FuNGI

Q6BGW0

Protein Details

Accession

Q6BGW0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
397-430	DVILVKKHYARKSRKSKNRKWKLKRMAKEHNDIV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
402-424	KKHYARKSRKSKNRKWKLKRMAK

Subcellular Location(s)

nucl 25, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport
KEGG	dha:DEHA2G23496g -
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MSNYTQLDHTHDQQQPVATVLCCNCGVPMDGSSGLVMCYDCIKLTVDITEGIPREANVSFCRNCERFLQPPQHWIKAELESRELLALCLRRLKGLNKVRLIDASFIWTEPHSRRIRVKLTVQGEAMSNTIVQQTFEVEYVVVAMQCPDCAKSYTANTWRATVQIRQKVPHKRTFLYLEQLILKHNAHMDTVSIKESRDGLDFFYGQKNHAVKMLDFLSAVAPIKSKKSEELVSTDIHSASSSYKFSYSVEIAPVCRDDLVVLPKKMANSLGNISRLVLCSKISNSIQFFDPASLQSADLNAPVYWRSPFPSLLNATELIEFIVLDVEPTGDIRGKYVLADITVSRASDFGSNDNSFYIRSHLGAILHPGDSCLGYYLANSNLNSDLFDTLDTDNIPDVILVKKHYARKSRKSKNRKWKLKRMAKEHNDIVANDDSRQAKQEQERAERDYELFLQQLEEDDELRQTINLYKTADDQYPKHSETDMEDEDDDEDAPQIGIDELLDELDDMTLDDHTMQS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.36
3	0.34
4	0.32
5	0.23
6	0.25
7	0.23
8	0.23
9	0.21
10	0.21
11	0.18
12	0.17
13	0.19
14	0.16
15	0.16
16	0.16
17	0.16
18	0.16
19	0.16
20	0.15
21	0.12
22	0.11
23	0.1
24	0.07
25	0.08
26	0.09
27	0.09
28	0.1
29	0.12
30	0.12
31	0.13
32	0.14
33	0.13
34	0.14
35	0.15
36	0.19
37	0.17
38	0.18
39	0.17
40	0.16
41	0.17
42	0.17
43	0.19
44	0.18
45	0.24
46	0.25
47	0.27
48	0.35
49	0.33
50	0.34
51	0.37
52	0.39
53	0.4
54	0.47
55	0.55
56	0.49
57	0.58
58	0.62
59	0.63
60	0.58
61	0.53
62	0.48
63	0.46
64	0.49
65	0.41
66	0.37
67	0.31
68	0.3
69	0.29
70	0.25
71	0.18
72	0.17
73	0.17
74	0.17
75	0.22
76	0.22
77	0.24
78	0.28
79	0.31
80	0.37
81	0.44
82	0.51
83	0.5
84	0.52
85	0.5
86	0.5
87	0.48
88	0.4
89	0.31
90	0.26
91	0.21
92	0.19
93	0.18
94	0.15
95	0.19
96	0.19
97	0.28
98	0.27
99	0.32
100	0.38
101	0.45
102	0.52
103	0.53
104	0.57
105	0.56
106	0.56
107	0.55
108	0.49
109	0.42
110	0.36
111	0.3
112	0.24
113	0.16
114	0.12
115	0.08
116	0.1
117	0.09
118	0.08
119	0.08
120	0.09
121	0.1
122	0.1
123	0.1
124	0.08
125	0.07
126	0.08
127	0.08
128	0.06
129	0.05
130	0.06
131	0.06
132	0.06
133	0.07
134	0.07
135	0.09
136	0.11
137	0.12
138	0.14
139	0.18
140	0.26
141	0.32
142	0.37
143	0.37
144	0.37
145	0.36
146	0.35
147	0.34
148	0.32
149	0.34
150	0.36
151	0.38
152	0.41
153	0.48
154	0.56
155	0.6
156	0.62
157	0.59
158	0.53
159	0.55
160	0.57
161	0.52
162	0.48
163	0.42
164	0.35
165	0.32
166	0.31
167	0.27
168	0.23
169	0.2
170	0.15
171	0.16
172	0.14
173	0.12
174	0.12
175	0.11
176	0.11
177	0.12
178	0.13
179	0.11
180	0.11
181	0.12
182	0.12
183	0.13
184	0.13
185	0.12
186	0.12
187	0.13
188	0.14
189	0.14
190	0.18
191	0.17
192	0.16
193	0.22
194	0.21
195	0.19
196	0.22
197	0.22
198	0.17
199	0.2
200	0.2
201	0.15
202	0.14
203	0.14
204	0.11
205	0.11
206	0.11
207	0.08
208	0.07
209	0.08
210	0.1
211	0.12
212	0.12
213	0.13
214	0.17
215	0.19
216	0.2
217	0.23
218	0.23
219	0.22
220	0.22
221	0.21
222	0.17
223	0.15
224	0.13
225	0.09
226	0.09
227	0.1
228	0.09
229	0.09
230	0.1
231	0.1
232	0.1
233	0.13
234	0.12
235	0.11
236	0.13
237	0.13
238	0.12
239	0.13
240	0.12
241	0.1
242	0.08
243	0.07
244	0.06
245	0.07
246	0.13
247	0.18
248	0.17
249	0.18
250	0.19
251	0.19
252	0.19
253	0.19
254	0.14
255	0.12
256	0.14
257	0.17
258	0.17
259	0.17
260	0.17
261	0.15
262	0.15
263	0.13
264	0.11
265	0.08
266	0.09
267	0.09
268	0.13
269	0.13
270	0.16
271	0.16
272	0.17
273	0.18
274	0.17
275	0.17
276	0.13
277	0.13
278	0.1
279	0.12
280	0.11
281	0.1
282	0.09
283	0.1
284	0.09
285	0.09
286	0.09
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.08
291	0.08
292	0.09
293	0.11
294	0.12
295	0.14
296	0.14
297	0.19
298	0.21
299	0.21
300	0.22
301	0.2
302	0.18
303	0.17
304	0.16
305	0.1
306	0.08
307	0.07
308	0.05
309	0.05
310	0.04
311	0.03
312	0.03
313	0.03
314	0.03
315	0.04
316	0.05
317	0.06
318	0.07
319	0.07
320	0.08
321	0.08
322	0.09
323	0.1
324	0.09
325	0.07
326	0.09
327	0.08
328	0.1
329	0.1
330	0.1
331	0.09
332	0.08
333	0.09
334	0.11
335	0.12
336	0.11
337	0.16
338	0.17
339	0.17
340	0.17
341	0.17
342	0.15
343	0.15
344	0.16
345	0.11
346	0.11
347	0.12
348	0.13
349	0.14
350	0.14
351	0.16
352	0.15
353	0.14
354	0.13
355	0.12
356	0.11
357	0.1
358	0.1
359	0.08
360	0.07
361	0.06
362	0.07
363	0.09
364	0.11
365	0.14
366	0.14
367	0.15
368	0.15
369	0.16
370	0.16
371	0.14
372	0.12
373	0.09
374	0.1
375	0.1
376	0.09
377	0.1
378	0.1
379	0.09
380	0.09
381	0.08
382	0.08
383	0.06
384	0.07
385	0.09
386	0.1
387	0.12
388	0.16
389	0.22
390	0.3
391	0.37
392	0.46
393	0.54
394	0.63
395	0.73
396	0.79
397	0.84
398	0.88
399	0.92
400	0.93
401	0.94
402	0.95
403	0.94
404	0.95
405	0.95
406	0.94
407	0.93
408	0.92
409	0.91
410	0.88
411	0.86
412	0.79
413	0.74
414	0.65
415	0.56
416	0.5
417	0.45
418	0.37
419	0.29
420	0.31
421	0.26
422	0.24
423	0.28
424	0.24
425	0.26
426	0.32
427	0.38
428	0.41
429	0.48
430	0.52
431	0.54
432	0.55
433	0.5
434	0.44
435	0.41
436	0.34
437	0.27
438	0.23
439	0.19
440	0.17
441	0.15
442	0.15
443	0.14
444	0.12
445	0.11
446	0.12
447	0.12
448	0.12
449	0.12
450	0.11
451	0.1
452	0.15
453	0.17
454	0.2
455	0.21
456	0.22
457	0.26
458	0.3
459	0.34
460	0.33
461	0.32
462	0.36
463	0.41
464	0.42
465	0.39
466	0.36
467	0.33
468	0.33
469	0.39
470	0.34
471	0.29
472	0.28
473	0.27
474	0.27
475	0.26
476	0.21
477	0.13
478	0.11
479	0.08
480	0.08
481	0.07
482	0.07
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.05
488	0.05
489	0.06
490	0.05
491	0.05
492	0.05
493	0.05
494	0.05
495	0.05
496	0.05
497	0.06

Q6BGW0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer