Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2DSS4

Protein Details
Accession A0A0D2DSS4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
171-197EEGTGKGKGRGRGRRKKRDREEDAAGPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
175-190GKGKGRGRGRRKKRDR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito_nucl 10.833, cyto_nucl 9.833, mito 7.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MEPRARAGRHKSNLNFGPELSALLYAYGAPTHPDIVSPLGGGGGGGPSSSSSSSTYLSSLPTPNTTSAPTPFNQPFPETVRVLDEILTDFIIETCHNAVSVAAYSGRAKLKLSDFEFVLRKDSIKLGRVQEMFKKKRDIDNKKKLFDTNEGREGTKLGVGDLMNLGEVVGEEGTGKGKGRGRGRRKKRDREEDAAGPGAGGGVGTGLDGTLEDDAEEPASKRARSEIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.6
3 0.5
4 0.46
5 0.37
6 0.34
7 0.24
8 0.19
9 0.13
10 0.11
11 0.11
12 0.07
13 0.07
14 0.06
15 0.06
16 0.07
17 0.08
18 0.1
19 0.09
20 0.1
21 0.11
22 0.13
23 0.13
24 0.11
25 0.1
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.06
30 0.04
31 0.04
32 0.04
33 0.04
34 0.04
35 0.06
36 0.07
37 0.08
38 0.09
39 0.11
40 0.13
41 0.13
42 0.14
43 0.13
44 0.14
45 0.15
46 0.16
47 0.15
48 0.17
49 0.18
50 0.18
51 0.19
52 0.19
53 0.19
54 0.2
55 0.21
56 0.19
57 0.24
58 0.24
59 0.26
60 0.25
61 0.25
62 0.25
63 0.27
64 0.31
65 0.25
66 0.24
67 0.23
68 0.22
69 0.21
70 0.18
71 0.14
72 0.1
73 0.1
74 0.09
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.09
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.12
97 0.14
98 0.2
99 0.21
100 0.2
101 0.19
102 0.22
103 0.24
104 0.21
105 0.22
106 0.16
107 0.15
108 0.14
109 0.17
110 0.17
111 0.17
112 0.21
113 0.21
114 0.26
115 0.28
116 0.29
117 0.33
118 0.4
119 0.42
120 0.41
121 0.46
122 0.42
123 0.49
124 0.58
125 0.62
126 0.63
127 0.7
128 0.74
129 0.71
130 0.7
131 0.65
132 0.58
133 0.55
134 0.53
135 0.48
136 0.47
137 0.45
138 0.43
139 0.4
140 0.37
141 0.29
142 0.22
143 0.16
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.06
162 0.07
163 0.11
164 0.16
165 0.23
166 0.32
167 0.43
168 0.53
169 0.63
170 0.74
171 0.8
172 0.87
173 0.91
174 0.93
175 0.94
176 0.91
177 0.88
178 0.85
179 0.79
180 0.72
181 0.63
182 0.51
183 0.4
184 0.31
185 0.23
186 0.15
187 0.09
188 0.04
189 0.02
190 0.02
191 0.03
192 0.03
193 0.02
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.15
206 0.19
207 0.2
208 0.2