Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q9P3A7

Protein Details
Accession Q9P3A7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-50DTATAILRKKRKPNSLVVDDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR005938  AAA_ATPase_CDC48  
IPR041569  AAA_lid_3  
IPR009010  Asp_de-COase-like_dom_sf  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR003960  ATPase_AAA_CS  
IPR004201  Cdc48_dom2  
IPR029067  CDC48_domain_2-like_sf  
IPR003338  CDC4_N-term_subdom  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0036266  C:Cdc48p-Npl4p-Vms1p AAA ATPase complex  
GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0032473  C:cytoplasmic side of mitochondrial outer membrane  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000836  C:Hrd1p ubiquitin ligase complex  
GO:1990023  C:mitotic spindle midzone  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990112  C:RQC complex  
GO:0034098  C:VCP-NPL4-UFD1 AAA ATPase complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0140545  F:ATP-dependent protein disaggregase activity  
GO:0031593  F:polyubiquitin modification-dependent protein binding  
GO:0030674  F:protein-macromolecule adaptor activity  
GO:0097352  P:autophagosome maturation  
GO:0061163  P:endoplasmic reticulum polarization  
GO:0071712  P:ER-associated misfolded protein catabolic process  
GO:0051228  P:mitotic spindle disassembly  
GO:0030970  P:retrograde protein transport, ER to cytosol  
GO:1990116  P:ribosome-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
GO:0032933  P:SREBP signaling pathway  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG spo:SPAC1565.08  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF17862  AAA_lid_3  
PF02933  CDC48_2  
PF02359  CDC48_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00674  AAA  
CDD cd19519  RecA-like_CDC48_r1-like  
cd19528  RecA-like_CDC48_r2-like  
Amino Acid Sequences MNAPSTMTDKKPEVEHLQGENPPKDTYSAEDTATAILRKKRKPNSLVVDDATNDDNSVITLSSNTMETLQLFRGDTVVVKGKRRKDTVLIVLTDEEMEDGVARINRVVRNNLRVRLGDIVTINPCPDIKYAERISVLPLADTVEGLTGSLFDVYLKPYFVEAYRPIRKGDLFVVRGSMRQVEFKVVDVAPDEFGIVSQDTIIHWEGEPINREDEESSLAEVGYDDIGGCRRQMAQIRELVELPLRHPQLFKSIGIKPPRGILMYGPPGTGKTLMARAVANETGAFFFLINGPEIMSKMAGESESNLRKAFEEAEKNSPAIIFIDEIDSIAPKREKTNGEVERRVVSQLLTLMDGMKARSNVVVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDVGIPDPTGRLEILRIHTKNMKLADDVDLEQIAAETHGYVGSDLASLCSEAAMQQIREKMDMIDLDEDEIDAEVLDSLGVTMDNFRFALGSSNPSALRETVVEVPNVRWEDIGGLEEVKRELRETVQMPVMYAEKFLRFGVTPSKGVLFFGPPGTGKTLLAKAIANECSANFISVKGPELLSMWFGESESNVRDIFDKARAAAPCVVFLDELDSIAKARGASAGDSGGGDRVVNQLLTEMDGVNSKKNVFVIGATNRPDQIDPALMRPGRLDQLIYVPLPDEEARFSILQTQLRHTPVAEDVDLRAVAKATHGFSGADLEFVVQRAVKLAIKDSIEEDIKRENETGEAPADDVVMDEDASVSQVQRHHVEEAMKMARRSVSDAEVRRYEAYAHQLLTSRGLTGFQFDSADSNTNGPSFGNDGADDLYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.46
3 0.45
4 0.48
5 0.5
6 0.54
7 0.5
8 0.46
9 0.41
10 0.36
11 0.33
12 0.29
13 0.29
14 0.28
15 0.27
16 0.26
17 0.26
18 0.25
19 0.25
20 0.26
21 0.24
22 0.22
23 0.27
24 0.35
25 0.43
26 0.53
27 0.61
28 0.68
29 0.73
30 0.78
31 0.81
32 0.79
33 0.77
34 0.69
35 0.62
36 0.52
37 0.48
38 0.39
39 0.29
40 0.22
41 0.16
42 0.13
43 0.1
44 0.1
45 0.08
46 0.06
47 0.07
48 0.08
49 0.09
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.1
54 0.12
55 0.14
56 0.14
57 0.16
58 0.16
59 0.15
60 0.15
61 0.15
62 0.14
63 0.16
64 0.24
65 0.25
66 0.33
67 0.41
68 0.49
69 0.57
70 0.61
71 0.61
72 0.6
73 0.64
74 0.65
75 0.65
76 0.57
77 0.5
78 0.46
79 0.41
80 0.34
81 0.25
82 0.15
83 0.08
84 0.07
85 0.06
86 0.05
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.11
91 0.16
92 0.2
93 0.24
94 0.33
95 0.36
96 0.45
97 0.52
98 0.55
99 0.54
100 0.51
101 0.49
102 0.46
103 0.41
104 0.34
105 0.28
106 0.27
107 0.25
108 0.24
109 0.22
110 0.17
111 0.17
112 0.15
113 0.15
114 0.18
115 0.18
116 0.25
117 0.27
118 0.3
119 0.31
120 0.3
121 0.31
122 0.3
123 0.27
124 0.19
125 0.18
126 0.16
127 0.14
128 0.14
129 0.11
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.08
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.12
146 0.12
147 0.17
148 0.2
149 0.29
150 0.36
151 0.37
152 0.38
153 0.4
154 0.4
155 0.37
156 0.38
157 0.37
158 0.32
159 0.31
160 0.34
161 0.31
162 0.31
163 0.3
164 0.27
165 0.19
166 0.2
167 0.21
168 0.22
169 0.22
170 0.22
171 0.25
172 0.21
173 0.2
174 0.19
175 0.19
176 0.14
177 0.13
178 0.12
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.07
183 0.06
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.09
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.12
192 0.13
193 0.16
194 0.19
195 0.18
196 0.19
197 0.19
198 0.2
199 0.17
200 0.16
201 0.16
202 0.14
203 0.13
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.06
210 0.05
211 0.04
212 0.05
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.13
219 0.2
220 0.23
221 0.26
222 0.3
223 0.32
224 0.32
225 0.32
226 0.29
227 0.25
228 0.22
229 0.19
230 0.22
231 0.21
232 0.21
233 0.21
234 0.21
235 0.24
236 0.27
237 0.26
238 0.24
239 0.28
240 0.34
241 0.39
242 0.4
243 0.34
244 0.34
245 0.34
246 0.3
247 0.25
248 0.2
249 0.22
250 0.25
251 0.25
252 0.23
253 0.21
254 0.2
255 0.21
256 0.2
257 0.13
258 0.09
259 0.11
260 0.12
261 0.13
262 0.13
263 0.13
264 0.15
265 0.14
266 0.13
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.05
273 0.05
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.07
289 0.14
290 0.17
291 0.18
292 0.18
293 0.18
294 0.18
295 0.19
296 0.2
297 0.19
298 0.23
299 0.25
300 0.3
301 0.31
302 0.3
303 0.29
304 0.26
305 0.21
306 0.15
307 0.12
308 0.07
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.06
316 0.09
317 0.1
318 0.1
319 0.12
320 0.18
321 0.2
322 0.23
323 0.33
324 0.37
325 0.43
326 0.45
327 0.44
328 0.41
329 0.39
330 0.36
331 0.26
332 0.18
333 0.13
334 0.12
335 0.11
336 0.09
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.09
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.08
352 0.1
353 0.12
354 0.12
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.14
359 0.13
360 0.16
361 0.16
362 0.21
363 0.25
364 0.25
365 0.25
366 0.26
367 0.26
368 0.27
369 0.28
370 0.24
371 0.24
372 0.24
373 0.24
374 0.21
375 0.19
376 0.14
377 0.13
378 0.11
379 0.07
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.05
384 0.04
385 0.05
386 0.08
387 0.12
388 0.19
389 0.19
390 0.21
391 0.25
392 0.25
393 0.28
394 0.27
395 0.24
396 0.18
397 0.18
398 0.19
399 0.16
400 0.16
401 0.13
402 0.11
403 0.1
404 0.09
405 0.08
406 0.06
407 0.04
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.03
425 0.06
426 0.06
427 0.07
428 0.09
429 0.12
430 0.12
431 0.13
432 0.13
433 0.11
434 0.12
435 0.12
436 0.11
437 0.1
438 0.09
439 0.09
440 0.08
441 0.08
442 0.06
443 0.06
444 0.04
445 0.03
446 0.03
447 0.02
448 0.02
449 0.02
450 0.02
451 0.02
452 0.02
453 0.02
454 0.02
455 0.04
456 0.04
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.06
462 0.09
463 0.09
464 0.11
465 0.12
466 0.14
467 0.14
468 0.15
469 0.16
470 0.12
471 0.12
472 0.1
473 0.11
474 0.14
475 0.15
476 0.15
477 0.15
478 0.15
479 0.19
480 0.2
481 0.17
482 0.12
483 0.11
484 0.11
485 0.11
486 0.11
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.09
496 0.09
497 0.14
498 0.15
499 0.17
500 0.2
501 0.2
502 0.19
503 0.19
504 0.2
505 0.14
506 0.14
507 0.13
508 0.1
509 0.11
510 0.11
511 0.11
512 0.1
513 0.11
514 0.18
515 0.19
516 0.2
517 0.19
518 0.21
519 0.2
520 0.2
521 0.19
522 0.13
523 0.12
524 0.12
525 0.12
526 0.11
527 0.12
528 0.14
529 0.14
530 0.12
531 0.14
532 0.15
533 0.15
534 0.16
535 0.15
536 0.13
537 0.17
538 0.18
539 0.15
540 0.14
541 0.13
542 0.16
543 0.15
544 0.15
545 0.11
546 0.11
547 0.12
548 0.12
549 0.14
550 0.11
551 0.11
552 0.1
553 0.11
554 0.11
555 0.1
556 0.1
557 0.09
558 0.08
559 0.08
560 0.08
561 0.07
562 0.09
563 0.09
564 0.1
565 0.1
566 0.1
567 0.11
568 0.13
569 0.15
570 0.17
571 0.16
572 0.16
573 0.21
574 0.21
575 0.23
576 0.25
577 0.23
578 0.21
579 0.21
580 0.2
581 0.15
582 0.15
583 0.15
584 0.1
585 0.1
586 0.09
587 0.08
588 0.08
589 0.08
590 0.1
591 0.06
592 0.07
593 0.09
594 0.09
595 0.1
596 0.1
597 0.1
598 0.09
599 0.1
600 0.1
601 0.08
602 0.07
603 0.06
604 0.06
605 0.07
606 0.08
607 0.07
608 0.07
609 0.08
610 0.08
611 0.09
612 0.09
613 0.07
614 0.07
615 0.11
616 0.12
617 0.14
618 0.15
619 0.15
620 0.15
621 0.15
622 0.16
623 0.13
624 0.13
625 0.17
626 0.21
627 0.26
628 0.28
629 0.29
630 0.29
631 0.3
632 0.28
633 0.23
634 0.2
635 0.21
636 0.19
637 0.2
638 0.27
639 0.25
640 0.26
641 0.25
642 0.26
643 0.22
644 0.22
645 0.2
646 0.14
647 0.18
648 0.2
649 0.19
650 0.16
651 0.14
652 0.14
653 0.16
654 0.15
655 0.12
656 0.11
657 0.12
658 0.14
659 0.14
660 0.14
661 0.17
662 0.21
663 0.25
664 0.26
665 0.29
666 0.33
667 0.34
668 0.35
669 0.29
670 0.27
671 0.25
672 0.27
673 0.23
674 0.19
675 0.17
676 0.19
677 0.19
678 0.17
679 0.14
680 0.11
681 0.1
682 0.11
683 0.14
684 0.13
685 0.14
686 0.15
687 0.15
688 0.14
689 0.2
690 0.17
691 0.14
692 0.12
693 0.12
694 0.11
695 0.12
696 0.13
697 0.08
698 0.08
699 0.09
700 0.12
701 0.14
702 0.14
703 0.17
704 0.21
705 0.21
706 0.23
707 0.22
708 0.25
709 0.26
710 0.25
711 0.25
712 0.27
713 0.27
714 0.28
715 0.27
716 0.23
717 0.21
718 0.22
719 0.23
720 0.17
721 0.17
722 0.15
723 0.14
724 0.14
725 0.11
726 0.1
727 0.08
728 0.07
729 0.06
730 0.06
731 0.06
732 0.06
733 0.07
734 0.07
735 0.07
736 0.1
737 0.13
738 0.17
739 0.2
740 0.23
741 0.23
742 0.27
743 0.29
744 0.28
745 0.33
746 0.36
747 0.37
748 0.34
749 0.35
750 0.34
751 0.33
752 0.36
753 0.32
754 0.31
755 0.35
756 0.4
757 0.45
758 0.45
759 0.46
760 0.43
761 0.4
762 0.36
763 0.32
764 0.34
765 0.31
766 0.29
767 0.28
768 0.3
769 0.3
770 0.32
771 0.28
772 0.22
773 0.18
774 0.19
775 0.17
776 0.18
777 0.18
778 0.15
779 0.16
780 0.14
781 0.17
782 0.18
783 0.21
784 0.18
785 0.19
786 0.19
787 0.18
788 0.18
789 0.15
790 0.15
791 0.15
792 0.15
793 0.15
794 0.14
795 0.15