FuNGI

A0A0D2D843

Protein Details

Accession

A0A0D2D843

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
425-450	KANPGGKRKGAKGKRGKNGNEKYGLQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
427-442	NPGGKRKGAKGKRGKN

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRKRWIDKNQAQTFQLLYRPQNDPSLHDETAGERALYPVSGPVPASRKTEQKAGLHLTDLEDDLDFESMRENEGEAAEYGVYFDDTNYDYMQHLRDIGEGGGESHFMEAAPVKVQGKGKGKAKTMKLEDALREVSLDDTQSVVGSEMLSTLSTSTRPATYQNQQDVPDEIAGFQPDMDPRLREVLEALDDDAYVDEKDEEDMFAALAKEGQFGELELAEFEANFEDEDDDGWESDATEKAPAQPAQLPMRTSFPTAAGAELVNEDGSLDAEAAAAEDGDWLKEFAKFKRDNTRRPEPKTADSIIAASAVQDKAPTLYTLNGTPLRQKKRKGALTNPSAYSMTSSSLARTDGQQLLDARFDQVEKMYSLDEADEFDDMDGGMSLASGMTGQSKMSQLSTTSFADEGAVRQDFGGMMDDFLGHWNKANPGGKRKGAKGKRGKNGNEKYGLQQLDEVRAELGPARVYSRPTKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.49
3	0.46
4	0.41
5	0.36
6	0.36
7	0.39
8	0.39
9	0.44
10	0.42
11	0.4
12	0.41
13	0.44
14	0.39
15	0.36
16	0.34
17	0.28
18	0.32
19	0.28
20	0.22
21	0.14
22	0.15
23	0.15
24	0.14
25	0.12
26	0.11
27	0.11
28	0.12
29	0.12
30	0.17
31	0.21
32	0.25
33	0.3
34	0.32
35	0.38
36	0.4
37	0.48
38	0.49
39	0.48
40	0.52
41	0.52
42	0.5
43	0.44
44	0.41
45	0.35
46	0.3
47	0.26
48	0.19
49	0.13
50	0.12
51	0.11
52	0.11
53	0.09
54	0.07
55	0.1
56	0.09
57	0.11
58	0.1
59	0.1
60	0.11
61	0.11
62	0.13
63	0.1
64	0.1
65	0.09
66	0.09
67	0.08
68	0.07
69	0.08
70	0.06
71	0.06
72	0.07
73	0.08
74	0.1
75	0.1
76	0.11
77	0.11
78	0.13
79	0.15
80	0.13
81	0.13
82	0.12
83	0.13
84	0.13
85	0.12
86	0.11
87	0.09
88	0.1
89	0.09
90	0.08
91	0.08
92	0.06
93	0.07
94	0.05
95	0.06
96	0.06
97	0.07
98	0.08
99	0.1
100	0.11
101	0.15
102	0.18
103	0.25
104	0.32
105	0.37
106	0.43
107	0.48
108	0.54
109	0.57
110	0.6
111	0.61
112	0.59
113	0.58
114	0.55
115	0.53
116	0.47
117	0.44
118	0.39
119	0.3
120	0.25
121	0.2
122	0.17
123	0.13
124	0.12
125	0.08
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.06
131	0.06
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.05
136	0.05
137	0.05
138	0.05
139	0.06
140	0.06
141	0.07
142	0.08
143	0.09
144	0.1
145	0.14
146	0.19
147	0.26
148	0.33
149	0.37
150	0.39
151	0.39
152	0.4
153	0.37
154	0.33
155	0.27
156	0.19
157	0.15
158	0.12
159	0.11
160	0.09
161	0.08
162	0.07
163	0.07
164	0.09
165	0.1
166	0.1
167	0.1
168	0.14
169	0.14
170	0.13
171	0.13
172	0.12
173	0.12
174	0.12
175	0.11
176	0.08
177	0.07
178	0.07
179	0.07
180	0.06
181	0.05
182	0.05
183	0.04
184	0.04
185	0.06
186	0.06
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.06
192	0.06
193	0.05
194	0.06
195	0.06
196	0.06
197	0.06
198	0.07
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.05
203	0.05
204	0.04
205	0.05
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.04
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.06
224	0.05
225	0.06
226	0.06
227	0.07
228	0.11
229	0.11
230	0.12
231	0.14
232	0.18
233	0.21
234	0.23
235	0.23
236	0.2
237	0.23
238	0.23
239	0.21
240	0.17
241	0.14
242	0.15
243	0.14
244	0.13
245	0.1
246	0.09
247	0.08
248	0.08
249	0.07
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.03
254	0.04
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.04
268	0.04
269	0.05
270	0.08
271	0.11
272	0.13
273	0.22
274	0.25
275	0.29
276	0.4
277	0.47
278	0.52
279	0.58
280	0.67
281	0.67
282	0.71
283	0.77
284	0.71
285	0.68
286	0.65
287	0.59
288	0.49
289	0.4
290	0.34
291	0.24
292	0.19
293	0.15
294	0.09
295	0.1
296	0.08
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.08
301	0.09
302	0.09
303	0.07
304	0.09
305	0.1
306	0.11
307	0.16
308	0.18
309	0.17
310	0.25
311	0.32
312	0.41
313	0.46
314	0.51
315	0.56
316	0.63
317	0.72
318	0.72
319	0.73
320	0.73
321	0.75
322	0.76
323	0.67
324	0.59
325	0.51
326	0.42
327	0.35
328	0.25
329	0.18
330	0.14
331	0.13
332	0.12
333	0.13
334	0.14
335	0.12
336	0.13
337	0.17
338	0.18
339	0.18
340	0.21
341	0.22
342	0.22
343	0.23
344	0.21
345	0.17
346	0.15
347	0.15
348	0.12
349	0.12
350	0.12
351	0.11
352	0.12
353	0.11
354	0.11
355	0.11
356	0.11
357	0.1
358	0.09
359	0.09
360	0.08
361	0.08
362	0.07
363	0.07
364	0.06
365	0.06
366	0.05
367	0.04
368	0.04
369	0.03
370	0.03
371	0.03
372	0.03
373	0.03
374	0.03
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.08
379	0.1
380	0.11
381	0.12
382	0.13
383	0.13
384	0.16
385	0.19
386	0.18
387	0.19
388	0.18
389	0.16
390	0.17
391	0.16
392	0.14
393	0.15
394	0.15
395	0.13
396	0.13
397	0.13
398	0.12
399	0.12
400	0.15
401	0.1
402	0.1
403	0.1
404	0.1
405	0.1
406	0.13
407	0.15
408	0.11
409	0.13
410	0.16
411	0.18
412	0.26
413	0.33
414	0.36
415	0.44
416	0.52
417	0.57
418	0.61
419	0.67
420	0.7
421	0.73
422	0.76
423	0.78
424	0.8
425	0.82
426	0.86
427	0.87
428	0.87
429	0.87
430	0.85
431	0.81
432	0.74
433	0.68
434	0.67
435	0.58
436	0.48
437	0.43
438	0.37
439	0.37
440	0.35
441	0.31
442	0.24
443	0.22
444	0.22
445	0.19
446	0.19
447	0.15
448	0.15
449	0.18
450	0.2
451	0.25

A0A0D2D843

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer