Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O74853

Protein Details
Accession O74853    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-38SKNPSDLPKKPANVKKNRRRFQKSQKKSISPSSGSHydrophilic
103-134DEELRKHAKGEGKRSKNRKRSSKHSEKQAVDLBasic
154-174SERSREAKSRMPKNSKEIKKGBasic
1037-1059KNEIVKTRSQRIHSKKKAFLSLVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-30KKPANVKKNRRRFQKSQKK
107-126RKHAKGEGKRSKNRKRSSKH
157-170SREAKSRMPKNSKE
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034077  R3H_FAP1  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR000967  Znf_NFX1  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR001841  Znf_RING  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005794  C:Golgi apparatus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000977  F:RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG spo:SPCC18.03  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF01422  zf-NF-X1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd06006  R3H_unknown_2  
cd16492  RING-CH-C4HC3_NFX1-like  
Amino Acid Sequences METSKNPSDLPKKPANVKKNRRRFQKSQKKSISPSSGSELPNFKTTISQNNEEVKTSLKEDSSKFHPSASAPIFVPTSSVQLNVSKNNGHKASDIVDAVSSKDEELRKHAKGEGKRSKNRKRSSKHSEKQAVDLKSSNSSQETSSSKGSVNNKSERSREAKSRMPKNSKEIKKGLDLSKLDMTSRMIVELKNRLYECSVCTDTINPSTSIWSCGTCYHVFHLSCIRKWCKNSIEQRNEDAWRCPYCQSNQTETSLHYLCWCGKQEKPEFVKNLVPHSCGDPCGKTRGQDCEHPCPLLCHPGPCPPCTATVEKFCLCGKESIHARCSNISKVNTEPFRCENVCDELLPCGEHTCKKRCHSGLCGACFEPINAKCYCGLHSKTYPCSSLPSPSISKKDENGSVKEWFGYYSCNNPCTLFFDCGLHKCSKTCHPISETRAHCPFATDVLTKCPCGKEDISFLLKGHERKSCSDPIPTCENICGKLLSCGHRCKYKCHLGSCGTCSETLTIPCRCTANEVQVTCEQLQNGFIPTCERLCTILLSCGRHQCNKKCCSGYSKAQTRLARRPKGAKLRYHLLTEEFEEEHICFRPCNKKLSCGNHFCQHMCHRGPCPRCLEASFEELPCTCGRTRLYPPVACGTPIPDCPYLCVLPKSCHHPQVKHNCHPTSEPCPPCPYFVKKRCLCGKHILENQPCYRENVRCGELCNKLLSCKTHFCEKLCHPDGECESSCKKECGKRRMYCEHVCQSPCHAGHPCDERIPCKAPLEVSCECGRIRKKVTCDASYDNPDPQHKVSCTLECSQQQRNKLFAEALNIKTDRRSNDVAQYTKSLLVFYGKHSDFADEVESLLRNFVNNKASSFRFPSMRREQRAFVHMFAKLLGLESVSFDPEPKRNVMVYNKGEAKLPNMLLKEANLYHLQHPEIPLKPDSLLGPEEENATASHIDGSSNASDSGYNAFVLKELLKEVNDESAIFSVLDDIVDFNHLTWSILFGENYIILKPLNTDLIVNKTGKLVALRPLVNRRLADAGIASRCEICEINDKNEIVKTRSQRIHSKKKAFLSLVPDKSIGVINRYKELATEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.77
3 0.79
4 0.83
5 0.86
6 0.88
7 0.91
8 0.92
9 0.92
10 0.92
11 0.92
12 0.93
13 0.92
14 0.92
15 0.93
16 0.91
17 0.88
18 0.87
19 0.85
20 0.78
21 0.71
22 0.67
23 0.63
24 0.55
25 0.54
26 0.49
27 0.42
28 0.42
29 0.38
30 0.32
31 0.31
32 0.32
33 0.37
34 0.39
35 0.41
36 0.43
37 0.51
38 0.52
39 0.48
40 0.46
41 0.4
42 0.35
43 0.34
44 0.31
45 0.26
46 0.3
47 0.3
48 0.35
49 0.37
50 0.41
51 0.38
52 0.36
53 0.36
54 0.33
55 0.4
56 0.37
57 0.34
58 0.28
59 0.3
60 0.3
61 0.26
62 0.27
63 0.19
64 0.19
65 0.16
66 0.16
67 0.16
68 0.21
69 0.25
70 0.26
71 0.29
72 0.3
73 0.33
74 0.41
75 0.41
76 0.37
77 0.35
78 0.33
79 0.33
80 0.32
81 0.29
82 0.21
83 0.2
84 0.19
85 0.19
86 0.18
87 0.16
88 0.12
89 0.17
90 0.19
91 0.19
92 0.27
93 0.33
94 0.34
95 0.36
96 0.41
97 0.44
98 0.49
99 0.58
100 0.61
101 0.65
102 0.72
103 0.8
104 0.86
105 0.88
106 0.91
107 0.9
108 0.89
109 0.89
110 0.9
111 0.91
112 0.88
113 0.89
114 0.89
115 0.8
116 0.8
117 0.77
118 0.68
119 0.6
120 0.55
121 0.46
122 0.42
123 0.4
124 0.34
125 0.28
126 0.26
127 0.24
128 0.26
129 0.27
130 0.25
131 0.27
132 0.26
133 0.25
134 0.31
135 0.37
136 0.41
137 0.45
138 0.49
139 0.54
140 0.58
141 0.6
142 0.6
143 0.59
144 0.56
145 0.58
146 0.56
147 0.58
148 0.62
149 0.69
150 0.73
151 0.76
152 0.75
153 0.76
154 0.8
155 0.8
156 0.79
157 0.76
158 0.69
159 0.68
160 0.7
161 0.65
162 0.63
163 0.55
164 0.51
165 0.5
166 0.46
167 0.39
168 0.33
169 0.3
170 0.24
171 0.23
172 0.21
173 0.17
174 0.17
175 0.22
176 0.28
177 0.28
178 0.3
179 0.31
180 0.3
181 0.31
182 0.32
183 0.29
184 0.28
185 0.28
186 0.23
187 0.24
188 0.24
189 0.25
190 0.27
191 0.28
192 0.21
193 0.19
194 0.22
195 0.22
196 0.23
197 0.21
198 0.18
199 0.17
200 0.17
201 0.22
202 0.19
203 0.2
204 0.2
205 0.26
206 0.25
207 0.26
208 0.35
209 0.35
210 0.37
211 0.45
212 0.48
213 0.47
214 0.5
215 0.57
216 0.53
217 0.58
218 0.64
219 0.67
220 0.71
221 0.69
222 0.7
223 0.68
224 0.66
225 0.59
226 0.52
227 0.47
228 0.4
229 0.38
230 0.35
231 0.34
232 0.35
233 0.4
234 0.42
235 0.43
236 0.43
237 0.44
238 0.44
239 0.39
240 0.4
241 0.33
242 0.27
243 0.21
244 0.2
245 0.19
246 0.23
247 0.26
248 0.23
249 0.26
250 0.35
251 0.4
252 0.47
253 0.51
254 0.53
255 0.52
256 0.52
257 0.55
258 0.48
259 0.5
260 0.43
261 0.39
262 0.32
263 0.33
264 0.31
265 0.27
266 0.28
267 0.24
268 0.23
269 0.28
270 0.29
271 0.28
272 0.31
273 0.37
274 0.37
275 0.42
276 0.46
277 0.49
278 0.5
279 0.48
280 0.44
281 0.39
282 0.37
283 0.38
284 0.33
285 0.26
286 0.27
287 0.34
288 0.36
289 0.34
290 0.36
291 0.27
292 0.3
293 0.31
294 0.34
295 0.29
296 0.33
297 0.37
298 0.34
299 0.35
300 0.32
301 0.3
302 0.27
303 0.26
304 0.21
305 0.24
306 0.3
307 0.32
308 0.37
309 0.37
310 0.36
311 0.38
312 0.4
313 0.38
314 0.38
315 0.35
316 0.32
317 0.34
318 0.4
319 0.41
320 0.39
321 0.38
322 0.35
323 0.39
324 0.37
325 0.35
326 0.3
327 0.29
328 0.29
329 0.25
330 0.22
331 0.18
332 0.18
333 0.17
334 0.14
335 0.1
336 0.12
337 0.17
338 0.22
339 0.28
340 0.35
341 0.38
342 0.47
343 0.5
344 0.53
345 0.54
346 0.58
347 0.58
348 0.54
349 0.53
350 0.45
351 0.41
352 0.35
353 0.29
354 0.27
355 0.2
356 0.2
357 0.18
358 0.18
359 0.18
360 0.19
361 0.22
362 0.21
363 0.23
364 0.26
365 0.32
366 0.35
367 0.39
368 0.4
369 0.39
370 0.33
371 0.34
372 0.3
373 0.29
374 0.26
375 0.26
376 0.27
377 0.3
378 0.34
379 0.33
380 0.34
381 0.32
382 0.35
383 0.37
384 0.37
385 0.36
386 0.35
387 0.33
388 0.31
389 0.29
390 0.25
391 0.18
392 0.14
393 0.14
394 0.12
395 0.18
396 0.21
397 0.21
398 0.21
399 0.22
400 0.22
401 0.23
402 0.24
403 0.18
404 0.17
405 0.18
406 0.2
407 0.21
408 0.24
409 0.22
410 0.2
411 0.19
412 0.22
413 0.27
414 0.33
415 0.33
416 0.34
417 0.36
418 0.43
419 0.47
420 0.53
421 0.47
422 0.45
423 0.45
424 0.42
425 0.37
426 0.32
427 0.27
428 0.2
429 0.21
430 0.17
431 0.15
432 0.2
433 0.21
434 0.2
435 0.21
436 0.2
437 0.17
438 0.2
439 0.21
440 0.16
441 0.19
442 0.23
443 0.24
444 0.23
445 0.23
446 0.22
447 0.24
448 0.24
449 0.23
450 0.23
451 0.23
452 0.26
453 0.31
454 0.34
455 0.33
456 0.37
457 0.36
458 0.36
459 0.39
460 0.36
461 0.31
462 0.28
463 0.27
464 0.21
465 0.21
466 0.17
467 0.12
468 0.15
469 0.18
470 0.21
471 0.25
472 0.29
473 0.3
474 0.37
475 0.38
476 0.39
477 0.45
478 0.49
479 0.49
480 0.47
481 0.5
482 0.49
483 0.51
484 0.48
485 0.42
486 0.33
487 0.28
488 0.25
489 0.2
490 0.16
491 0.14
492 0.16
493 0.15
494 0.15
495 0.16
496 0.16
497 0.15
498 0.19
499 0.19
500 0.22
501 0.25
502 0.25
503 0.26
504 0.27
505 0.29
506 0.24
507 0.24
508 0.16
509 0.12
510 0.12
511 0.1
512 0.1
513 0.08
514 0.07
515 0.08
516 0.09
517 0.09
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.09
522 0.1
523 0.09
524 0.14
525 0.15
526 0.17
527 0.18
528 0.24
529 0.25
530 0.3
531 0.36
532 0.39
533 0.46
534 0.47
535 0.52
536 0.48
537 0.48
538 0.49
539 0.48
540 0.49
541 0.49
542 0.53
543 0.52
544 0.56
545 0.58
546 0.57
547 0.61
548 0.62
549 0.58
550 0.54
551 0.56
552 0.57
553 0.64
554 0.65
555 0.6
556 0.56
557 0.57
558 0.56
559 0.51
560 0.44
561 0.35
562 0.3
563 0.25
564 0.22
565 0.15
566 0.13
567 0.12
568 0.11
569 0.11
570 0.11
571 0.1
572 0.08
573 0.12
574 0.22
575 0.23
576 0.32
577 0.32
578 0.39
579 0.46
580 0.55
581 0.59
582 0.56
583 0.57
584 0.54
585 0.56
586 0.48
587 0.45
588 0.4
589 0.39
590 0.35
591 0.34
592 0.33
593 0.39
594 0.42
595 0.41
596 0.42
597 0.37
598 0.36
599 0.34
600 0.34
601 0.28
602 0.3
603 0.27
604 0.22
605 0.22
606 0.2
607 0.21
608 0.16
609 0.16
610 0.11
611 0.13
612 0.14
613 0.19
614 0.24
615 0.31
616 0.36
617 0.35
618 0.37
619 0.37
620 0.36
621 0.31
622 0.27
623 0.21
624 0.17
625 0.17
626 0.2
627 0.17
628 0.17
629 0.18
630 0.2
631 0.19
632 0.18
633 0.2
634 0.18
635 0.2
636 0.22
637 0.28
638 0.29
639 0.37
640 0.39
641 0.42
642 0.49
643 0.57
644 0.64
645 0.65
646 0.69
647 0.62
648 0.59
649 0.57
650 0.53
651 0.49
652 0.5
653 0.44
654 0.38
655 0.43
656 0.41
657 0.41
658 0.41
659 0.42
660 0.43
661 0.49
662 0.57
663 0.55
664 0.63
665 0.68
666 0.66
667 0.63
668 0.62
669 0.61
670 0.6
671 0.64
672 0.64
673 0.6
674 0.62
675 0.6
676 0.55
677 0.49
678 0.44
679 0.41
680 0.35
681 0.35
682 0.34
683 0.34
684 0.3
685 0.32
686 0.34
687 0.34
688 0.32
689 0.3
690 0.26
691 0.25
692 0.27
693 0.27
694 0.26
695 0.28
696 0.29
697 0.36
698 0.38
699 0.38
700 0.43
701 0.44
702 0.5
703 0.48
704 0.47
705 0.39
706 0.41
707 0.42
708 0.41
709 0.36
710 0.3
711 0.28
712 0.31
713 0.32
714 0.29
715 0.32
716 0.33
717 0.42
718 0.48
719 0.56
720 0.58
721 0.65
722 0.72
723 0.74
724 0.73
725 0.72
726 0.68
727 0.64
728 0.59
729 0.51
730 0.47
731 0.46
732 0.39
733 0.35
734 0.32
735 0.27
736 0.32
737 0.36
738 0.34
739 0.32
740 0.34
741 0.32
742 0.34
743 0.36
744 0.33
745 0.3
746 0.29
747 0.26
748 0.27
749 0.32
750 0.28
751 0.27
752 0.26
753 0.26
754 0.25
755 0.29
756 0.3
757 0.3
758 0.36
759 0.38
760 0.42
761 0.49
762 0.56
763 0.52
764 0.53
765 0.52
766 0.51
767 0.52
768 0.49
769 0.43
770 0.39
771 0.39
772 0.37
773 0.34
774 0.34
775 0.28
776 0.31
777 0.31
778 0.31
779 0.33
780 0.32
781 0.36
782 0.35
783 0.39
784 0.43
785 0.44
786 0.48
787 0.48
788 0.49
789 0.44
790 0.41
791 0.39
792 0.31
793 0.34
794 0.32
795 0.3
796 0.32
797 0.31
798 0.3
799 0.31
800 0.34
801 0.29
802 0.29
803 0.32
804 0.3
805 0.38
806 0.44
807 0.43
808 0.41
809 0.41
810 0.37
811 0.35
812 0.32
813 0.23
814 0.17
815 0.18
816 0.17
817 0.17
818 0.25
819 0.23
820 0.24
821 0.25
822 0.26
823 0.22
824 0.22
825 0.21
826 0.12
827 0.12
828 0.12
829 0.12
830 0.1
831 0.11
832 0.1
833 0.09
834 0.1
835 0.15
836 0.2
837 0.2
838 0.22
839 0.26
840 0.28
841 0.32
842 0.36
843 0.35
844 0.36
845 0.38
846 0.46
847 0.52
848 0.59
849 0.61
850 0.6
851 0.6
852 0.58
853 0.63
854 0.56
855 0.48
856 0.42
857 0.36
858 0.32
859 0.28
860 0.24
861 0.16
862 0.14
863 0.11
864 0.08
865 0.07
866 0.09
867 0.1
868 0.11
869 0.11
870 0.11
871 0.15
872 0.19
873 0.22
874 0.22
875 0.24
876 0.23
877 0.3
878 0.35
879 0.41
880 0.41
881 0.45
882 0.48
883 0.45
884 0.47
885 0.41
886 0.38
887 0.34
888 0.32
889 0.29
890 0.26
891 0.27
892 0.25
893 0.25
894 0.26
895 0.2
896 0.22
897 0.2
898 0.22
899 0.24
900 0.27
901 0.27
902 0.25
903 0.28
904 0.31
905 0.31
906 0.32
907 0.3
908 0.28
909 0.27
910 0.27
911 0.24
912 0.21
913 0.19
914 0.17
915 0.17
916 0.16
917 0.17
918 0.16
919 0.16
920 0.12
921 0.13
922 0.12
923 0.1
924 0.11
925 0.1
926 0.1
927 0.09
928 0.13
929 0.12
930 0.13
931 0.13
932 0.11
933 0.11
934 0.12
935 0.15
936 0.12
937 0.11
938 0.1
939 0.1
940 0.1
941 0.12
942 0.12
943 0.1
944 0.12
945 0.14
946 0.14
947 0.16
948 0.17
949 0.19
950 0.18
951 0.18
952 0.16
953 0.15
954 0.15
955 0.13
956 0.12
957 0.09
958 0.09
959 0.08
960 0.07
961 0.06
962 0.06
963 0.08
964 0.08
965 0.07
966 0.09
967 0.1
968 0.1
969 0.1
970 0.12
971 0.13
972 0.15
973 0.15
974 0.13
975 0.14
976 0.15
977 0.16
978 0.14
979 0.12
980 0.1
981 0.11
982 0.12
983 0.13
984 0.13
985 0.13
986 0.15
987 0.17
988 0.23
989 0.27
990 0.26
991 0.25
992 0.24
993 0.24
994 0.24
995 0.23
996 0.2
997 0.23
998 0.3
999 0.32
1000 0.37
1001 0.45
1002 0.49
1003 0.51
1004 0.49
1005 0.45
1006 0.42
1007 0.38
1008 0.33
1009 0.27
1010 0.28
1011 0.25
1012 0.26
1013 0.24
1014 0.2
1015 0.2
1016 0.21
1017 0.19
1018 0.17
1019 0.24
1020 0.27
1021 0.31
1022 0.37
1023 0.37
1024 0.37
1025 0.41
1026 0.42
1027 0.36
1028 0.4
1029 0.42
1030 0.46
1031 0.53
1032 0.57
1033 0.63
1034 0.7
1035 0.77
1036 0.8
1037 0.83
1038 0.81
1039 0.82
1040 0.84
1041 0.77
1042 0.72
1043 0.7
1044 0.7
1045 0.65
1046 0.59
1047 0.52
1048 0.43
1049 0.4
1050 0.4
1051 0.32
1052 0.28
1053 0.29
1054 0.29
1055 0.33
1056 0.34
1057 0.32