Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P26659

Protein Details
Accession P26659    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
679-698ADKRYGRSDKRTKLPKWIQQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006555  ATP-dep_Helicase_C  
IPR010614  DEAD_2  
IPR045028  DinG/Rad3-like  
IPR010643  HBB  
IPR014013  Helic_SF1/SF2_ATP-bd_DinG/Rad3  
IPR006554  Helicase-like_DEXD_c2  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR013020  Rad3/Chl1-like  
IPR001945  RAD3/XPD  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000112  C:nucleotide-excision repair factor 3 complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0005675  C:transcription factor TFIIH holo complex  
GO:0051539  F:4 iron, 4 sulfur cluster binding  
GO:0043139  F:5'-3' DNA helicase activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0003678  F:DNA helicase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0016251  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0045951  P:positive regulation of mitotic recombination  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG spo:SPAC1D4.12  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06733  DEAD_2  
PF06777  HBB  
PF13307  Helicase_C_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51193  HELICASE_ATP_BIND_2  
CDD cd18788  SF2_C_XPD  
Amino Acid Sequences MKFYIDDLPILFPYPRIYPEQYQYMCDLKHSLDAGGIALLEMPSGTGKTISLLSLIVSYQQHYPEHRKLIYCSRTMSEIDKALAELKRLMAYRTSQLGYEEPFLGLGLTSRKNLCLHPSVRREKNGNVVDARCRSLTAGFVREQRLAGMDVPTCEFHDNLEDLEPHSLISNGVWTLDDITEYGEKTTRCPYFTVRRMLPFCNVIIYSYHYLLDPKIAERVSRELSKDCIVVFDEAHNIDNVCIESLSIDLTESSLRKASKSILSLEQKVNEVKQSDSKKLQDEYQKLVRGLQDANAANDEDQFMANPVLPEDVLKEAVPGNIRRAEHFIAFLKRFVEYLKTRMKVLHVIAETPTSFLQHVKDITFIDKKPLRFCAERLTSLVRALQISLVEDFHSLQQVVAFATLVATYERGFILILEPFETENATVPNPILRFSCLDASIAIKPVFERFRSVIITSGTLSPLDMYPKMLQFNTVMQESYGMSLARNCFLPMVVTRGSDQVAISSKFEARNDPSVVRNYGNILVEFSKITPDGLVAFFPSYLYLESIVSSWQSMGILDEVWKYKLILVETPDPHETTLALETYRAACSNGRGAVLLSVARGKVSEGVDFDHHYGRAVIMFGIPYQYTESRVLKARLEFLRDTYQIREADFLTFDAMRHAAQCLGRVLRGKDDHGIMVLADKRYGRSDKRTKLPKWIQQYITEGATNLSTDMSLALAKKFLRTMAQPFTASDQEGISWWSLDDLLIHQKKALKSAAIEQSKHEDEMDIDVVET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.24
4 0.3
5 0.34
6 0.39
7 0.48
8 0.46
9 0.46
10 0.47
11 0.46
12 0.4
13 0.36
14 0.33
15 0.24
16 0.28
17 0.26
18 0.22
19 0.18
20 0.18
21 0.17
22 0.14
23 0.13
24 0.08
25 0.07
26 0.07
27 0.06
28 0.05
29 0.05
30 0.05
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.07
35 0.08
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.09
40 0.09
41 0.1
42 0.1
43 0.12
44 0.12
45 0.14
46 0.16
47 0.19
48 0.22
49 0.28
50 0.36
51 0.4
52 0.47
53 0.49
54 0.49
55 0.52
56 0.59
57 0.59
58 0.54
59 0.5
60 0.45
61 0.44
62 0.43
63 0.41
64 0.35
65 0.31
66 0.28
67 0.25
68 0.23
69 0.26
70 0.25
71 0.23
72 0.2
73 0.19
74 0.22
75 0.22
76 0.23
77 0.22
78 0.23
79 0.26
80 0.3
81 0.29
82 0.25
83 0.27
84 0.28
85 0.27
86 0.26
87 0.22
88 0.17
89 0.16
90 0.15
91 0.13
92 0.11
93 0.1
94 0.12
95 0.13
96 0.16
97 0.17
98 0.2
99 0.22
100 0.25
101 0.29
102 0.32
103 0.36
104 0.42
105 0.52
106 0.59
107 0.64
108 0.68
109 0.67
110 0.62
111 0.68
112 0.63
113 0.58
114 0.53
115 0.49
116 0.5
117 0.48
118 0.47
119 0.37
120 0.33
121 0.28
122 0.24
123 0.27
124 0.23
125 0.25
126 0.26
127 0.3
128 0.33
129 0.33
130 0.32
131 0.27
132 0.24
133 0.21
134 0.19
135 0.18
136 0.16
137 0.16
138 0.17
139 0.17
140 0.17
141 0.17
142 0.15
143 0.13
144 0.15
145 0.15
146 0.14
147 0.15
148 0.14
149 0.14
150 0.16
151 0.15
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.07
166 0.09
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.12
171 0.13
172 0.15
173 0.23
174 0.23
175 0.23
176 0.25
177 0.31
178 0.38
179 0.45
180 0.51
181 0.47
182 0.53
183 0.55
184 0.55
185 0.51
186 0.43
187 0.36
188 0.3
189 0.27
190 0.2
191 0.18
192 0.2
193 0.19
194 0.17
195 0.17
196 0.15
197 0.16
198 0.15
199 0.17
200 0.14
201 0.12
202 0.15
203 0.15
204 0.16
205 0.18
206 0.22
207 0.23
208 0.26
209 0.27
210 0.25
211 0.28
212 0.29
213 0.27
214 0.22
215 0.19
216 0.17
217 0.16
218 0.14
219 0.12
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.14
245 0.17
246 0.2
247 0.21
248 0.24
249 0.29
250 0.33
251 0.37
252 0.38
253 0.35
254 0.33
255 0.32
256 0.3
257 0.24
258 0.21
259 0.18
260 0.24
261 0.27
262 0.3
263 0.34
264 0.36
265 0.38
266 0.38
267 0.42
268 0.43
269 0.43
270 0.43
271 0.45
272 0.45
273 0.41
274 0.41
275 0.37
276 0.31
277 0.27
278 0.23
279 0.23
280 0.19
281 0.2
282 0.19
283 0.18
284 0.15
285 0.15
286 0.13
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.1
305 0.12
306 0.12
307 0.14
308 0.18
309 0.18
310 0.19
311 0.23
312 0.23
313 0.2
314 0.22
315 0.22
316 0.23
317 0.23
318 0.23
319 0.19
320 0.18
321 0.18
322 0.16
323 0.19
324 0.15
325 0.21
326 0.28
327 0.28
328 0.28
329 0.29
330 0.3
331 0.28
332 0.27
333 0.26
334 0.19
335 0.19
336 0.19
337 0.19
338 0.18
339 0.14
340 0.13
341 0.08
342 0.08
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.11
347 0.1
348 0.12
349 0.12
350 0.15
351 0.18
352 0.17
353 0.23
354 0.25
355 0.26
356 0.27
357 0.31
358 0.32
359 0.29
360 0.31
361 0.32
362 0.32
363 0.31
364 0.31
365 0.3
366 0.26
367 0.25
368 0.25
369 0.16
370 0.13
371 0.12
372 0.11
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.06
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.03
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.11
421 0.12
422 0.14
423 0.12
424 0.12
425 0.11
426 0.13
427 0.12
428 0.14
429 0.12
430 0.11
431 0.1
432 0.14
433 0.17
434 0.15
435 0.18
436 0.16
437 0.19
438 0.2
439 0.21
440 0.19
441 0.17
442 0.18
443 0.15
444 0.15
445 0.13
446 0.11
447 0.1
448 0.08
449 0.08
450 0.09
451 0.08
452 0.1
453 0.11
454 0.13
455 0.15
456 0.14
457 0.15
458 0.14
459 0.16
460 0.16
461 0.15
462 0.13
463 0.11
464 0.12
465 0.11
466 0.11
467 0.1
468 0.07
469 0.07
470 0.09
471 0.1
472 0.1
473 0.11
474 0.1
475 0.09
476 0.09
477 0.1
478 0.08
479 0.12
480 0.12
481 0.12
482 0.13
483 0.14
484 0.15
485 0.13
486 0.13
487 0.1
488 0.13
489 0.14
490 0.14
491 0.14
492 0.16
493 0.18
494 0.18
495 0.2
496 0.2
497 0.25
498 0.27
499 0.27
500 0.28
501 0.3
502 0.32
503 0.28
504 0.25
505 0.21
506 0.22
507 0.21
508 0.18
509 0.16
510 0.15
511 0.15
512 0.14
513 0.12
514 0.11
515 0.1
516 0.1
517 0.08
518 0.07
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.07
523 0.08
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.07
530 0.07
531 0.07
532 0.08
533 0.08
534 0.08
535 0.07
536 0.07
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.05
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.07
545 0.09
546 0.1
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.12
551 0.14
552 0.15
553 0.16
554 0.19
555 0.25
556 0.26
557 0.3
558 0.3
559 0.27
560 0.26
561 0.24
562 0.19
563 0.14
564 0.14
565 0.11
566 0.1
567 0.09
568 0.1
569 0.12
570 0.12
571 0.11
572 0.11
573 0.11
574 0.13
575 0.17
576 0.17
577 0.16
578 0.15
579 0.15
580 0.15
581 0.15
582 0.13
583 0.09
584 0.1
585 0.09
586 0.09
587 0.09
588 0.09
589 0.12
590 0.13
591 0.14
592 0.13
593 0.16
594 0.18
595 0.2
596 0.21
597 0.19
598 0.18
599 0.17
600 0.16
601 0.14
602 0.13
603 0.12
604 0.1
605 0.08
606 0.08
607 0.07
608 0.09
609 0.09
610 0.09
611 0.12
612 0.13
613 0.15
614 0.21
615 0.23
616 0.24
617 0.3
618 0.32
619 0.32
620 0.34
621 0.38
622 0.36
623 0.4
624 0.37
625 0.36
626 0.41
627 0.38
628 0.38
629 0.33
630 0.36
631 0.31
632 0.31
633 0.29
634 0.22
635 0.22
636 0.21
637 0.18
638 0.15
639 0.14
640 0.13
641 0.14
642 0.14
643 0.12
644 0.12
645 0.13
646 0.14
647 0.14
648 0.17
649 0.19
650 0.2
651 0.23
652 0.27
653 0.28
654 0.32
655 0.35
656 0.34
657 0.34
658 0.34
659 0.32
660 0.27
661 0.26
662 0.17
663 0.2
664 0.21
665 0.18
666 0.18
667 0.18
668 0.19
669 0.25
670 0.32
671 0.33
672 0.4
673 0.5
674 0.57
675 0.67
676 0.75
677 0.73
678 0.77
679 0.81
680 0.79
681 0.78
682 0.78
683 0.72
684 0.67
685 0.68
686 0.6
687 0.53
688 0.45
689 0.35
690 0.27
691 0.24
692 0.19
693 0.14
694 0.1
695 0.07
696 0.07
697 0.07
698 0.07
699 0.08
700 0.09
701 0.1
702 0.13
703 0.14
704 0.16
705 0.17
706 0.18
707 0.21
708 0.25
709 0.31
710 0.35
711 0.4
712 0.38
713 0.38
714 0.42
715 0.39
716 0.35
717 0.29
718 0.22
719 0.17
720 0.17
721 0.18
722 0.13
723 0.11
724 0.1
725 0.1
726 0.09
727 0.09
728 0.09
729 0.11
730 0.21
731 0.24
732 0.24
733 0.27
734 0.32
735 0.34
736 0.39
737 0.39
738 0.32
739 0.32
740 0.4
741 0.47
742 0.49
743 0.48
744 0.46
745 0.5
746 0.49
747 0.47
748 0.39
749 0.3
750 0.24
751 0.28
752 0.26