Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3CHN7

Protein Details
Accession A0A0C3CHN7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-109AAPSTPQQPKHGRPPKKIKPTLSSSQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-104KHGRPPKKIKPT
112-126HRLGRPPGSGPKQRA
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.833, cyto 4, cyto_mito 3.833, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Amino Acid Sequences MDVDYLDVSTSSTGLPSLDAASGSFMLPTACVPRNLLGSPNLFPFPMDVDISDRVSLLDVEDDHSFSFAPEPEASGATVSLETAAPSTPQQPKHGRPPKKIKPTLSSSQTHHRLGRPPGSGPKQRAKAELLASGRNVSLPKKCPVGWPHKNKDMGGRVMVKLIQGKIQSLPDSSTGPRSSSAPLPSNLNTRSIFQFPVQRTCRASSVPSGHHPFSAQLGPLCHSAGASTPALSTFTSTTPYTSFTNLPPPPSTSSATMPFISHQIIPLEDPQCPVELEDKDDKNPEVSGDGLGDEDEFDVEGDEGDDERDPKEEDSGIQDVTGQCPRCLMPLWLRNAFKVKVTESAQRNENRLLPLYATHQSFWFPQPSMFFILQRKGVSPQHLYNPNAEICALDHSHKIMKHIAKVNGEEVFTALLTVTNQLGEIRSCNLVATKSHAQFEEALKQIQWSLELYGHILPYLFFTDNMADKQFLEHCFPSLSESVVPVEKYQNLEPLVVPDNVPIFIKKSKSAINDAMHTIIDDLPPDDSGAKIVIGFDSEWNVELSGNGNVIERGKTAIIQIAYKEQIYVLQIGDMVQYFTMPPHSMWIPHGMKILNGFHVDSIWNTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.08
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.11
9 0.12
10 0.11
11 0.1
12 0.09
13 0.08
14 0.08
15 0.1
16 0.14
17 0.16
18 0.17
19 0.2
20 0.22
21 0.26
22 0.27
23 0.29
24 0.27
25 0.28
26 0.29
27 0.31
28 0.29
29 0.25
30 0.24
31 0.21
32 0.2
33 0.19
34 0.17
35 0.14
36 0.17
37 0.2
38 0.22
39 0.21
40 0.18
41 0.15
42 0.15
43 0.15
44 0.11
45 0.11
46 0.1
47 0.12
48 0.13
49 0.13
50 0.12
51 0.13
52 0.12
53 0.1
54 0.12
55 0.11
56 0.14
57 0.13
58 0.15
59 0.16
60 0.17
61 0.17
62 0.14
63 0.13
64 0.1
65 0.1
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.09
74 0.16
75 0.22
76 0.26
77 0.34
78 0.42
79 0.49
80 0.59
81 0.68
82 0.7
83 0.74
84 0.82
85 0.84
86 0.87
87 0.88
88 0.85
89 0.82
90 0.81
91 0.79
92 0.75
93 0.7
94 0.63
95 0.65
96 0.64
97 0.61
98 0.58
99 0.53
100 0.54
101 0.56
102 0.59
103 0.52
104 0.5
105 0.55
106 0.59
107 0.61
108 0.6
109 0.62
110 0.63
111 0.62
112 0.62
113 0.56
114 0.53
115 0.48
116 0.48
117 0.41
118 0.35
119 0.34
120 0.31
121 0.27
122 0.23
123 0.22
124 0.19
125 0.23
126 0.25
127 0.28
128 0.31
129 0.31
130 0.37
131 0.44
132 0.52
133 0.55
134 0.61
135 0.66
136 0.69
137 0.72
138 0.65
139 0.66
140 0.62
141 0.54
142 0.49
143 0.45
144 0.38
145 0.36
146 0.35
147 0.28
148 0.25
149 0.22
150 0.21
151 0.18
152 0.19
153 0.19
154 0.21
155 0.21
156 0.18
157 0.19
158 0.17
159 0.19
160 0.18
161 0.22
162 0.2
163 0.2
164 0.2
165 0.2
166 0.21
167 0.23
168 0.27
169 0.25
170 0.25
171 0.29
172 0.3
173 0.34
174 0.32
175 0.32
176 0.27
177 0.26
178 0.28
179 0.26
180 0.26
181 0.22
182 0.28
183 0.26
184 0.35
185 0.36
186 0.37
187 0.38
188 0.38
189 0.38
190 0.33
191 0.32
192 0.29
193 0.31
194 0.31
195 0.35
196 0.37
197 0.35
198 0.34
199 0.32
200 0.27
201 0.24
202 0.22
203 0.17
204 0.13
205 0.14
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.12
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.11
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.1
219 0.09
220 0.1
221 0.08
222 0.08
223 0.11
224 0.11
225 0.12
226 0.12
227 0.14
228 0.14
229 0.15
230 0.16
231 0.15
232 0.24
233 0.24
234 0.26
235 0.24
236 0.26
237 0.27
238 0.29
239 0.29
240 0.23
241 0.24
242 0.25
243 0.25
244 0.23
245 0.2
246 0.17
247 0.17
248 0.16
249 0.13
250 0.11
251 0.1
252 0.09
253 0.1
254 0.14
255 0.13
256 0.12
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.15
265 0.21
266 0.21
267 0.22
268 0.23
269 0.23
270 0.19
271 0.19
272 0.15
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.11
303 0.12
304 0.11
305 0.1
306 0.11
307 0.1
308 0.12
309 0.16
310 0.13
311 0.12
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.14
316 0.14
317 0.18
318 0.23
319 0.28
320 0.33
321 0.33
322 0.34
323 0.37
324 0.35
325 0.3
326 0.26
327 0.23
328 0.22
329 0.25
330 0.31
331 0.3
332 0.33
333 0.37
334 0.37
335 0.39
336 0.35
337 0.35
338 0.29
339 0.27
340 0.24
341 0.18
342 0.17
343 0.18
344 0.2
345 0.18
346 0.16
347 0.15
348 0.16
349 0.18
350 0.19
351 0.18
352 0.15
353 0.15
354 0.16
355 0.17
356 0.2
357 0.19
358 0.19
359 0.19
360 0.22
361 0.23
362 0.23
363 0.22
364 0.23
365 0.25
366 0.26
367 0.28
368 0.28
369 0.33
370 0.39
371 0.39
372 0.36
373 0.36
374 0.32
375 0.28
376 0.25
377 0.17
378 0.11
379 0.14
380 0.13
381 0.11
382 0.11
383 0.12
384 0.16
385 0.17
386 0.19
387 0.23
388 0.25
389 0.3
390 0.37
391 0.4
392 0.39
393 0.4
394 0.4
395 0.35
396 0.32
397 0.25
398 0.18
399 0.14
400 0.1
401 0.09
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.06
406 0.06
407 0.05
408 0.05
409 0.06
410 0.07
411 0.07
412 0.08
413 0.09
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.11
418 0.12
419 0.12
420 0.18
421 0.23
422 0.25
423 0.27
424 0.27
425 0.27
426 0.28
427 0.31
428 0.31
429 0.25
430 0.24
431 0.22
432 0.22
433 0.22
434 0.19
435 0.17
436 0.1
437 0.1
438 0.11
439 0.11
440 0.12
441 0.12
442 0.12
443 0.11
444 0.1
445 0.09
446 0.09
447 0.12
448 0.11
449 0.09
450 0.11
451 0.13
452 0.15
453 0.17
454 0.17
455 0.14
456 0.14
457 0.16
458 0.19
459 0.18
460 0.21
461 0.2
462 0.2
463 0.21
464 0.21
465 0.22
466 0.19
467 0.18
468 0.14
469 0.14
470 0.15
471 0.16
472 0.17
473 0.15
474 0.17
475 0.18
476 0.21
477 0.21
478 0.25
479 0.23
480 0.24
481 0.23
482 0.23
483 0.25
484 0.22
485 0.2
486 0.17
487 0.17
488 0.16
489 0.17
490 0.14
491 0.14
492 0.18
493 0.21
494 0.22
495 0.25
496 0.3
497 0.34
498 0.4
499 0.44
500 0.43
501 0.44
502 0.43
503 0.4
504 0.34
505 0.3
506 0.24
507 0.17
508 0.14
509 0.11
510 0.1
511 0.09
512 0.1
513 0.1
514 0.09
515 0.08
516 0.09
517 0.09
518 0.08
519 0.08
520 0.08
521 0.07
522 0.08
523 0.09
524 0.09
525 0.11
526 0.11
527 0.12
528 0.12
529 0.12
530 0.1
531 0.1
532 0.11
533 0.1
534 0.1
535 0.1
536 0.1
537 0.11
538 0.13
539 0.13
540 0.12
541 0.13
542 0.13
543 0.13
544 0.14
545 0.18
546 0.18
547 0.18
548 0.2
549 0.23
550 0.24
551 0.24
552 0.23
553 0.18
554 0.19
555 0.19
556 0.19
557 0.13
558 0.12
559 0.12
560 0.12
561 0.14
562 0.11
563 0.1
564 0.08
565 0.08
566 0.08
567 0.09
568 0.12
569 0.12
570 0.12
571 0.17
572 0.18
573 0.2
574 0.22
575 0.31
576 0.3
577 0.31
578 0.35
579 0.3
580 0.3
581 0.34
582 0.35
583 0.29
584 0.28
585 0.26
586 0.22
587 0.23
588 0.22