Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40379

Protein Details
Accession P40379    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-124DPVKLIINNRNKRKINRQKSRLQGLYRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0010672  P:regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in meiotic cell cycle  
KEGG spo:SPBC2D10.06  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MDSDRCLTDEISLNTLSSTFASDNNLRRKENFLKSRYPSKFDLNVSMLTKSDDVGKTPFSIFDSPSNPGFSRSHQMCSDKNKSPFLFDKIRDEPVSVDPVKLIINNRNKRKINRQKSRLQGLYRSDANGLQPLNSENVKMKKSTALSLTSSPLNSWKTDFKTPPKANVVCISLVIEGDGCASLLYEDLNQISNSCPEVAPNRQNALFSDETLTTMFYSGVTEDEGSCNNLLQSSFGDDLDLGMQRSATWAPGYNYPSKFDSIPFASASPKIKAAFPFDPNVYALNTNDGPVTSTDNNCDQLNTRMQAWNNGFNYSNLNGDIQYPAVTPKFFQQEGRALNVSDCNFGNEEIAYGGIPMRVCHSDSTLCDARIAAKQALKGKRQYDTSTSKAELSTPPSKRRHIDDADLVFHSSPLLSRSRFICCYCTKPFLSISKLQEHESSCSHVERLFGFAPNRLYDDGDGFLGSSFCSDW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.19
4 0.12
5 0.13
6 0.11
7 0.12
8 0.18
9 0.24
10 0.33
11 0.42
12 0.48
13 0.47
14 0.48
15 0.55
16 0.59
17 0.63
18 0.65
19 0.61
20 0.65
21 0.69
22 0.78
23 0.75
24 0.71
25 0.64
26 0.63
27 0.64
28 0.57
29 0.58
30 0.5
31 0.49
32 0.46
33 0.42
34 0.35
35 0.3
36 0.26
37 0.19
38 0.24
39 0.19
40 0.2
41 0.21
42 0.22
43 0.23
44 0.23
45 0.24
46 0.21
47 0.23
48 0.22
49 0.26
50 0.28
51 0.28
52 0.3
53 0.33
54 0.29
55 0.31
56 0.3
57 0.28
58 0.35
59 0.34
60 0.37
61 0.38
62 0.42
63 0.44
64 0.52
65 0.56
66 0.55
67 0.57
68 0.6
69 0.56
70 0.57
71 0.57
72 0.54
73 0.55
74 0.49
75 0.52
76 0.48
77 0.53
78 0.47
79 0.42
80 0.38
81 0.32
82 0.37
83 0.29
84 0.25
85 0.2
86 0.2
87 0.2
88 0.2
89 0.21
90 0.22
91 0.33
92 0.41
93 0.5
94 0.59
95 0.65
96 0.7
97 0.77
98 0.8
99 0.81
100 0.83
101 0.83
102 0.82
103 0.85
104 0.87
105 0.83
106 0.76
107 0.72
108 0.66
109 0.63
110 0.56
111 0.48
112 0.39
113 0.33
114 0.3
115 0.26
116 0.21
117 0.15
118 0.14
119 0.14
120 0.16
121 0.15
122 0.15
123 0.17
124 0.22
125 0.23
126 0.23
127 0.23
128 0.26
129 0.27
130 0.29
131 0.27
132 0.26
133 0.27
134 0.28
135 0.29
136 0.25
137 0.23
138 0.2
139 0.21
140 0.19
141 0.18
142 0.18
143 0.22
144 0.25
145 0.32
146 0.38
147 0.4
148 0.5
149 0.51
150 0.55
151 0.58
152 0.55
153 0.5
154 0.48
155 0.42
156 0.32
157 0.3
158 0.24
159 0.15
160 0.14
161 0.12
162 0.08
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.09
184 0.13
185 0.19
186 0.23
187 0.24
188 0.26
189 0.26
190 0.26
191 0.26
192 0.28
193 0.22
194 0.17
195 0.17
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.14
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.08
237 0.09
238 0.14
239 0.18
240 0.23
241 0.23
242 0.25
243 0.26
244 0.25
245 0.24
246 0.2
247 0.21
248 0.17
249 0.18
250 0.16
251 0.15
252 0.15
253 0.18
254 0.2
255 0.17
256 0.17
257 0.17
258 0.18
259 0.19
260 0.24
261 0.25
262 0.25
263 0.27
264 0.25
265 0.25
266 0.24
267 0.23
268 0.17
269 0.14
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.11
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.14
279 0.13
280 0.13
281 0.15
282 0.17
283 0.19
284 0.18
285 0.18
286 0.15
287 0.17
288 0.21
289 0.2
290 0.2
291 0.22
292 0.22
293 0.29
294 0.3
295 0.33
296 0.3
297 0.3
298 0.29
299 0.26
300 0.29
301 0.22
302 0.21
303 0.14
304 0.14
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.09
309 0.09
310 0.08
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.14
316 0.19
317 0.2
318 0.21
319 0.23
320 0.29
321 0.31
322 0.35
323 0.31
324 0.26
325 0.26
326 0.29
327 0.25
328 0.21
329 0.19
330 0.16
331 0.16
332 0.16
333 0.15
334 0.11
335 0.1
336 0.08
337 0.08
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.1
345 0.11
346 0.12
347 0.13
348 0.16
349 0.18
350 0.19
351 0.26
352 0.27
353 0.26
354 0.25
355 0.24
356 0.24
357 0.25
358 0.28
359 0.24
360 0.22
361 0.27
362 0.35
363 0.42
364 0.45
365 0.48
366 0.48
367 0.5
368 0.52
369 0.52
370 0.52
371 0.52
372 0.51
373 0.49
374 0.46
375 0.42
376 0.38
377 0.36
378 0.31
379 0.31
380 0.37
381 0.38
382 0.46
383 0.5
384 0.56
385 0.58
386 0.61
387 0.63
388 0.6
389 0.6
390 0.59
391 0.58
392 0.55
393 0.51
394 0.45
395 0.36
396 0.3
397 0.23
398 0.15
399 0.11
400 0.11
401 0.15
402 0.15
403 0.19
404 0.22
405 0.28
406 0.32
407 0.34
408 0.38
409 0.38
410 0.44
411 0.46
412 0.51
413 0.45
414 0.44
415 0.49
416 0.48
417 0.49
418 0.5
419 0.5
420 0.51
421 0.52
422 0.51
423 0.5
424 0.46
425 0.44
426 0.39
427 0.38
428 0.32
429 0.31
430 0.3
431 0.26
432 0.26
433 0.23
434 0.26
435 0.23
436 0.26
437 0.26
438 0.29
439 0.32
440 0.31
441 0.34
442 0.29
443 0.29
444 0.25
445 0.26
446 0.23
447 0.2
448 0.18
449 0.15
450 0.14
451 0.12
452 0.1