Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2D5W5

Protein Details
Accession A0A0D2D5W5    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
313-334TSMPDGPAKIKRRKSKAGEPSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
311-312KA
314-332SMPDGPAKIKRRKSKAGEP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MADSKDDLTDKAHFDPNWIAWNGGYLHSNNVLFYFATSPFFDQVSGNQSLFTQWAGTPNQNDILGTRAKFEANLRHQRGIQYVVEHDPLEENVMQDGPNGPEKSNVWVIRKQNRENEEDSSVTTLGYYYIVNDVIYQAPPVASIFNHRMLNTISALEKVLSAPASMSYFDVSHGHTYHKPVHKFTSHSLNGASQQSKETTPLPGNQASTGGKPASNGIRPHGENESDGRTLWDALRMTLQHGKEYTDDVSLVGEPGNFRFSRHREAAASQSKSQPQGPSTGTPIQSRAASVLPGAKSPGTGLVKGSKPGEKATSMPDGPAKIKRRKSKAGEPSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.35
3 0.35
4 0.37
5 0.35
6 0.31
7 0.24
8 0.28
9 0.25
10 0.22
11 0.22
12 0.16
13 0.18
14 0.22
15 0.22
16 0.19
17 0.18
18 0.17
19 0.14
20 0.15
21 0.15
22 0.12
23 0.15
24 0.16
25 0.17
26 0.17
27 0.18
28 0.17
29 0.15
30 0.16
31 0.2
32 0.21
33 0.19
34 0.18
35 0.18
36 0.18
37 0.18
38 0.15
39 0.11
40 0.09
41 0.14
42 0.17
43 0.2
44 0.21
45 0.23
46 0.25
47 0.23
48 0.23
49 0.18
50 0.19
51 0.2
52 0.18
53 0.18
54 0.17
55 0.17
56 0.19
57 0.22
58 0.28
59 0.34
60 0.44
61 0.46
62 0.49
63 0.5
64 0.51
65 0.5
66 0.44
67 0.36
68 0.28
69 0.26
70 0.25
71 0.25
72 0.23
73 0.2
74 0.16
75 0.15
76 0.15
77 0.13
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.11
84 0.1
85 0.16
86 0.16
87 0.16
88 0.18
89 0.19
90 0.23
91 0.29
92 0.31
93 0.29
94 0.34
95 0.41
96 0.47
97 0.54
98 0.56
99 0.56
100 0.56
101 0.56
102 0.53
103 0.5
104 0.44
105 0.37
106 0.32
107 0.26
108 0.22
109 0.17
110 0.14
111 0.1
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.05
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.09
131 0.11
132 0.16
133 0.17
134 0.17
135 0.18
136 0.18
137 0.2
138 0.17
139 0.15
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.12
162 0.13
163 0.17
164 0.23
165 0.29
166 0.3
167 0.31
168 0.35
169 0.36
170 0.37
171 0.37
172 0.4
173 0.34
174 0.33
175 0.31
176 0.27
177 0.27
178 0.28
179 0.26
180 0.16
181 0.16
182 0.17
183 0.17
184 0.17
185 0.15
186 0.15
187 0.16
188 0.18
189 0.21
190 0.21
191 0.22
192 0.2
193 0.22
194 0.19
195 0.18
196 0.18
197 0.14
198 0.13
199 0.12
200 0.15
201 0.17
202 0.21
203 0.21
204 0.21
205 0.27
206 0.27
207 0.29
208 0.29
209 0.26
210 0.22
211 0.24
212 0.25
213 0.19
214 0.19
215 0.17
216 0.15
217 0.15
218 0.14
219 0.16
220 0.12
221 0.12
222 0.15
223 0.15
224 0.17
225 0.22
226 0.22
227 0.21
228 0.21
229 0.22
230 0.2
231 0.23
232 0.2
233 0.15
234 0.15
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.08
243 0.13
244 0.12
245 0.14
246 0.22
247 0.26
248 0.34
249 0.36
250 0.38
251 0.37
252 0.4
253 0.48
254 0.49
255 0.48
256 0.43
257 0.46
258 0.47
259 0.47
260 0.48
261 0.42
262 0.34
263 0.35
264 0.36
265 0.33
266 0.35
267 0.38
268 0.37
269 0.34
270 0.35
271 0.32
272 0.29
273 0.27
274 0.23
275 0.18
276 0.15
277 0.15
278 0.19
279 0.17
280 0.17
281 0.19
282 0.17
283 0.16
284 0.16
285 0.23
286 0.2
287 0.2
288 0.22
289 0.27
290 0.3
291 0.33
292 0.37
293 0.33
294 0.32
295 0.35
296 0.37
297 0.32
298 0.32
299 0.33
300 0.37
301 0.33
302 0.34
303 0.33
304 0.33
305 0.35
306 0.42
307 0.46
308 0.48
309 0.57
310 0.65
311 0.71
312 0.78
313 0.82
314 0.84