Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C3C6X8

Protein Details
Accession A0A0C3C6X8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
319-357SEDQRDPDSKKPRKERGAYYKNIERKMHLKKKRVNAYDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
328-351KKPRKERGAYYKNIERKMHLKKKR
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 9.5, cyto_nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007133  RNA_pol_II-assoc_Paf1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF03985  Paf1  
Amino Acid Sequences MSSKKSSKLDLLVRVRYSNPLPPPPCPPKLLNVSTNPMRYARSEFLNVLANETPLPMIVDAECGMPLDLGKWECLWEEKGDDSSLNPDPKILPKVDPRDAFLLTDPSSSAGAYPVNGGNHPNSSTAAHQTPIANVTWLRKTEYISREGVQRAAAPEQKQSASSTIDVSRNAQLRDIEASFAACNETFSLEELRHPNKPDVVAVESYPLLPDEDIWANQYDLFRFSERPGDRPLDVEDPRLDCAILRPMKTEHDSFLAFYLTQTDEAAVAFKETRFGLAPYEVPENEEETTFHFVRDYETVKVEQEVPNEFLLVLYEGDSEDQRDPDSKKPRKERGAYYKNIERKMHLKKKRVNAYDEYEDKWEIIRVLHAPMSKEEEDEREEALAEVIDPMFLLNRADVDADGEVDDTGGIDIVTES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.55
3 0.52
4 0.48
5 0.45
6 0.45
7 0.47
8 0.48
9 0.48
10 0.57
11 0.6
12 0.6
13 0.58
14 0.53
15 0.51
16 0.57
17 0.6
18 0.57
19 0.54
20 0.58
21 0.59
22 0.59
23 0.53
24 0.46
25 0.41
26 0.37
27 0.38
28 0.34
29 0.32
30 0.33
31 0.31
32 0.32
33 0.37
34 0.34
35 0.31
36 0.28
37 0.24
38 0.21
39 0.21
40 0.18
41 0.11
42 0.12
43 0.08
44 0.08
45 0.07
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.1
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.12
61 0.15
62 0.17
63 0.15
64 0.16
65 0.17
66 0.18
67 0.19
68 0.18
69 0.16
70 0.19
71 0.23
72 0.23
73 0.21
74 0.21
75 0.22
76 0.27
77 0.31
78 0.28
79 0.28
80 0.34
81 0.42
82 0.48
83 0.48
84 0.45
85 0.45
86 0.43
87 0.38
88 0.31
89 0.28
90 0.21
91 0.2
92 0.17
93 0.15
94 0.14
95 0.13
96 0.11
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.1
102 0.11
103 0.12
104 0.13
105 0.14
106 0.15
107 0.16
108 0.15
109 0.14
110 0.15
111 0.16
112 0.19
113 0.19
114 0.17
115 0.18
116 0.18
117 0.17
118 0.18
119 0.16
120 0.13
121 0.12
122 0.16
123 0.18
124 0.18
125 0.2
126 0.2
127 0.22
128 0.29
129 0.32
130 0.32
131 0.31
132 0.31
133 0.32
134 0.32
135 0.3
136 0.23
137 0.21
138 0.19
139 0.2
140 0.23
141 0.2
142 0.21
143 0.23
144 0.22
145 0.22
146 0.21
147 0.19
148 0.17
149 0.17
150 0.17
151 0.17
152 0.19
153 0.18
154 0.19
155 0.22
156 0.23
157 0.23
158 0.22
159 0.19
160 0.18
161 0.2
162 0.19
163 0.15
164 0.11
165 0.11
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.11
178 0.16
179 0.18
180 0.2
181 0.22
182 0.23
183 0.23
184 0.23
185 0.21
186 0.18
187 0.18
188 0.15
189 0.13
190 0.13
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.08
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.2
213 0.2
214 0.22
215 0.24
216 0.26
217 0.25
218 0.25
219 0.27
220 0.25
221 0.24
222 0.24
223 0.23
224 0.21
225 0.22
226 0.2
227 0.17
228 0.11
229 0.12
230 0.18
231 0.19
232 0.18
233 0.19
234 0.2
235 0.24
236 0.27
237 0.26
238 0.19
239 0.19
240 0.19
241 0.18
242 0.17
243 0.15
244 0.12
245 0.1
246 0.11
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.12
265 0.13
266 0.13
267 0.17
268 0.15
269 0.16
270 0.16
271 0.16
272 0.15
273 0.14
274 0.12
275 0.12
276 0.18
277 0.17
278 0.16
279 0.15
280 0.14
281 0.16
282 0.2
283 0.2
284 0.16
285 0.18
286 0.19
287 0.19
288 0.2
289 0.21
290 0.2
291 0.2
292 0.21
293 0.2
294 0.2
295 0.19
296 0.18
297 0.14
298 0.12
299 0.11
300 0.08
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.08
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.16
311 0.19
312 0.27
313 0.38
314 0.44
315 0.52
316 0.62
317 0.71
318 0.77
319 0.81
320 0.83
321 0.84
322 0.85
323 0.82
324 0.79
325 0.78
326 0.75
327 0.74
328 0.65
329 0.58
330 0.58
331 0.63
332 0.66
333 0.66
334 0.69
335 0.7
336 0.79
337 0.85
338 0.83
339 0.78
340 0.74
341 0.73
342 0.72
343 0.66
344 0.58
345 0.51
346 0.44
347 0.38
348 0.32
349 0.26
350 0.18
351 0.15
352 0.16
353 0.15
354 0.17
355 0.21
356 0.22
357 0.22
358 0.24
359 0.31
360 0.28
361 0.28
362 0.27
363 0.28
364 0.29
365 0.29
366 0.27
367 0.2
368 0.2
369 0.18
370 0.16
371 0.12
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.07
382 0.08
383 0.09
384 0.1
385 0.1
386 0.11
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.1
391 0.09
392 0.08
393 0.08
394 0.06
395 0.06
396 0.05
397 0.04