Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2IGM8

Protein Details
Accession A0A0D2IGM8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
371-398LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
177-206AKAKAKVSRKKSPSTSKLAEKAPTLKRKAR
377-390KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 8, mito_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MKANPTESSHNASQPSSQVLSLVSSFLAEHGFHSTIKALKKELKRTNQSAEVLTIRDSQDGVNLQEIVENWNKQGELQPTQSSSEDNSSDASESATSGSASESSGASSAEESDGSMSSEDTSALESESESGTDEEKINKKLSSNLKKVKANKRDPSPSSSSSASSDSDADDEREIGAKAKAKVSRKKSPSTSKLAEKAPTLKRKARSSSPESSSSDADSDSSDDDRPVKRAKTDANNDTEKTSSSEVSSSSSDEDSDDAKDSSSEAEKVEDEGMSTDMSKDQAEPDGAADDLSDSSSGTVTGDVVEPDVSSARQLGAIINKDDKQPVAGKKAHVGARPTPLAQLSAQATADSHISNAYRSYDYADRAYKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDISGGKAFKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.35
3 0.29
4 0.25
5 0.22
6 0.2
7 0.21
8 0.18
9 0.16
10 0.11
11 0.1
12 0.1
13 0.1
14 0.11
15 0.09
16 0.09
17 0.13
18 0.15
19 0.14
20 0.16
21 0.18
22 0.21
23 0.26
24 0.28
25 0.29
26 0.36
27 0.45
28 0.54
29 0.61
30 0.67
31 0.71
32 0.75
33 0.77
34 0.76
35 0.7
36 0.62
37 0.56
38 0.47
39 0.39
40 0.34
41 0.31
42 0.24
43 0.22
44 0.2
45 0.16
46 0.19
47 0.2
48 0.19
49 0.17
50 0.16
51 0.15
52 0.16
53 0.17
54 0.17
55 0.2
56 0.19
57 0.18
58 0.2
59 0.2
60 0.19
61 0.24
62 0.25
63 0.26
64 0.29
65 0.32
66 0.31
67 0.34
68 0.34
69 0.29
70 0.26
71 0.25
72 0.21
73 0.19
74 0.18
75 0.16
76 0.17
77 0.15
78 0.14
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.1
121 0.15
122 0.19
123 0.22
124 0.23
125 0.24
126 0.24
127 0.3
128 0.4
129 0.44
130 0.5
131 0.55
132 0.6
133 0.66
134 0.74
135 0.77
136 0.77
137 0.77
138 0.75
139 0.75
140 0.77
141 0.74
142 0.71
143 0.67
144 0.59
145 0.53
146 0.46
147 0.39
148 0.31
149 0.3
150 0.24
151 0.18
152 0.16
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.11
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.1
164 0.13
165 0.15
166 0.19
167 0.24
168 0.31
169 0.39
170 0.46
171 0.53
172 0.54
173 0.6
174 0.64
175 0.69
176 0.67
177 0.67
178 0.64
179 0.6
180 0.6
181 0.56
182 0.49
183 0.41
184 0.42
185 0.42
186 0.45
187 0.45
188 0.45
189 0.48
190 0.53
191 0.56
192 0.55
193 0.55
194 0.54
195 0.57
196 0.55
197 0.54
198 0.49
199 0.47
200 0.4
201 0.33
202 0.26
203 0.18
204 0.15
205 0.1
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.12
212 0.12
213 0.15
214 0.19
215 0.19
216 0.19
217 0.23
218 0.29
219 0.35
220 0.42
221 0.44
222 0.46
223 0.48
224 0.47
225 0.44
226 0.38
227 0.3
228 0.25
229 0.2
230 0.15
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.11
240 0.1
241 0.11
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.1
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.08
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.14
304 0.17
305 0.2
306 0.23
307 0.24
308 0.26
309 0.27
310 0.25
311 0.23
312 0.27
313 0.29
314 0.34
315 0.36
316 0.36
317 0.39
318 0.46
319 0.47
320 0.45
321 0.44
322 0.41
323 0.45
324 0.45
325 0.41
326 0.37
327 0.32
328 0.3
329 0.25
330 0.25
331 0.19
332 0.19
333 0.18
334 0.16
335 0.16
336 0.15
337 0.16
338 0.11
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.11
343 0.13
344 0.15
345 0.15
346 0.16
347 0.21
348 0.22
349 0.25
350 0.3
351 0.33
352 0.32
353 0.33
354 0.33
355 0.3
356 0.28
357 0.29
358 0.29
359 0.31
360 0.32
361 0.34
362 0.38
363 0.38
364 0.43
365 0.47
366 0.52
367 0.55
368 0.64
369 0.71
370 0.76
371 0.85
372 0.87
373 0.9
374 0.91
375 0.9
376 0.9
377 0.88
378 0.86
379 0.84
380 0.78
381 0.67
382 0.56
383 0.49
384 0.4
385 0.33
386 0.25
387 0.17
388 0.14