Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

F9F8Y6

Protein Details
Accession F9F8Y6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-267DRDERRSQSRGRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-152RKLRRRG
241-267RSQSRGRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSP
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSRNKDTVHADARRFLDERGSNVSVAPNGLNPATIMEKAVKDRIVDSYFYKEQCFALNEADIVDRVVEHVNFIGGTYGVTQKPSPFLCLAFKLLELSPSDAVLMEYLKYGGEAFKYLRALACFYFRLTRQAKDVYEMLEPFLEDRRKLRRRGRAGVVLTFMDEFVDELLTKERVCGTSLWKMPKREVLEDLEILEPRVSPLGDLEDLLEEEDEAEKENGTREESGEISDRDDMEVDRDERRSQSRGRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.4
3 0.39
4 0.35
5 0.36
6 0.37
7 0.36
8 0.32
9 0.32
10 0.33
11 0.24
12 0.23
13 0.2
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.11
19 0.12
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.16
25 0.19
26 0.23
27 0.22
28 0.21
29 0.22
30 0.27
31 0.26
32 0.26
33 0.25
34 0.29
35 0.32
36 0.32
37 0.31
38 0.27
39 0.25
40 0.27
41 0.27
42 0.21
43 0.19
44 0.18
45 0.17
46 0.17
47 0.16
48 0.13
49 0.1
50 0.08
51 0.06
52 0.07
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.09
65 0.09
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.17
70 0.17
71 0.18
72 0.16
73 0.18
74 0.19
75 0.2
76 0.22
77 0.18
78 0.17
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.13
83 0.14
84 0.12
85 0.11
86 0.11
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.07
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.07
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.14
109 0.12
110 0.12
111 0.15
112 0.14
113 0.21
114 0.22
115 0.22
116 0.23
117 0.26
118 0.25
119 0.25
120 0.25
121 0.19
122 0.18
123 0.17
124 0.14
125 0.11
126 0.1
127 0.08
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.15
132 0.25
133 0.31
134 0.39
135 0.47
136 0.52
137 0.59
138 0.66
139 0.68
140 0.66
141 0.62
142 0.56
143 0.5
144 0.4
145 0.32
146 0.24
147 0.18
148 0.1
149 0.07
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.14
164 0.22
165 0.27
166 0.35
167 0.39
168 0.4
169 0.41
170 0.47
171 0.47
172 0.42
173 0.41
174 0.37
175 0.35
176 0.33
177 0.32
178 0.27
179 0.23
180 0.2
181 0.17
182 0.12
183 0.09
184 0.1
185 0.08
186 0.06
187 0.07
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.06
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.12
205 0.12
206 0.14
207 0.15
208 0.13
209 0.16
210 0.16
211 0.18
212 0.19
213 0.18
214 0.18
215 0.19
216 0.18
217 0.17
218 0.17
219 0.15
220 0.14
221 0.19
222 0.18
223 0.2
224 0.22
225 0.24
226 0.28
227 0.33
228 0.35
229 0.36
230 0.46
231 0.52
232 0.6
233 0.67
234 0.73
235 0.79
236 0.84
237 0.89
238 0.89
239 0.89
240 0.91
241 0.92
242 0.93
243 0.94
244 0.94
245 0.94
246 0.94
247 0.95