Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O42975

Protein Details
Accession O42975    Localization Confidence Low Confidence Score 8.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-40SSFNSVKAKKNPITKSNKKYRSSHDQVSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito_nucl 11.665, nucl 11.5, mito 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013633  NRDE-2  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:1902369  P:negative regulation of RNA catabolic process  
GO:1902802  P:regulation of siRNA-dependent facultative heterochromatin formation  
GO:0031048  P:small ncRNA-mediated heterochromatin formation  
KEGG spo:SPBC20F10.05  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08424  NRDE-2  
Amino Acid Sequences MPSNHNTSVPKFSSFNSVKAKKNPITKSNKKYRSSHDQVSSNHAKSSFPSHRSIQSNFAVDTKGEKQNLLYGINKRPVPKYHRSSSSVYGSAPLLRIVKESKEGITLNKKKSLEIKYDEERSFDEKENDESEFEDGQQGFIPLLVNRNSDPSEKSTFSLNILKAIKETDEEIKKNPGKARLWIKMCEYQERLLFDEFRRSNSDDIKGKLKIENNSRSVKLSILEKALKEVKGCDHEILVSYYLQLGSEEWSKEETNQKFEEVLIEHPGYLNLWMKYAEYFTGISEFTFNDCLNMFSKCFKFLKQKLSDRKSCKERESTDVTSNFEVEEAILHLLIRLCDFLKNCGYYELAWSIFQANMELCYFYPRYLEKKLDSTFFESFSKFWNSDTPKFSEENARGWCNVLDDESSQQNQNFSSEIGIFQTVKLWYLNESKFDTNPPPRSTMSCRKLSGIDDPFRYIVFNDIQDFIVCFESETIAFAFKYKFFAFCGVPLFPPGISTNSWFASYDKGIYNLLFGMASSESFINGQIAEKNSFQFPCSILPSYIDLFISLMSFKNLNFKLFDYNLAHHVKESMERAFHQLVFSADDEYLASVYLIYLKQMETKNLSEEKPQVNKIVKKILKKYDSSVSVWNTYAQLEHLSGAFTMAETIFKTIFQIHASQLRYIDNLNVYKNWAFRKLLINDTEGCLVIIKCLLFPGDKSLTSDNNRASEMLFGMLENCASKEELLYVCLIYTIWTHCTDMDSMDNCVYLCIQKFESYGWGASSEMECYFSYCSLIFYYQATTLQFYNLPKVRPFFEKGVTLFSANTAIWEVYIFFESKLRQENKPKIRAMKILKSASNAVVTACWYLFYVAVQQIEPTNSQYFLRTLDITLNNEKLKSVAKFWRIYLKILNLRLNGTEWVSAITTKALASCPCNKGVCMDVIDLLLKKEMESRAIICYIIMLEKGFRVHNEIRRDVLKFERGDELILSPN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.45
3 0.47
4 0.52
5 0.55
6 0.62
7 0.71
8 0.67
9 0.74
10 0.75
11 0.74
12 0.78
13 0.81
14 0.84
15 0.85
16 0.88
17 0.86
18 0.85
19 0.83
20 0.83
21 0.81
22 0.8
23 0.77
24 0.75
25 0.7
26 0.72
27 0.72
28 0.62
29 0.57
30 0.48
31 0.4
32 0.35
33 0.43
34 0.43
35 0.38
36 0.41
37 0.42
38 0.5
39 0.55
40 0.56
41 0.53
42 0.49
43 0.49
44 0.45
45 0.42
46 0.35
47 0.29
48 0.32
49 0.31
50 0.32
51 0.3
52 0.29
53 0.29
54 0.33
55 0.36
56 0.34
57 0.34
58 0.34
59 0.41
60 0.47
61 0.49
62 0.47
63 0.5
64 0.55
65 0.58
66 0.62
67 0.62
68 0.64
69 0.69
70 0.7
71 0.69
72 0.67
73 0.66
74 0.57
75 0.49
76 0.42
77 0.35
78 0.32
79 0.28
80 0.24
81 0.19
82 0.17
83 0.2
84 0.21
85 0.22
86 0.25
87 0.26
88 0.24
89 0.27
90 0.28
91 0.32
92 0.41
93 0.46
94 0.47
95 0.53
96 0.52
97 0.5
98 0.58
99 0.57
100 0.55
101 0.53
102 0.55
103 0.55
104 0.63
105 0.6
106 0.53
107 0.5
108 0.45
109 0.43
110 0.4
111 0.36
112 0.3
113 0.34
114 0.34
115 0.32
116 0.28
117 0.25
118 0.23
119 0.2
120 0.18
121 0.19
122 0.17
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.12
127 0.12
128 0.13
129 0.09
130 0.14
131 0.16
132 0.17
133 0.17
134 0.22
135 0.23
136 0.24
137 0.27
138 0.27
139 0.31
140 0.3
141 0.31
142 0.31
143 0.3
144 0.31
145 0.35
146 0.3
147 0.31
148 0.31
149 0.31
150 0.27
151 0.27
152 0.24
153 0.18
154 0.21
155 0.22
156 0.28
157 0.3
158 0.32
159 0.4
160 0.43
161 0.48
162 0.5
163 0.5
164 0.46
165 0.52
166 0.59
167 0.58
168 0.59
169 0.57
170 0.57
171 0.56
172 0.56
173 0.55
174 0.48
175 0.43
176 0.42
177 0.41
178 0.38
179 0.33
180 0.34
181 0.28
182 0.35
183 0.32
184 0.31
185 0.34
186 0.33
187 0.35
188 0.36
189 0.42
190 0.37
191 0.4
192 0.43
193 0.4
194 0.4
195 0.41
196 0.42
197 0.42
198 0.46
199 0.51
200 0.51
201 0.54
202 0.53
203 0.51
204 0.46
205 0.4
206 0.33
207 0.28
208 0.25
209 0.26
210 0.28
211 0.25
212 0.29
213 0.33
214 0.31
215 0.29
216 0.28
217 0.27
218 0.29
219 0.31
220 0.26
221 0.22
222 0.22
223 0.22
224 0.22
225 0.18
226 0.13
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.08
232 0.07
233 0.08
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.15
238 0.15
239 0.19
240 0.27
241 0.27
242 0.29
243 0.29
244 0.3
245 0.27
246 0.27
247 0.27
248 0.2
249 0.19
250 0.18
251 0.17
252 0.16
253 0.15
254 0.15
255 0.12
256 0.13
257 0.15
258 0.11
259 0.12
260 0.12
261 0.13
262 0.13
263 0.14
264 0.12
265 0.1
266 0.1
267 0.09
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.11
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.16
283 0.17
284 0.21
285 0.22
286 0.26
287 0.35
288 0.4
289 0.49
290 0.54
291 0.63
292 0.68
293 0.76
294 0.8
295 0.77
296 0.79
297 0.78
298 0.75
299 0.71
300 0.69
301 0.64
302 0.61
303 0.62
304 0.57
305 0.55
306 0.5
307 0.47
308 0.39
309 0.35
310 0.29
311 0.2
312 0.16
313 0.09
314 0.07
315 0.06
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.1
326 0.11
327 0.13
328 0.16
329 0.17
330 0.17
331 0.18
332 0.18
333 0.15
334 0.17
335 0.16
336 0.13
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.11
341 0.11
342 0.09
343 0.07
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.07
348 0.1
349 0.11
350 0.1
351 0.13
352 0.14
353 0.18
354 0.22
355 0.26
356 0.25
357 0.31
358 0.33
359 0.33
360 0.33
361 0.34
362 0.3
363 0.29
364 0.28
365 0.22
366 0.21
367 0.21
368 0.22
369 0.17
370 0.17
371 0.22
372 0.27
373 0.32
374 0.35
375 0.35
376 0.34
377 0.35
378 0.35
379 0.35
380 0.31
381 0.31
382 0.31
383 0.29
384 0.27
385 0.27
386 0.26
387 0.19
388 0.17
389 0.13
390 0.1
391 0.09
392 0.11
393 0.12
394 0.13
395 0.13
396 0.13
397 0.13
398 0.13
399 0.13
400 0.11
401 0.09
402 0.09
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.09
407 0.08
408 0.07
409 0.1
410 0.09
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.11
415 0.17
416 0.18
417 0.18
418 0.21
419 0.21
420 0.22
421 0.24
422 0.28
423 0.3
424 0.35
425 0.34
426 0.35
427 0.35
428 0.38
429 0.43
430 0.47
431 0.45
432 0.44
433 0.43
434 0.41
435 0.42
436 0.4
437 0.4
438 0.35
439 0.33
440 0.29
441 0.29
442 0.28
443 0.26
444 0.25
445 0.17
446 0.13
447 0.11
448 0.1
449 0.1
450 0.11
451 0.11
452 0.11
453 0.11
454 0.09
455 0.09
456 0.08
457 0.06
458 0.05
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.07
467 0.07
468 0.11
469 0.1
470 0.11
471 0.1
472 0.14
473 0.13
474 0.13
475 0.16
476 0.13
477 0.13
478 0.13
479 0.13
480 0.09
481 0.1
482 0.1
483 0.09
484 0.09
485 0.1
486 0.12
487 0.12
488 0.13
489 0.12
490 0.12
491 0.12
492 0.12
493 0.13
494 0.11
495 0.11
496 0.11
497 0.11
498 0.11
499 0.08
500 0.08
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.07
515 0.09
516 0.11
517 0.11
518 0.12
519 0.14
520 0.14
521 0.14
522 0.13
523 0.12
524 0.13
525 0.15
526 0.15
527 0.14
528 0.15
529 0.16
530 0.15
531 0.15
532 0.12
533 0.09
534 0.08
535 0.08
536 0.07
537 0.06
538 0.05
539 0.05
540 0.06
541 0.06
542 0.14
543 0.14
544 0.15
545 0.16
546 0.17
547 0.2
548 0.21
549 0.25
550 0.2
551 0.2
552 0.25
553 0.26
554 0.25
555 0.2
556 0.21
557 0.17
558 0.17
559 0.18
560 0.14
561 0.13
562 0.14
563 0.18
564 0.19
565 0.19
566 0.17
567 0.15
568 0.14
569 0.15
570 0.14
571 0.11
572 0.09
573 0.09
574 0.09
575 0.08
576 0.07
577 0.05
578 0.05
579 0.03
580 0.03
581 0.05
582 0.05
583 0.05
584 0.06
585 0.06
586 0.12
587 0.13
588 0.15
589 0.17
590 0.18
591 0.23
592 0.26
593 0.26
594 0.24
595 0.29
596 0.34
597 0.35
598 0.35
599 0.37
600 0.4
601 0.43
602 0.43
603 0.47
604 0.45
605 0.48
606 0.54
607 0.57
608 0.56
609 0.54
610 0.54
611 0.51
612 0.51
613 0.46
614 0.43
615 0.37
616 0.34
617 0.32
618 0.29
619 0.22
620 0.19
621 0.17
622 0.12
623 0.1
624 0.08
625 0.09
626 0.08
627 0.07
628 0.07
629 0.07
630 0.06
631 0.05
632 0.05
633 0.05
634 0.05
635 0.05
636 0.07
637 0.06
638 0.06
639 0.07
640 0.08
641 0.09
642 0.1
643 0.11
644 0.12
645 0.18
646 0.2
647 0.2
648 0.21
649 0.2
650 0.2
651 0.18
652 0.18
653 0.17
654 0.18
655 0.18
656 0.17
657 0.19
658 0.21
659 0.24
660 0.24
661 0.25
662 0.24
663 0.25
664 0.33
665 0.34
666 0.38
667 0.36
668 0.36
669 0.32
670 0.32
671 0.3
672 0.21
673 0.18
674 0.13
675 0.11
676 0.09
677 0.09
678 0.08
679 0.07
680 0.07
681 0.08
682 0.07
683 0.08
684 0.14
685 0.15
686 0.16
687 0.19
688 0.21
689 0.26
690 0.3
691 0.35
692 0.32
693 0.31
694 0.31
695 0.28
696 0.26
697 0.21
698 0.17
699 0.13
700 0.1
701 0.08
702 0.08
703 0.08
704 0.08
705 0.07
706 0.06
707 0.06
708 0.07
709 0.07
710 0.07
711 0.09
712 0.09
713 0.1
714 0.1
715 0.09
716 0.09
717 0.09
718 0.08
719 0.06
720 0.07
721 0.08
722 0.1
723 0.12
724 0.12
725 0.12
726 0.14
727 0.14
728 0.14
729 0.17
730 0.16
731 0.17
732 0.16
733 0.17
734 0.15
735 0.14
736 0.14
737 0.11
738 0.11
739 0.12
740 0.13
741 0.14
742 0.15
743 0.16
744 0.19
745 0.18
746 0.17
747 0.15
748 0.15
749 0.13
750 0.14
751 0.13
752 0.11
753 0.1
754 0.12
755 0.11
756 0.12
757 0.13
758 0.12
759 0.12
760 0.11
761 0.12
762 0.11
763 0.12
764 0.12
765 0.12
766 0.13
767 0.13
768 0.15
769 0.15
770 0.15
771 0.14
772 0.15
773 0.18
774 0.17
775 0.25
776 0.26
777 0.28
778 0.3
779 0.32
780 0.34
781 0.36
782 0.4
783 0.36
784 0.36
785 0.38
786 0.36
787 0.39
788 0.37
789 0.32
790 0.27
791 0.23
792 0.21
793 0.16
794 0.15
795 0.12
796 0.1
797 0.09
798 0.09
799 0.09
800 0.08
801 0.1
802 0.1
803 0.09
804 0.12
805 0.13
806 0.17
807 0.26
808 0.28
809 0.35
810 0.45
811 0.55
812 0.62
813 0.69
814 0.72
815 0.71
816 0.73
817 0.75
818 0.73
819 0.72
820 0.71
821 0.68
822 0.64
823 0.59
824 0.56
825 0.49
826 0.43
827 0.33
828 0.25
829 0.19
830 0.18
831 0.16
832 0.13
833 0.11
834 0.09
835 0.1
836 0.1
837 0.09
838 0.13
839 0.14
840 0.15
841 0.15
842 0.15
843 0.17
844 0.19
845 0.19
846 0.19
847 0.18
848 0.18
849 0.19
850 0.2
851 0.19
852 0.19
853 0.21
854 0.18
855 0.18
856 0.24
857 0.27
858 0.29
859 0.33
860 0.36
861 0.34
862 0.34
863 0.33
864 0.27
865 0.29
866 0.27
867 0.3
868 0.33
869 0.39
870 0.42
871 0.45
872 0.53
873 0.49
874 0.5
875 0.49
876 0.5
877 0.5
878 0.53
879 0.57
880 0.48
881 0.48
882 0.46
883 0.41
884 0.34
885 0.28
886 0.23
887 0.17
888 0.17
889 0.16
890 0.15
891 0.13
892 0.12
893 0.11
894 0.1
895 0.11
896 0.12
897 0.14
898 0.2
899 0.27
900 0.3
901 0.35
902 0.36
903 0.35
904 0.35
905 0.36
906 0.34
907 0.28
908 0.26
909 0.22
910 0.21
911 0.23
912 0.21
913 0.19
914 0.18
915 0.15
916 0.14
917 0.19
918 0.2
919 0.21
920 0.23
921 0.24
922 0.25
923 0.26
924 0.26
925 0.19
926 0.18
927 0.16
928 0.15
929 0.14
930 0.1
931 0.1
932 0.13
933 0.15
934 0.16
935 0.16
936 0.23
937 0.3
938 0.37
939 0.44
940 0.46
941 0.48
942 0.51
943 0.52
944 0.49
945 0.49
946 0.49
947 0.42
948 0.41
949 0.43
950 0.39
951 0.38
952 0.34