Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2JNT0

Protein Details
Accession A0A0D2JNT0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
947-968IVNVRFPSLQRNKKRRFCYVEFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034397  Prp24_RRM1  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR031766  RRM_occluded  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16842  RRM_occluded  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12296  RRM1_Prp24  
cd12299  RRM4_Prp24  
Amino Acid Sequences MDINSLLSPSDNTRASSLTPSTGTPSLTHSNSNSNSLSQSQSQPQSPFRHVQRTQSGTAGLVNSPLGRSVQPPSSIPAHVRSPAQQTPHSSPLISPVPAGTASAHLPRSSSTPTMESLADFNASKPSLTSRESTDSQKSSSGLFPHLTSAGATSKPRASIDINMVETPQTVIRADYTDTSLPVEAQQRLAVLAAHIQETPSSYEAHKEIIKILHQGFVDHIYPSSSPNAHGDPRKYDLLADLRRARENLDKLFAVGEEQWLDWLQDESILAQTADERVAVVDKCRRAVTEEYGSTRLWLTYGDWVSYCHKWALDSTGDAQGDVDTERLIGREVFDWSIVLDTWSEAVERTKHDMSRSHEVWDKYLAVRFGDVSQKLPSRDATTVLELFESRLRIPHAEWQQTFQAFSSFVSANIPADQYEEIMASNLRDSADAKKIWNDRDTLEMSLLEPQTAGDTATEYQVFSKYIEWERAEENKPQTQRKGRGKKAQEVRNPYFDLVDALYERAELRFPSVPAIWEEHIDYLIEKSKAGLLDVLARATKHCPWSGSLWKQYMLTSELAEEPFDETEKIKHKATSTGLLDAAGIEEALVVHDAWCGYLLRRTKRPDAIEEDADVAEMGIRSSIEAVHSLASKLGIGSAYDPSFRLQRKYVEYLKSQNRLDNAGAQFNDAVADYGKYYKFWLRYYEFEMQKSMQVALLQRSRPDRLDTLSSAPFAVGVLKQGLQQPGLDYPEPLMEALLNHCEDYEDADELQSAISLVRKVQKELTARRQREVLQAAEVAAQKEQAEEEVASRTQEVANGLHIGKRKRDEESEEEEAKKRQRNEETAAPSIEPDRPPAEELKRDREHASVLVQNIPPNVTETKIRQYFSSCGSVKQVKLLQDEENSVIVEFEDADAASFALSRDGREFEGAELSIILNTGSTLFVTNYLAAADESYIRNLFRSYGEIVNVRFPSLQRNKKRRFCYVEFKRPSEAQAATELDNKDIDGLKLVAKISNPTVRQPRKERSSDGRTIFVGHLPFKATAEDVEKHFTKYGAIEQLRLPKDQKNSSRNRGIAFLTFANAGEAQAALSMHGVEFQGRKLTVNISEGDSRPAKSINGRSKSPSLPPDTASDTTSVTKTVDQDTIESRRQRTVVICDVPDIVNESRIKAVAEKIAPVRKVILKTNHQGAFIEFESIPDAGRAMIELDNLEITPGRHIRVTTEKDMLQQEREHKTDQFARRPAPNAVTPANGPVRRPAQPGVRRKGGHLGQRSSALHGSNEKESSSADTEKESGKKTNEDFRNMINPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.3
4 0.28
5 0.25
6 0.25
7 0.25
8 0.28
9 0.28
10 0.28
11 0.23
12 0.27
13 0.3
14 0.31
15 0.34
16 0.31
17 0.38
18 0.39
19 0.43
20 0.39
21 0.33
22 0.34
23 0.33
24 0.35
25 0.3
26 0.34
27 0.36
28 0.4
29 0.44
30 0.47
31 0.52
32 0.54
33 0.56
34 0.59
35 0.58
36 0.63
37 0.61
38 0.65
39 0.67
40 0.67
41 0.63
42 0.57
43 0.51
44 0.41
45 0.41
46 0.33
47 0.23
48 0.18
49 0.16
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.13
54 0.12
55 0.15
56 0.19
57 0.23
58 0.26
59 0.27
60 0.3
61 0.32
62 0.34
63 0.34
64 0.34
65 0.33
66 0.33
67 0.35
68 0.35
69 0.39
70 0.41
71 0.44
72 0.43
73 0.46
74 0.5
75 0.53
76 0.49
77 0.42
78 0.37
79 0.39
80 0.39
81 0.32
82 0.26
83 0.2
84 0.21
85 0.2
86 0.21
87 0.14
88 0.12
89 0.14
90 0.19
91 0.2
92 0.18
93 0.19
94 0.19
95 0.23
96 0.25
97 0.25
98 0.23
99 0.23
100 0.25
101 0.27
102 0.26
103 0.23
104 0.2
105 0.18
106 0.18
107 0.16
108 0.15
109 0.18
110 0.17
111 0.17
112 0.16
113 0.2
114 0.23
115 0.25
116 0.27
117 0.27
118 0.33
119 0.36
120 0.41
121 0.44
122 0.42
123 0.41
124 0.41
125 0.36
126 0.33
127 0.34
128 0.3
129 0.26
130 0.25
131 0.24
132 0.24
133 0.23
134 0.21
135 0.17
136 0.17
137 0.16
138 0.18
139 0.19
140 0.2
141 0.22
142 0.24
143 0.25
144 0.26
145 0.25
146 0.27
147 0.33
148 0.35
149 0.35
150 0.33
151 0.33
152 0.29
153 0.27
154 0.23
155 0.17
156 0.12
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.13
161 0.14
162 0.14
163 0.17
164 0.17
165 0.17
166 0.18
167 0.17
168 0.16
169 0.18
170 0.22
171 0.19
172 0.19
173 0.19
174 0.18
175 0.18
176 0.18
177 0.14
178 0.09
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.15
187 0.12
188 0.13
189 0.12
190 0.16
191 0.17
192 0.2
193 0.2
194 0.19
195 0.22
196 0.24
197 0.26
198 0.27
199 0.27
200 0.28
201 0.26
202 0.26
203 0.23
204 0.23
205 0.22
206 0.17
207 0.16
208 0.14
209 0.14
210 0.16
211 0.18
212 0.15
213 0.16
214 0.19
215 0.23
216 0.27
217 0.33
218 0.36
219 0.36
220 0.4
221 0.41
222 0.38
223 0.34
224 0.33
225 0.36
226 0.36
227 0.39
228 0.41
229 0.41
230 0.44
231 0.44
232 0.41
233 0.4
234 0.42
235 0.39
236 0.37
237 0.34
238 0.31
239 0.32
240 0.28
241 0.22
242 0.16
243 0.14
244 0.11
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.09
250 0.1
251 0.08
252 0.07
253 0.08
254 0.07
255 0.08
256 0.09
257 0.08
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.09
266 0.1
267 0.14
268 0.19
269 0.21
270 0.24
271 0.24
272 0.25
273 0.26
274 0.3
275 0.32
276 0.34
277 0.36
278 0.37
279 0.39
280 0.38
281 0.34
282 0.3
283 0.24
284 0.15
285 0.13
286 0.1
287 0.15
288 0.16
289 0.16
290 0.16
291 0.18
292 0.22
293 0.23
294 0.23
295 0.17
296 0.16
297 0.16
298 0.17
299 0.2
300 0.17
301 0.18
302 0.19
303 0.22
304 0.22
305 0.21
306 0.2
307 0.15
308 0.14
309 0.13
310 0.1
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.09
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.1
325 0.09
326 0.08
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.09
334 0.11
335 0.13
336 0.19
337 0.22
338 0.24
339 0.27
340 0.32
341 0.36
342 0.43
343 0.42
344 0.4
345 0.41
346 0.4
347 0.39
348 0.36
349 0.31
350 0.24
351 0.25
352 0.23
353 0.17
354 0.17
355 0.16
356 0.16
357 0.2
358 0.19
359 0.18
360 0.22
361 0.25
362 0.25
363 0.26
364 0.26
365 0.24
366 0.24
367 0.24
368 0.23
369 0.23
370 0.22
371 0.21
372 0.19
373 0.15
374 0.16
375 0.15
376 0.14
377 0.1
378 0.12
379 0.13
380 0.14
381 0.15
382 0.22
383 0.28
384 0.34
385 0.34
386 0.36
387 0.38
388 0.37
389 0.37
390 0.28
391 0.22
392 0.15
393 0.15
394 0.15
395 0.11
396 0.11
397 0.12
398 0.12
399 0.11
400 0.12
401 0.12
402 0.08
403 0.09
404 0.09
405 0.08
406 0.08
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.07
414 0.06
415 0.07
416 0.08
417 0.12
418 0.17
419 0.18
420 0.19
421 0.24
422 0.29
423 0.32
424 0.33
425 0.3
426 0.26
427 0.3
428 0.31
429 0.25
430 0.21
431 0.18
432 0.16
433 0.19
434 0.18
435 0.13
436 0.1
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.05
442 0.06
443 0.06
444 0.08
445 0.08
446 0.07
447 0.08
448 0.09
449 0.1
450 0.09
451 0.1
452 0.13
453 0.15
454 0.2
455 0.2
456 0.21
457 0.24
458 0.29
459 0.3
460 0.32
461 0.33
462 0.34
463 0.39
464 0.41
465 0.46
466 0.49
467 0.56
468 0.61
469 0.68
470 0.71
471 0.75
472 0.77
473 0.79
474 0.79
475 0.79
476 0.75
477 0.74
478 0.69
479 0.65
480 0.6
481 0.51
482 0.42
483 0.33
484 0.26
485 0.17
486 0.14
487 0.09
488 0.08
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.06
493 0.07
494 0.06
495 0.09
496 0.11
497 0.11
498 0.13
499 0.14
500 0.14
501 0.15
502 0.18
503 0.15
504 0.13
505 0.14
506 0.12
507 0.11
508 0.1
509 0.09
510 0.08
511 0.11
512 0.11
513 0.1
514 0.1
515 0.12
516 0.12
517 0.12
518 0.11
519 0.07
520 0.11
521 0.12
522 0.12
523 0.11
524 0.11
525 0.12
526 0.13
527 0.16
528 0.14
529 0.15
530 0.16
531 0.17
532 0.23
533 0.31
534 0.35
535 0.37
536 0.36
537 0.35
538 0.35
539 0.33
540 0.29
541 0.23
542 0.17
543 0.12
544 0.12
545 0.12
546 0.11
547 0.11
548 0.09
549 0.08
550 0.07
551 0.08
552 0.07
553 0.06
554 0.1
555 0.15
556 0.18
557 0.18
558 0.2
559 0.21
560 0.26
561 0.27
562 0.3
563 0.26
564 0.25
565 0.24
566 0.22
567 0.2
568 0.15
569 0.13
570 0.06
571 0.05
572 0.03
573 0.03
574 0.02
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.03
579 0.04
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.05
584 0.05
585 0.09
586 0.15
587 0.19
588 0.25
589 0.3
590 0.35
591 0.41
592 0.43
593 0.43
594 0.45
595 0.44
596 0.39
597 0.35
598 0.31
599 0.24
600 0.22
601 0.17
602 0.1
603 0.06
604 0.05
605 0.04
606 0.03
607 0.03
608 0.03
609 0.03
610 0.04
611 0.04
612 0.04
613 0.05
614 0.06
615 0.06
616 0.06
617 0.06
618 0.06
619 0.06
620 0.05
621 0.05
622 0.04
623 0.04
624 0.05
625 0.07
626 0.07
627 0.07
628 0.08
629 0.08
630 0.13
631 0.14
632 0.16
633 0.17
634 0.21
635 0.25
636 0.3
637 0.35
638 0.34
639 0.37
640 0.42
641 0.46
642 0.48
643 0.44
644 0.4
645 0.36
646 0.34
647 0.32
648 0.29
649 0.24
650 0.21
651 0.2
652 0.18
653 0.17
654 0.14
655 0.14
656 0.08
657 0.07
658 0.04
659 0.05
660 0.05
661 0.07
662 0.07
663 0.07
664 0.09
665 0.12
666 0.15
667 0.16
668 0.22
669 0.22
670 0.25
671 0.31
672 0.37
673 0.35
674 0.33
675 0.33
676 0.28
677 0.27
678 0.25
679 0.19
680 0.12
681 0.11
682 0.12
683 0.15
684 0.19
685 0.18
686 0.2
687 0.22
688 0.24
689 0.24
690 0.25
691 0.22
692 0.2
693 0.23
694 0.22
695 0.23
696 0.22
697 0.21
698 0.18
699 0.16
700 0.13
701 0.1
702 0.09
703 0.05
704 0.05
705 0.06
706 0.06
707 0.08
708 0.11
709 0.12
710 0.11
711 0.11
712 0.11
713 0.13
714 0.15
715 0.13
716 0.11
717 0.1
718 0.1
719 0.11
720 0.09
721 0.07
722 0.05
723 0.05
724 0.06
725 0.08
726 0.07
727 0.07
728 0.07
729 0.07
730 0.07
731 0.09
732 0.1
733 0.08
734 0.08
735 0.08
736 0.08
737 0.08
738 0.08
739 0.05
740 0.04
741 0.04
742 0.05
743 0.05
744 0.07
745 0.13
746 0.14
747 0.15
748 0.18
749 0.23
750 0.3
751 0.37
752 0.46
753 0.51
754 0.52
755 0.52
756 0.52
757 0.49
758 0.48
759 0.44
760 0.34
761 0.25
762 0.24
763 0.23
764 0.23
765 0.22
766 0.15
767 0.12
768 0.11
769 0.09
770 0.09
771 0.09
772 0.06
773 0.06
774 0.06
775 0.07
776 0.08
777 0.09
778 0.09
779 0.09
780 0.09
781 0.08
782 0.09
783 0.1
784 0.08
785 0.09
786 0.11
787 0.11
788 0.13
789 0.17
790 0.18
791 0.21
792 0.25
793 0.27
794 0.28
795 0.32
796 0.35
797 0.38
798 0.43
799 0.45
800 0.43
801 0.43
802 0.42
803 0.42
804 0.41
805 0.4
806 0.36
807 0.37
808 0.41
809 0.45
810 0.48
811 0.53
812 0.52
813 0.5
814 0.47
815 0.39
816 0.33
817 0.29
818 0.27
819 0.19
820 0.16
821 0.15
822 0.15
823 0.17
824 0.22
825 0.24
826 0.28
827 0.32
828 0.39
829 0.4
830 0.42
831 0.42
832 0.38
833 0.35
834 0.29
835 0.28
836 0.22
837 0.21
838 0.23
839 0.22
840 0.22
841 0.2
842 0.19
843 0.16
844 0.16
845 0.15
846 0.12
847 0.14
848 0.16
849 0.25
850 0.28
851 0.29
852 0.27
853 0.3
854 0.31
855 0.31
856 0.37
857 0.28
858 0.26
859 0.31
860 0.34
861 0.31
862 0.33
863 0.33
864 0.29
865 0.31
866 0.32
867 0.3
868 0.27
869 0.29
870 0.25
871 0.22
872 0.18
873 0.15
874 0.13
875 0.1
876 0.08
877 0.06
878 0.05
879 0.04
880 0.04
881 0.04
882 0.04
883 0.04
884 0.04
885 0.04
886 0.04
887 0.08
888 0.08
889 0.09
890 0.11
891 0.12
892 0.13
893 0.14
894 0.15
895 0.11
896 0.13
897 0.12
898 0.11
899 0.09
900 0.09
901 0.07
902 0.07
903 0.06
904 0.04
905 0.04
906 0.04
907 0.04
908 0.04
909 0.05
910 0.05
911 0.06
912 0.07
913 0.08
914 0.07
915 0.07
916 0.07
917 0.06
918 0.06
919 0.06
920 0.07
921 0.08
922 0.09
923 0.1
924 0.1
925 0.1
926 0.11
927 0.12
928 0.1
929 0.13
930 0.15
931 0.16
932 0.18
933 0.2
934 0.21
935 0.25
936 0.24
937 0.22
938 0.2
939 0.19
940 0.27
941 0.35
942 0.44
943 0.49
944 0.59
945 0.69
946 0.77
947 0.83
948 0.82
949 0.81
950 0.79
951 0.79
952 0.79
953 0.8
954 0.78
955 0.75
956 0.69
957 0.61
958 0.56
959 0.51
960 0.41
961 0.31
962 0.29
963 0.28
964 0.24
965 0.29
966 0.27
967 0.22
968 0.21
969 0.19
970 0.16
971 0.15
972 0.14
973 0.1
974 0.11
975 0.12
976 0.14
977 0.14
978 0.14
979 0.14
980 0.16
981 0.19
982 0.25
983 0.25
984 0.3
985 0.4
986 0.46
987 0.54
988 0.6
989 0.65
990 0.67
991 0.71
992 0.72
993 0.71
994 0.72
995 0.72
996 0.66
997 0.59
998 0.51
999 0.48
1000 0.42
1001 0.35
1002 0.3
1003 0.22
1004 0.21
1005 0.2
1006 0.2
1007 0.18
1008 0.17
1009 0.15
1010 0.14
1011 0.18
1012 0.19
1013 0.19
1014 0.24
1015 0.24
1016 0.26
1017 0.26
1018 0.24
1019 0.2
1020 0.19
1021 0.23
1022 0.26
1023 0.26
1024 0.26
1025 0.29
1026 0.38
1027 0.38
1028 0.39
1029 0.37
1030 0.33
1031 0.4
1032 0.48
1033 0.53
1034 0.55
1035 0.62
1036 0.69
1037 0.75
1038 0.72
1039 0.66
1040 0.6
1041 0.53
1042 0.45
1043 0.39
1044 0.3
1045 0.23
1046 0.2
1047 0.18
1048 0.16
1049 0.14
1050 0.12
1051 0.09
1052 0.08
1053 0.06
1054 0.07
1055 0.07
1056 0.05
1057 0.05
1058 0.06
1059 0.05
1060 0.07
1061 0.07
1062 0.08
1063 0.09
1064 0.11
1065 0.15
1066 0.15
1067 0.17
1068 0.17
1069 0.2
1070 0.21
1071 0.22
1072 0.22
1073 0.21
1074 0.25
1075 0.25
1076 0.29
1077 0.28
1078 0.26
1079 0.25
1080 0.25
1081 0.24
1082 0.27
1083 0.36
1084 0.41
1085 0.45
1086 0.47
1087 0.51
1088 0.55
1089 0.57
1090 0.56
1091 0.54
1092 0.51
1093 0.48
1094 0.46
1095 0.45
1096 0.45
1097 0.43
1098 0.37
1099 0.31
1100 0.26
1101 0.25
1102 0.24
1103 0.21
1104 0.16
1105 0.17
1106 0.18
1107 0.2
1108 0.21
1109 0.19
1110 0.21
1111 0.26
1112 0.31
1113 0.36
1114 0.39
1115 0.38
1116 0.4
1117 0.4
1118 0.41
1119 0.4
1120 0.4
1121 0.42
1122 0.42
1123 0.4
1124 0.36
1125 0.38
1126 0.34
1127 0.3
1128 0.28
1129 0.19
1130 0.21
1131 0.21
1132 0.21
1133 0.2
1134 0.21
1135 0.21
1136 0.19
1137 0.22
1138 0.22
1139 0.23
1140 0.26
1141 0.32
1142 0.38
1143 0.37
1144 0.36
1145 0.38
1146 0.37
1147 0.4
1148 0.43
1149 0.46
1150 0.47
1151 0.53
1152 0.61
1153 0.59
1154 0.54
1155 0.51
1156 0.44
1157 0.4
1158 0.32
1159 0.29
1160 0.2
1161 0.18
1162 0.19
1163 0.18
1164 0.17
1165 0.12
1166 0.11
1167 0.07
1168 0.07
1169 0.07
1170 0.07
1171 0.08
1172 0.09
1173 0.09
1174 0.09
1175 0.1
1176 0.1
1177 0.1
1178 0.09
1179 0.09
1180 0.15
1181 0.17
1182 0.18
1183 0.19
1184 0.2
1185 0.25
1186 0.34
1187 0.41
1188 0.39
1189 0.42
1190 0.42
1191 0.45
1192 0.52
1193 0.5
1194 0.45
1195 0.43
1196 0.47
1197 0.48
1198 0.51
1199 0.49
1200 0.43
1201 0.48
1202 0.52
1203 0.56
1204 0.57
1205 0.57
1206 0.6
1207 0.62
1208 0.65
1209 0.63
1210 0.59
1211 0.54
1212 0.51
1213 0.46
1214 0.43
1215 0.38
1216 0.4
1217 0.43
1218 0.39
1219 0.36
1220 0.38
1221 0.41
1222 0.43
1223 0.46
1224 0.46
1225 0.48
1226 0.55
1227 0.65
1228 0.66
1229 0.69
1230 0.66
1231 0.65
1232 0.68
1233 0.65
1234 0.64
1235 0.63
1236 0.6
1237 0.54
1238 0.59
1239 0.57
1240 0.51
1241 0.48
1242 0.4
1243 0.35
1244 0.35
1245 0.36
1246 0.35
1247 0.35
1248 0.31
1249 0.28
1250 0.27
1251 0.29
1252 0.28
1253 0.28
1254 0.23
1255 0.25
1256 0.27
1257 0.32
1258 0.36
1259 0.35
1260 0.37
1261 0.38
1262 0.45
1263 0.47
1264 0.55
1265 0.57
1266 0.59
1267 0.57
1268 0.56