Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2IRB8

Protein Details
Accession A0A0D2IRB8    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
957-979ETAKAVLKEYKRRRNAEREWLIEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 10.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences MPFKFKYLVELLEDLDTARKQAQSSSTRPCTPVHELIIHWFRGHDSEIIRHGPSAVAFLSCLLLDRVPHLVYGLREKSLADVLCKALFIENTTRGRQLHGWKATGLDFATCLEKHVMALAENDPPAPHREVTLEEIDVVLRQLAANSRFASPEMKRHRDGVKPEVLLRSILSRLCSKEAKWFVRMIQKSYDPVQIPEHLVLGCFHFLLPDVLPFQNSLEEAIKFLEKPELNSIPHHPPSLLQRQYRRECALHLTPKLGVMIKRQEYARARSIRHCCQMANTRTMSVERKYDGWYCQVHIDKSKGKDCIQLFSKSGKDSTKPWVRLHGALEAGLRLSEADCAITQNCIVEGEMLVWSRSRKAILPFEKIRKYIKYGGRAIGAAADSPRSSDEQLMVIFYDCLWHDNHNLVIEPHHRRRQRLEQIVSVTEGVAQLGDRREIRFGSISAKEELQKFFGYAIEQRWEGLVLKGRRDSYLSPSWNTNAIKLKKDYIKGLGDAADLCIVGGRRDAVEAEKYGGSINWTMFYVACLTNKEAVQTFGIRPEFLILDILSRQTMSEDTFRELNQRGLGFCLPVTELTEQMNVKIDQPNIRRQPPTAYFTKPLVVEVTGAAFTKPSDVAYYTLRFPRDVKLHFGRPLTETHSFEELQEMAKDSLTPAHPEEQEEVDWIMRLTEADGKRNQCVDLHAGGTPSPSRGSVASISMCESSLLAGSRVDPTGTLICPPQPPPSNGAVFVTHSDTLSQKDVSTCRLSPILPSASRVELANESVTLPMTAQHAFGPELGMKRKYEGSNLQTAANKRPRKDATRRLLVPWESSLRTQTPSVHPHKPPAIFQSPTKRMDQRSSASVERQPLGELKNVRVKHGLGKHTTTLAESVDHGEIEPETTVGKSLETRSSATHPQSRSRASSACSLDDIILTVLSSSALSLQEIKSVNWVTMVFVQLVDKANSTVVRNPTYETAKAVLKEYKRRRNAEREWLIERCDGDPNQPQPQPQQQPPSQRRMILFYDEKIRSFFSNSLSNILKGAGDILLKQQVRKYFAGALLINVREDREGVVSRAIWSWRESVRLLDELQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.18
4 0.16
5 0.17
6 0.18
7 0.18
8 0.23
9 0.31
10 0.35
11 0.42
12 0.5
13 0.55
14 0.56
15 0.58
16 0.55
17 0.53
18 0.53
19 0.53
20 0.48
21 0.43
22 0.4
23 0.47
24 0.51
25 0.45
26 0.37
27 0.31
28 0.27
29 0.26
30 0.28
31 0.23
32 0.2
33 0.24
34 0.29
35 0.32
36 0.32
37 0.29
38 0.27
39 0.25
40 0.22
41 0.19
42 0.15
43 0.12
44 0.11
45 0.11
46 0.12
47 0.1
48 0.11
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.12
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.15
57 0.16
58 0.18
59 0.27
60 0.28
61 0.25
62 0.25
63 0.25
64 0.27
65 0.29
66 0.28
67 0.21
68 0.21
69 0.23
70 0.23
71 0.23
72 0.21
73 0.18
74 0.17
75 0.18
76 0.22
77 0.27
78 0.31
79 0.34
80 0.37
81 0.34
82 0.38
83 0.41
84 0.43
85 0.46
86 0.47
87 0.46
88 0.43
89 0.45
90 0.42
91 0.38
92 0.3
93 0.2
94 0.15
95 0.14
96 0.18
97 0.15
98 0.17
99 0.16
100 0.16
101 0.15
102 0.17
103 0.17
104 0.14
105 0.17
106 0.16
107 0.18
108 0.18
109 0.18
110 0.16
111 0.16
112 0.2
113 0.2
114 0.19
115 0.17
116 0.19
117 0.22
118 0.26
119 0.27
120 0.23
121 0.2
122 0.2
123 0.18
124 0.17
125 0.14
126 0.09
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.13
131 0.15
132 0.18
133 0.19
134 0.2
135 0.21
136 0.22
137 0.28
138 0.24
139 0.33
140 0.4
141 0.44
142 0.45
143 0.5
144 0.56
145 0.56
146 0.6
147 0.58
148 0.56
149 0.52
150 0.54
151 0.51
152 0.46
153 0.39
154 0.33
155 0.28
156 0.23
157 0.21
158 0.21
159 0.21
160 0.23
161 0.28
162 0.3
163 0.28
164 0.35
165 0.43
166 0.45
167 0.44
168 0.44
169 0.44
170 0.51
171 0.53
172 0.47
173 0.44
174 0.42
175 0.43
176 0.43
177 0.45
178 0.36
179 0.35
180 0.35
181 0.32
182 0.31
183 0.28
184 0.27
185 0.2
186 0.19
187 0.17
188 0.15
189 0.13
190 0.1
191 0.09
192 0.08
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.12
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.14
205 0.13
206 0.13
207 0.13
208 0.14
209 0.15
210 0.13
211 0.14
212 0.19
213 0.17
214 0.2
215 0.27
216 0.3
217 0.3
218 0.33
219 0.37
220 0.38
221 0.4
222 0.38
223 0.3
224 0.28
225 0.35
226 0.42
227 0.44
228 0.42
229 0.49
230 0.58
231 0.64
232 0.68
233 0.65
234 0.56
235 0.51
236 0.52
237 0.52
238 0.5
239 0.45
240 0.41
241 0.36
242 0.36
243 0.35
244 0.31
245 0.24
246 0.22
247 0.3
248 0.3
249 0.33
250 0.33
251 0.39
252 0.41
253 0.45
254 0.48
255 0.45
256 0.46
257 0.51
258 0.59
259 0.59
260 0.59
261 0.55
262 0.47
263 0.48
264 0.55
265 0.51
266 0.49
267 0.42
268 0.37
269 0.36
270 0.39
271 0.36
272 0.28
273 0.27
274 0.23
275 0.24
276 0.26
277 0.29
278 0.28
279 0.29
280 0.28
281 0.25
282 0.3
283 0.32
284 0.31
285 0.31
286 0.35
287 0.36
288 0.4
289 0.44
290 0.42
291 0.39
292 0.44
293 0.41
294 0.43
295 0.41
296 0.4
297 0.36
298 0.37
299 0.38
300 0.32
301 0.34
302 0.29
303 0.27
304 0.27
305 0.35
306 0.4
307 0.42
308 0.42
309 0.47
310 0.47
311 0.48
312 0.47
313 0.4
314 0.31
315 0.27
316 0.26
317 0.18
318 0.15
319 0.11
320 0.09
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.05
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.09
343 0.1
344 0.11
345 0.11
346 0.14
347 0.19
348 0.29
349 0.33
350 0.41
351 0.47
352 0.54
353 0.57
354 0.56
355 0.55
356 0.48
357 0.48
358 0.48
359 0.47
360 0.47
361 0.47
362 0.47
363 0.44
364 0.41
365 0.35
366 0.28
367 0.22
368 0.14
369 0.11
370 0.09
371 0.07
372 0.08
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.1
377 0.1
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.1
382 0.09
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.06
387 0.07
388 0.08
389 0.09
390 0.1
391 0.11
392 0.13
393 0.12
394 0.12
395 0.11
396 0.13
397 0.19
398 0.26
399 0.32
400 0.39
401 0.41
402 0.44
403 0.51
404 0.59
405 0.62
406 0.64
407 0.6
408 0.57
409 0.57
410 0.55
411 0.48
412 0.37
413 0.26
414 0.17
415 0.13
416 0.08
417 0.06
418 0.05
419 0.06
420 0.07
421 0.09
422 0.09
423 0.1
424 0.12
425 0.12
426 0.14
427 0.13
428 0.13
429 0.16
430 0.17
431 0.19
432 0.19
433 0.2
434 0.2
435 0.21
436 0.22
437 0.19
438 0.16
439 0.14
440 0.14
441 0.13
442 0.12
443 0.12
444 0.13
445 0.13
446 0.13
447 0.13
448 0.12
449 0.12
450 0.12
451 0.11
452 0.16
453 0.16
454 0.18
455 0.21
456 0.22
457 0.22
458 0.23
459 0.23
460 0.23
461 0.29
462 0.29
463 0.27
464 0.28
465 0.28
466 0.32
467 0.3
468 0.28
469 0.28
470 0.29
471 0.31
472 0.31
473 0.36
474 0.35
475 0.37
476 0.35
477 0.31
478 0.3
479 0.27
480 0.26
481 0.21
482 0.17
483 0.15
484 0.13
485 0.08
486 0.06
487 0.05
488 0.06
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.06
496 0.06
497 0.07
498 0.08
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.08
505 0.08
506 0.08
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.08
513 0.08
514 0.09
515 0.09
516 0.1
517 0.13
518 0.13
519 0.13
520 0.12
521 0.12
522 0.12
523 0.12
524 0.12
525 0.13
526 0.14
527 0.12
528 0.12
529 0.12
530 0.11
531 0.09
532 0.1
533 0.05
534 0.06
535 0.06
536 0.07
537 0.06
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.06
542 0.07
543 0.09
544 0.1
545 0.12
546 0.13
547 0.13
548 0.16
549 0.17
550 0.17
551 0.16
552 0.15
553 0.14
554 0.15
555 0.15
556 0.11
557 0.1
558 0.09
559 0.07
560 0.07
561 0.09
562 0.08
563 0.08
564 0.09
565 0.11
566 0.11
567 0.11
568 0.14
569 0.12
570 0.13
571 0.16
572 0.17
573 0.21
574 0.24
575 0.33
576 0.36
577 0.4
578 0.39
579 0.37
580 0.42
581 0.4
582 0.41
583 0.36
584 0.34
585 0.33
586 0.33
587 0.34
588 0.27
589 0.23
590 0.19
591 0.15
592 0.12
593 0.1
594 0.09
595 0.07
596 0.07
597 0.06
598 0.06
599 0.05
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.07
605 0.09
606 0.12
607 0.14
608 0.15
609 0.18
610 0.18
611 0.18
612 0.19
613 0.23
614 0.26
615 0.27
616 0.31
617 0.34
618 0.38
619 0.41
620 0.4
621 0.36
622 0.31
623 0.31
624 0.3
625 0.29
626 0.26
627 0.24
628 0.26
629 0.24
630 0.23
631 0.23
632 0.17
633 0.14
634 0.12
635 0.12
636 0.1
637 0.09
638 0.09
639 0.08
640 0.11
641 0.11
642 0.13
643 0.12
644 0.17
645 0.17
646 0.18
647 0.2
648 0.18
649 0.17
650 0.17
651 0.16
652 0.11
653 0.11
654 0.09
655 0.07
656 0.06
657 0.05
658 0.05
659 0.12
660 0.13
661 0.17
662 0.22
663 0.24
664 0.26
665 0.27
666 0.27
667 0.2
668 0.22
669 0.21
670 0.18
671 0.17
672 0.16
673 0.15
674 0.15
675 0.15
676 0.13
677 0.1
678 0.09
679 0.08
680 0.09
681 0.09
682 0.11
683 0.11
684 0.13
685 0.12
686 0.12
687 0.13
688 0.13
689 0.12
690 0.1
691 0.09
692 0.07
693 0.07
694 0.08
695 0.07
696 0.06
697 0.07
698 0.09
699 0.09
700 0.09
701 0.07
702 0.09
703 0.11
704 0.11
705 0.11
706 0.11
707 0.13
708 0.15
709 0.17
710 0.22
711 0.24
712 0.26
713 0.29
714 0.33
715 0.32
716 0.3
717 0.3
718 0.24
719 0.21
720 0.21
721 0.19
722 0.15
723 0.13
724 0.14
725 0.13
726 0.14
727 0.15
728 0.14
729 0.12
730 0.15
731 0.16
732 0.2
733 0.23
734 0.21
735 0.21
736 0.22
737 0.22
738 0.2
739 0.24
740 0.25
741 0.22
742 0.24
743 0.24
744 0.23
745 0.23
746 0.22
747 0.19
748 0.14
749 0.15
750 0.13
751 0.11
752 0.11
753 0.1
754 0.1
755 0.08
756 0.07
757 0.07
758 0.08
759 0.09
760 0.09
761 0.09
762 0.1
763 0.11
764 0.11
765 0.11
766 0.11
767 0.15
768 0.18
769 0.2
770 0.19
771 0.21
772 0.27
773 0.26
774 0.29
775 0.34
776 0.34
777 0.39
778 0.4
779 0.41
780 0.4
781 0.41
782 0.45
783 0.47
784 0.47
785 0.41
786 0.49
787 0.53
788 0.58
789 0.66
790 0.68
791 0.68
792 0.73
793 0.74
794 0.68
795 0.69
796 0.61
797 0.53
798 0.46
799 0.41
800 0.33
801 0.31
802 0.31
803 0.26
804 0.26
805 0.25
806 0.27
807 0.29
808 0.36
809 0.42
810 0.46
811 0.46
812 0.51
813 0.56
814 0.53
815 0.5
816 0.49
817 0.49
818 0.43
819 0.47
820 0.51
821 0.52
822 0.52
823 0.55
824 0.52
825 0.5
826 0.54
827 0.55
828 0.49
829 0.46
830 0.49
831 0.46
832 0.45
833 0.44
834 0.41
835 0.35
836 0.32
837 0.28
838 0.27
839 0.26
840 0.27
841 0.25
842 0.26
843 0.33
844 0.33
845 0.34
846 0.34
847 0.34
848 0.36
849 0.42
850 0.43
851 0.4
852 0.44
853 0.43
854 0.42
855 0.41
856 0.34
857 0.27
858 0.21
859 0.17
860 0.14
861 0.15
862 0.13
863 0.13
864 0.12
865 0.11
866 0.1
867 0.1
868 0.1
869 0.07
870 0.07
871 0.07
872 0.08
873 0.07
874 0.08
875 0.1
876 0.13
877 0.18
878 0.19
879 0.21
880 0.23
881 0.28
882 0.34
883 0.37
884 0.41
885 0.4
886 0.46
887 0.51
888 0.53
889 0.53
890 0.5
891 0.47
892 0.43
893 0.48
894 0.43
895 0.38
896 0.34
897 0.3
898 0.26
899 0.22
900 0.21
901 0.13
902 0.1
903 0.08
904 0.06
905 0.06
906 0.05
907 0.05
908 0.04
909 0.06
910 0.06
911 0.07
912 0.1
913 0.1
914 0.15
915 0.16
916 0.16
917 0.21
918 0.21
919 0.21
920 0.2
921 0.2
922 0.17
923 0.18
924 0.19
925 0.14
926 0.13
927 0.14
928 0.15
929 0.18
930 0.17
931 0.15
932 0.14
933 0.16
934 0.18
935 0.2
936 0.24
937 0.26
938 0.29
939 0.29
940 0.31
941 0.35
942 0.37
943 0.36
944 0.32
945 0.3
946 0.3
947 0.3
948 0.32
949 0.34
950 0.36
951 0.46
952 0.54
953 0.61
954 0.67
955 0.73
956 0.78
957 0.82
958 0.83
959 0.84
960 0.82
961 0.78
962 0.74
963 0.69
964 0.63
965 0.56
966 0.48
967 0.39
968 0.36
969 0.31
970 0.31
971 0.37
972 0.39
973 0.44
974 0.45
975 0.46
976 0.47
977 0.57
978 0.6
979 0.58
980 0.63
981 0.61
982 0.7
983 0.74
984 0.76
985 0.7
986 0.66
987 0.61
988 0.58
989 0.55
990 0.52
991 0.49
992 0.43
993 0.48
994 0.45
995 0.44
996 0.4
997 0.38
998 0.32
999 0.32
1000 0.31
1001 0.26
1002 0.32
1003 0.32
1004 0.36
1005 0.35
1006 0.34
1007 0.3
1008 0.28
1009 0.23
1010 0.15
1011 0.16
1012 0.12
1013 0.1
1014 0.11
1015 0.14
1016 0.21
1017 0.22
1018 0.25
1019 0.28
1020 0.32
1021 0.37
1022 0.38
1023 0.38
1024 0.35
1025 0.37
1026 0.4
1027 0.36
1028 0.34
1029 0.34
1030 0.33
1031 0.31
1032 0.26
1033 0.25
1034 0.19
1035 0.19
1036 0.17
1037 0.16
1038 0.18
1039 0.18
1040 0.22
1041 0.21
1042 0.23
1043 0.26
1044 0.27
1045 0.24
1046 0.24
1047 0.28
1048 0.26
1049 0.3
1050 0.29
1051 0.29
1052 0.31
1053 0.33