.13
769	0.15
770	0.16
771	0.16
772	0.18
773	0.19
774	0.25
775	0.28
776	0.3
777	0.31
778	0.31
779	0.31
780	0.3
781	0.29
782	0.22
783	0.16
784	0.13
785	0.14
786	0.15
787	0.18
788	0.17
789	0.17
790	0.16
791	0.16
792	0.17
793	0.14
794	0.14
795	0.12
796	0.17
797	0.18
798	0.23
799	0.26
800	0.26
801	0.28
802	0.3
803	0.3
804	0.26
805	0.26
806	0.2
807	0.19
808	0.19
809	0.17
810	0.14
811	0.13
812	0.12
813	0.1
814	0.11
815	0.08
816	0.07
817	0.07
818	0.07
819	0.07
820	0.08
821	0.08
822	0.06
823	0.07
824	0.07
825	0.07
826	0.07
827	0.08
828	0.07
829	0.09
830	0.12
831	0.11
832	0.14
833	0.15
834	0.16
835	0.15
836	0.17
837	0.16
838	0.13
839	0.14
840	0.12
841	0.11
842	0.1
843	0.13
844	0.11
845	0.12
846	0.11
847	0.11
848	0.11
849	0.1
850	0.1
851	0.07
852	0.07
853	0.06
854	0.06
855	0.07
856	0.11
857	0.13
858	0.15
859	0.22
860	0.24
861	0.25
862	0.26
863	0.25
864	0.21
865	0.2
866	0.2
867	0.14
868	0.12
869	0.12
870	0.13
871	0.13
872	0.13
873	0.12
874	0.1
875	0.1
876	0.09
877	0.09
878	0.07
879	0.08
880	0.09
881	0.09
882	0.12
883	0.13
884	0.13
885	0.14
886	0.15
887	0.16
888	0.21
889	0.24
890	0.22
891	0.22
892	0.21
893	0.24
894	0.23
895	0.23
896	0.17
897	0.19
898	0.2
899	0.2
900	0.26
901	0.24
902	0.23
903	0.23
904	0.23
905	0.22
906	0.23
907	0.22
908	0.17
909	0.16
910	0.16
911	0.15
912	0.15
913	0.11
914	0.08
915	0.07
916	0.1
917	0.09
918	0.09
919	0.09
920	0.1
921	0.09
922	0.09
923	0.13
924	0.12
925	0.14
926	0.15
927	0.17
928	0.18
929	0.2
930	0.21
931	0.2
932	0.21
933	0.26
934	0.26
935	0.25
936	0.31
937	0.31
938	0.32
939	0.29
940	0.27
941	0.2
942	0.25
943	0.27
944	0.21
945	0.25
946	0.32
947	0.33
948	0.39
949	0.46
950	0.48
951	0.48
952	0.53
953	0.57
954	0.56
955	0.56
956	0.54
957	0.54
958	0.52
959	0.52
960	0.51
961	0.44
962	0.37
963	0.4
964	0.36
965	0.32
966	0.26
967	0.24
968	0.18
969	0.18
970	0.17
971	0.13
972	0.14
973	0.13
974	0.12
975	0.14
976	0.14
977	0.13
978	0.13
979	0.12
980	0.12
981	0.13
982	0.15
983	0.14
984	0.14
985	0.14
986	0.17
987	0.16
988	0.19
989	0.23
990	0.21
991	0.25
992	0.27
993	0.28
994	0.27
995	0.28
996	0.3
997	0.27
998	0.28
999	0.27
1000	0.28
1001	0.27
1002	0.27
1003	0.29
1004	0.27
1005	0.26
1006	0.27
1007	0.26
1008	0.25
1009	0.25
1010	0.28
1011	0.28
1012	0.25
1013	0.24
1014	0.23
1015	0.18
1016	0.17
1017	0.17
1018	0.12
1019	0.09
1020	0.07
1021	0.06
1022	0.06
1023	0.07
1024	0.07
1025	0.06
1026	0.05
1027	0.05
1028	0.06
1029	0.05
1030	0.05
1031	0.07
1032	0.08
1033	0.08
1034	0.08
1035	0.08
1036	0.08
1037	0.09
1038	0.09
1039	0.08
1040	0.07
1041	0.06
1042	0.06
1043	0.06
1044	0.07
1045	0.07
1046	0.07
1047	0.12
1048	0.13
1049	0.15
1050	0.18
1051	0.18
1052	0.18
1053	0.21
1054	0.24
1055	0.24
1056	0.24
1057	0.21
1058	0.21
1059	0.26
1060	0.26
1061	0.23
1062	0.23
1063	0.2
1064	0.2
1065	0.2
1066	0.18
1067	0.13
1068	0.13
1069	0.12
1070	0.12
1071	0.09
1072	0.09
1073	0.09
1074	0.11
1075	0.1
1076	0.11
1077	0.13
1078	0.2
1079	0.22
1080	0.23
1081	0.26
1082	0.26
1083	0.26
1084	0.32
1085	0.33
1086	0.26
1087	0.25
1088	0.29
1089	0.26
1090	0.26
1091	0.25
1092	0.19
1093	0.16
1094	0.15
1095	0.18
1096	0.14
1097	0.13
1098	0.13
1099	0.16
1100	0.15
1101	0.15
1102	0.15
1103	0.11
1104	0.11
1105	0.11
1106	0.11
1107	0.13
1108	0.14
1109	0.15
1110	0.16
1111	0.17
1112	0.19
1113	0.23
1114	0.22
1115	0.16
1116	0.16
1117	0.14
1118	0.13
1119	0.12
1120	0.1
1121	0.07
1122	0.09
1123	0.09
1124	0.09
1125	0.1
1126	0.1
1127	0.11
1128	0.16
1129	0.17
1130	0.19
1131	0.24
1132	0.3
1133	0.34
1134	0.36
1135	0.36
1136	0.35
1137	0.34
1138	0.38
1139	0.37
1140	0.33
1141	0.3
1142	0.28
1143	0.26
1144	0.25
1145	0.24
1146	0.18
1147	0.15
1148	0.17
1149	0.15
1150	0.15
1151	0.16
1152	0.15
1153	0.22
1154	0.28
1155	0.33
1156	0.39
1157	0.48
1158	0.53
1159	0.55
1160	0.61
1161	0.56
1162	0.53
1163	0.53
1164	0.47
1165	0.42

A0A0C2YCU9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer