Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BQ88

Protein Details
Accession Q6BQ88    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
162-183AETNIKPTKKKSDSFKNNRKGRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
167-183KPTKKKSDSFKNNRKGR
Subcellular Location(s) nucl 17, mito_nucl 12.666, cyto_nucl 11.666, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG dha:DEHA2E07392g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MNNNSNGIQKSKLNTTKSSDRRLAAGRQPANYLHNAILNQPSNITKVLPKSNTSHLSPETQKTVKRAGGGKIWEDSSLLEWNPKHFRLFVGNLGTDATDELLANAFGKYKTLSKVKVPMDNKTGKNKGYGFVAFESPDDYFQAFKDMNGKYIGQHPVQLKRAETNIKPTKKKSDSFKNNRKGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.52
3 0.59
4 0.63
5 0.66
6 0.62
7 0.56
8 0.56
9 0.56
10 0.56
11 0.53
12 0.55
13 0.5
14 0.46
15 0.47
16 0.45
17 0.43
18 0.37
19 0.32
20 0.23
21 0.23
22 0.21
23 0.21
24 0.25
25 0.23
26 0.21
27 0.21
28 0.2
29 0.19
30 0.19
31 0.18
32 0.15
33 0.19
34 0.26
35 0.27
36 0.29
37 0.31
38 0.38
39 0.41
40 0.4
41 0.39
42 0.34
43 0.37
44 0.37
45 0.36
46 0.35
47 0.34
48 0.34
49 0.32
50 0.36
51 0.32
52 0.33
53 0.33
54 0.3
55 0.32
56 0.32
57 0.3
58 0.27
59 0.25
60 0.21
61 0.18
62 0.15
63 0.12
64 0.12
65 0.1
66 0.12
67 0.12
68 0.16
69 0.19
70 0.2
71 0.19
72 0.17
73 0.18
74 0.2
75 0.22
76 0.21
77 0.2
78 0.19
79 0.18
80 0.18
81 0.17
82 0.12
83 0.1
84 0.06
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.07
96 0.09
97 0.14
98 0.18
99 0.2
100 0.23
101 0.31
102 0.34
103 0.41
104 0.41
105 0.42
106 0.45
107 0.5
108 0.5
109 0.51
110 0.52
111 0.45
112 0.48
113 0.44
114 0.38
115 0.35
116 0.32
117 0.25
118 0.23
119 0.23
120 0.18
121 0.17
122 0.17
123 0.14
124 0.13
125 0.12
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.14
130 0.12
131 0.12
132 0.19
133 0.18
134 0.2
135 0.22
136 0.22
137 0.19
138 0.26
139 0.3
140 0.23
141 0.28
142 0.31
143 0.37
144 0.43
145 0.44
146 0.39
147 0.38
148 0.44
149 0.46
150 0.44
151 0.47
152 0.51
153 0.58
154 0.63
155 0.65
156 0.7
157 0.7
158 0.74
159 0.74
160 0.76
161 0.78
162 0.82
163 0.86