FuNGI

Q6BHI6

Protein Details

Accession

Q6BHI6

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
70-90	IENFTKPVRLHRKDPRNIQFH	Hydrophilic
147-172	PDGGARKSKKSLFKRKTRQINLMDDQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
152-162	RKSKKSLFKRK
385-387	GKK

Subcellular Location(s)

nucl 27

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	dha:DEHA2G18282g -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSHSPVKKEVVVKKEEADGSSSPAMSSSNGKSSSDQGWQDIPLKCCTKEDIKDIRYHIMKFQSKQNVDIIENFTKPVRLHRKDPRNIQFHLTRAEVDKRKREEEEAKIEKEKQKQESIEAAEKEAIANGEDPKNINRDEVDMSQVAPDGGARKSKKSLFKRKTRQINLMDDQKRKLRYEEYYPWVVEDYDGKNVFVGNYEAGSSDTQQVLFVFDKDGFKMVPAEKVYKFTQRNKYATLTLEEAEAKMEKNSSVPRWLMRHMEDNSGLEGATADQRFRHNVGSSRDGSTSASSNNRGRLRTVLGGSTSNERDSDHDDLDFDEEFADDEEAPIMDGDEEENKLSEQKIKKEMLKAAHFDGQSDAEVDDDDLDDLFETEKSRKVDKEGKKLRKVLNKTEGGVYDSDDDDKLNPYLSKSDLESDDESDDDAAIKKEDEDRLLDNIDSDKPAQRSFTAQNIGDGFVLVRAPPSFLSGFPNGDWNPNGRKRPAVANNDPSKKAKFDDGKTKLKVSIKKENGSPSPSLPGSPINATSDVDLTSGGPDNVLVTVKEVLDIVKDNPLTTKELLFGLKNRVNAHKDNKLRIISIVKQNLRLVDGKLVLKDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.51
3	0.43
4	0.4
5	0.32
6	0.32
7	0.31
8	0.29
9	0.22
10	0.2
11	0.19
12	0.16
13	0.21
14	0.19
15	0.24
16	0.26
17	0.27
18	0.29
19	0.32
20	0.35
21	0.37
22	0.35
23	0.31
24	0.31
25	0.33
26	0.38
27	0.4
28	0.38
29	0.39
30	0.41
31	0.39
32	0.39
33	0.41
34	0.43
35	0.43
36	0.5
37	0.52
38	0.52
39	0.58
40	0.59
41	0.62
42	0.58
43	0.54
44	0.5
45	0.5
46	0.53
47	0.5
48	0.56
49	0.58
50	0.55
51	0.56
52	0.55
53	0.49
54	0.43
55	0.45
56	0.42
57	0.36
58	0.35
59	0.33
60	0.29
61	0.29
62	0.27
63	0.33
64	0.38
65	0.39
66	0.48
67	0.58
68	0.68
69	0.74
70	0.84
71	0.83
72	0.78
73	0.75
74	0.73
75	0.67
76	0.6
77	0.55
78	0.46
79	0.38
80	0.37
81	0.44
82	0.45
83	0.47
84	0.53
85	0.54
86	0.58
87	0.59
88	0.62
89	0.61
90	0.61
91	0.64
92	0.62
93	0.6
94	0.6
95	0.63
96	0.62
97	0.62
98	0.62
99	0.57
100	0.57
101	0.55
102	0.55
103	0.55
104	0.54
105	0.53
106	0.46
107	0.41
108	0.35
109	0.33
110	0.28
111	0.22
112	0.16
113	0.1
114	0.11
115	0.13
116	0.14
117	0.15
118	0.17
119	0.18
120	0.22
121	0.21
122	0.21
123	0.18
124	0.19
125	0.22
126	0.21
127	0.23
128	0.19
129	0.19
130	0.18
131	0.17
132	0.14
133	0.1
134	0.09
135	0.09
136	0.1
137	0.17
138	0.18
139	0.22
140	0.28
141	0.35
142	0.44
143	0.52
144	0.62
145	0.65
146	0.74
147	0.82
148	0.86
149	0.9
150	0.87
151	0.86
152	0.82
153	0.81
154	0.76
155	0.76
156	0.73
157	0.66
158	0.62
159	0.59
160	0.56
161	0.48
162	0.45
163	0.41
164	0.38
165	0.44
166	0.48
167	0.47
168	0.47
169	0.45
170	0.42
171	0.37
172	0.32
173	0.24
174	0.2
175	0.16
176	0.18
177	0.19
178	0.18
179	0.17
180	0.17
181	0.17
182	0.14
183	0.13
184	0.07
185	0.07
186	0.07
187	0.08
188	0.09
189	0.09
190	0.09
191	0.1
192	0.1
193	0.1
194	0.1
195	0.1
196	0.11
197	0.11
198	0.1
199	0.09
200	0.11
201	0.12
202	0.12
203	0.13
204	0.1
205	0.1
206	0.14
207	0.13
208	0.16
209	0.17
210	0.22
211	0.21
212	0.26
213	0.27
214	0.32
215	0.38
216	0.42
217	0.5
218	0.53
219	0.56
220	0.55
221	0.56
222	0.5
223	0.45
224	0.39
225	0.3
226	0.23
227	0.21
228	0.18
229	0.15
230	0.13
231	0.11
232	0.09
233	0.08
234	0.08
235	0.07
236	0.09
237	0.13
238	0.14
239	0.17
240	0.18
241	0.22
242	0.24
243	0.26
244	0.27
245	0.26
246	0.31
247	0.29
248	0.31
249	0.28
250	0.26
251	0.24
252	0.2
253	0.18
254	0.1
255	0.09
256	0.06
257	0.09
258	0.08
259	0.08
260	0.09
261	0.1
262	0.12
263	0.14
264	0.16
265	0.15
266	0.21
267	0.25
268	0.28
269	0.29
270	0.29
271	0.28
272	0.26
273	0.24
274	0.2
275	0.17
276	0.14
277	0.14
278	0.16
279	0.18
280	0.24
281	0.26
282	0.26
283	0.26
284	0.26
285	0.26
286	0.25
287	0.24
288	0.18
289	0.16
290	0.16
291	0.16
292	0.17
293	0.15
294	0.13
295	0.12
296	0.12
297	0.12
298	0.15
299	0.17
300	0.14
301	0.14
302	0.13
303	0.13
304	0.15
305	0.13
306	0.09
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.03
320	0.03
321	0.04
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.06
326	0.06
327	0.07
328	0.08
329	0.14
330	0.16
331	0.21
332	0.28
333	0.31
334	0.35
335	0.39
336	0.43
337	0.43
338	0.44
339	0.41
340	0.37
341	0.38
342	0.35
343	0.3
344	0.27
345	0.21
346	0.17
347	0.15
348	0.12
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.06
353	0.05
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.05
361	0.06
362	0.07
363	0.12
364	0.15
365	0.18
366	0.19
367	0.25
368	0.34
369	0.41
370	0.51
371	0.57
372	0.65
373	0.7
374	0.76
375	0.77
376	0.77
377	0.75
378	0.74
379	0.72
380	0.66
381	0.6
382	0.55
383	0.48
384	0.4
385	0.34
386	0.25
387	0.18
388	0.15
389	0.14
390	0.11
391	0.11
392	0.1
393	0.11
394	0.1
395	0.11
396	0.11
397	0.11
398	0.13
399	0.14
400	0.15
401	0.14
402	0.17
403	0.17
404	0.2
405	0.2
406	0.2
407	0.19
408	0.17
409	0.16
410	0.13
411	0.12
412	0.09
413	0.09
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.08
418	0.13
419	0.14
420	0.15
421	0.17
422	0.18
423	0.2
424	0.21
425	0.2
426	0.16
427	0.17
428	0.16
429	0.15
430	0.15
431	0.18
432	0.18
433	0.2
434	0.2
435	0.19
436	0.24
437	0.25
438	0.31
439	0.31
440	0.3
441	0.32
442	0.31
443	0.31
444	0.25
445	0.22
446	0.15
447	0.1
448	0.1
449	0.07
450	0.07
451	0.06
452	0.08
453	0.08
454	0.11
455	0.11
456	0.12
457	0.17
458	0.18
459	0.19
460	0.19
461	0.25
462	0.22
463	0.25
464	0.25
465	0.24
466	0.31
467	0.37
468	0.42
469	0.38
470	0.42
471	0.41
472	0.51
473	0.56
474	0.56
475	0.57
476	0.62
477	0.69
478	0.71
479	0.72
480	0.65
481	0.59
482	0.52
483	0.45
484	0.45
485	0.44
486	0.45
487	0.53
488	0.57
489	0.64
490	0.64
491	0.65
492	0.62
493	0.61
494	0.61
495	0.57
496	0.6
497	0.59
498	0.61
499	0.63
500	0.65
501	0.63
502	0.6
503	0.55
504	0.47
505	0.45
506	0.4
507	0.36
508	0.29
509	0.27
510	0.25
511	0.25
512	0.24
513	0.21
514	0.22
515	0.22
516	0.21
517	0.19
518	0.16
519	0.14
520	0.13
521	0.1
522	0.1
523	0.12
524	0.1
525	0.09
526	0.09
527	0.09
528	0.1
529	0.11
530	0.09
531	0.09
532	0.11
533	0.11
534	0.12
535	0.11
536	0.1
537	0.12
538	0.14
539	0.13
540	0.18
541	0.18
542	0.18
543	0.21
544	0.23
545	0.25
546	0.25
547	0.25
548	0.2
549	0.22
550	0.25
551	0.25
552	0.27
553	0.32
554	0.34
555	0.37
556	0.39
557	0.45
558	0.48
559	0.53
560	0.57
561	0.58
562	0.62
563	0.66
564	0.7
565	0.65
566	0.6
567	0.57
568	0.56
569	0.54
570	0.56
571	0.58
572	0.54
573	0.56
574	0.57
575	0.54
576	0.5
577	0.45
578	0.37
579	0.34
580	0.36
581	0.33

Q6BHI6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer