Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P87235

Protein Details
Accession P87235    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-30MPPKRKASKNSVRGRKRRTRTNNLPLNPEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-19PKRKASKNSVRGRKRRT
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 5.5, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR018026  DNA_repair_Rad4_subgr  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0000111  C:nucleotide-excision repair factor 2 complex  
GO:0071942  C:XPC complex  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006298  P:mismatch repair  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
KEGG spo:SPCC4G3.10c  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MPPKRKASKNSVRGRKRRTRTNNLPLNPEVKEETVVSSTHRQTRSQSKKPSLSSSAEPPSESLDDNISALNSLQRSASSSEKGSDEDNEKLGSSEDDEFDDDFDTWEQVDLSPNKQEDKKDLHIVTQHITPQLTKESKKGSSSAMDKSIRLSIHIMHFTCLLYHGSVRNRWLMNSLLLDGLRDLLVEKQPSVVEAWVCSSQTHEDLLKLLNGLRMWWNKSFKIESHGLRKLGYRTLKQGFDIGFSPEIFHNFHEYQASLLSLKGSRDLAAQGFTALCRSLNLKARLIFSLQPLTFSTASYDDWSPHILPEETSTSIDDDLRYPIFWTEIYDQSEKKWIAVDAVVLNGVYTNDMTWFEPKGAYAESKHLRMGIVAAYDNDLYAKDVTLRYTDYQSSRLKKIRHVSFADKYFDFYKAIFGQLAKRNKDAEDIYEEKELESKVPIREPKSFADFKNHPEFVLIRHLRREEALLPNAKPVKTATFGNGKKATSEEVYLRKDVVICKTPENYHKEGRVIKEGEQPRKMVKARAVTISRKREHEFRVAETNEPVLQGLYSSDQTELYVPPPIKDGIIPKNGYGNMDCFVESMIPKGAAHLPYRGIAKIAKKLNIDYADAVTGFEFRKHRAIPVTTGIIVPEESAQMVYEEFLECEKIRIEKQQMKERKIIYGQWKHLLNALRIRKRIEEQYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.91
3 0.9
4 0.91
5 0.91
6 0.91
7 0.91
8 0.92
9 0.92
10 0.86
11 0.83
12 0.76
13 0.7
14 0.6
15 0.52
16 0.44
17 0.35
18 0.32
19 0.26
20 0.25
21 0.22
22 0.21
23 0.22
24 0.27
25 0.32
26 0.38
27 0.4
28 0.39
29 0.45
30 0.56
31 0.62
32 0.64
33 0.68
34 0.7
35 0.76
36 0.79
37 0.8
38 0.75
39 0.69
40 0.64
41 0.62
42 0.59
43 0.52
44 0.47
45 0.4
46 0.38
47 0.34
48 0.3
49 0.23
50 0.18
51 0.18
52 0.18
53 0.17
54 0.13
55 0.11
56 0.11
57 0.13
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.14
63 0.17
64 0.22
65 0.21
66 0.23
67 0.25
68 0.26
69 0.27
70 0.25
71 0.27
72 0.26
73 0.25
74 0.25
75 0.23
76 0.22
77 0.21
78 0.2
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.14
83 0.15
84 0.16
85 0.16
86 0.16
87 0.16
88 0.13
89 0.12
90 0.12
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.16
97 0.17
98 0.19
99 0.24
100 0.25
101 0.3
102 0.33
103 0.35
104 0.35
105 0.41
106 0.44
107 0.48
108 0.47
109 0.46
110 0.47
111 0.47
112 0.42
113 0.38
114 0.34
115 0.28
116 0.28
117 0.24
118 0.22
119 0.28
120 0.31
121 0.3
122 0.33
123 0.37
124 0.4
125 0.42
126 0.42
127 0.37
128 0.38
129 0.4
130 0.4
131 0.41
132 0.39
133 0.37
134 0.37
135 0.38
136 0.31
137 0.28
138 0.25
139 0.2
140 0.24
141 0.29
142 0.28
143 0.24
144 0.25
145 0.23
146 0.22
147 0.2
148 0.15
149 0.11
150 0.12
151 0.16
152 0.2
153 0.23
154 0.25
155 0.3
156 0.29
157 0.29
158 0.3
159 0.26
160 0.24
161 0.23
162 0.21
163 0.16
164 0.16
165 0.15
166 0.13
167 0.11
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.15
179 0.13
180 0.1
181 0.1
182 0.13
183 0.12
184 0.13
185 0.12
186 0.13
187 0.13
188 0.14
189 0.15
190 0.13
191 0.12
192 0.13
193 0.14
194 0.13
195 0.11
196 0.11
197 0.12
198 0.11
199 0.12
200 0.17
201 0.2
202 0.23
203 0.29
204 0.32
205 0.31
206 0.35
207 0.37
208 0.32
209 0.34
210 0.36
211 0.35
212 0.4
213 0.43
214 0.4
215 0.38
216 0.41
217 0.37
218 0.38
219 0.38
220 0.32
221 0.34
222 0.38
223 0.38
224 0.36
225 0.37
226 0.3
227 0.27
228 0.25
229 0.2
230 0.16
231 0.15
232 0.16
233 0.12
234 0.14
235 0.13
236 0.13
237 0.17
238 0.16
239 0.16
240 0.16
241 0.16
242 0.14
243 0.14
244 0.14
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.12
255 0.11
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.08
266 0.12
267 0.2
268 0.23
269 0.26
270 0.28
271 0.29
272 0.3
273 0.3
274 0.26
275 0.21
276 0.24
277 0.21
278 0.2
279 0.19
280 0.22
281 0.2
282 0.18
283 0.18
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.14
288 0.11
289 0.11
290 0.13
291 0.12
292 0.11
293 0.12
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.13
298 0.12
299 0.12
300 0.13
301 0.11
302 0.11
303 0.12
304 0.1
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.1
314 0.11
315 0.14
316 0.18
317 0.19
318 0.19
319 0.19
320 0.25
321 0.22
322 0.19
323 0.17
324 0.14
325 0.13
326 0.13
327 0.14
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.04
336 0.03
337 0.03
338 0.04
339 0.05
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.16
351 0.18
352 0.19
353 0.19
354 0.18
355 0.17
356 0.16
357 0.16
358 0.09
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.07
372 0.08
373 0.09
374 0.11
375 0.11
376 0.14
377 0.16
378 0.16
379 0.22
380 0.27
381 0.3
382 0.35
383 0.4
384 0.39
385 0.43
386 0.51
387 0.52
388 0.53
389 0.53
390 0.54
391 0.54
392 0.56
393 0.53
394 0.44
395 0.4
396 0.34
397 0.3
398 0.24
399 0.18
400 0.17
401 0.14
402 0.15
403 0.14
404 0.13
405 0.19
406 0.26
407 0.33
408 0.31
409 0.32
410 0.33
411 0.33
412 0.36
413 0.3
414 0.25
415 0.25
416 0.26
417 0.26
418 0.26
419 0.26
420 0.21
421 0.23
422 0.2
423 0.14
424 0.13
425 0.15
426 0.15
427 0.2
428 0.25
429 0.27
430 0.32
431 0.35
432 0.36
433 0.39
434 0.41
435 0.37
436 0.41
437 0.4
438 0.4
439 0.46
440 0.43
441 0.36
442 0.34
443 0.33
444 0.26
445 0.35
446 0.32
447 0.25
448 0.3
449 0.31
450 0.29
451 0.3
452 0.3
453 0.24
454 0.27
455 0.3
456 0.3
457 0.3
458 0.35
459 0.38
460 0.35
461 0.31
462 0.26
463 0.24
464 0.23
465 0.23
466 0.21
467 0.28
468 0.29
469 0.36
470 0.38
471 0.35
472 0.33
473 0.33
474 0.32
475 0.23
476 0.25
477 0.22
478 0.26
479 0.28
480 0.28
481 0.28
482 0.25
483 0.26
484 0.27
485 0.27
486 0.27
487 0.26
488 0.29
489 0.32
490 0.36
491 0.41
492 0.45
493 0.44
494 0.43
495 0.45
496 0.47
497 0.48
498 0.48
499 0.48
500 0.44
501 0.42
502 0.45
503 0.5
504 0.53
505 0.51
506 0.49
507 0.44
508 0.5
509 0.49
510 0.45
511 0.43
512 0.43
513 0.43
514 0.49
515 0.52
516 0.53
517 0.6
518 0.64
519 0.62
520 0.6
521 0.6
522 0.59
523 0.59
524 0.59
525 0.54
526 0.48
527 0.53
528 0.49
529 0.47
530 0.41
531 0.38
532 0.29
533 0.26
534 0.21
535 0.12
536 0.1
537 0.09
538 0.09
539 0.09
540 0.09
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.11
545 0.12
546 0.12
547 0.11
548 0.16
549 0.16
550 0.16
551 0.18
552 0.18
553 0.17
554 0.19
555 0.24
556 0.26
557 0.34
558 0.34
559 0.33
560 0.38
561 0.38
562 0.38
563 0.32
564 0.26
565 0.2
566 0.2
567 0.19
568 0.14
569 0.13
570 0.14
571 0.12
572 0.12
573 0.13
574 0.12
575 0.12
576 0.15
577 0.19
578 0.21
579 0.23
580 0.23
581 0.23
582 0.25
583 0.28
584 0.25
585 0.23
586 0.24
587 0.28
588 0.33
589 0.38
590 0.4
591 0.4
592 0.42
593 0.47
594 0.45
595 0.42
596 0.36
597 0.31
598 0.27
599 0.25
600 0.23
601 0.16
602 0.15
603 0.14
604 0.17
605 0.18
606 0.19
607 0.26
608 0.27
609 0.32
610 0.37
611 0.41
612 0.4
613 0.44
614 0.45
615 0.38
616 0.37
617 0.33
618 0.26
619 0.22
620 0.18
621 0.13
622 0.09
623 0.09
624 0.09
625 0.09
626 0.08
627 0.08
628 0.08
629 0.08
630 0.08
631 0.08
632 0.09
633 0.12
634 0.12
635 0.14
636 0.16
637 0.19
638 0.21
639 0.29
640 0.39
641 0.43
642 0.52
643 0.61
644 0.68
645 0.69
646 0.74
647 0.68
648 0.66
649 0.63
650 0.63
651 0.63
652 0.64
653 0.64
654 0.64
655 0.64
656 0.57
657 0.57
658 0.55
659 0.5
660 0.5
661 0.54
662 0.55
663 0.57
664 0.6
665 0.61
666 0.61