Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O74343

Protein Details
Accession O74343    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
211-236TFTVSKTTRKNQPRSRRDPRLSWKALHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001656  PsdUridine_synth_TruD  
IPR020119  PsdUridine_synth_TruD_CS  
IPR011760  PsdUridine_synth_TruD_insert  
IPR042214  TruD_catalytic  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0106029  F:tRNA pseudouridine synthase activity  
GO:0000455  P:enzyme-directed rRNA pseudouridine synthesis  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008380  P:RNA splicing  
GO:0031120  P:snRNA pseudouridine synthesis  
GO:0031119  P:tRNA pseudouridine synthesis  
KEGG spo:SPBC1A4.09  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01142  TruD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50984  TRUD  
PS01268  UPF0024  
CDD cd02576  PseudoU_synth_ScPUS7  
Amino Acid Sequences MSQENHVDVPRKRIRIDQSESSRNLERNGLEDEANAPSDLSGQKFYMTESDVGIDAFLNPNLPSIDGIIKARFTDFAVFEVDTDGNIVHLTDMEAHDPILSKATGDKETEDAKDSSNQDISNDQKAPSFKEQEPATLPILPNDLQSIIPKGIGNEFIQSLHKLSVGEITDPISLILPENTPPMDKGQRTILHQFIRNNFSGLESSTKGNGTFTVSKTTRKNQPRSRRDPRLSWKALGGEYCHFHLYKENRDSMDCLGKIARLLKVPTRTLSIAGTKDRRGVTCQRVAIHHVRASRLAQLNSGSLKNSTYGFLLGNYSYKNSNLRLGDLKGNEFHIVVRNVITPKEKVVEALNSLKEHGFINYFGLQRFGTSSVGTHTIGVRLLQSDWKGAVDLILSPRPEHTGSVKEAIDLWHSTHDAEASLRILPRRMIAESSILETWSRSGNQTDYLGAFQRIPRHLRSIYPHAYQSYVWNRVASWRIKNLGDRPVVGDLVYSTESNGLSQKSPIVDPEAPDLLEDLPVSSKLSARPIEEDEVNNFSIYDIVLPLPGRNVIYPKNETFDIYKSVMNEASLDPLNMSRKDRELSLPGDYRKLLVRPENMEFNFIKYDNMEQQLILTDKDRLENRSISVSSEVGKHTAVTLKFVLPSSAYATMALREALRTATASGDQRMLMPAVLKDSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.62
3 0.67
4 0.66
5 0.67
6 0.71
7 0.72
8 0.69
9 0.65
10 0.57
11 0.52
12 0.47
13 0.39
14 0.33
15 0.35
16 0.32
17 0.26
18 0.25
19 0.24
20 0.21
21 0.21
22 0.18
23 0.13
24 0.11
25 0.15
26 0.16
27 0.16
28 0.17
29 0.16
30 0.18
31 0.18
32 0.19
33 0.19
34 0.19
35 0.18
36 0.16
37 0.17
38 0.16
39 0.15
40 0.14
41 0.11
42 0.09
43 0.1
44 0.09
45 0.1
46 0.09
47 0.11
48 0.11
49 0.12
50 0.11
51 0.12
52 0.14
53 0.15
54 0.18
55 0.18
56 0.18
57 0.18
58 0.19
59 0.17
60 0.17
61 0.19
62 0.17
63 0.17
64 0.19
65 0.18
66 0.18
67 0.19
68 0.17
69 0.12
70 0.12
71 0.1
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.05
76 0.05
77 0.06
78 0.08
79 0.09
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.11
88 0.1
89 0.13
90 0.17
91 0.19
92 0.2
93 0.21
94 0.22
95 0.25
96 0.26
97 0.27
98 0.24
99 0.23
100 0.28
101 0.28
102 0.28
103 0.28
104 0.27
105 0.24
106 0.29
107 0.3
108 0.31
109 0.31
110 0.27
111 0.28
112 0.3
113 0.35
114 0.37
115 0.4
116 0.34
117 0.4
118 0.4
119 0.4
120 0.42
121 0.39
122 0.34
123 0.31
124 0.3
125 0.24
126 0.27
127 0.23
128 0.19
129 0.17
130 0.16
131 0.13
132 0.14
133 0.16
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.14
138 0.15
139 0.17
140 0.16
141 0.14
142 0.15
143 0.14
144 0.16
145 0.16
146 0.16
147 0.14
148 0.14
149 0.12
150 0.12
151 0.16
152 0.15
153 0.15
154 0.14
155 0.15
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.16
170 0.22
171 0.21
172 0.23
173 0.29
174 0.32
175 0.36
176 0.4
177 0.41
178 0.39
179 0.44
180 0.46
181 0.44
182 0.46
183 0.42
184 0.37
185 0.31
186 0.28
187 0.24
188 0.2
189 0.18
190 0.15
191 0.15
192 0.16
193 0.16
194 0.15
195 0.14
196 0.14
197 0.16
198 0.18
199 0.18
200 0.26
201 0.26
202 0.32
203 0.37
204 0.43
205 0.47
206 0.53
207 0.62
208 0.64
209 0.74
210 0.79
211 0.84
212 0.88
213 0.89
214 0.86
215 0.85
216 0.84
217 0.84
218 0.77
219 0.68
220 0.6
221 0.52
222 0.47
223 0.38
224 0.31
225 0.22
226 0.2
227 0.2
228 0.19
229 0.16
230 0.15
231 0.21
232 0.24
233 0.3
234 0.33
235 0.35
236 0.35
237 0.36
238 0.38
239 0.33
240 0.35
241 0.26
242 0.22
243 0.19
244 0.18
245 0.19
246 0.2
247 0.19
248 0.14
249 0.17
250 0.2
251 0.25
252 0.26
253 0.26
254 0.27
255 0.25
256 0.24
257 0.24
258 0.23
259 0.21
260 0.24
261 0.26
262 0.24
263 0.28
264 0.28
265 0.27
266 0.29
267 0.33
268 0.34
269 0.37
270 0.38
271 0.35
272 0.35
273 0.39
274 0.39
275 0.35
276 0.32
277 0.28
278 0.26
279 0.27
280 0.26
281 0.27
282 0.27
283 0.23
284 0.21
285 0.21
286 0.21
287 0.21
288 0.21
289 0.15
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.1
295 0.08
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.08
301 0.09
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.12
307 0.12
308 0.17
309 0.16
310 0.18
311 0.19
312 0.21
313 0.24
314 0.22
315 0.22
316 0.18
317 0.18
318 0.17
319 0.14
320 0.13
321 0.13
322 0.12
323 0.12
324 0.12
325 0.13
326 0.13
327 0.15
328 0.16
329 0.12
330 0.13
331 0.14
332 0.13
333 0.12
334 0.13
335 0.12
336 0.13
337 0.17
338 0.17
339 0.16
340 0.17
341 0.16
342 0.15
343 0.14
344 0.12
345 0.09
346 0.08
347 0.1
348 0.13
349 0.14
350 0.13
351 0.14
352 0.13
353 0.12
354 0.13
355 0.12
356 0.09
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.11
361 0.11
362 0.11
363 0.09
364 0.09
365 0.1
366 0.1
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.06
379 0.07
380 0.08
381 0.1
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.13
386 0.14
387 0.14
388 0.14
389 0.16
390 0.18
391 0.21
392 0.21
393 0.19
394 0.19
395 0.18
396 0.17
397 0.14
398 0.13
399 0.11
400 0.11
401 0.11
402 0.1
403 0.1
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.07
408 0.08
409 0.1
410 0.1
411 0.11
412 0.11
413 0.13
414 0.14
415 0.14
416 0.14
417 0.13
418 0.16
419 0.15
420 0.17
421 0.16
422 0.14
423 0.13
424 0.12
425 0.12
426 0.11
427 0.11
428 0.1
429 0.11
430 0.12
431 0.14
432 0.15
433 0.15
434 0.14
435 0.14
436 0.15
437 0.14
438 0.14
439 0.14
440 0.19
441 0.22
442 0.25
443 0.26
444 0.3
445 0.31
446 0.34
447 0.38
448 0.41
449 0.42
450 0.41
451 0.41
452 0.36
453 0.37
454 0.33
455 0.34
456 0.32
457 0.32
458 0.3
459 0.28
460 0.27
461 0.31
462 0.36
463 0.34
464 0.31
465 0.31
466 0.34
467 0.36
468 0.41
469 0.41
470 0.43
471 0.39
472 0.35
473 0.33
474 0.31
475 0.29
476 0.24
477 0.19
478 0.11
479 0.12
480 0.12
481 0.1
482 0.08
483 0.1
484 0.1
485 0.1
486 0.13
487 0.12
488 0.11
489 0.12
490 0.14
491 0.14
492 0.14
493 0.15
494 0.19
495 0.19
496 0.19
497 0.23
498 0.22
499 0.2
500 0.2
501 0.19
502 0.13
503 0.13
504 0.11
505 0.08
506 0.07
507 0.08
508 0.09
509 0.09
510 0.1
511 0.12
512 0.18
513 0.2
514 0.21
515 0.24
516 0.26
517 0.29
518 0.3
519 0.29
520 0.26
521 0.27
522 0.26
523 0.22
524 0.18
525 0.15
526 0.13
527 0.11
528 0.09
529 0.06
530 0.06
531 0.08
532 0.08
533 0.08
534 0.09
535 0.11
536 0.11
537 0.12
538 0.16
539 0.19
540 0.26
541 0.31
542 0.31
543 0.34
544 0.33
545 0.34
546 0.32
547 0.3
548 0.29
549 0.25
550 0.25
551 0.22
552 0.24
553 0.23
554 0.2
555 0.19
556 0.15
557 0.17
558 0.16
559 0.15
560 0.13
561 0.16
562 0.21
563 0.22
564 0.25
565 0.24
566 0.28
567 0.3
568 0.32
569 0.33
570 0.33
571 0.33
572 0.37
573 0.41
574 0.39
575 0.41
576 0.38
577 0.35
578 0.34
579 0.34
580 0.32
581 0.33
582 0.37
583 0.39
584 0.43
585 0.5
586 0.46
587 0.48
588 0.43
589 0.39
590 0.36
591 0.31
592 0.28
593 0.21
594 0.25
595 0.26
596 0.29
597 0.26
598 0.22
599 0.22
600 0.26
601 0.26
602 0.22
603 0.18
604 0.18
605 0.19
606 0.25
607 0.28
608 0.27
609 0.31
610 0.33
611 0.34
612 0.36
613 0.36
614 0.32
615 0.31
616 0.29
617 0.25
618 0.26
619 0.25
620 0.2
621 0.2
622 0.17
623 0.17
624 0.23
625 0.21
626 0.22
627 0.23
628 0.23
629 0.25
630 0.26
631 0.25
632 0.19
633 0.2
634 0.21
635 0.21
636 0.19
637 0.18
638 0.18
639 0.18
640 0.18
641 0.17
642 0.13
643 0.12
644 0.12
645 0.12
646 0.12
647 0.12
648 0.12
649 0.13
650 0.18
651 0.2
652 0.21
653 0.22
654 0.22
655 0.22
656 0.23
657 0.21
658 0.17
659 0.17
660 0.15