FuNGI

A0A0D2IHP6

Protein Details

Accession

A0A0D2IHP6

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-38	TPMIRRKKPASDPFFKGPRF	Hydrophilic
209-228	PSQNTGKKLNFKKKTQQVFR	Hydrophilic
538-561	GTDASTRKKKLKSKHVPSSQPTPG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-28	RRKKPA
154-166	HRRDPRAPPPGQK
426-445	KREAEARKKNFKDLRKALER
545-550	KKKLKS

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNPGSAPSGGPATRPPGATPMIRRKKPASDPFFKGPRFKPAATKPQLNGHLTPPVNGNVNMNVNGHSPPKPQSLTALHSRPLSPSKATIPDHERVSGFSDPRIAAEGISYTDYKLVTTKRDLLNGLRYHILQLAGDKPIDIRNEAEFSKPVRLHRRDPRAPPPGQKEEKKEEEQAEPKDGLNAAEREDLNRRKEIRQKEREANLAQIAPSQNTGKKLNFKKKTQQVFRPDFTAEEKRRIQNNYEEKLPWHLEDFDNKHCFIGHHQIGSVCSNAAFVYEPAVDASTGKFRLIPIEKVYQFKPKRENLQKMTIEEVEAAMKKGGSDPEWLIRHREARIQEALKERAVRESKALFSGAARTTTDAGRTGEEADLDYEDDFADDEEGDLFVDKDEDEKLAEKRIKEDQLQANFLDFKDLKEYDEAEEREKREAEARKKNFKDLRKALERRERNYNHGSDSEYESSTDSEEERERIERERLANIKKEEEAEAKKSALSSGANTPSGRKEKRGSDHDDEGGMKKSTSTRSLKRPGSPNLSDASGTDASTRKKKLKSKHVPSSQPTPGHSRPMSPVNFPPSSSAPQTLDPLAALKARKRAGAASPIGAGSDTDTDGAAMSDSSRARRLKLKMSASPPPSGAAGTASPPAQPSSRAASPTPVSAGGSVPRPVAFPSAQDIKNAIPPQGITIKDLMKVVAHPKDKQKEFVALVKEVASYHKERGVLLPK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.27
3	0.27
4	0.31
5	0.35
6	0.41
7	0.47
8	0.54
9	0.57
10	0.62
11	0.64
12	0.69
13	0.74
14	0.75
15	0.74
16	0.72
17	0.75
18	0.78
19	0.81
20	0.75
21	0.73
22	0.65
23	0.66
24	0.64
25	0.59
26	0.6
27	0.61
28	0.68
29	0.67
30	0.72
31	0.65
32	0.67
33	0.72
34	0.66
35	0.59
36	0.51
37	0.53
38	0.45
39	0.43
40	0.37
41	0.32
42	0.32
43	0.3
44	0.29
45	0.25
46	0.28
47	0.28
48	0.26
49	0.24
50	0.22
51	0.24
52	0.25
53	0.24
54	0.24
55	0.27
56	0.33
57	0.34
58	0.33
59	0.37
60	0.4
61	0.42
62	0.47
63	0.47
64	0.43
65	0.44
66	0.44
67	0.41
68	0.41
69	0.39
70	0.33
71	0.32
72	0.35
73	0.4
74	0.41
75	0.44
76	0.45
77	0.47
78	0.47
79	0.46
80	0.41
81	0.34
82	0.37
83	0.35
84	0.29
85	0.25
86	0.27
87	0.24
88	0.24
89	0.27
90	0.22
91	0.16
92	0.16
93	0.15
94	0.12
95	0.14
96	0.14
97	0.11
98	0.12
99	0.12
100	0.12
101	0.16
102	0.17
103	0.2
104	0.25
105	0.32
106	0.33
107	0.37
108	0.39
109	0.39
110	0.45
111	0.42
112	0.4
113	0.34
114	0.32
115	0.29
116	0.29
117	0.25
118	0.16
119	0.17
120	0.17
121	0.17
122	0.16
123	0.15
124	0.14
125	0.18
126	0.19
127	0.17
128	0.16
129	0.17
130	0.21
131	0.21
132	0.23
133	0.21
134	0.22
135	0.29
136	0.3
137	0.35
138	0.42
139	0.47
140	0.54
141	0.62
142	0.7
143	0.71
144	0.76
145	0.79
146	0.77
147	0.77
148	0.76
149	0.75
150	0.74
151	0.74
152	0.73
153	0.7
154	0.7
155	0.72
156	0.67
157	0.65
158	0.58
159	0.57
160	0.58
161	0.53
162	0.48
163	0.42
164	0.38
165	0.34
166	0.3
167	0.24
168	0.21
169	0.19
170	0.17
171	0.2
172	0.2
173	0.21
174	0.29
175	0.34
176	0.33
177	0.38
178	0.4
179	0.43
180	0.51
181	0.59
182	0.62
183	0.66
184	0.71
185	0.73
186	0.74
187	0.74
188	0.67
189	0.6
190	0.52
191	0.42
192	0.34
193	0.28
194	0.25
195	0.18
196	0.19
197	0.18
198	0.18
199	0.21
200	0.25
201	0.25
202	0.34
203	0.43
204	0.52
205	0.57
206	0.62
207	0.68
208	0.74
209	0.8
210	0.8
211	0.79
212	0.79
213	0.78
214	0.73
215	0.66
216	0.57
217	0.48
218	0.45
219	0.46
220	0.38
221	0.38
222	0.41
223	0.43
224	0.48
225	0.49
226	0.47
227	0.47
228	0.54
229	0.49
230	0.48
231	0.43
232	0.39
233	0.41
234	0.39
235	0.3
236	0.22
237	0.22
238	0.19
239	0.26
240	0.29
241	0.31
242	0.32
243	0.31
244	0.29
245	0.28
246	0.27
247	0.24
248	0.29
249	0.24
250	0.22
251	0.23
252	0.24
253	0.24
254	0.25
255	0.21
256	0.11
257	0.09
258	0.09
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.05
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.08
271	0.09
272	0.09
273	0.09
274	0.1
275	0.1
276	0.17
277	0.19
278	0.21
279	0.21
280	0.28
281	0.3
282	0.32
283	0.34
284	0.38
285	0.38
286	0.41
287	0.45
288	0.43
289	0.52
290	0.58
291	0.66
292	0.61
293	0.68
294	0.65
295	0.58
296	0.56
297	0.45
298	0.36
299	0.27
300	0.22
301	0.14
302	0.11
303	0.11
304	0.08
305	0.07
306	0.07
307	0.08
308	0.09
309	0.08
310	0.1
311	0.11
312	0.18
313	0.2
314	0.21
315	0.22
316	0.24
317	0.26
318	0.24
319	0.28
320	0.23
321	0.24
322	0.29
323	0.27
324	0.29
325	0.31
326	0.32
327	0.29
328	0.3
329	0.26
330	0.28
331	0.29
332	0.25
333	0.23
334	0.23
335	0.22
336	0.21
337	0.21
338	0.13
339	0.12
340	0.15
341	0.13
342	0.12
343	0.11
344	0.11
345	0.12
346	0.12
347	0.13
348	0.1
349	0.1
350	0.1
351	0.1
352	0.1
353	0.09
354	0.09
355	0.09
356	0.07
357	0.07
358	0.06
359	0.06
360	0.05
361	0.05
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.04
370	0.03
371	0.04
372	0.04
373	0.03
374	0.04
375	0.03
376	0.04
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.08
381	0.09
382	0.15
383	0.18
384	0.17
385	0.2
386	0.26
387	0.28
388	0.28
389	0.35
390	0.36
391	0.36
392	0.38
393	0.35
394	0.31
395	0.28
396	0.26
397	0.23
398	0.16
399	0.14
400	0.16
401	0.17
402	0.16
403	0.16
404	0.18
405	0.14
406	0.21
407	0.21
408	0.2
409	0.24
410	0.25
411	0.26
412	0.25
413	0.24
414	0.25
415	0.32
416	0.38
417	0.44
418	0.51
419	0.58
420	0.6
421	0.68
422	0.68
423	0.67
424	0.68
425	0.65
426	0.66
427	0.67
428	0.7
429	0.7
430	0.73
431	0.72
432	0.65
433	0.69
434	0.63
435	0.59
436	0.61
437	0.54
438	0.47
439	0.42
440	0.4
441	0.31
442	0.33
443	0.29
444	0.22
445	0.21
446	0.18
447	0.17
448	0.16
449	0.14
450	0.09
451	0.1
452	0.11
453	0.11
454	0.12
455	0.14
456	0.15
457	0.18
458	0.21
459	0.22
460	0.23
461	0.29
462	0.34
463	0.36
464	0.42
465	0.4
466	0.4
467	0.37
468	0.36
469	0.32
470	0.32
471	0.32
472	0.29
473	0.29
474	0.26
475	0.26
476	0.24
477	0.22
478	0.17
479	0.14
480	0.13
481	0.17
482	0.19
483	0.21
484	0.21
485	0.23
486	0.28
487	0.36
488	0.35
489	0.34
490	0.37
491	0.43
492	0.52
493	0.57
494	0.58
495	0.56
496	0.59
497	0.55
498	0.51
499	0.44
500	0.38
501	0.34
502	0.26
503	0.2
504	0.16
505	0.19
506	0.21
507	0.27
508	0.33
509	0.36
510	0.45
511	0.55
512	0.59
513	0.63
514	0.67
515	0.67
516	0.68
517	0.63
518	0.56
519	0.48
520	0.44
521	0.37
522	0.29
523	0.27
524	0.19
525	0.17
526	0.17
527	0.19
528	0.22
529	0.29
530	0.34
531	0.36
532	0.44
533	0.51
534	0.59
535	0.66
536	0.73
537	0.77
538	0.83
539	0.85
540	0.86
541	0.83
542	0.82
543	0.78
544	0.7
545	0.62
546	0.6
547	0.53
548	0.52
549	0.48
550	0.42
551	0.39
552	0.44
553	0.43
554	0.39
555	0.42
556	0.4
557	0.41
558	0.38
559	0.38
560	0.34
561	0.35
562	0.34
563	0.32
564	0.27
565	0.28
566	0.3
567	0.27
568	0.23
569	0.19
570	0.17
571	0.15
572	0.16
573	0.17
574	0.18
575	0.25
576	0.26
577	0.28
578	0.28
579	0.3
580	0.32
581	0.38
582	0.37
583	0.31
584	0.3
585	0.29
586	0.27
587	0.23
588	0.18
589	0.11
590	0.1
591	0.09
592	0.08
593	0.08
594	0.08
595	0.08
596	0.08
597	0.06
598	0.05
599	0.05
600	0.09
601	0.11
602	0.14
603	0.2
604	0.22
605	0.25
606	0.33
607	0.38
608	0.44
609	0.51
610	0.57
611	0.58
612	0.63
613	0.69
614	0.64
615	0.62
616	0.53
617	0.45
618	0.38
619	0.3
620	0.24
621	0.17
622	0.15
623	0.13
624	0.15
625	0.14
626	0.13
627	0.14
628	0.16
629	0.15
630	0.16
631	0.18
632	0.23
633	0.26
634	0.29
635	0.29
636	0.33
637	0.33
638	0.33
639	0.32
640	0.26
641	0.23
642	0.21
643	0.22
644	0.18
645	0.2
646	0.19
647	0.18
648	0.18
649	0.18
650	0.19
651	0.22
652	0.19
653	0.17
654	0.22
655	0.29
656	0.3
657	0.3
658	0.31
659	0.28
660	0.36
661	0.35
662	0.3
663	0.24
664	0.23
665	0.27
666	0.31
667	0.29
668	0.24
669	0.27
670	0.27
671	0.28
672	0.28
673	0.24
674	0.19
675	0.22
676	0.28
677	0.32
678	0.36
679	0.4
680	0.5
681	0.59
682	0.62
683	0.64
684	0.6
685	0.59
686	0.58
687	0.59
688	0.54
689	0.46
690	0.43
691	0.38
692	0.34
693	0.27
694	0.27
695	0.25
696	0.23
697	0.25
698	0.28
699	0.28
700	0.28

A0A0D2IHP6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer