Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q10267

Protein Details
Accession Q10267    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-189VEKGKSKPSKKSVKAKKKLRLAEKPABasic
215-244AVIKEDKVSDRKKSKKKPKKTPVSNSTASQHydrophilic
246-276SENASDKKTKEKKSSGKQKIASKKKDQLTTDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
165-235EKGKSKPSKKSVKAKKKLRLAEKPASNNSKAGKSSQESKKSSKAPAESAAAVIKEDKVSDRKKSKKKPKKT
252-270KKTKEKKSSGKQKIASKKK
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 10, cyto_nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0070478  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0045727  P:positive regulation of translation  
KEGG spo:SPAC13G7.03  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MAPDISKKRLPCKVLVFNLPPTLPEQVFLQSINSFLPHVEWHRFSKGKATVGTRSELLSFAYLKFQSATAVQEFFRVYQGHTFIDKKNNTYRAIVTIAPYQKIPPSKVKADSLEGSLEQDPKFQEFKVQRESYSQTASNDDVIEKLQTSTPLLQYLAEKKNAVVEKGKSKPSKKSVKAKKKLRLAEKPASNNSKAGKSSQESKKSSKAPAESAAAVIKEDKVSDRKKSKKKPKKTPVSNSTASQASENASDKKTKEKKSSGKQKIASKKKDQLTTDNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.69
3 0.65
4 0.61
5 0.62
6 0.54
7 0.45
8 0.37
9 0.36
10 0.27
11 0.24
12 0.21
13 0.19
14 0.2
15 0.19
16 0.19
17 0.14
18 0.15
19 0.15
20 0.13
21 0.11
22 0.1
23 0.11
24 0.13
25 0.17
26 0.22
27 0.25
28 0.29
29 0.37
30 0.39
31 0.38
32 0.43
33 0.44
34 0.44
35 0.45
36 0.46
37 0.44
38 0.45
39 0.47
40 0.38
41 0.34
42 0.29
43 0.24
44 0.2
45 0.15
46 0.14
47 0.12
48 0.16
49 0.15
50 0.15
51 0.15
52 0.14
53 0.13
54 0.13
55 0.16
56 0.13
57 0.14
58 0.14
59 0.15
60 0.16
61 0.15
62 0.17
63 0.15
64 0.14
65 0.16
66 0.18
67 0.18
68 0.2
69 0.23
70 0.23
71 0.32
72 0.33
73 0.33
74 0.39
75 0.42
76 0.41
77 0.41
78 0.38
79 0.32
80 0.33
81 0.29
82 0.23
83 0.24
84 0.24
85 0.22
86 0.21
87 0.19
88 0.2
89 0.23
90 0.24
91 0.26
92 0.3
93 0.34
94 0.37
95 0.4
96 0.38
97 0.38
98 0.36
99 0.29
100 0.25
101 0.21
102 0.19
103 0.17
104 0.18
105 0.14
106 0.14
107 0.13
108 0.15
109 0.16
110 0.13
111 0.19
112 0.2
113 0.25
114 0.32
115 0.33
116 0.31
117 0.34
118 0.37
119 0.32
120 0.31
121 0.28
122 0.2
123 0.21
124 0.21
125 0.18
126 0.15
127 0.12
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.06
132 0.07
133 0.06
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.12
142 0.18
143 0.2
144 0.2
145 0.19
146 0.18
147 0.24
148 0.24
149 0.24
150 0.21
151 0.22
152 0.28
153 0.33
154 0.41
155 0.42
156 0.45
157 0.52
158 0.57
159 0.64
160 0.64
161 0.7
162 0.74
163 0.79
164 0.85
165 0.87
166 0.86
167 0.85
168 0.84
169 0.83
170 0.82
171 0.79
172 0.78
173 0.75
174 0.73
175 0.71
176 0.69
177 0.6
178 0.53
179 0.47
180 0.43
181 0.37
182 0.33
183 0.31
184 0.28
185 0.37
186 0.42
187 0.49
188 0.49
189 0.53
190 0.58
191 0.58
192 0.6
193 0.57
194 0.52
195 0.46
196 0.46
197 0.44
198 0.37
199 0.33
200 0.29
201 0.23
202 0.19
203 0.16
204 0.13
205 0.1
206 0.11
207 0.13
208 0.2
209 0.24
210 0.34
211 0.43
212 0.53
213 0.63
214 0.74
215 0.82
216 0.84
217 0.91
218 0.93
219 0.94
220 0.95
221 0.95
222 0.95
223 0.93
224 0.91
225 0.84
226 0.74
227 0.67
228 0.58
229 0.48
230 0.38
231 0.29
232 0.22
233 0.22
234 0.24
235 0.24
236 0.23
237 0.27
238 0.27
239 0.37
240 0.45
241 0.49
242 0.56
243 0.62
244 0.71
245 0.78
246 0.88
247 0.88
248 0.89
249 0.87
250 0.88
251 0.88
252 0.88
253 0.87
254 0.85
255 0.84
256 0.82
257 0.83
258 0.78