Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3CKY3

Protein Details
Accession A0A0C3CKY3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-106LLDYRPQKSKEPPPKAPQKTHVVLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
900-910PKKSVQAGKKT
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MAGYNRTRSVEQLLEKTESSPPSFTVHLHPEFWVLNNGSKFLYQNQIASLLDDIRGHRIPVDFLELFDLARVPFYDGCMIVELLDYRPQKSKEPPPKAPQKTHVVLHPNSETLWADICSLNQKHGSKWTDMNALEVEAKLLLATSPPLCLDPDPHLTRIVNHVLRVSTPSMPLSLKRKAAAMEPEEDGPEKARRERLLAFMAPRDNKLHTPSYRILDTIASWKQRTNDSAPMPTVPSNQFTALRPQSTQPIRPHSQPPAAPPTPAPAVQAHSPADSIDRKAQKQKKTDTPQTSFNVAFARSNGSHTPIPPQPTHQFVNQHPPTHTTSTGTPAMQPQVYASLQAAQEAAKRSATPSQQLQMHQQQMQLQQQYMQQYHLPSQQQQLQQSQQGQSQQQAQQTQQTQNRPPSQPQQPQAQQQQAAQQAQQRYTQSPKPPAPAAPAQSPQSYPGAPPQFQPPLPTAHFLQQPPTGVRQPQKQHLATGVQQQGVGQPLHPPNASQAQLQQAMLFSQQMQQSQQQLHQQQANLLMQQRMNMVAAQKNSGRATPQMQVQPTQGQGQAHTPQSVAASPSPARASPVVTNQQLAARGSPMPPKAQIPQQQPLGGQQQQHTLTATAAQGMQHRIAFSQYNPSQLRPTIHGNVGQGTPTLAAASPRINARPITPAVGDGKQHQQPQIQQQQAMQIQMQMQMQGQQPIRGPTPLQQAQQQMQAQQMQNAAAAAAAAQAQGQDTQGHGQAQQQQGQQQHQAAPQTQTPVQQAAQGAAAQQIPHYPQIYGYQQFNGGYWRIPGMLPNGTQVTPQQQQQLLQLQQQRQQQQQQGLGVAQGMMGNGQTQQGGQQQFTNLLVQQHRMQQQQAAAAAQQSMLMVGGGGQQGQGMVMGKMHTQTPTQMQAQQAMKGKVAPKKSVQAGKKTGPPQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.41
3 0.41
4 0.4
5 0.37
6 0.34
7 0.3
8 0.27
9 0.27
10 0.28
11 0.28
12 0.3
13 0.34
14 0.34
15 0.34
16 0.33
17 0.33
18 0.33
19 0.32
20 0.32
21 0.26
22 0.29
23 0.29
24 0.29
25 0.27
26 0.27
27 0.27
28 0.24
29 0.3
30 0.25
31 0.26
32 0.26
33 0.28
34 0.26
35 0.26
36 0.24
37 0.17
38 0.17
39 0.17
40 0.17
41 0.2
42 0.21
43 0.2
44 0.22
45 0.22
46 0.22
47 0.22
48 0.28
49 0.22
50 0.21
51 0.25
52 0.22
53 0.2
54 0.19
55 0.18
56 0.1
57 0.11
58 0.12
59 0.11
60 0.12
61 0.14
62 0.16
63 0.16
64 0.17
65 0.17
66 0.16
67 0.13
68 0.14
69 0.13
70 0.12
71 0.19
72 0.19
73 0.2
74 0.28
75 0.3
76 0.35
77 0.43
78 0.52
79 0.56
80 0.65
81 0.72
82 0.75
83 0.84
84 0.87
85 0.86
86 0.82
87 0.81
88 0.76
89 0.7
90 0.67
91 0.64
92 0.57
93 0.55
94 0.49
95 0.41
96 0.35
97 0.34
98 0.28
99 0.2
100 0.21
101 0.15
102 0.15
103 0.14
104 0.15
105 0.21
106 0.21
107 0.23
108 0.28
109 0.29
110 0.3
111 0.38
112 0.41
113 0.37
114 0.41
115 0.42
116 0.43
117 0.41
118 0.41
119 0.33
120 0.3
121 0.27
122 0.22
123 0.18
124 0.11
125 0.1
126 0.07
127 0.07
128 0.05
129 0.05
130 0.08
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.1
135 0.11
136 0.12
137 0.14
138 0.17
139 0.26
140 0.28
141 0.29
142 0.31
143 0.3
144 0.31
145 0.35
146 0.38
147 0.31
148 0.29
149 0.31
150 0.28
151 0.28
152 0.3
153 0.27
154 0.2
155 0.19
156 0.19
157 0.19
158 0.2
159 0.24
160 0.27
161 0.31
162 0.32
163 0.31
164 0.33
165 0.32
166 0.36
167 0.38
168 0.35
169 0.32
170 0.3
171 0.3
172 0.29
173 0.29
174 0.24
175 0.19
176 0.21
177 0.21
178 0.24
179 0.29
180 0.29
181 0.33
182 0.36
183 0.37
184 0.38
185 0.39
186 0.37
187 0.35
188 0.41
189 0.37
190 0.37
191 0.34
192 0.32
193 0.31
194 0.33
195 0.37
196 0.32
197 0.37
198 0.39
199 0.41
200 0.39
201 0.36
202 0.32
203 0.25
204 0.25
205 0.25
206 0.25
207 0.25
208 0.25
209 0.27
210 0.29
211 0.32
212 0.35
213 0.33
214 0.36
215 0.36
216 0.39
217 0.38
218 0.37
219 0.35
220 0.32
221 0.32
222 0.25
223 0.24
224 0.22
225 0.23
226 0.23
227 0.22
228 0.3
229 0.29
230 0.29
231 0.28
232 0.28
233 0.35
234 0.37
235 0.43
236 0.4
237 0.45
238 0.47
239 0.5
240 0.54
241 0.52
242 0.54
243 0.48
244 0.48
245 0.48
246 0.45
247 0.42
248 0.36
249 0.34
250 0.3
251 0.29
252 0.25
253 0.17
254 0.19
255 0.2
256 0.23
257 0.19
258 0.17
259 0.17
260 0.15
261 0.18
262 0.17
263 0.18
264 0.22
265 0.27
266 0.3
267 0.4
268 0.47
269 0.51
270 0.58
271 0.64
272 0.67
273 0.71
274 0.78
275 0.77
276 0.73
277 0.73
278 0.67
279 0.63
280 0.52
281 0.44
282 0.36
283 0.27
284 0.24
285 0.17
286 0.19
287 0.16
288 0.19
289 0.18
290 0.2
291 0.21
292 0.21
293 0.26
294 0.24
295 0.28
296 0.26
297 0.31
298 0.29
299 0.33
300 0.34
301 0.33
302 0.35
303 0.33
304 0.43
305 0.41
306 0.41
307 0.37
308 0.39
309 0.39
310 0.37
311 0.35
312 0.26
313 0.24
314 0.25
315 0.27
316 0.23
317 0.2
318 0.18
319 0.2
320 0.18
321 0.17
322 0.12
323 0.14
324 0.14
325 0.13
326 0.11
327 0.12
328 0.12
329 0.13
330 0.12
331 0.09
332 0.12
333 0.14
334 0.15
335 0.12
336 0.12
337 0.13
338 0.19
339 0.2
340 0.21
341 0.21
342 0.24
343 0.28
344 0.29
345 0.34
346 0.35
347 0.37
348 0.35
349 0.34
350 0.33
351 0.34
352 0.37
353 0.32
354 0.26
355 0.24
356 0.25
357 0.27
358 0.24
359 0.21
360 0.18
361 0.18
362 0.2
363 0.23
364 0.22
365 0.2
366 0.23
367 0.28
368 0.3
369 0.32
370 0.33
371 0.3
372 0.32
373 0.34
374 0.32
375 0.28
376 0.28
377 0.26
378 0.24
379 0.28
380 0.27
381 0.27
382 0.28
383 0.26
384 0.28
385 0.31
386 0.36
387 0.35
388 0.38
389 0.4
390 0.45
391 0.51
392 0.48
393 0.48
394 0.49
395 0.53
396 0.54
397 0.53
398 0.54
399 0.52
400 0.56
401 0.58
402 0.54
403 0.46
404 0.4
405 0.42
406 0.37
407 0.34
408 0.29
409 0.27
410 0.25
411 0.25
412 0.27
413 0.23
414 0.22
415 0.25
416 0.29
417 0.31
418 0.36
419 0.37
420 0.37
421 0.37
422 0.36
423 0.36
424 0.34
425 0.32
426 0.27
427 0.28
428 0.26
429 0.26
430 0.25
431 0.22
432 0.19
433 0.16
434 0.13
435 0.18
436 0.2
437 0.19
438 0.2
439 0.23
440 0.24
441 0.24
442 0.25
443 0.2
444 0.21
445 0.21
446 0.22
447 0.19
448 0.2
449 0.24
450 0.22
451 0.24
452 0.21
453 0.21
454 0.21
455 0.23
456 0.21
457 0.21
458 0.25
459 0.29
460 0.32
461 0.37
462 0.43
463 0.4
464 0.39
465 0.37
466 0.36
467 0.31
468 0.34
469 0.3
470 0.23
471 0.22
472 0.21
473 0.2
474 0.19
475 0.17
476 0.1
477 0.12
478 0.14
479 0.16
480 0.15
481 0.15
482 0.15
483 0.19
484 0.2
485 0.16
486 0.16
487 0.18
488 0.19
489 0.19
490 0.17
491 0.12
492 0.12
493 0.12
494 0.1
495 0.06
496 0.09
497 0.11
498 0.11
499 0.13
500 0.15
501 0.18
502 0.19
503 0.22
504 0.25
505 0.25
506 0.27
507 0.28
508 0.26
509 0.24
510 0.27
511 0.24
512 0.2
513 0.2
514 0.18
515 0.16
516 0.17
517 0.15
518 0.12
519 0.12
520 0.11
521 0.11
522 0.12
523 0.13
524 0.14
525 0.15
526 0.17
527 0.17
528 0.17
529 0.16
530 0.15
531 0.18
532 0.18
533 0.22
534 0.23
535 0.24
536 0.25
537 0.25
538 0.25
539 0.23
540 0.22
541 0.2
542 0.16
543 0.16
544 0.19
545 0.21
546 0.2
547 0.19
548 0.17
549 0.15
550 0.16
551 0.16
552 0.13
553 0.1
554 0.12
555 0.12
556 0.14
557 0.14
558 0.13
559 0.15
560 0.13
561 0.16
562 0.15
563 0.21
564 0.25
565 0.24
566 0.25
567 0.23
568 0.24
569 0.24
570 0.22
571 0.16
572 0.12
573 0.13
574 0.14
575 0.18
576 0.18
577 0.18
578 0.19
579 0.2
580 0.22
581 0.29
582 0.35
583 0.36
584 0.4
585 0.41
586 0.41
587 0.39
588 0.4
589 0.39
590 0.34
591 0.3
592 0.25
593 0.29
594 0.28
595 0.28
596 0.25
597 0.2
598 0.17
599 0.17
600 0.15
601 0.1
602 0.09
603 0.1
604 0.12
605 0.13
606 0.14
607 0.13
608 0.13
609 0.12
610 0.14
611 0.14
612 0.12
613 0.21
614 0.2
615 0.28
616 0.29
617 0.3
618 0.31
619 0.32
620 0.34
621 0.28
622 0.33
623 0.29
624 0.29
625 0.3
626 0.28
627 0.28
628 0.26
629 0.22
630 0.16
631 0.13
632 0.11
633 0.08
634 0.08
635 0.06
636 0.06
637 0.07
638 0.09
639 0.1
640 0.12
641 0.13
642 0.15
643 0.15
644 0.16
645 0.2
646 0.2
647 0.21
648 0.19
649 0.2
650 0.22
651 0.24
652 0.23
653 0.21
654 0.26
655 0.28
656 0.31
657 0.32
658 0.32
659 0.35
660 0.44
661 0.5
662 0.46
663 0.43
664 0.41
665 0.46
666 0.43
667 0.4
668 0.3
669 0.22
670 0.2
671 0.22
672 0.22
673 0.15
674 0.14
675 0.17
676 0.18
677 0.23
678 0.22
679 0.22
680 0.24
681 0.26
682 0.27
683 0.24
684 0.24
685 0.23
686 0.32
687 0.34
688 0.33
689 0.35
690 0.39
691 0.39
692 0.45
693 0.41
694 0.33
695 0.32
696 0.37
697 0.32
698 0.3
699 0.29
700 0.22
701 0.21
702 0.19
703 0.15
704 0.09
705 0.08
706 0.05
707 0.04
708 0.04
709 0.04
710 0.04
711 0.04
712 0.05
713 0.05
714 0.06
715 0.06
716 0.07
717 0.09
718 0.11
719 0.12
720 0.12
721 0.16
722 0.22
723 0.26
724 0.3
725 0.31
726 0.33
727 0.37
728 0.4
729 0.4
730 0.36
731 0.36
732 0.33
733 0.36
734 0.34
735 0.33
736 0.32
737 0.32
738 0.31
739 0.31
740 0.3
741 0.29
742 0.26
743 0.26
744 0.24
745 0.2
746 0.2
747 0.16
748 0.14
749 0.13
750 0.14
751 0.11
752 0.11
753 0.12
754 0.13
755 0.16
756 0.17
757 0.15
758 0.15
759 0.21
760 0.26
761 0.27
762 0.27
763 0.25
764 0.27
765 0.27
766 0.26
767 0.24
768 0.2
769 0.17
770 0.16
771 0.15
772 0.14
773 0.14
774 0.16
775 0.16
776 0.19
777 0.19
778 0.21
779 0.23
780 0.22
781 0.23
782 0.22
783 0.25
784 0.25
785 0.27
786 0.3
787 0.3
788 0.31
789 0.36
790 0.42
791 0.38
792 0.41
793 0.45
794 0.43
795 0.47
796 0.53
797 0.54
798 0.53
799 0.58
800 0.59
801 0.58
802 0.58
803 0.54
804 0.49
805 0.43
806 0.36
807 0.28
808 0.21
809 0.15
810 0.1
811 0.08
812 0.06
813 0.06
814 0.06
815 0.06
816 0.07
817 0.07
818 0.06
819 0.1
820 0.16
821 0.18
822 0.19
823 0.21
824 0.22
825 0.24
826 0.25
827 0.24
828 0.2
829 0.24
830 0.25
831 0.26
832 0.29
833 0.35
834 0.4
835 0.41
836 0.4
837 0.38
838 0.39
839 0.39
840 0.37
841 0.3
842 0.25
843 0.23
844 0.21
845 0.17
846 0.14
847 0.1
848 0.08
849 0.07
850 0.06
851 0.05
852 0.05
853 0.07
854 0.07
855 0.07
856 0.07
857 0.07
858 0.07
859 0.07
860 0.08
861 0.07
862 0.07
863 0.08
864 0.09
865 0.1
866 0.12
867 0.14
868 0.14
869 0.15
870 0.19
871 0.23
872 0.29
873 0.31
874 0.34
875 0.34
876 0.4
877 0.41
878 0.43
879 0.45
880 0.41
881 0.39
882 0.4
883 0.45
884 0.43
885 0.47
886 0.47
887 0.46
888 0.53
889 0.6
890 0.65
891 0.66
892 0.69
893 0.71
894 0.71
895 0.73