Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2DV70

Protein Details
Accession A0A0D2DV70    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
129-167HLGGLIPKRHRSRERRRSRRSRSRSRTPSPSRRARPFDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-163PKRHRSRERRRSRRSRSRSRTPSPSRRAR
300-309AARSQKKRGG
Subcellular Location(s) mito 16, mito_nucl 11.833, cyto_mito 9.833, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51257  PROKAR_LIPOPROTEIN  
Amino Acid Sequences MPLGPARLSFTSRLVTRHHCLAAATSISASSGCPIQGRCRSSSSSFSSALTPSTPKATMSTTPHYPPPTPTQTTSAPMPPEAGDYTSYSNSELISRISHLESQLREQTTRLAQFTFSDDDSNGPCTTHHLGGLIPKRHRSRERRRSRRSRSRSRTPSPSRRARPFDASAYSTRRIALKFAYLGHRYNGFEHANGNVTPAPTIEEVLWKALRKARLISPSLADGADTSVDVVWGEKERLARYTRGDNPSDYDETKVRLDLSWDGCEYSKCGRTDRGVSAFGQVIGVRVRSNKPIEKRSEDAARSQKKRGGKEEPGVHHQSEEEQEGEQDMFGMMVGDSENESETESKTETKSFDPVKDELSYISILNAILPADIRMLAWCPNPPPTFDARFSCRERRYKYFFTNPAFCPTPGALGLKKNDSGIREGYLNIEKMRIAAKKLEGLHDFRNLCKIDASKQMPNCERRVTFADVVKFHEDDHNNTPPFAASVMSQFGFDSITSTGVNKAGARPEVYTFCVHGTAFLWHQVRCMVAILFLVGQGLEQPSIVDELLDIEKNPGRPMYEMADDAPLVLWDCIFPDDDSKMVDSLDWLYAGDKRTLPSLTTKGDGKFGAGGVVDELWTVWREAKMKEILAGSLLDLAIGQGDGSSLRRGAQKDANHPPSRSQKLFQGGDNARIAGKYVPVMQKPKMDTLEALNAKFANGKKVRRDARNGVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.4
3 0.42
4 0.46
5 0.44
6 0.39
7 0.37
8 0.37
9 0.35
10 0.29
11 0.25
12 0.18
13 0.17
14 0.16
15 0.16
16 0.13
17 0.09
18 0.09
19 0.09
20 0.13
21 0.15
22 0.24
23 0.32
24 0.36
25 0.38
26 0.41
27 0.46
28 0.47
29 0.52
30 0.5
31 0.47
32 0.44
33 0.42
34 0.4
35 0.35
36 0.33
37 0.28
38 0.23
39 0.2
40 0.23
41 0.22
42 0.2
43 0.22
44 0.24
45 0.28
46 0.33
47 0.37
48 0.38
49 0.41
50 0.46
51 0.48
52 0.46
53 0.45
54 0.47
55 0.49
56 0.48
57 0.48
58 0.47
59 0.46
60 0.48
61 0.47
62 0.43
63 0.36
64 0.32
65 0.31
66 0.26
67 0.25
68 0.23
69 0.2
70 0.17
71 0.17
72 0.2
73 0.2
74 0.2
75 0.18
76 0.17
77 0.16
78 0.16
79 0.15
80 0.13
81 0.13
82 0.14
83 0.15
84 0.17
85 0.18
86 0.2
87 0.24
88 0.24
89 0.29
90 0.34
91 0.34
92 0.32
93 0.31
94 0.34
95 0.35
96 0.38
97 0.33
98 0.27
99 0.26
100 0.26
101 0.3
102 0.27
103 0.21
104 0.19
105 0.18
106 0.19
107 0.2
108 0.21
109 0.18
110 0.15
111 0.14
112 0.18
113 0.21
114 0.2
115 0.19
116 0.16
117 0.17
118 0.25
119 0.34
120 0.36
121 0.36
122 0.43
123 0.48
124 0.57
125 0.66
126 0.69
127 0.72
128 0.76
129 0.83
130 0.86
131 0.92
132 0.94
133 0.95
134 0.96
135 0.95
136 0.95
137 0.94
138 0.94
139 0.93
140 0.9
141 0.9
142 0.89
143 0.89
144 0.88
145 0.89
146 0.87
147 0.86
148 0.85
149 0.79
150 0.76
151 0.69
152 0.65
153 0.59
154 0.53
155 0.49
156 0.47
157 0.43
158 0.36
159 0.33
160 0.31
161 0.27
162 0.25
163 0.22
164 0.2
165 0.2
166 0.23
167 0.29
168 0.28
169 0.29
170 0.29
171 0.31
172 0.28
173 0.28
174 0.3
175 0.24
176 0.22
177 0.21
178 0.2
179 0.2
180 0.18
181 0.19
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.13
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.15
193 0.17
194 0.15
195 0.18
196 0.21
197 0.25
198 0.24
199 0.27
200 0.3
201 0.35
202 0.37
203 0.36
204 0.33
205 0.31
206 0.3
207 0.26
208 0.2
209 0.13
210 0.1
211 0.09
212 0.07
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.07
221 0.09
222 0.11
223 0.12
224 0.17
225 0.19
226 0.21
227 0.23
228 0.3
229 0.36
230 0.39
231 0.4
232 0.37
233 0.38
234 0.39
235 0.39
236 0.31
237 0.26
238 0.22
239 0.23
240 0.22
241 0.2
242 0.16
243 0.13
244 0.15
245 0.17
246 0.19
247 0.19
248 0.18
249 0.18
250 0.18
251 0.18
252 0.18
253 0.18
254 0.2
255 0.19
256 0.21
257 0.23
258 0.26
259 0.31
260 0.33
261 0.33
262 0.29
263 0.28
264 0.28
265 0.25
266 0.22
267 0.17
268 0.12
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.1
274 0.12
275 0.17
276 0.22
277 0.26
278 0.32
279 0.4
280 0.45
281 0.47
282 0.48
283 0.47
284 0.5
285 0.45
286 0.46
287 0.48
288 0.51
289 0.49
290 0.5
291 0.49
292 0.48
293 0.52
294 0.52
295 0.51
296 0.48
297 0.52
298 0.56
299 0.55
300 0.56
301 0.54
302 0.47
303 0.39
304 0.32
305 0.27
306 0.21
307 0.18
308 0.12
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.07
314 0.06
315 0.04
316 0.04
317 0.03
318 0.04
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.07
332 0.09
333 0.09
334 0.11
335 0.12
336 0.13
337 0.18
338 0.19
339 0.21
340 0.23
341 0.23
342 0.24
343 0.23
344 0.22
345 0.16
346 0.16
347 0.14
348 0.1
349 0.09
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.16
368 0.16
369 0.17
370 0.2
371 0.23
372 0.26
373 0.28
374 0.3
375 0.29
376 0.34
377 0.38
378 0.43
379 0.45
380 0.49
381 0.52
382 0.56
383 0.6
384 0.61
385 0.63
386 0.63
387 0.64
388 0.61
389 0.61
390 0.54
391 0.52
392 0.47
393 0.4
394 0.33
395 0.26
396 0.23
397 0.18
398 0.19
399 0.15
400 0.16
401 0.19
402 0.18
403 0.18
404 0.18
405 0.19
406 0.18
407 0.2
408 0.17
409 0.16
410 0.15
411 0.15
412 0.16
413 0.17
414 0.17
415 0.14
416 0.13
417 0.12
418 0.12
419 0.16
420 0.15
421 0.14
422 0.16
423 0.17
424 0.22
425 0.23
426 0.27
427 0.25
428 0.27
429 0.28
430 0.32
431 0.31
432 0.26
433 0.32
434 0.28
435 0.25
436 0.24
437 0.23
438 0.21
439 0.29
440 0.33
441 0.32
442 0.35
443 0.42
444 0.46
445 0.48
446 0.47
447 0.44
448 0.4
449 0.39
450 0.41
451 0.39
452 0.36
453 0.36
454 0.38
455 0.33
456 0.36
457 0.35
458 0.3
459 0.25
460 0.28
461 0.26
462 0.26
463 0.3
464 0.34
465 0.32
466 0.32
467 0.32
468 0.25
469 0.23
470 0.19
471 0.14
472 0.06
473 0.08
474 0.1
475 0.1
476 0.1
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.08
481 0.08
482 0.07
483 0.08
484 0.08
485 0.09
486 0.1
487 0.1
488 0.11
489 0.1
490 0.12
491 0.14
492 0.16
493 0.16
494 0.17
495 0.19
496 0.2
497 0.22
498 0.21
499 0.18
500 0.17
501 0.18
502 0.16
503 0.14
504 0.13
505 0.13
506 0.12
507 0.18
508 0.19
509 0.17
510 0.18
511 0.18
512 0.17
513 0.16
514 0.16
515 0.1
516 0.08
517 0.08
518 0.08
519 0.07
520 0.07
521 0.06
522 0.04
523 0.04
524 0.05
525 0.06
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.07
531 0.07
532 0.06
533 0.05
534 0.07
535 0.09
536 0.09
537 0.09
538 0.11
539 0.14
540 0.15
541 0.16
542 0.15
543 0.15
544 0.16
545 0.19
546 0.2
547 0.19
548 0.19
549 0.19
550 0.19
551 0.18
552 0.17
553 0.14
554 0.1
555 0.09
556 0.08
557 0.07
558 0.05
559 0.06
560 0.07
561 0.08
562 0.08
563 0.1
564 0.12
565 0.12
566 0.14
567 0.14
568 0.13
569 0.12
570 0.11
571 0.1
572 0.11
573 0.11
574 0.1
575 0.09
576 0.1
577 0.13
578 0.15
579 0.17
580 0.16
581 0.16
582 0.2
583 0.2
584 0.21
585 0.24
586 0.28
587 0.27
588 0.29
589 0.32
590 0.3
591 0.33
592 0.32
593 0.26
594 0.22
595 0.2
596 0.18
597 0.14
598 0.13
599 0.1
600 0.1
601 0.08
602 0.07
603 0.07
604 0.06
605 0.07
606 0.08
607 0.09
608 0.13
609 0.16
610 0.17
611 0.24
612 0.26
613 0.26
614 0.29
615 0.28
616 0.25
617 0.23
618 0.23
619 0.16
620 0.13
621 0.12
622 0.09
623 0.07
624 0.07
625 0.06
626 0.05
627 0.05
628 0.03
629 0.03
630 0.05
631 0.07
632 0.09
633 0.09
634 0.12
635 0.17
636 0.19
637 0.25
638 0.32
639 0.38
640 0.46
641 0.56
642 0.63
643 0.64
644 0.64
645 0.66
646 0.69
647 0.71
648 0.66
649 0.58
650 0.56
651 0.59
652 0.61
653 0.55
654 0.55
655 0.48
656 0.5
657 0.48
658 0.41
659 0.32
660 0.29
661 0.29
662 0.2
663 0.19
664 0.15
665 0.2
666 0.27
667 0.33
668 0.39
669 0.42
670 0.47
671 0.49
672 0.55
673 0.5
674 0.45
675 0.4
676 0.4
677 0.46
678 0.43
679 0.4
680 0.35
681 0.32
682 0.3
683 0.34
684 0.29
685 0.3
686 0.34
687 0.41
688 0.48
689 0.58
690 0.67
691 0.7
692 0.78