Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2HBQ4

Protein Details
Accession A0A0D2HBQ4    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
377-400AARERERARRERRQENERQLRQSRBasic
564-585QAEDREKEERERQRKRARVDDDAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
221-238PPKFKHKKIPRGPPSPPP
331-358KEEHLREMAKKAREERQRGGETRTRRSR
383-389RARRERR
575-578RQRK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MATGLFASLPKPKYTGEHEEVPLHAQPRGPRVVGPGVIDESQIVLKRSGPPPYGQRSGWRPRSAEDFGDGGAFPEIPVAQYPLDMGRKGTASTSNALAIQVDAEGKVKYDAIARQGHSEGRIIHSSFKDLIPLRQRADAGDLSLDRPTAEEAQATAERTRLALEKLVSGAVAAQKPKNVKGVNREEPTYVRYTPANQMGDNSKKNDRIFKIVKRQEDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWRIPPPISNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEALFTADRHAREEVRLRAQMQQKLAEKEKLAKEEHLREMAKKAREERQRGGETRTRRSRSRSYSASSYDSRSDSEDEAARERERARRERRQENERQLRQSRMGAEKRIQMMAREQNRDISEKVALGLAKPTQNQETMYDSRLFNQTSGFDSGFNEDQHYDRPLFAAHDAINSIYRPSAGNQDDEEYGEEAAESAMGKINKSNRFEVLGRAKEGFKGADVAEREAGPVQFEKDKDDPFGIDSLIGEASARAGGGEGASKKRYGLEQAEDREKEERERQRKRARVDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.43
3 0.42
4 0.47
5 0.48
6 0.49
7 0.48
8 0.46
9 0.42
10 0.34
11 0.3
12 0.26
13 0.27
14 0.32
15 0.36
16 0.33
17 0.3
18 0.34
19 0.38
20 0.37
21 0.35
22 0.31
23 0.29
24 0.28
25 0.27
26 0.21
27 0.17
28 0.17
29 0.18
30 0.17
31 0.14
32 0.17
33 0.25
34 0.29
35 0.35
36 0.34
37 0.38
38 0.45
39 0.52
40 0.55
41 0.49
42 0.52
43 0.55
44 0.63
45 0.67
46 0.64
47 0.58
48 0.55
49 0.62
50 0.57
51 0.5
52 0.42
53 0.34
54 0.28
55 0.27
56 0.24
57 0.17
58 0.14
59 0.11
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.08
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.1
69 0.14
70 0.17
71 0.17
72 0.18
73 0.18
74 0.19
75 0.2
76 0.21
77 0.2
78 0.2
79 0.22
80 0.22
81 0.21
82 0.2
83 0.2
84 0.18
85 0.13
86 0.1
87 0.09
88 0.08
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.13
97 0.15
98 0.2
99 0.25
100 0.26
101 0.29
102 0.3
103 0.31
104 0.28
105 0.29
106 0.24
107 0.22
108 0.26
109 0.23
110 0.27
111 0.26
112 0.28
113 0.27
114 0.25
115 0.27
116 0.24
117 0.31
118 0.34
119 0.38
120 0.37
121 0.38
122 0.38
123 0.33
124 0.36
125 0.3
126 0.22
127 0.2
128 0.19
129 0.17
130 0.17
131 0.16
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.15
140 0.16
141 0.18
142 0.16
143 0.15
144 0.14
145 0.14
146 0.15
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.15
151 0.15
152 0.15
153 0.15
154 0.13
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.13
159 0.15
160 0.15
161 0.18
162 0.21
163 0.23
164 0.29
165 0.29
166 0.31
167 0.38
168 0.47
169 0.53
170 0.54
171 0.53
172 0.48
173 0.46
174 0.45
175 0.39
176 0.3
177 0.22
178 0.2
179 0.22
180 0.25
181 0.3
182 0.28
183 0.24
184 0.26
185 0.31
186 0.37
187 0.37
188 0.36
189 0.33
190 0.37
191 0.39
192 0.45
193 0.41
194 0.43
195 0.47
196 0.52
197 0.58
198 0.58
199 0.62
200 0.57
201 0.59
202 0.54
203 0.51
204 0.5
205 0.48
206 0.5
207 0.45
208 0.44
209 0.51
210 0.53
211 0.5
212 0.54
213 0.55
214 0.58
215 0.66
216 0.76
217 0.75
218 0.77
219 0.79
220 0.78
221 0.76
222 0.72
223 0.65
224 0.56
225 0.52
226 0.49
227 0.5
228 0.5
229 0.5
230 0.48
231 0.48
232 0.51
233 0.46
234 0.43
235 0.43
236 0.42
237 0.4
238 0.37
239 0.34
240 0.34
241 0.33
242 0.32
243 0.28
244 0.21
245 0.15
246 0.16
247 0.18
248 0.26
249 0.29
250 0.36
251 0.41
252 0.46
253 0.52
254 0.49
255 0.49
256 0.42
257 0.4
258 0.38
259 0.41
260 0.38
261 0.38
262 0.39
263 0.35
264 0.33
265 0.33
266 0.29
267 0.2
268 0.18
269 0.14
270 0.14
271 0.15
272 0.14
273 0.11
274 0.13
275 0.12
276 0.15
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.13
282 0.11
283 0.11
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.11
296 0.11
297 0.14
298 0.2
299 0.23
300 0.26
301 0.27
302 0.27
303 0.32
304 0.38
305 0.38
306 0.34
307 0.36
308 0.35
309 0.38
310 0.4
311 0.35
312 0.3
313 0.34
314 0.35
315 0.33
316 0.31
317 0.3
318 0.33
319 0.36
320 0.38
321 0.37
322 0.34
323 0.31
324 0.35
325 0.38
326 0.36
327 0.33
328 0.35
329 0.38
330 0.46
331 0.51
332 0.5
333 0.53
334 0.55
335 0.54
336 0.56
337 0.53
338 0.5
339 0.54
340 0.58
341 0.54
342 0.52
343 0.57
344 0.6
345 0.63
346 0.64
347 0.6
348 0.55
349 0.56
350 0.55
351 0.53
352 0.45
353 0.4
354 0.35
355 0.31
356 0.27
357 0.23
358 0.22
359 0.18
360 0.19
361 0.19
362 0.17
363 0.19
364 0.21
365 0.19
366 0.2
367 0.21
368 0.25
369 0.3
370 0.39
371 0.45
372 0.54
373 0.62
374 0.7
375 0.75
376 0.79
377 0.81
378 0.83
379 0.84
380 0.8
381 0.8
382 0.74
383 0.7
384 0.64
385 0.57
386 0.51
387 0.5
388 0.48
389 0.44
390 0.43
391 0.44
392 0.43
393 0.43
394 0.38
395 0.3
396 0.33
397 0.37
398 0.4
399 0.4
400 0.38
401 0.4
402 0.41
403 0.42
404 0.36
405 0.29
406 0.23
407 0.19
408 0.19
409 0.16
410 0.14
411 0.11
412 0.13
413 0.14
414 0.16
415 0.17
416 0.19
417 0.19
418 0.21
419 0.21
420 0.21
421 0.25
422 0.24
423 0.26
424 0.27
425 0.25
426 0.26
427 0.29
428 0.27
429 0.21
430 0.21
431 0.19
432 0.19
433 0.22
434 0.2
435 0.16
436 0.16
437 0.2
438 0.21
439 0.2
440 0.18
441 0.16
442 0.17
443 0.19
444 0.21
445 0.18
446 0.16
447 0.16
448 0.15
449 0.16
450 0.15
451 0.16
452 0.13
453 0.14
454 0.14
455 0.14
456 0.15
457 0.13
458 0.13
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.11
463 0.2
464 0.2
465 0.22
466 0.22
467 0.25
468 0.25
469 0.25
470 0.25
471 0.17
472 0.15
473 0.12
474 0.11
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.05
479 0.05
480 0.09
481 0.1
482 0.1
483 0.15
484 0.23
485 0.3
486 0.34
487 0.37
488 0.35
489 0.4
490 0.41
491 0.45
492 0.47
493 0.45
494 0.43
495 0.42
496 0.41
497 0.37
498 0.38
499 0.3
500 0.21
501 0.19
502 0.17
503 0.2
504 0.21
505 0.22
506 0.22
507 0.21
508 0.21
509 0.21
510 0.21
511 0.17
512 0.17
513 0.17
514 0.2
515 0.21
516 0.26
517 0.28
518 0.31
519 0.31
520 0.32
521 0.29
522 0.27
523 0.28
524 0.21
525 0.17
526 0.15
527 0.13
528 0.11
529 0.1
530 0.08
531 0.07
532 0.07
533 0.07
534 0.06
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.06
539 0.11
540 0.14
541 0.19
542 0.21
543 0.22
544 0.23
545 0.25
546 0.28
547 0.31
548 0.33
549 0.37
550 0.44
551 0.51
552 0.6
553 0.58
554 0.57
555 0.54
556 0.5
557 0.48
558 0.49
559 0.53
560 0.54
561 0.64
562 0.72
563 0.78
564 0.84
565 0.86