Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2HKI2

Protein Details
Accession A0A0D2HKI2    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-84KSVKDAQSLSPPKKRKRDTEGIDTSKKKKKPRTEDVAETPAAIAESPVERKEKKKKKKKKQKLEEEGDAVVHydrophilic
292-317NGPSREQLPKTKKGRKGRLRDENGLDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-45PPKKRKRDTEGIDTSKKKKKPR
62-75ERKEKKKKKKKKQK
298-309QLPKTKKGRKGR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSVQAKHKHTTSSKSVKDAQSLSPPKKRKRDTEGIDTSKKKKKPRTEDVAETPAAIAESPVERKEKKKKKKKKQKLEEEGDAVVRRVEEEEEAPVSQDAEQRDEDATDEDMKSTEETDAAVLDGSVAVDEEEVEETEFKLLESEDPSSFYSTRLSLYLSIPAISLEAAKSSVLAVHLAPLLLTYFPPARGIVLGFSDPVLSAQPNSSINLPLLPPRNGEIEAQAEVLADTADEFGVCWVWLTATFLVFRPERGDELCGWTNVTSEGFVGLVSYNYFQTAIGKSRIPAEWKWNGPSREQLPKTKKGRKGRLRDENGLDEEEEAGTQETATTLAEAPSSQTLLADDGGYFADASGTKIKSTLKFRVADTEIVPAHDRNKWSLQIDGTLLDDEAERNVLEEERAKFERVQETSRSRSLGGEDAAVMSGALSRSLSREGSVGSRISGHTPGRHRVTY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.69
3 0.64
4 0.65
5 0.61
6 0.55
7 0.56
8 0.6
9 0.62
10 0.63
11 0.69
12 0.72
13 0.79
14 0.83
15 0.82
16 0.82
17 0.85
18 0.83
19 0.84
20 0.85
21 0.83
22 0.83
23 0.8
24 0.79
25 0.77
26 0.76
27 0.75
28 0.74
29 0.77
30 0.79
31 0.83
32 0.84
33 0.84
34 0.87
35 0.85
36 0.81
37 0.7
38 0.59
39 0.48
40 0.38
41 0.29
42 0.19
43 0.11
44 0.07
45 0.1
46 0.13
47 0.16
48 0.21
49 0.24
50 0.33
51 0.45
52 0.54
53 0.62
54 0.71
55 0.79
56 0.85
57 0.94
58 0.96
59 0.96
60 0.97
61 0.97
62 0.97
63 0.95
64 0.91
65 0.83
66 0.73
67 0.65
68 0.55
69 0.43
70 0.33
71 0.23
72 0.16
73 0.14
74 0.13
75 0.11
76 0.11
77 0.13
78 0.14
79 0.14
80 0.14
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.15
85 0.14
86 0.15
87 0.16
88 0.16
89 0.17
90 0.16
91 0.15
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.13
96 0.12
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.1
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.04
118 0.04
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.09
130 0.12
131 0.11
132 0.14
133 0.15
134 0.17
135 0.17
136 0.16
137 0.15
138 0.13
139 0.14
140 0.12
141 0.13
142 0.12
143 0.13
144 0.15
145 0.14
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.09
151 0.08
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.12
199 0.15
200 0.15
201 0.15
202 0.16
203 0.17
204 0.17
205 0.17
206 0.15
207 0.13
208 0.12
209 0.12
210 0.1
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.05
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.02
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.05
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.12
237 0.12
238 0.13
239 0.13
240 0.15
241 0.12
242 0.18
243 0.19
244 0.16
245 0.16
246 0.15
247 0.14
248 0.13
249 0.12
250 0.07
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.05
264 0.08
265 0.1
266 0.13
267 0.14
268 0.15
269 0.15
270 0.18
271 0.2
272 0.22
273 0.22
274 0.26
275 0.3
276 0.32
277 0.36
278 0.4
279 0.4
280 0.37
281 0.42
282 0.39
283 0.43
284 0.45
285 0.5
286 0.5
287 0.58
288 0.67
289 0.69
290 0.73
291 0.74
292 0.81
293 0.81
294 0.85
295 0.86
296 0.87
297 0.85
298 0.84
299 0.77
300 0.71
301 0.63
302 0.53
303 0.43
304 0.32
305 0.25
306 0.18
307 0.13
308 0.09
309 0.07
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.09
329 0.08
330 0.06
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.08
339 0.13
340 0.14
341 0.14
342 0.16
343 0.2
344 0.25
345 0.32
346 0.38
347 0.4
348 0.42
349 0.43
350 0.49
351 0.48
352 0.44
353 0.38
354 0.37
355 0.3
356 0.29
357 0.3
358 0.23
359 0.24
360 0.25
361 0.26
362 0.24
363 0.29
364 0.31
365 0.31
366 0.33
367 0.32
368 0.3
369 0.3
370 0.26
371 0.22
372 0.17
373 0.16
374 0.12
375 0.11
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.07
380 0.07
381 0.09
382 0.09
383 0.1
384 0.16
385 0.18
386 0.23
387 0.26
388 0.27
389 0.28
390 0.33
391 0.4
392 0.39
393 0.41
394 0.43
395 0.48
396 0.52
397 0.54
398 0.5
399 0.42
400 0.4
401 0.38
402 0.35
403 0.29
404 0.23
405 0.2
406 0.19
407 0.18
408 0.16
409 0.12
410 0.07
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.08
416 0.11
417 0.14
418 0.15
419 0.14
420 0.15
421 0.16
422 0.19
423 0.22
424 0.21
425 0.19
426 0.2
427 0.21
428 0.23
429 0.27
430 0.28
431 0.32
432 0.38
433 0.46