Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

O42964

Protein Details
Accession O42964    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-129NLEVPRKVRKEQKPRRRRGKRSSTVDALNHydrophilic
398-422TEQVRKLKAKMKAIRSKSSKKSGVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-121RKVRKEQKPRRRRGKR
402-419RKLKAKMKAIRSKSSKKS
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0072686  C:mitotic spindle  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008023  C:transcription elongation factor complex  
GO:0003711  F:transcription elongation factor activity  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG spo:SPBC19G7.16  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSEEEKAELENMQVESEAKTSENDQTIDTKVDVADVTTHVDEDLDNKEEALDFSEDELSDLDENQFENFDESKIGREAEEPTIYNLPTFKKKQEPNTIEENLEVPRKVRKEQKPRRRRGKRSSTVDALNDELNELGENEEEVLTEQKQLDPTLAAKKELDLQMDAVLKPTRTKKRSNEDNLEQMADDEVLRLREQMRLAALRDAELNSEQLPATEKLKMLPLVDAVLRKTHLYDTILDNNVLDSVRMWLEPLPDRSLPALNIQRSLMDILTKLPIQTEHLRESKIGRIVLFYTISKKPEPFIKRIADNLVSEWSRPIIKRSANYRDRAVGVASFNPEVFQTRRRRDLAAAESNDDAQASRTGRTVIPRSIDSRYQVAPRVRLNPTAMTIAGRMKPADTEQVRKLKAKMKAIRSKSSKKSGVSIEGRGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.15
4 0.15
5 0.11
6 0.12
7 0.15
8 0.2
9 0.23
10 0.23
11 0.24
12 0.26
13 0.27
14 0.28
15 0.26
16 0.21
17 0.17
18 0.17
19 0.15
20 0.13
21 0.13
22 0.11
23 0.15
24 0.13
25 0.14
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.12
30 0.15
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.15
36 0.15
37 0.16
38 0.13
39 0.11
40 0.12
41 0.14
42 0.14
43 0.14
44 0.13
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.1
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.13
58 0.13
59 0.16
60 0.17
61 0.17
62 0.14
63 0.15
64 0.19
65 0.21
66 0.23
67 0.21
68 0.23
69 0.25
70 0.25
71 0.24
72 0.23
73 0.23
74 0.28
75 0.32
76 0.34
77 0.41
78 0.48
79 0.57
80 0.65
81 0.66
82 0.62
83 0.67
84 0.64
85 0.54
86 0.48
87 0.4
88 0.31
89 0.29
90 0.25
91 0.17
92 0.21
93 0.24
94 0.3
95 0.38
96 0.46
97 0.55
98 0.66
99 0.76
100 0.8
101 0.88
102 0.93
103 0.94
104 0.95
105 0.94
106 0.94
107 0.94
108 0.91
109 0.88
110 0.82
111 0.75
112 0.66
113 0.56
114 0.46
115 0.36
116 0.28
117 0.2
118 0.14
119 0.1
120 0.08
121 0.07
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.07
130 0.07
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.13
139 0.19
140 0.2
141 0.2
142 0.18
143 0.19
144 0.24
145 0.25
146 0.23
147 0.16
148 0.16
149 0.18
150 0.19
151 0.19
152 0.16
153 0.15
154 0.14
155 0.17
156 0.26
157 0.32
158 0.35
159 0.43
160 0.5
161 0.59
162 0.69
163 0.74
164 0.74
165 0.69
166 0.71
167 0.64
168 0.55
169 0.45
170 0.34
171 0.25
172 0.17
173 0.12
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.08
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.12
184 0.13
185 0.14
186 0.15
187 0.15
188 0.12
189 0.13
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.09
194 0.07
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.13
205 0.14
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.12
221 0.16
222 0.2
223 0.21
224 0.2
225 0.19
226 0.17
227 0.17
228 0.15
229 0.1
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.1
237 0.14
238 0.16
239 0.18
240 0.18
241 0.19
242 0.2
243 0.2
244 0.18
245 0.21
246 0.24
247 0.21
248 0.22
249 0.22
250 0.2
251 0.2
252 0.2
253 0.14
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.1
258 0.1
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.13
263 0.18
264 0.21
265 0.25
266 0.27
267 0.28
268 0.28
269 0.3
270 0.31
271 0.29
272 0.26
273 0.21
274 0.21
275 0.21
276 0.22
277 0.21
278 0.17
279 0.18
280 0.2
281 0.22
282 0.23
283 0.22
284 0.22
285 0.3
286 0.34
287 0.34
288 0.39
289 0.41
290 0.42
291 0.44
292 0.46
293 0.4
294 0.36
295 0.32
296 0.3
297 0.25
298 0.23
299 0.21
300 0.18
301 0.18
302 0.18
303 0.21
304 0.22
305 0.26
306 0.32
307 0.4
308 0.49
309 0.53
310 0.56
311 0.55
312 0.52
313 0.49
314 0.44
315 0.37
316 0.29
317 0.24
318 0.22
319 0.21
320 0.18
321 0.17
322 0.16
323 0.15
324 0.16
325 0.17
326 0.23
327 0.31
328 0.37
329 0.45
330 0.47
331 0.5
332 0.49
333 0.55
334 0.56
335 0.55
336 0.5
337 0.45
338 0.43
339 0.41
340 0.37
341 0.28
342 0.2
343 0.12
344 0.14
345 0.14
346 0.14
347 0.15
348 0.17
349 0.19
350 0.26
351 0.3
352 0.29
353 0.32
354 0.34
355 0.37
356 0.4
357 0.42
358 0.38
359 0.37
360 0.36
361 0.36
362 0.41
363 0.42
364 0.44
365 0.45
366 0.49
367 0.48
368 0.49
369 0.49
370 0.44
371 0.41
372 0.38
373 0.33
374 0.27
375 0.26
376 0.26
377 0.25
378 0.24
379 0.22
380 0.2
381 0.22
382 0.23
383 0.31
384 0.3
385 0.34
386 0.41
387 0.49
388 0.53
389 0.55
390 0.58
391 0.56
392 0.6
393 0.64
394 0.64
395 0.66
396 0.73
397 0.76
398 0.8
399 0.82
400 0.84
401 0.83
402 0.84
403 0.81
404 0.74
405 0.74
406 0.7
407 0.7
408 0.65