Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q9HDY7

Protein Details
Accession Q9HDY7    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-276KTPLRRSFSKSKVRNSNSTKRRNFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, golg 2, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR018465  Scm3/HJURP  
Gene Ontology GO:0034506  C:chromosome, centromeric core domain  
GO:0000775  C:chromosome, centromeric region  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0140713  F:histone chaperone activity  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0034080  P:CENP-A containing chromatin assembly  
KEGG spo:SPAPB1A10.02  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10384  Scm3  
Amino Acid Sequences MCNRQPKAVDLPPNYSCPHLLSFQSVEFNTNPTACDDVFCKRIESEKKYNDFLESLFKKYGRDTSDIADEVDLATGEIIVNNGHLEALKTKDDIWDPTFNNLEISASNGYEKKLDSSIGNPGEKAVSPVHIEDFQSPQIYKFKNLSLRDEMVSDCVFADEVPLASLFVENVCNETIPSQSCVRLKINDKTRKVDASALEKKSCLLPNSSGTLTDQRGLDTIKHKSIEQNEILHVISDTLSSPRRRNPLLSSPKTPLRRSFSKSKVRNSNSTKRRNFISLISMISPRPNLSTHHFNLGFQPLSQQTSFSGSSTQNPHSSSTCKKAFCFQCISESKKC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.45
3 0.38
4 0.32
5 0.3
6 0.26
7 0.25
8 0.26
9 0.27
10 0.27
11 0.31
12 0.28
13 0.28
14 0.25
15 0.26
16 0.24
17 0.22
18 0.2
19 0.17
20 0.2
21 0.17
22 0.18
23 0.18
24 0.2
25 0.23
26 0.23
27 0.23
28 0.22
29 0.3
30 0.38
31 0.44
32 0.49
33 0.55
34 0.59
35 0.61
36 0.61
37 0.55
38 0.47
39 0.4
40 0.39
41 0.32
42 0.32
43 0.32
44 0.31
45 0.3
46 0.31
47 0.37
48 0.3
49 0.32
50 0.3
51 0.29
52 0.34
53 0.33
54 0.31
55 0.24
56 0.2
57 0.16
58 0.14
59 0.11
60 0.05
61 0.05
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.05
73 0.08
74 0.11
75 0.12
76 0.12
77 0.13
78 0.16
79 0.18
80 0.21
81 0.23
82 0.27
83 0.27
84 0.3
85 0.31
86 0.27
87 0.26
88 0.22
89 0.18
90 0.11
91 0.13
92 0.11
93 0.1
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.13
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.13
102 0.12
103 0.13
104 0.2
105 0.23
106 0.23
107 0.21
108 0.21
109 0.2
110 0.19
111 0.2
112 0.13
113 0.1
114 0.11
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.14
119 0.13
120 0.15
121 0.14
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.2
126 0.2
127 0.21
128 0.21
129 0.24
130 0.3
131 0.32
132 0.35
133 0.34
134 0.35
135 0.33
136 0.31
137 0.27
138 0.21
139 0.19
140 0.14
141 0.09
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.04
155 0.05
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.1
165 0.1
166 0.13
167 0.14
168 0.18
169 0.19
170 0.23
171 0.27
172 0.33
173 0.42
174 0.48
175 0.5
176 0.51
177 0.52
178 0.48
179 0.45
180 0.42
181 0.35
182 0.35
183 0.4
184 0.39
185 0.36
186 0.34
187 0.33
188 0.33
189 0.33
190 0.25
191 0.2
192 0.19
193 0.21
194 0.25
195 0.24
196 0.21
197 0.19
198 0.22
199 0.2
200 0.2
201 0.17
202 0.14
203 0.15
204 0.15
205 0.17
206 0.18
207 0.21
208 0.23
209 0.24
210 0.24
211 0.28
212 0.32
213 0.35
214 0.33
215 0.32
216 0.29
217 0.29
218 0.28
219 0.23
220 0.18
221 0.12
222 0.09
223 0.07
224 0.07
225 0.09
226 0.14
227 0.18
228 0.21
229 0.27
230 0.33
231 0.35
232 0.39
233 0.43
234 0.48
235 0.56
236 0.58
237 0.57
238 0.56
239 0.62
240 0.65
241 0.62
242 0.59
243 0.56
244 0.58
245 0.59
246 0.64
247 0.66
248 0.7
249 0.73
250 0.75
251 0.78
252 0.77
253 0.8
254 0.79
255 0.8
256 0.8
257 0.83
258 0.79
259 0.72
260 0.7
261 0.64
262 0.57
263 0.5
264 0.47
265 0.38
266 0.35
267 0.34
268 0.31
269 0.27
270 0.27
271 0.25
272 0.19
273 0.19
274 0.18
275 0.2
276 0.25
277 0.33
278 0.33
279 0.41
280 0.41
281 0.39
282 0.42
283 0.44
284 0.38
285 0.29
286 0.32
287 0.25
288 0.28
289 0.28
290 0.24
291 0.19
292 0.24
293 0.24
294 0.2
295 0.22
296 0.19
297 0.26
298 0.31
299 0.34
300 0.33
301 0.34
302 0.37
303 0.36
304 0.41
305 0.42
306 0.45
307 0.48
308 0.47
309 0.47
310 0.54
311 0.57
312 0.57
313 0.58
314 0.51
315 0.53
316 0.57