Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C2YFN8

Protein Details
Accession A0A0C2YFN8    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-73RESKKLQDKIAKVRNRRELNTHydrophilic
86-114DVDDTLKWIKRNKKKERELAKKRQLELENHydrophilic
268-293EGDVGFKKPKTKKKRPSRRAPVEAELBasic
674-700AQPLAKGKTEKAKKKKESKNAQQAGDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
56-57KK
94-108IKRNKKKERELAKKR
274-287KKPKTKKKRPSRRA
331-339AKLRKTKKL
601-627SHKFHGKGSGKMKTEKRLKKIAEEKKK
679-691KGKTEKAKKKKES
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MSMEESISLEETNKIRISLGLKPLTDDKAPAGDPEQQAESNYAKKRELDAKERESKKLQDKIAKVRNRRELNTSLKGATLGDAEEDVDDTLKWIKRNKKKERELAKKRQLELENRDKEVQDEYTERDLVGLKVSHDFDEMDEGEARILTLKDSRILDNEEDELQNVEMAEEERLKERLELKIKKRDYTGYDDDEFLEGNQGLMKRSVLAKYDEYIEGPRHSEFRLGSSTSSNKVKRDEESRHAAASLNKSLLTIDYAKNIETADYIQEGDVGFKKPKTKKKRPSRRAPVEAELLDGDMDVDQRVVPLVRDLDANFVDDDELQAALARSRQAKLRKTKKLSPEELAKKIAAQRVKEEEEENQSLVKAENPDLEEEGGLTFDETSEFVQAVGNNPIVKPKREPREPTLPQAALPTSTPKPESRDVSMAPGDVALDELEAGEVRVKDEEEEDFDMNMLDAIEDAIKKTEEEEKAAIEGGDAGVGTSSEQTFSTGMASTLNILRQQGILAQPSSDLLDREKTQKQRDLWLADQRRRVAQRELEKLQSRGANKDQAQREYENRLREQQEARDNMEAFKNYKPDVNIVYYDEFGRSLTPKEAWKALSHKFHGKGSGKMKTEKRLKKIAEEKKKEAMASGDTPLSMNKAFQQRQEKTGQAHFILSVGNRGAVPQAADFLDAQPLAKGKTEKAKKKKESKNAQQAGDSGFMTVPAPQLHLTSNGASPGASASASPAPKAGFSRISSGAVEVPSSHGGTPVPGDRVKVAFGMKRKAMEDAQGSPLPKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.23
4 0.26
5 0.28
6 0.36
7 0.37
8 0.36
9 0.39
10 0.43
11 0.43
12 0.4
13 0.34
14 0.27
15 0.27
16 0.27
17 0.26
18 0.25
19 0.28
20 0.28
21 0.3
22 0.31
23 0.27
24 0.27
25 0.29
26 0.29
27 0.3
28 0.35
29 0.35
30 0.35
31 0.37
32 0.42
33 0.48
34 0.53
35 0.54
36 0.58
37 0.63
38 0.71
39 0.72
40 0.72
41 0.68
42 0.69
43 0.69
44 0.68
45 0.67
46 0.66
47 0.7
48 0.75
49 0.78
50 0.79
51 0.78
52 0.8
53 0.82
54 0.81
55 0.76
56 0.73
57 0.71
58 0.71
59 0.69
60 0.63
61 0.53
62 0.46
63 0.42
64 0.36
65 0.28
66 0.2
67 0.13
68 0.1
69 0.09
70 0.09
71 0.08
72 0.09
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.14
78 0.16
79 0.2
80 0.28
81 0.38
82 0.48
83 0.59
84 0.69
85 0.74
86 0.82
87 0.88
88 0.91
89 0.93
90 0.94
91 0.94
92 0.93
93 0.9
94 0.82
95 0.81
96 0.76
97 0.74
98 0.73
99 0.72
100 0.68
101 0.64
102 0.63
103 0.54
104 0.49
105 0.43
106 0.35
107 0.28
108 0.25
109 0.25
110 0.27
111 0.27
112 0.25
113 0.23
114 0.22
115 0.19
116 0.2
117 0.16
118 0.14
119 0.18
120 0.19
121 0.19
122 0.18
123 0.18
124 0.15
125 0.19
126 0.18
127 0.16
128 0.15
129 0.15
130 0.14
131 0.13
132 0.13
133 0.1
134 0.09
135 0.08
136 0.11
137 0.12
138 0.17
139 0.19
140 0.2
141 0.21
142 0.25
143 0.25
144 0.24
145 0.25
146 0.22
147 0.2
148 0.19
149 0.17
150 0.13
151 0.13
152 0.1
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.09
157 0.09
158 0.1
159 0.12
160 0.13
161 0.14
162 0.16
163 0.19
164 0.26
165 0.34
166 0.42
167 0.48
168 0.57
169 0.6
170 0.6
171 0.61
172 0.59
173 0.53
174 0.53
175 0.52
176 0.47
177 0.45
178 0.42
179 0.39
180 0.34
181 0.29
182 0.2
183 0.16
184 0.1
185 0.09
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.13
193 0.15
194 0.16
195 0.19
196 0.19
197 0.2
198 0.23
199 0.21
200 0.2
201 0.2
202 0.21
203 0.18
204 0.19
205 0.18
206 0.17
207 0.17
208 0.2
209 0.17
210 0.18
211 0.21
212 0.2
213 0.2
214 0.23
215 0.25
216 0.26
217 0.33
218 0.33
219 0.32
220 0.36
221 0.38
222 0.38
223 0.44
224 0.46
225 0.45
226 0.5
227 0.49
228 0.44
229 0.42
230 0.39
231 0.35
232 0.33
233 0.29
234 0.22
235 0.2
236 0.19
237 0.19
238 0.17
239 0.16
240 0.14
241 0.12
242 0.15
243 0.15
244 0.16
245 0.16
246 0.16
247 0.13
248 0.1
249 0.1
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.11
258 0.12
259 0.13
260 0.15
261 0.24
262 0.31
263 0.41
264 0.51
265 0.6
266 0.68
267 0.78
268 0.87
269 0.9
270 0.93
271 0.94
272 0.94
273 0.91
274 0.86
275 0.79
276 0.72
277 0.62
278 0.51
279 0.4
280 0.29
281 0.2
282 0.14
283 0.1
284 0.05
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.09
298 0.11
299 0.11
300 0.12
301 0.1
302 0.1
303 0.09
304 0.08
305 0.08
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.08
314 0.09
315 0.11
316 0.17
317 0.23
318 0.31
319 0.42
320 0.51
321 0.59
322 0.65
323 0.71
324 0.75
325 0.77
326 0.73
327 0.68
328 0.67
329 0.64
330 0.6
331 0.55
332 0.45
333 0.37
334 0.36
335 0.35
336 0.29
337 0.23
338 0.24
339 0.27
340 0.29
341 0.29
342 0.26
343 0.25
344 0.27
345 0.27
346 0.23
347 0.18
348 0.16
349 0.15
350 0.14
351 0.13
352 0.09
353 0.09
354 0.11
355 0.11
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.1
360 0.08
361 0.08
362 0.05
363 0.05
364 0.04
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.15
381 0.16
382 0.18
383 0.21
384 0.27
385 0.35
386 0.42
387 0.48
388 0.48
389 0.57
390 0.58
391 0.58
392 0.56
393 0.48
394 0.41
395 0.37
396 0.31
397 0.21
398 0.18
399 0.18
400 0.13
401 0.14
402 0.16
403 0.15
404 0.2
405 0.23
406 0.26
407 0.25
408 0.27
409 0.26
410 0.28
411 0.26
412 0.22
413 0.18
414 0.15
415 0.11
416 0.08
417 0.07
418 0.04
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.08
432 0.08
433 0.09
434 0.12
435 0.12
436 0.11
437 0.11
438 0.11
439 0.09
440 0.09
441 0.06
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.07
452 0.13
453 0.14
454 0.16
455 0.17
456 0.16
457 0.17
458 0.17
459 0.15
460 0.09
461 0.08
462 0.05
463 0.04
464 0.04
465 0.03
466 0.03
467 0.03
468 0.03
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.05
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.08
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.09
489 0.1
490 0.11
491 0.12
492 0.11
493 0.11
494 0.1
495 0.11
496 0.12
497 0.1
498 0.09
499 0.09
500 0.12
501 0.14
502 0.2
503 0.26
504 0.31
505 0.37
506 0.43
507 0.44
508 0.48
509 0.52
510 0.52
511 0.51
512 0.54
513 0.56
514 0.55
515 0.59
516 0.53
517 0.53
518 0.51
519 0.5
520 0.46
521 0.45
522 0.48
523 0.51
524 0.52
525 0.53
526 0.54
527 0.51
528 0.48
529 0.45
530 0.38
531 0.36
532 0.37
533 0.37
534 0.37
535 0.45
536 0.46
537 0.45
538 0.48
539 0.45
540 0.45
541 0.46
542 0.47
543 0.45
544 0.42
545 0.45
546 0.43
547 0.45
548 0.46
549 0.44
550 0.47
551 0.45
552 0.45
553 0.43
554 0.41
555 0.37
556 0.37
557 0.31
558 0.26
559 0.26
560 0.26
561 0.22
562 0.25
563 0.24
564 0.24
565 0.25
566 0.26
567 0.24
568 0.24
569 0.25
570 0.22
571 0.22
572 0.19
573 0.15
574 0.13
575 0.13
576 0.11
577 0.12
578 0.14
579 0.16
580 0.19
581 0.22
582 0.25
583 0.25
584 0.28
585 0.32
586 0.37
587 0.42
588 0.44
589 0.48
590 0.48
591 0.49
592 0.53
593 0.5
594 0.51
595 0.51
596 0.55
597 0.51
598 0.56
599 0.59
600 0.6
601 0.67
602 0.68
603 0.67
604 0.68
605 0.66
606 0.68
607 0.73
608 0.74
609 0.75
610 0.75
611 0.74
612 0.72
613 0.72
614 0.62
615 0.53
616 0.45
617 0.39
618 0.33
619 0.3
620 0.23
621 0.2
622 0.21
623 0.19
624 0.19
625 0.14
626 0.12
627 0.16
628 0.25
629 0.27
630 0.34
631 0.45
632 0.45
633 0.5
634 0.55
635 0.54
636 0.49
637 0.52
638 0.49
639 0.4
640 0.37
641 0.32
642 0.27
643 0.25
644 0.2
645 0.17
646 0.13
647 0.13
648 0.11
649 0.12
650 0.12
651 0.11
652 0.12
653 0.09
654 0.11
655 0.1
656 0.11
657 0.12
658 0.11
659 0.13
660 0.12
661 0.12
662 0.11
663 0.13
664 0.13
665 0.17
666 0.18
667 0.19
668 0.3
669 0.4
670 0.49
671 0.59
672 0.69
673 0.75
674 0.84
675 0.9
676 0.9
677 0.92
678 0.92
679 0.93
680 0.9
681 0.82
682 0.74
683 0.66
684 0.58
685 0.5
686 0.38
687 0.28
688 0.2
689 0.17
690 0.15
691 0.13
692 0.13
693 0.1
694 0.13
695 0.12
696 0.14
697 0.15
698 0.17
699 0.19
700 0.18
701 0.19
702 0.18
703 0.17
704 0.16
705 0.14
706 0.13
707 0.11
708 0.09
709 0.07
710 0.1
711 0.16
712 0.17
713 0.17
714 0.18
715 0.17
716 0.2
717 0.23
718 0.24
719 0.25
720 0.26
721 0.31
722 0.32
723 0.34
724 0.31
725 0.3
726 0.29
727 0.23
728 0.21
729 0.16
730 0.17
731 0.17
732 0.18
733 0.16
734 0.15
735 0.14
736 0.15
737 0.19
738 0.19
739 0.22
740 0.22
741 0.24
742 0.26
743 0.27
744 0.27
745 0.26
746 0.27
747 0.28
748 0.34
749 0.4
750 0.41
751 0.44
752 0.44
753 0.46
754 0.43
755 0.44
756 0.42
757 0.38
758 0.41
759 0.41
760 0.41