FuNGI

A0A0D2IWF3

Protein Details

Accession

A0A0D2IWF3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-43	AAKPRPRAGIQRKTKAEREQFA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
19-72	RGGAAKPRPRAGIQRKTKAEREQFAKAEAERQKARAAEVNRGARGGRATTRGGR

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSDDSPSTAPTASARSTTRGGAAKPRPRAGIQRKTKAEREQFAKAEAERQKARAAEVNRGARGGRATTRGGRGSSAAGHREEPVAGGGVFGAGSSARLPTKSRTSYEGYGELVEGSLRRVEDAHQAASASGRATTAGHNGSGQAVTLAAGKAGIPRTAAALDTTTDEEPDDENKRDIERIMISSDDDDDEDIVTTSSRKGKQKATSSTKRMPTRGLALRPVRAPRTLKEEEGQEGDAGRLRSKRARTAAGHSKDAEPQEIDSKSEPEEDTEDAGDSESLQFIKEQPSSPEMRKRTLKKQLGASAGKTTGRDVNKGPVTETVEERAERMRAMEDTQKLRRLFVPAPATDVKMKVDEDEDKSEEEEDTTSELKDGKLFLFQLPPLTPFLVDSTTAMHTNGAAVKTEPGTTGNSTTTIDLEASDERTAGAANTTDPEIKADPDAPAKATAKPGLQMDGLLTASEPKRLPAGVVGKLRVHKSGKVTLDWGGTDMEVRYGSEVNFLQDVVLVEPGRRKQEDPAQEEDENGGASGGGGDDDDDDRAEKEKQEKDIKGTAYAMGPVRRKMVLIPDWVKLYD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.26
3	0.28
4	0.29
5	0.32
6	0.32
7	0.33
8	0.39
9	0.47
10	0.51
11	0.57
12	0.6
13	0.59
14	0.59
15	0.67
16	0.68
17	0.68
18	0.7
19	0.72
20	0.77
21	0.8
22	0.83
23	0.83
24	0.81
25	0.79
26	0.75
27	0.73
28	0.66
29	0.62
30	0.59
31	0.49
32	0.49
33	0.46
34	0.48
35	0.43
36	0.43
37	0.44
38	0.41
39	0.43
40	0.42
41	0.39
42	0.4
43	0.45
44	0.5
45	0.46
46	0.46
47	0.43
48	0.37
49	0.37
50	0.32
51	0.27
52	0.25
53	0.29
54	0.33
55	0.39
56	0.4
57	0.38
58	0.35
59	0.32
60	0.3
61	0.31
62	0.3
63	0.28
64	0.27
65	0.27
66	0.27
67	0.27
68	0.24
69	0.2
70	0.15
71	0.13
72	0.11
73	0.1
74	0.08
75	0.07
76	0.07
77	0.06
78	0.05
79	0.03
80	0.04
81	0.05
82	0.07
83	0.08
84	0.1
85	0.13
86	0.18
87	0.28
88	0.32
89	0.34
90	0.37
91	0.42
92	0.45
93	0.46
94	0.43
95	0.35
96	0.3
97	0.28
98	0.23
99	0.16
100	0.13
101	0.09
102	0.08
103	0.09
104	0.08
105	0.08
106	0.09
107	0.11
108	0.18
109	0.21
110	0.21
111	0.2
112	0.2
113	0.2
114	0.2
115	0.19
116	0.11
117	0.08
118	0.07
119	0.07
120	0.08
121	0.09
122	0.13
123	0.13
124	0.13
125	0.13
126	0.13
127	0.14
128	0.13
129	0.11
130	0.07
131	0.06
132	0.06
133	0.07
134	0.06
135	0.05
136	0.05
137	0.06
138	0.09
139	0.1
140	0.1
141	0.09
142	0.1
143	0.11
144	0.12
145	0.12
146	0.09
147	0.09
148	0.09
149	0.1
150	0.12
151	0.11
152	0.11
153	0.1
154	0.1
155	0.11
156	0.14
157	0.17
158	0.16
159	0.17
160	0.18
161	0.2
162	0.2
163	0.19
164	0.18
165	0.16
166	0.16
167	0.16
168	0.15
169	0.15
170	0.14
171	0.14
172	0.12
173	0.09
174	0.08
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.06
179	0.05
180	0.05
181	0.06
182	0.08
183	0.14
184	0.2
185	0.25
186	0.3
187	0.37
188	0.45
189	0.54
190	0.62
191	0.66
192	0.69
193	0.72
194	0.75
195	0.76
196	0.72
197	0.65
198	0.58
199	0.5
200	0.49
201	0.48
202	0.43
203	0.42
204	0.4
205	0.41
206	0.42
207	0.44
208	0.38
209	0.36
210	0.36
211	0.3
212	0.36
213	0.35
214	0.33
215	0.31
216	0.31
217	0.28
218	0.27
219	0.25
220	0.17
221	0.15
222	0.13
223	0.14
224	0.12
225	0.12
226	0.12
227	0.14
228	0.2
229	0.22
230	0.29
231	0.3
232	0.36
233	0.36
234	0.43
235	0.51
236	0.49
237	0.49
238	0.43
239	0.41
240	0.38
241	0.36
242	0.28
243	0.19
244	0.16
245	0.18
246	0.17
247	0.17
248	0.15
249	0.15
250	0.14
251	0.16
252	0.15
253	0.11
254	0.12
255	0.12
256	0.12
257	0.11
258	0.1
259	0.08
260	0.08
261	0.07
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.04
266	0.04
267	0.05
268	0.05
269	0.09
270	0.11
271	0.11
272	0.13
273	0.16
274	0.19
275	0.22
276	0.29
277	0.28
278	0.32
279	0.39
280	0.43
281	0.49
282	0.56
283	0.6
284	0.56
285	0.6
286	0.6
287	0.59
288	0.55
289	0.47
290	0.39
291	0.35
292	0.31
293	0.25
294	0.2
295	0.19
296	0.18
297	0.19
298	0.18
299	0.23
300	0.25
301	0.25
302	0.25
303	0.22
304	0.25
305	0.24
306	0.24
307	0.19
308	0.18
309	0.18
310	0.18
311	0.16
312	0.13
313	0.12
314	0.11
315	0.1
316	0.09
317	0.12
318	0.17
319	0.2
320	0.25
321	0.28
322	0.34
323	0.33
324	0.34
325	0.33
326	0.33
327	0.3
328	0.31
329	0.33
330	0.26
331	0.31
332	0.31
333	0.31
334	0.27
335	0.26
336	0.2
337	0.16
338	0.17
339	0.12
340	0.14
341	0.16
342	0.18
343	0.21
344	0.21
345	0.2
346	0.2
347	0.2
348	0.18
349	0.14
350	0.11
351	0.08
352	0.09
353	0.09
354	0.09
355	0.09
356	0.1
357	0.09
358	0.1
359	0.11
360	0.09
361	0.11
362	0.12
363	0.12
364	0.14
365	0.14
366	0.16
367	0.16
368	0.17
369	0.16
370	0.15
371	0.14
372	0.12
373	0.13
374	0.11
375	0.11
376	0.1
377	0.11
378	0.12
379	0.12
380	0.12
381	0.1
382	0.09
383	0.1
384	0.12
385	0.1
386	0.09
387	0.09
388	0.11
389	0.12
390	0.12
391	0.11
392	0.1
393	0.12
394	0.13
395	0.15
396	0.14
397	0.14
398	0.15
399	0.14
400	0.13
401	0.12
402	0.1
403	0.08
404	0.1
405	0.1
406	0.11
407	0.1
408	0.1
409	0.09
410	0.09
411	0.09
412	0.07
413	0.07
414	0.06
415	0.06
416	0.08
417	0.09
418	0.1
419	0.1
420	0.12
421	0.12
422	0.13
423	0.14
424	0.14
425	0.15
426	0.17
427	0.18
428	0.17
429	0.21
430	0.22
431	0.22
432	0.24
433	0.25
434	0.23
435	0.25
436	0.24
437	0.22
438	0.21
439	0.19
440	0.16
441	0.15
442	0.14
443	0.11
444	0.1
445	0.12
446	0.13
447	0.17
448	0.16
449	0.15
450	0.17
451	0.17
452	0.18
453	0.2
454	0.25
455	0.28
456	0.32
457	0.34
458	0.36
459	0.4
460	0.41
461	0.41
462	0.39
463	0.36
464	0.38
465	0.43
466	0.42
467	0.4
468	0.41
469	0.37
470	0.36
471	0.32
472	0.27
473	0.19
474	0.16
475	0.15
476	0.13
477	0.11
478	0.09
479	0.09
480	0.1
481	0.11
482	0.11
483	0.14
484	0.15
485	0.15
486	0.15
487	0.15
488	0.13
489	0.14
490	0.14
491	0.11
492	0.14
493	0.12
494	0.13
495	0.19
496	0.23
497	0.28
498	0.3
499	0.3
500	0.35
501	0.44
502	0.52
503	0.52
504	0.54
505	0.54
506	0.52
507	0.51
508	0.45
509	0.36
510	0.26
511	0.21
512	0.14
513	0.07
514	0.07
515	0.06
516	0.05
517	0.04
518	0.04
519	0.04
520	0.06
521	0.07
522	0.07
523	0.08
524	0.09
525	0.1
526	0.13
527	0.15
528	0.19
529	0.26
530	0.32
531	0.4
532	0.49
533	0.52
534	0.56
535	0.61
536	0.57
537	0.53
538	0.48
539	0.42
540	0.33
541	0.34
542	0.32
543	0.32
544	0.34
545	0.33
546	0.35
547	0.33
548	0.33
549	0.32
550	0.36
551	0.35
552	0.41
553	0.42
554	0.42

A0A0D2IWF3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer