Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O74908

Protein Details
Accession O74908    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
361-384KVYTDFSKKGSKRKRVSKKFQQLVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
368-379KKGSKRKRVSKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024337  tRNA_splic_suSen54  
IPR024336  tRNA_splic_suSen54_N  
Gene Ontology GO:0031966  C:mitochondrial membrane  
GO:0005741  C:mitochondrial outer membrane  
GO:0000214  C:tRNA-intron endonuclease complex  
GO:0090502  P:RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic  
GO:0000379  P:tRNA-type intron splice site recognition and cleavage  
KEGG spo:SPCC613.09  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12928  tRNA_int_end_N2  
Amino Acid Sequences MDAQDEDNPFTNLETTVDVTEEIQDWRFLSNVEKDQGTYTIPKRGQKDFEPDGTNKQHSALDLSRKAMFDALSVERLISAKHAIIATWNAQNGMSCVEKAHGPLFKTMGTADSQNRMWLLPEETLYLVERGSMECWSEEGLPMSLQAVYSASIPLCGSLENYLVYAHLRRCGFSVIRSNLVPVKEDEYRCDSKIMNFKDLLFLGLGKASQILQTFNFRKLAFPFSKRRRQSILLHDTFYTYEEVYHDLQIVRGYVPIACNLITSSDSLFQITFHAYKPSASFKKSALSEPDFRICVVSSQDTLLPTIFEIDALFSSTPLRQNMPQHMFQRLKEGYRNIIIAIVDYGVISYIRLSDVCFEEKVYTDFSKKGSKRKRVSKKFQQLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.14
4 0.14
5 0.14
6 0.13
7 0.14
8 0.14
9 0.14
10 0.13
11 0.13
12 0.13
13 0.14
14 0.14
15 0.13
16 0.17
17 0.22
18 0.27
19 0.29
20 0.29
21 0.29
22 0.31
23 0.31
24 0.29
25 0.29
26 0.27
27 0.33
28 0.37
29 0.42
30 0.45
31 0.51
32 0.54
33 0.52
34 0.58
35 0.55
36 0.57
37 0.57
38 0.54
39 0.56
40 0.56
41 0.52
42 0.44
43 0.4
44 0.35
45 0.29
46 0.33
47 0.31
48 0.33
49 0.34
50 0.36
51 0.37
52 0.36
53 0.35
54 0.31
55 0.25
56 0.17
57 0.18
58 0.18
59 0.17
60 0.16
61 0.16
62 0.14
63 0.15
64 0.14
65 0.11
66 0.11
67 0.09
68 0.12
69 0.12
70 0.11
71 0.13
72 0.16
73 0.17
74 0.18
75 0.18
76 0.16
77 0.16
78 0.16
79 0.14
80 0.14
81 0.12
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.11
86 0.13
87 0.16
88 0.17
89 0.17
90 0.19
91 0.2
92 0.2
93 0.19
94 0.18
95 0.15
96 0.13
97 0.16
98 0.16
99 0.18
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.17
104 0.17
105 0.15
106 0.15
107 0.12
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.14
112 0.13
113 0.11
114 0.09
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.09
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.06
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.07
152 0.09
153 0.09
154 0.13
155 0.14
156 0.14
157 0.15
158 0.18
159 0.18
160 0.19
161 0.27
162 0.24
163 0.26
164 0.25
165 0.26
166 0.25
167 0.25
168 0.22
169 0.14
170 0.16
171 0.18
172 0.19
173 0.2
174 0.23
175 0.25
176 0.25
177 0.26
178 0.23
179 0.23
180 0.3
181 0.3
182 0.27
183 0.25
184 0.24
185 0.25
186 0.25
187 0.2
188 0.13
189 0.1
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.04
194 0.05
195 0.04
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.16
201 0.18
202 0.19
203 0.23
204 0.21
205 0.23
206 0.24
207 0.3
208 0.27
209 0.32
210 0.4
211 0.46
212 0.56
213 0.57
214 0.59
215 0.57
216 0.59
217 0.6
218 0.6
219 0.62
220 0.54
221 0.53
222 0.48
223 0.43
224 0.38
225 0.31
226 0.22
227 0.11
228 0.09
229 0.09
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.12
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.08
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.11
255 0.11
256 0.1
257 0.11
258 0.12
259 0.12
260 0.11
261 0.14
262 0.14
263 0.15
264 0.17
265 0.26
266 0.28
267 0.29
268 0.3
269 0.29
270 0.35
271 0.36
272 0.38
273 0.36
274 0.37
275 0.4
276 0.42
277 0.44
278 0.38
279 0.36
280 0.33
281 0.26
282 0.22
283 0.2
284 0.18
285 0.15
286 0.16
287 0.18
288 0.17
289 0.17
290 0.15
291 0.12
292 0.1
293 0.11
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.1
300 0.09
301 0.08
302 0.1
303 0.12
304 0.16
305 0.17
306 0.2
307 0.23
308 0.3
309 0.4
310 0.44
311 0.49
312 0.47
313 0.54
314 0.55
315 0.51
316 0.54
317 0.47
318 0.46
319 0.46
320 0.47
321 0.43
322 0.42
323 0.42
324 0.33
325 0.32
326 0.27
327 0.21
328 0.18
329 0.13
330 0.09
331 0.08
332 0.08
333 0.06
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.11
342 0.15
343 0.18
344 0.18
345 0.19
346 0.2
347 0.22
348 0.23
349 0.24
350 0.24
351 0.24
352 0.26
353 0.29
354 0.38
355 0.41
356 0.5
357 0.56
358 0.64
359 0.71
360 0.79
361 0.87
362 0.88
363 0.94
364 0.94