FuNGI

O43088

Protein Details

Accession

O43088

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
114-134	MLKKRAFKKKAERELAQRKDR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
116-127	KKRAFKKKAERE

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 12.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0005634 C:nucleus GO:0005665 C:RNA polymerase II, core complex GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
KEGG	spo:SPBC947.13 -
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MENHRSVFSNVIGDIVEKPPKQLVEVKRSVQRHARGFPAVSRTLPKRESKSMSAYKEKMLRKNKESPGLEGKGNLDDQGIDEENRVRLERMNDLEIEGAQEEIRATIRDDLLEMLKKRAFKKKAERELAQRKDRSSQVNTPDLSQRPSDDSFLSNEKLRSSEKLNRNLQSVLSSEAVDSSSGSPSPPMALSQAEIRSRQTKRVMFPDKAEELTKIFSLPTLAPIKGNEEDDASEDAKHSPKKHSPALSDGTTSNDGAPLEFDTTHLPEKQVTLDPNDPSFYEQLHDKYFPNLPVDEKQMQWLHDPSPAENSYHPSVESLHAHEIRFGFKGEIITPSQSQTIPVNEGLHHHGDAPFSAGYTLVELAHLLRSSFPTQRCIAIQTIGRIIYRLNSGEFREVLSPELHTLVEDAHIYELLAAAASDQVKHLTVRSLAIEALWLCSQSQHGSSRSAV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.2
3	0.25
4	0.22
5	0.25
6	0.28
7	0.28
8	0.31
9	0.37
10	0.41
11	0.44
12	0.51
13	0.55
14	0.59
15	0.61
16	0.65
17	0.65
18	0.64
19	0.62
20	0.6
21	0.59
22	0.56
23	0.55
24	0.53
25	0.51
26	0.46
27	0.4
28	0.43
29	0.42
30	0.45
31	0.49
32	0.52
33	0.52
34	0.58
35	0.62
36	0.61
37	0.65
38	0.66
39	0.68
40	0.69
41	0.64
42	0.62
43	0.64
44	0.65
45	0.65
46	0.67
47	0.68
48	0.66
49	0.74
50	0.75
51	0.77
52	0.72
53	0.69
54	0.68
55	0.63
56	0.56
57	0.47
58	0.42
59	0.35
60	0.32
61	0.26
62	0.17
63	0.13
64	0.13
65	0.16
66	0.15
67	0.12
68	0.14
69	0.16
70	0.17
71	0.19
72	0.19
73	0.16
74	0.18
75	0.21
76	0.26
77	0.27
78	0.28
79	0.26
80	0.26
81	0.26
82	0.22
83	0.2
84	0.13
85	0.1
86	0.07
87	0.07
88	0.07
89	0.07
90	0.08
91	0.07
92	0.08
93	0.11
94	0.12
95	0.12
96	0.12
97	0.13
98	0.16
99	0.21
100	0.21
101	0.22
102	0.24
103	0.28
104	0.34
105	0.42
106	0.45
107	0.49
108	0.59
109	0.65
110	0.74
111	0.77
112	0.77
113	0.78
114	0.82
115	0.82
116	0.8
117	0.73
118	0.64
119	0.62
120	0.61
121	0.57
122	0.53
123	0.51
124	0.48
125	0.51
126	0.49
127	0.46
128	0.47
129	0.42
130	0.38
131	0.31
132	0.27
133	0.25
134	0.26
135	0.25
136	0.2
137	0.19
138	0.2
139	0.22
140	0.23
141	0.21
142	0.2
143	0.19
144	0.2
145	0.21
146	0.2
147	0.24
148	0.32
149	0.37
150	0.45
151	0.51
152	0.51
153	0.52
154	0.5
155	0.44
156	0.36
157	0.29
158	0.23
159	0.17
160	0.15
161	0.12
162	0.11
163	0.11
164	0.09
165	0.09
166	0.07
167	0.07
168	0.07
169	0.07
170	0.07
171	0.07
172	0.08
173	0.07
174	0.06
175	0.07
176	0.07
177	0.08
178	0.11
179	0.15
180	0.15
181	0.16
182	0.18
183	0.25
184	0.26
185	0.31
186	0.35
187	0.35
188	0.37
189	0.47
190	0.51
191	0.45
192	0.46
193	0.46
194	0.4
195	0.37
196	0.34
197	0.25
198	0.2
199	0.19
200	0.16
201	0.11
202	0.09
203	0.07
204	0.08
205	0.08
206	0.11
207	0.13
208	0.13
209	0.13
210	0.13
211	0.17
212	0.16
213	0.17
214	0.13
215	0.11
216	0.11
217	0.12
218	0.14
219	0.11
220	0.1
221	0.1
222	0.11
223	0.14
224	0.17
225	0.17
226	0.22
227	0.27
228	0.33
229	0.38
230	0.41
231	0.4
232	0.42
233	0.44
234	0.39
235	0.35
236	0.3
237	0.27
238	0.23
239	0.21
240	0.15
241	0.12
242	0.11
243	0.09
244	0.1
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.08
249	0.08
250	0.11
251	0.13
252	0.13
253	0.12
254	0.12
255	0.13
256	0.15
257	0.16
258	0.15
259	0.18
260	0.21
261	0.22
262	0.23
263	0.23
264	0.2
265	0.19
266	0.18
267	0.14
268	0.11
269	0.12
270	0.14
271	0.16
272	0.18
273	0.17
274	0.19
275	0.22
276	0.23
277	0.23
278	0.21
279	0.21
280	0.22
281	0.27
282	0.27
283	0.23
284	0.27
285	0.27
286	0.27
287	0.27
288	0.26
289	0.21
290	0.23
291	0.24
292	0.19
293	0.23
294	0.23
295	0.21
296	0.2
297	0.24
298	0.23
299	0.22
300	0.22
301	0.16
302	0.17
303	0.19
304	0.2
305	0.18
306	0.22
307	0.24
308	0.24
309	0.26
310	0.25
311	0.24
312	0.23
313	0.21
314	0.15
315	0.14
316	0.15
317	0.14
318	0.16
319	0.16
320	0.18
321	0.17
322	0.18
323	0.19
324	0.17
325	0.18
326	0.17
327	0.18
328	0.18
329	0.19
330	0.19
331	0.18
332	0.2
333	0.22
334	0.22
335	0.19
336	0.18
337	0.18
338	0.17
339	0.16
340	0.17
341	0.13
342	0.11
343	0.1
344	0.09
345	0.08
346	0.09
347	0.09
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.09
353	0.09
354	0.08
355	0.09
356	0.13
357	0.17
358	0.23
359	0.24
360	0.27
361	0.28
362	0.31
363	0.31
364	0.3
365	0.29
366	0.27
367	0.28
368	0.26
369	0.28
370	0.27
371	0.25
372	0.22
373	0.21
374	0.19
375	0.2
376	0.18
377	0.18
378	0.2
379	0.22
380	0.26
381	0.26
382	0.25
383	0.24
384	0.23
385	0.22
386	0.2
387	0.18
388	0.16
389	0.17
390	0.14
391	0.12
392	0.12
393	0.1
394	0.11
395	0.1
396	0.1
397	0.09
398	0.09
399	0.09
400	0.08
401	0.08
402	0.06
403	0.06
404	0.05
405	0.04
406	0.07
407	0.08
408	0.08
409	0.09
410	0.1
411	0.12
412	0.13
413	0.14
414	0.16
415	0.17
416	0.19
417	0.2
418	0.2
419	0.19
420	0.18
421	0.2
422	0.16
423	0.17
424	0.15
425	0.14
426	0.13
427	0.14
428	0.16
429	0.16
430	0.21
431	0.23
432	0.25

O43088

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer