Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O74833

Protein Details
Accession O74833    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-50EPLSRIGKTRKSKTSNLDPYEHydrophilic
627-652VSFHVNKKRKVSQKREKQKKFLYDEPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
633-645KKRKVSQKREKQK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044125  Adenylation_DNA_ligase_IV  
IPR001357  BRCT_dom  
IPR036420  BRCT_dom_sf  
IPR000977  DNA_ligase_ATP-dep  
IPR012309  DNA_ligase_ATP-dep_C  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0032807  C:DNA ligase IV complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0071897  P:DNA biosynthetic process  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006303  P:double-strand break repair via nonhomologous end joining  
GO:0006297  P:nucleotide-excision repair, DNA gap filling  
KEGG spo:SPCC1183.05c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04679  DNA_ligase_A_C  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50172  BRCT  
PS00697  DNA_LIGASE_A1  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd07903  Adenylation_DNA_ligase_IV  
cd07968  OBF_DNA_ligase_IV  
Amino Acid Sequences MDEAKETVFTKPQNHSSTLEFYDFVTTLLEPLSRIGKTRKSKTSNLDPYELKRKILLDYFNKWRQHVGPDLYPLLRLMLPDLDRERGSYGFKEFGLGKLFIRAMHLSPTSEDAKSLKNWRGSESKHTGDFSTMLQDILQRRAYRTFPGAFTVGDVNALLDQLADASSEDTRVNILEQFYRSLSPLELRWLIPILLKVRKYGTSEKFILSVFHPDAARLYRLCSSLKRICWELYDPSRSLDETETDVEVFSCFQPQLANFKKKDLHQTLEAMGNKPFWIEEKLDGERIQLHMSSGKFQFYSRNARSYTYAYGSSYFDEQSRLTQYIIGAFDKRISQIILDGEMVTWDPVLETVIPYGSLRSIFEDSSSHSSYSPYYVVFDILYLNGKSLVKYSLESRRRILEKVIVRESHRMSILPYKVGSTIEDIEAELRNVIQEGSEGLVIKKPSGSYHLGERMDDWIKVKPYYLQGFGEDLDCLILGGYFGRGKQSGKINSFLCGLRMDYTPKDHSEKFQSFVRVGGGFTYFDRDIIRKETEGKWLPWSSDALEYMELAGTKQDFEKPDMWIHPKDSLVLQIKAAEVVVSNRFKTNYTLRFPRLEKVRLDRSWKDALTINEFFTLKNAVEKQDNVSFHVNKKRKVSQKREKQKKFLYDEPTFKKEASPHSDVLKNLHFVVLPPTELHETKAGLQQIIIENGGLIHQGVGNFGKERLFLVADRVSTRVSIERSKNMCTIIRSQWVMDSVNNQRLMPQWSYLLFSKDEKYSWKTALESLSAKSLSNLLVELKQLDLSKEYSKISDDTSILNLTISKEEASFVGAFPFLKFTVFLDLKGIENSELYDVRMGQYRLTKCILLWNGATIEKDISSKKLTHVVMFVEDSTRLEQLTKACELYQIEPKFVNFEWVVNEWKKASTNILG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.5
3 0.49
4 0.51
5 0.48
6 0.42
7 0.34
8 0.3
9 0.3
10 0.27
11 0.22
12 0.18
13 0.14
14 0.12
15 0.13
16 0.13
17 0.09
18 0.11
19 0.16
20 0.15
21 0.19
22 0.26
23 0.34
24 0.44
25 0.53
26 0.62
27 0.64
28 0.72
29 0.77
30 0.81
31 0.82
32 0.77
33 0.75
34 0.68
35 0.69
36 0.71
37 0.63
38 0.53
39 0.46
40 0.42
41 0.41
42 0.43
43 0.44
44 0.41
45 0.47
46 0.56
47 0.6
48 0.62
49 0.58
50 0.57
51 0.52
52 0.5
53 0.51
54 0.47
55 0.44
56 0.46
57 0.49
58 0.44
59 0.41
60 0.35
61 0.28
62 0.23
63 0.18
64 0.15
65 0.17
66 0.17
67 0.23
68 0.25
69 0.26
70 0.26
71 0.27
72 0.28
73 0.24
74 0.27
75 0.24
76 0.25
77 0.24
78 0.24
79 0.25
80 0.23
81 0.25
82 0.26
83 0.24
84 0.21
85 0.23
86 0.24
87 0.21
88 0.24
89 0.23
90 0.19
91 0.24
92 0.25
93 0.21
94 0.22
95 0.26
96 0.25
97 0.23
98 0.23
99 0.2
100 0.22
101 0.27
102 0.33
103 0.36
104 0.4
105 0.41
106 0.44
107 0.51
108 0.51
109 0.55
110 0.55
111 0.53
112 0.5
113 0.5
114 0.46
115 0.39
116 0.36
117 0.27
118 0.24
119 0.2
120 0.16
121 0.15
122 0.19
123 0.19
124 0.23
125 0.28
126 0.24
127 0.27
128 0.32
129 0.33
130 0.34
131 0.37
132 0.36
133 0.31
134 0.34
135 0.32
136 0.27
137 0.27
138 0.24
139 0.18
140 0.15
141 0.13
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.12
162 0.14
163 0.16
164 0.18
165 0.18
166 0.19
167 0.19
168 0.17
169 0.17
170 0.16
171 0.15
172 0.19
173 0.2
174 0.19
175 0.2
176 0.2
177 0.19
178 0.18
179 0.21
180 0.21
181 0.25
182 0.25
183 0.26
184 0.28
185 0.31
186 0.34
187 0.4
188 0.4
189 0.41
190 0.43
191 0.42
192 0.41
193 0.37
194 0.34
195 0.26
196 0.26
197 0.2
198 0.21
199 0.2
200 0.18
201 0.21
202 0.21
203 0.23
204 0.16
205 0.18
206 0.18
207 0.21
208 0.23
209 0.23
210 0.3
211 0.34
212 0.37
213 0.38
214 0.38
215 0.37
216 0.38
217 0.39
218 0.38
219 0.38
220 0.39
221 0.36
222 0.35
223 0.35
224 0.32
225 0.3
226 0.23
227 0.18
228 0.16
229 0.17
230 0.16
231 0.14
232 0.14
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.08
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.1
241 0.11
242 0.2
243 0.28
244 0.36
245 0.35
246 0.4
247 0.44
248 0.46
249 0.56
250 0.52
251 0.48
252 0.43
253 0.45
254 0.42
255 0.44
256 0.43
257 0.33
258 0.28
259 0.24
260 0.21
261 0.18
262 0.16
263 0.11
264 0.12
265 0.13
266 0.15
267 0.2
268 0.22
269 0.24
270 0.24
271 0.22
272 0.21
273 0.21
274 0.18
275 0.13
276 0.13
277 0.14
278 0.15
279 0.18
280 0.17
281 0.18
282 0.17
283 0.17
284 0.23
285 0.24
286 0.34
287 0.32
288 0.37
289 0.36
290 0.38
291 0.4
292 0.37
293 0.35
294 0.28
295 0.26
296 0.21
297 0.22
298 0.21
299 0.19
300 0.17
301 0.15
302 0.13
303 0.13
304 0.13
305 0.13
306 0.16
307 0.15
308 0.14
309 0.15
310 0.14
311 0.16
312 0.17
313 0.16
314 0.14
315 0.13
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.11
320 0.1
321 0.09
322 0.1
323 0.11
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.06
331 0.05
332 0.04
333 0.03
334 0.03
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.09
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.11
351 0.13
352 0.18
353 0.19
354 0.17
355 0.16
356 0.17
357 0.16
358 0.18
359 0.15
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.09
365 0.09
366 0.07
367 0.07
368 0.09
369 0.07
370 0.07
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.1
375 0.11
376 0.1
377 0.11
378 0.15
379 0.23
380 0.28
381 0.3
382 0.31
383 0.36
384 0.37
385 0.38
386 0.35
387 0.33
388 0.33
389 0.36
390 0.39
391 0.35
392 0.35
393 0.39
394 0.38
395 0.33
396 0.28
397 0.22
398 0.2
399 0.24
400 0.23
401 0.2
402 0.18
403 0.17
404 0.17
405 0.17
406 0.16
407 0.11
408 0.11
409 0.1
410 0.1
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.06
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.04
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.12
434 0.15
435 0.14
436 0.18
437 0.24
438 0.24
439 0.23
440 0.23
441 0.23
442 0.21
443 0.2
444 0.17
445 0.14
446 0.16
447 0.16
448 0.16
449 0.14
450 0.18
451 0.2
452 0.21
453 0.18
454 0.18
455 0.18
456 0.18
457 0.16
458 0.11
459 0.08
460 0.06
461 0.05
462 0.04
463 0.03
464 0.03
465 0.02
466 0.02
467 0.03
468 0.04
469 0.04
470 0.06
471 0.07
472 0.08
473 0.12
474 0.19
475 0.24
476 0.26
477 0.3
478 0.29
479 0.3
480 0.32
481 0.28
482 0.21
483 0.16
484 0.15
485 0.12
486 0.13
487 0.14
488 0.13
489 0.17
490 0.18
491 0.2
492 0.24
493 0.22
494 0.25
495 0.31
496 0.31
497 0.3
498 0.31
499 0.31
500 0.27
501 0.27
502 0.26
503 0.17
504 0.16
505 0.14
506 0.11
507 0.09
508 0.09
509 0.12
510 0.1
511 0.1
512 0.11
513 0.11
514 0.12
515 0.16
516 0.17
517 0.14
518 0.19
519 0.2
520 0.27
521 0.3
522 0.29
523 0.31
524 0.3
525 0.3
526 0.27
527 0.26
528 0.19
529 0.18
530 0.17
531 0.13
532 0.12
533 0.11
534 0.1
535 0.1
536 0.08
537 0.06
538 0.06
539 0.05
540 0.05
541 0.06
542 0.1
543 0.11
544 0.14
545 0.16
546 0.17
547 0.21
548 0.24
549 0.28
550 0.27
551 0.27
552 0.26
553 0.25
554 0.23
555 0.21
556 0.23
557 0.23
558 0.22
559 0.2
560 0.19
561 0.18
562 0.18
563 0.17
564 0.1
565 0.06
566 0.08
567 0.13
568 0.14
569 0.14
570 0.16
571 0.17
572 0.18
573 0.22
574 0.28
575 0.3
576 0.34
577 0.4
578 0.42
579 0.47
580 0.48
581 0.5
582 0.49
583 0.47
584 0.45
585 0.46
586 0.52
587 0.5
588 0.56
589 0.52
590 0.5
591 0.51
592 0.47
593 0.41
594 0.37
595 0.35
596 0.34
597 0.33
598 0.28
599 0.25
600 0.25
601 0.23
602 0.2
603 0.19
604 0.12
605 0.15
606 0.16
607 0.16
608 0.18
609 0.19
610 0.22
611 0.26
612 0.26
613 0.26
614 0.31
615 0.31
616 0.35
617 0.44
618 0.46
619 0.45
620 0.51
621 0.57
622 0.6
623 0.69
624 0.74
625 0.74
626 0.8
627 0.86
628 0.91
629 0.9
630 0.9
631 0.88
632 0.87
633 0.83
634 0.8
635 0.77
636 0.73
637 0.73
638 0.7
639 0.65
640 0.56
641 0.49
642 0.44
643 0.4
644 0.41
645 0.4
646 0.38
647 0.36
648 0.39
649 0.43
650 0.4
651 0.41
652 0.36
653 0.29
654 0.25
655 0.23
656 0.19
657 0.16
658 0.21
659 0.17
660 0.14
661 0.13
662 0.16
663 0.18
664 0.18
665 0.2
666 0.16
667 0.16
668 0.18
669 0.22
670 0.21
671 0.17
672 0.17
673 0.19
674 0.18
675 0.19
676 0.16
677 0.12
678 0.1
679 0.1
680 0.1
681 0.07
682 0.05
683 0.04
684 0.05
685 0.05
686 0.07
687 0.08
688 0.09
689 0.1
690 0.11
691 0.11
692 0.1
693 0.11
694 0.12
695 0.12
696 0.11
697 0.16
698 0.17
699 0.18
700 0.19
701 0.2
702 0.18
703 0.17
704 0.18
705 0.18
706 0.19
707 0.25
708 0.29
709 0.37
710 0.39
711 0.43
712 0.43
713 0.42
714 0.42
715 0.37
716 0.39
717 0.36
718 0.39
719 0.36
720 0.34
721 0.33
722 0.32
723 0.3
724 0.25
725 0.26
726 0.26
727 0.31
728 0.32
729 0.3
730 0.29
731 0.31
732 0.35
733 0.3
734 0.25
735 0.22
736 0.21
737 0.25
738 0.25
739 0.24
740 0.22
741 0.22
742 0.24
743 0.24
744 0.25
745 0.27
746 0.3
747 0.32
748 0.32
749 0.32
750 0.31
751 0.32
752 0.33
753 0.32
754 0.29
755 0.25
756 0.27
757 0.25
758 0.23
759 0.21
760 0.2
761 0.16
762 0.15
763 0.14
764 0.12
765 0.12
766 0.13
767 0.13
768 0.12
769 0.14
770 0.14
771 0.15
772 0.15
773 0.17
774 0.19
775 0.22
776 0.22
777 0.21
778 0.23
779 0.23
780 0.23
781 0.24
782 0.22
783 0.21
784 0.22
785 0.22
786 0.19
787 0.18
788 0.17
789 0.14
790 0.15
791 0.14
792 0.12
793 0.11
794 0.12
795 0.12
796 0.14
797 0.12
798 0.11
799 0.11
800 0.12
801 0.12
802 0.11
803 0.14
804 0.11
805 0.11
806 0.11
807 0.11
808 0.2
809 0.2
810 0.2
811 0.21
812 0.22
813 0.22
814 0.23
815 0.23
816 0.14
817 0.13
818 0.14
819 0.15
820 0.14
821 0.14
822 0.15
823 0.14
824 0.15
825 0.21
826 0.2
827 0.21
828 0.28
829 0.3
830 0.32
831 0.35
832 0.34
833 0.28
834 0.37
835 0.36
836 0.31
837 0.29
838 0.28
839 0.28
840 0.29
841 0.29
842 0.21
843 0.2
844 0.17
845 0.2
846 0.19
847 0.2
848 0.23
849 0.24
850 0.26
851 0.33
852 0.34
853 0.33
854 0.34
855 0.32
856 0.32
857 0.31
858 0.29
859 0.22
860 0.21
861 0.2
862 0.2
863 0.18
864 0.15
865 0.14
866 0.16
867 0.18
868 0.23
869 0.23
870 0.23
871 0.22
872 0.26
873 0.29
874 0.31
875 0.37
876 0.34
877 0.34
878 0.34
879 0.34
880 0.34
881 0.31
882 0.33
883 0.24
884 0.24
885 0.25
886 0.26
887 0.33
888 0.31
889 0.34
890 0.28
891 0.31
892 0.31
893 0.29